Daxx-Mediated Accumulation of Human Cytomegalovirus Tegument Protein pp71 at ND10 Facilitates Initiation of Viral Infection at These Nuclear Domains

Human cytomegalovirus (HCMV) starts immediate-early transcription at nuclear domains 10 (ND10), forming a highly dynamic immediate transcript environment at this nuclear site. The reason for this spatial correlation remains enigmatic, and the mechanism for induction of transcription at ND10 is unknown. We investigated whether tegument-based transactivators are involved in the specific intranuclear location of HCMV. Here, we demonstrate that the HCMV transactivator tegument protein pp71 accumulates at ND10 before the production of immediate-early proteins. Intracellular trafficking of pp71 is facilitated through binding to a coiled-coil region of Daxx. The C-terminal domain of Daxx then interacts with SUMO-modified PML, resulting in the deposition of pp71 at ND10. In Daxx-deficient cells, pp71 does not accumulate at ND10, proving in vivo the necessity of Daxx for pp71 deposition. Also, HCMV forms immediate transcript environments at sites other than ND10 in Daxx-deficient cells, and so does the HCMV pp71 knockout mutant UL82(−/−) in normal cells. This result strongly suggests that pp71 and Daxx are essential for HCMV transcription at ND10. Lack of Daxx had the effect of reducing the infection rate. We conclude that the tegument transactivator pp71 facilitates viral genome deposition and transcription at ND10, possibly priming HCMV for more efficient productive infection

Динамика инновационной восприимчивости регионов Сибирского федерального округа в контексте рейтинга инновационного развития субъектов Российской Федерации в 2000-2013 годах

There is no alternative to the innovative way of competitive stability in the open economy. Susceptibility to innovation becomes an indicator of motivation and an essential factor in the economic system growth. The effectiveness of regulation both the innovation process and innovation sector of the territorial economy determines the adequacy of the tools selected. The choice of approach to the regulation puts the focus on differences in the research methods and theoretical explanation of the phenomena of innovation as an economic good. It is possible to determine differences and peculiarities of innovative susceptibility of the Siberian Federal District through the use of statistical data (official and regional statistical reports for the SFD 2000-2013), the analytical model of innovative susceptibility of regional economy, Oslo Guidelines approach, the use of the factor approach to innovation and defining the relationship between the results of innovative activity and regional product. This analysis allows us to construct a matrix of tools for innovative management. Analytical matrix can serve as a basis for effective adaptation of innovation policy to the region’s realias. The concept of tools for administrative influence from the state regional authorities is proposed on the basis of requirements in case of the presence of the “irreducible infrastructural minimum” in subject’s innovative orientation. Only this composition of innovative infrastructure is capable of ensuring the flow and going through the nature of innovation. The authors offered the matrix method of the innovation policy’s “target orientation”. The method will provide adequate and timely reaction of innovative policy and multi-channel regulation. A model of “irreducible minimum” for the innovative sector infrastructure of the regional economy was postulated, the relation between the level of innovative susceptibility and development of the “through innovation” technological approach, as well as the possibility of the matrix approach to the form the innovation policy of the territory (continuity purposes, tools, resource, and methods) were provedВозможность управления инновациями обеспечивается учетом закономерностей терри- ториально укорененной инновационной системы. В практике сравнительного анализа ин- новационности стран и регионов используются методики оценки конкурентоспособности Всемирного экономического форума, методика Комиссии европейских сообществ (КЕС), методика Организации экономического сотрудничества и развития (ОЭСР), методика Американского научного фонда (NCF). В отечественной литературе имеются: типизация регионов России и ближнего зарубежья по степени развития инновационного потенциала и масштабам инновационной деятельности В. Л. Бабурина ( Бабурин, 2002); типологиза- ция по инновационному потенциалу на основе дисперсионного анализа и экспертных оценок Н. Н. Волкова, Н. И. Маркова (Движение регионов…,2006), модель российского регионально- го инновационного индекса (исследовательский университет ВШЭ) (Рейтинг инновацион- ного.., 2015) и группировка регионов методом индекса инновационности (Доклад к обзору ОЭСР, 2000). Статистика регионов СФО, в том числе общая экономическая и специальная за период 2000-2013 гг. в сравнении с состоянием показателей инновационной деятель- ности РФ обнаруживает недостаточность уровня и динамики индикаторов инновацион- ного развития (Владимирова, 2013). Так, доля инновационной продукции в России в общем выпуске составляет 8–9 % (в странах-лидерах этот показатель около 15 %) и, по дан- ным за последние 3 года, не растет. Результаты российских инноваций обладают низкой конкурентоспособностью: доля России в общем мировом экспорте высокотехнологичных товаров – 0,4 % (Национальный доклад, 2015), что свидетельствует о необходимости безотлагательных усилий по преобразованию регуляторных механизмов и инструментов в направлении повышения связанности и взаимной поддерживаемости компонентов инно- вационных систем территори

Динамика инновационной восприимчивости регионов Сибирского федерального округа в контексте рейтинга инновационного развития субъектов Российской Федерации в 2000-2013 годах

There is no alternative to the innovative way of competitive stability in the open economy. Susceptibility to innovation becomes an indicator of motivation and an essential factor in the economic system growth. The effectiveness of regulation both the innovation process and innovation sector of the territorial economy determines the adequacy of the tools selected. The choice of approach to the regulation puts the focus on differences in the research methods and theoretical explanation of the phenomena of innovation as an economic good. It is possible to determine differences and peculiarities of innovative susceptibility of the Siberian Federal District through the use of statistical data (official and regional statistical reports for the SFD 2000-2013), the analytical model of innovative susceptibility of regional economy, Oslo Guidelines approach, the use of the factor approach to innovation and defining the relationship between the results of innovative activity and regional product. This analysis allows us to construct a matrix of tools for innovative management. Analytical matrix can serve as a basis for effective adaptation of innovation policy to the region’s realias. The concept of tools for administrative influence from the state regional authorities is proposed on the basis of requirements in case of the presence of the “irreducible infrastructural minimum” in subject’s innovative orientation. Only this composition of innovative infrastructure is capable of ensuring the flow and going through the nature of innovation. The authors offered the matrix method of the innovation policy’s “target orientation”. The method will provide adequate and timely reaction of innovative policy and multi-channel regulation. A model of “irreducible minimum” for the innovative sector infrastructure of the regional economy was postulated, the relation between the level of innovative susceptibility and development of the “through innovation” technological approach, as well as the possibility of the matrix approach to the form the innovation policy of the territory (continuity purposes, tools, resource, and methods) were provedВозможность управления инновациями обеспечивается учетом закономерностей терри- ториально укорененной инновационной системы. В практике сравнительного анализа ин- новационности стран и регионов используются методики оценки конкурентоспособности Всемирного экономического форума, методика Комиссии европейских сообществ (КЕС), методика Организации экономического сотрудничества и развития (ОЭСР), методика Американского научного фонда (NCF). В отечественной литературе имеются: типизация регионов России и ближнего зарубежья по степени развития инновационного потенциала и масштабам инновационной деятельности В. Л. Бабурина ( Бабурин, 2002); типологиза- ция по инновационному потенциалу на основе дисперсионного анализа и экспертных оценок Н. Н. Волкова, Н. И. Маркова (Движение регионов…,2006), модель российского регионально- го инновационного индекса (исследовательский университет ВШЭ) (Рейтинг инновацион- ного.., 2015) и группировка регионов методом индекса инновационности (Доклад к обзору ОЭСР, 2000). Статистика регионов СФО, в том числе общая экономическая и специальная за период 2000-2013 гг. в сравнении с состоянием показателей инновационной деятель- ности РФ обнаруживает недостаточность уровня и динамики индикаторов инновацион- ного развития (Владимирова, 2013). Так, доля инновационной продукции в России в общем выпуске составляет 8–9 % (в странах-лидерах этот показатель около 15 %) и, по дан- ным за последние 3 года, не растет. Результаты российских инноваций обладают низкой конкурентоспособностью: доля России в общем мировом экспорте высокотехнологичных товаров – 0,4 % (Национальный доклад, 2015), что свидетельствует о необходимости безотлагательных усилий по преобразованию регуляторных механизмов и инструментов в направлении повышения связанности и взаимной поддерживаемости компонентов инно- вационных систем территори

Differential Functions of Interferon-Upregulated Sp100 Isoforms: Herpes Simplex Virus Type 1 Promoter-Based Immediate-Early Gene Suppression and PML Protection from ICP0-Mediated Degradation▿

Cells have intrinsic defenses against virus infection, acting before the innate or the adaptive immune response. Preexisting antiviral proteins such as PML, Daxx, and Sp100 are stored in specific nuclear domains (ND10). In herpes simplex virus type 1 (HSV-1), the immediate-early protein ICP0 serves as a counterdefense through degradation of the detrimental protein PML. We asked whether interferon (IFN)-upregulated Sp100 is similarly antagonized by ICP0 in normal human fibroblasts by using a selective-knockdown approach. We find that of the four Sp100 isoforms, the three containing a SAND domain block the transcription of HSV-1 proteins ICP0 and ICP4 at the promoter level and that IFN changes the differential splicing of the Sp100 transcript in favor of the inhibitor Sp100C. At the protein level, ICP0 activity does not lead to the hydrolysis of any of the Sp100 isoforms. The SAND domain-containing isoforms are not general inhibitors of viral promoters, as the activity of the major immediate-early cytomegalovirus promoter is not diminished, whereas the long terminal repeat of a retrovirus, like the ICP0 promoter, is strongly inhibited. Since we could not find a specific promoter region in the ICP0 gene that responds to the SAND domain-containing isoforms, we questioned whether Sp100 could act through other antiviral proteins such as PML. We find that all four Sp100 isoforms stabilize ND10 and protect PML from ICP0-based hydrolysis. Loss of either all PML isoforms or all Sp100 isoforms reduces the opposite constituent ND10 protein, suggesting that various interdependent mechanisms of ND10-based proteins inhibit virus infection at the immediate-early level

Differential Role of Sp100 Isoforms in Interferon-Mediated Repression of Herpes Simplex Virus Type 1 Immediate-Early Protein Expression

Nuclear domains called ND10 or PML nuclear bodies contain interferon (IFN)-upregulated proteins like PML and Sp100. Paradoxically, herpes simplex virus 1 (HSV-1) begins its transcriptional cascade at aggregates of ND10-associated proteins, which in turn are destroyed by the HSV-1 immediate-early protein ICP0. While PML is essential in the formation of ND10, the function of Sp100 in the cells' defense against viral infection is unknown. In this study we investigated the potential antiviral effect of IFN-β-induced Sp100. We found that IFN-β treatment leads to a differential accumulation of four Sp100 isoforms in different cell lines. Using an HEK293 cell line derivative, 293-S, producing no detectable amounts of Sp100 even after IFN exposure, we analyzed individual Sp100 isoforms for their effect on HSV-1 infection. Sp100 isoforms B, C, and HMG, but not Sp100A, suppressed ICP0 and ICP4 early after infection. Isoforms B, C, and HMG suppressed expression from the ICP0 promoter in transient transfection, whereas Sp100A enhanced expression. Moreover, Sp100A localized in ND10, whereas the repressive isoforms were either dispersed within the nucleus or, at unphysiologically higher expression levels, formed new aggregates. The repressive activity was dependent on an intact SAND domain, since Sp100B bearing a W655Q mutation in the SAND domain lost this repressive activity and accumulated in ND10. Using RNA interference to knock down the repressive Sp100 isoforms B, C, and HMG, we find that they are an essential part of the IFN-β-mediated suppression of ICP0 expression. These data suggest that repression by the Sp100 isoforms B, C, and HMG takes place outside of ND10 and raise the possibility that viral genomes at Sp100A accumulations are more likely to start their transcription program because of a more permissive local environment

Институциональные инструменты региональной инновационной политики как маркеры реалистичности реализации инноваций (на примере регионов Сибирского федерального округа России)

The proposed article deals with institutional instruments of regional innovation policy. The authors, putting forward a hypothesis about the existence of the influence of the level of sufficiency and completeness of institutional support on the effectiveness of the implementation of innovations, conduct research on the existing one. The research uses the approach of counter verification of the conclusions of desk analysis of documentary support of innovation processes in the regions and analysis of regular public statistics on their innovation sector, which is the basis for conclusions about the correlation of the innovation process and its normative reflection in the innovative sectors of regional economies. It is illustrated and justified that the state of institutional support of the innovation sector can be used as a marker of the quality of innovation transformation processes in the regional economyВ предлагаемой статье рассматриваются институциональные инструменты региональной инновационной политики. Авторы, выдвигая гипотезу о наличии влияния уровня достаточности и полноты институционального обеспечения на эффективность реализации инноваций, проводят исследование существующей. В исследовании использован подход встречной верификации выводов камерального анализа документарного сопровождения инновационных процессов регионов и анализа регулярных общедоступных статистических данных по их инновационному сектору, что служит основанием выводов о корреляции инновационного процесса и его нормативного отражения в инновационных секторах региональных хозяйств. Проиллюстрировано и обосновано, что состояние институционального сопровождения инновационного сектора может использоваться как маркер качества процессов инновационной трансформации регионального хозяйств

Институциональные инструменты региональной инновационной политики как маркеры реалистичности реализации инноваций (на примере регионов Сибирского федерального округа России)

The proposed article deals with institutional instruments of regional innovation policy. The authors, putting forward a hypothesis about the existence of the influence of the level of sufficiency and completeness of institutional support on the effectiveness of the implementation of innovations, conduct research on the existing one. The research uses the approach of counter verification of the conclusions of desk analysis of documentary support of innovation processes in the regions and analysis of regular public statistics on their innovation sector, which is the basis for conclusions about the correlation of the innovation process and its normative reflection in the innovative sectors of regional economies. It is illustrated and justified that the state of institutional support of the innovation sector can be used as a marker of the quality of innovation transformation processes in the regional economyВ предлагаемой статье рассматриваются институциональные инструменты региональной инновационной политики. Авторы, выдвигая гипотезу о наличии влияния уровня достаточности и полноты институционального обеспечения на эффективность реализации инноваций, проводят исследование существующей. В исследовании использован подход встречной верификации выводов камерального анализа документарного сопровождения инновационных процессов регионов и анализа регулярных общедоступных статистических данных по их инновационному сектору, что служит основанием выводов о корреляции инновационного процесса и его нормативного отражения в инновационных секторах региональных хозяйств. Проиллюстрировано и обосновано, что состояние институционального сопровождения инновационного сектора может использоваться как маркер качества процессов инновационной трансформации регионального хозяйств