Common sequence motifs of nascent chains engage the ribosome surface and trigger factor

In the cell, the conformations of nascent polypeptide chains during translation are modulated by both the ribosome and its associated molecular chaperone, trigger factor. The specific interactions that underlie these modulations, however, are still not known in detail. Here, we combine protein engineering, in-cell and in vitro NMR spectroscopy, and molecular dynamics simulations to explore how proteins interact with the ribosome during their biosynthesis before folding occurs. Our observations of α-synuclein nascent chains in living Escherichia coli cells reveal that ribosome surface interactions dictate the dynamics of emerging disordered polypeptides in the crowded cytosol. We show that specific basic and aromatic motifs drive such interactions and directly compete with trigger factor binding while biasing the direction of the nascent chain during its exit out of the tunnel. These results reveal a structural basis for the functional role of the ribosome as a scaffold with holdase characteristics and explain how handover of the nascent chain to specific auxiliary proteins occurs among a host of other factors in the cytosol

Expression of genes for bone morphogenetic proteins BMP-2, BMP-4 and BMP-6 in various parts of the human skeleton

BACKGROUND: Differences in duration of bone healing in various parts of the human skeleton are common experience for orthopaedic surgeons. The reason for these differences is not obvious and not clear.METHODS: In this paper we decided to measure by the use of real-time RT-PCR technique the level of expression of genes for some isoforms of bone morphogenetic proteins (BMPs), whose role is proven in bone formation, bone induction and bone turnover. Seven bone samples recovered from various parts of skeletons from six cadavers of young healthy men who died in traffic accidents were collected. Activity of genes for BMP-2, -4 and -6 was measured by the use of fluorescent SYBR Green I.RESULTS: It was found that expression of m-RNA for BMP-2 and BMP-4 is higher in trabecular bone in epiphyses of long bones, cranial flat bones and corpus mandibulae then in the compact bone of diaphyses of long bones. In all samples examined the expression of m-RNA for BMP-4 was higher than for BMP-2.CONCLUSION: It was shown that m-RNA for BMP-6 is not expressed in the collected samples at all. It is postulated that differences in the level of activation of genes for BMPs is one of the important factors which determine the differences in duration of bone healing of various parts of the human skeleton.Author has checked copyrightDG 16/11/1

Problems of colour conversion in the work of Optical Cover Laboratory

Zmiana składu spektralnego powoduje zmianę barwy przetworzonego promieniowania, a w następstwie zmianę jego temperatury barwowej. W wielu zastosowaniach parametr ten nie jest istotny, ale są dziedziny, gdzie właściwa temperatura barwowa przetworzonego interferencyjnie promieniowania jest celem podstawowym, a wskaźniki oddawania barw winny być utrzymane na bardzo wysokim poziomie.Change in spectral composition causes the colour of the converted radiation to change and in turn it changes the temperature of its colour. In many applications this parameter is not important but there are domains where the proper colour temperature of the radiation converted interferentionaly is the basic aim and the indices of colour reproduction must be kept at a very high level

Miara samopodobieństwa natężenia ruchu sieciowego - ocena wybranych metod estymacji

Fractal nature of computer network traffic involves a big impact on performance of queueing systems (routers, switches, etc.), increasing delay values and packet losses. In this article, methods of measurement of network traffic as well as estimation methods of the self-similarity degree are presented and discussed. The most popular time-domain estimation techniques are evaluated from the point of view of reliability: R/S, variance-time and IDC analysis.Fraktalny charakter natężenia ruchu w sieciach komputerowych wywiera duży wpływ na wydajność systemów kolejkowych (rutery, przełączniki sieciowe, itd.), zwiększając wartości opóźnień oraz poziom strat pakietów. W niniejszym artykule zostanie podjęta dyskusja dotycząca zarówno metod pomiaru natężenia ruchu jak i metod późniejszej estymacji poziomu samopodobieństwa. Najbardziej popularne techniki estymacji w dziedzinie czasu (analiza R/S. variance-time oraz IDC) zostały ocenione z punktu widzenia wiarygodności dostarczanych przez nie wyników

Investigations of optical and spectroscopic properties of new active media doped with Er³⁺ and Yb³⁺ ions for "eye-safe" microchip lasers

Przeprowadzono badania własności optycznych i spektroskopowych nowych szklanych oraz krystalicznych ośrodków aktywnych domieszkowanych jonami Er³⁺ i Yb³⁺. Ośrodki szklane SELG (Strong Erbium Laser Glass) i "Cncentrated Glass" o podwyższonej koncentracji iterbu zostały opracowane w Rosyjskiej Akademii Nauk. Monokryształy KGW, KYW, KYbW oraz LaCaBO otrzymano metodą wzrostu z topników w Instytucie Fizyki Technicznej WAT, a kryształy YAG metodą Czochralskiego w Instytucie Materiałów Elektronicznych. Wyznaczono widma absorpcji badanych ośrodków w zakresie spektralnym 200-3200 nm. Badano widma luminescencji i wyznaczono czasy życia górnych poziomów laserowych - ⁴I₁₃/₂ jonów Er³⁺ i ²F₅/₂ jonów Yb³⁺ w badanych szkłach i kryształach.Studies of optical and spectroscopic properties of new glasses and crystals doped with Er³⁺ and Yb³⁺ ions were curried out. Concentrated Yb-Er laser glasses and SELG (Strong Erbium Laser Glass) were developed at the General Physics Institute of Laser Materials and Technology Research Center at Russian Academy of Sciences in Moscow under Professor Denker leadership. KGW, KYW, KYbW and LaCaBO crystals were grown from a flux with the use of Top Seeded Solution Growth (TSSG) technique at the Institute of Applied Physics of the Military University of technology. YAG crystals were obtained by means of the Czochralski method at the Institute of Electronic Materials Technology in Warsaw. Absorption coefficient spectra of the investigated active were evaluated with the use of the Lambda-900 spectrometer in the range of 200-3200 nm. Luminescence spectra were measured using FS 900 spectrometr and lifetimes of the Er³⁺ and Yb³⁺ ions on the levels ⁴I₁₃/₂ and ²F₅/₂ were estimated

Excitation-emission characteristics of phosphors doped with cerium and chromium ions

W pracy przedstawiono wyniki badań materiałów luminescencyjnych, na osnowie granatu itrowo-glinowego, domieszkowanych jonami ceru i chromu, przeznaczonych do nowoczesnych półprzewodnikowych źródeł światła białego. Przeprowadzono pomiary charakterystyk wzbudzeniowo-emisyjnych luminoforów występujących w postaci krystalicznej oraz materiału ceramicznego. Analizowano wpływ struktury krystalicznej oraz poziomu domieszkowania na charakterystyki emisyjne potencjalnych luminoforów.As a class of inorganic phosphors, yttrium aluminium garnet (Y₃Al₅O₁₂,YAG) has received considerable attention because of its applications. YAG is commonly used as a host material in various solid state lasers, cathode ray tubes and as a scintillator. In this article we focus on luminescence of synthetic crystalline and ceramic phosphors of the garnet group for white light emitting diodes (LEDs). The article places importance on methods of white light receiving. This sheds light on interesting trends connected with solid state lightening issues. Exciting emitting spectra of chromium, magnesium and rare earth elements doped (active ions) YAG were gathered in order to compare results and find major differences between particular samples. Moreover, we have analysed influence of crystalline structure and doping's level on emitting characteristics of potential phosphors for semiconductor sources of white light

Analiza i klasyfikacja bioaerozoli w czasie rzeczywistym w oparciu o właściwości rozpraszania światła

The size and shape of biological particles are important parameters allowing discrimination between various species. We have studied several aerosols of biological origin such as pollens, bacterial spores and vegetative bacteria. All of them presented different morphology. Using optical size and shape analyser we found good correlation between light scattering properties and actual particle features determined by scanning electron and fluorescence microscopy. In this study, we demonstrated that HCA (Hierarchical Cluster Analysis) offers fast and continuous bioaerosol classification based on shape and size data matrices of aerosols. The HCA gives an unequivocal interpretation of particle size vs. asymmetry data. Therefore, it may provide high throughput and reliable screening and classification of bioaerosols using scattering characteristics.Rozmiar i kształt cząstek biologicznych są ważnymi parametrami pozwalającymi na rozróżnianie pomiędzy różnymi rodzajami cząstek. Przeprowadzone zostały badania aerozoli pochodzenia biologicznego takich jak pyłki roślin, przetrwalniki oraz wegetatywne bakterie. Substancje te wykazywały różne właściwości morfologiczne. W wyniku przeprowadzonych badań przy pomocy optycznego analizatora wielkości i kształtu cząstek znaleziona została wysoka korelacja pomiędzy właściwościami rozpraszania światła a rzeczywistymi właściwościami cząstek określonymi na podstawie SEM (Skaningowego Mikroskopu Elektronowego) oraz mikroskopu fluorescencyjnego. Przedstawione badania pokazują, że HCA (Hierarchical Cluster Analysis) umożliwia szybką, wiarygodną, prowadzoną w sposób ciągły analizę i klasyfikację bioaerozoli w oparciu o ich charakterystyki rozproszeniowe