7 research outputs found
International study on inter-reader variability for circulating tumor cells in breast cancer
Introduction
Circulating tumor cells (CTCs) have been studied in breast cancer with the CellSearch® system. Given the low CTC counts in non-metastatic breast cancer, it is important to evaluate the inter-reader agreement.
Methods
CellSearch® images (N = 272) of either CTCs or white blood cells or artifacts from 109 non-metastatic (M0) and 22 metastatic (M1) breast cancer patients from reported studies were sent to 22 readers from 15 academic laboratories and 8 readers from two Veridex laboratories. Each image was scored as No CTC vs CTC HER2- vs CTC HER2+. The 8 Veridex readers were summarized to a Veridex Consensus (VC) to compare each academic reader using % agreement and kappa (κ) statistics. Agreement was compared according to disease stage and CTC counts using the Wilcoxon signed rank test.
Results
For CTC definition (No CTC vs CTC), the median agreement between academic readers and VC was 92% (range 69 to 97%) with a median κ of 0.83 (range 0.37 to 0.93). Lower agreement was observed in images from M0 (median 91%, range 70 to 96%) compared to M1 (median 98%, range 64 to 100%) patients (P < 0.001) and from M0 and <3CTCs (median 87%, range 66 to 95%) compared to M0 and ≥3CTCs samples (median 95%, range 77 to 99%), (P < 0.001). For CTC HER2 expression (HER2- vs HER2+), the median agreement was 87% (range 51 to 95%) with a median κ of 0.74 (range 0.25 to 0.90).
Conclusions
The inter-reader agreement for CTC definition was high. Reduced agreement was observed in M0 patients with low CTC counts. Continuous training and independent image review are require
International study on inter-reader variability for circulating tumor cells in breast cancer
Introduction: Circulating tumor cells (CTCs) have been studied in breast cancer with the CellSearch® system. Given the low CTC counts in non-metastatic breast cancer, it is important to evaluate the inter-reader agreement.Methods: CellSearch® images (N = 272) of either CTCs or white blood cells or artifacts from 109 non-metastatic (M0) and 22 metastatic (M1) breast cancer patients from reported studies were sent to 22 readers from 15 academic laboratories and 8 readers from two Veridex laboratories. Each image was scored as No CTC vs CTC HER2- vs CTC HER2+. The 8 Veridex readers were summarized to a Veridex Consensus (VC) to compare each academic reader using % agreement and kappa (κ) statistics. Agreement was compared according to disease stage and CTC counts using the Wilcoxon signed rank test.Results: For CTC definition (No CTC vs CTC), the median agreement between academic readers and VC was 92% (range 69 to 97%) with a median κ of 0.83 (range 0.37 to 0.93). Lower agreement was observed in images from M0 (median 91%, range 70 to 96%) compared to M1 (median 98%, range 64 to 100%) patients (P < 0.001) and from M0 and <3CTCs (median 87%, range 66 to 95%) compared to M0 and ≥3CTCs samples (median 95%, range 77 to 99%), (P < 0.001). For CTC HER2 expression (HER2- vs HER2+), the median agreement was 87% (range 51 to 95%) with a median κ of 0.74 (range 0.25 to 0.90).Conclusions: The inter-reader agreement for CTC definition was high. Reduced agreement was observed in M0 patients with low CTC counts. Continuous training and independent image review are required
International study on inter-reader variability for circulating tumor cells in breast cancer
De la danse Ă la documentation: organisation, gestion et mise Ă disposition de la collection de l'ADC
L’association pour la danse contemporaine est basée à Genève. Elle existe depuis 1986 et a pour mission principale de promouvoir la danse contemporaine à Genève. L’association emploie trois collaborateurs qui ont regroupé un fonds documentaire en lien avec la danse. Celui-ci est constitué d’environ 350 monographies, 340 cassettes vidéo, 8 titres de périodiques ainsi que des dossiers documentaires, des photographies et des affiches. Mises à part les cassettes vidéo, qui ont fait l’objet d’un classement sommaire, la documentation de l’adc n’a jamais été organisée. Ce fonds nécessitait une structure, afin de favoriser le repérage de l’information et son exploitation par les collaborateurs de l’adc et les personnes extérieures. Les objectifs généraux ont été reformulés comme suit : • Identifier précisément les besoins documentaires des utilisateurs • Évaluer la structure documentaire • Proposer un modèle concret de centre d’information et de documentation et son concept d’organisation • Effectuer une étude de faisabilité concernant la migration des vidéos vers un support optique (DVD) • Assurer la promotion du centre d’information et de documentation auprès des utilisateurs. Cette étape nous a permis de clarifier les attentes du mandant et d’identifier divers types de contraintes financières, structurelles, organisationnelles dont il fallait tenir compte pour le choix des solutions à mettre en place. Elle nous a servi de point de départ pour notre travail
Divergent Expression and Metabolic Functions of Human Glucuronosyltransferases through Alternative Splicing
Maintenance of cellular homeostasis and xenobiotic detoxification is mediated by 19 human UDP-glucuronosyltransferase enzymes (UGTs) encoded by ten genes that comprise the glucuronidation pathway. Deep RNA sequencing of major metabolic organs exposes a substantial expansion of the UGT transcriptome by alternative splicing, with variants representing 20% to 60% of canonical transcript expression. Nearly a fifth of expressed variants comprise in-frame sequences that may create distinct structural and functional features. Follow-up cell-based assays reveal biological functions for these alternative UGT proteins. Some isoforms were found to inhibit or induce inactivation of drugs and steroids in addition to perturbing global cell metabolism (energy, amino acids, nucleotides), cell adhesion, and proliferation. This work highlights the biological relevance of alternative UGT expression, which we propose increases protein diversity through the evolution of metabolic regulators from specific enzymes
Accessibilité et participation sociale
La Convention relative aux droits des personnes handicapées (CDPH) adoptée en 2006 par l’ONU réaffirme le principe selon lequel les personnes vivant une situation de handicap jouissent des mêmes droits de participer à la vie politique et communautaire que tout autre citoyen ou citoyenne. A travers lois, règlements ou conventions, les Etats ayant signé et ratifié cette convention établissent des politiques qui dessinent les orientations à suivre en faveur du développement de pratiques inclusives. Cependant, pour les personnes en situation de handicap, l’écart entre les lois et les pratiques peut s’avérer important tant les attitudes négatives, les préjugés, les lacunes dans l’organisation des services et les problèmes d’accessibilité sont lents à disparaître. Passer du principe à la réalité peut souvent sembler utopique. Pourtant, des initiatives citoyennes et scientifiques menées avec succès démontrent que l’émancipation des personnes avec une déficience intellectuelle est en marche et que l’autodétermination tend à devenir une réalité pour une partie croissante d’entre elles. Pour les enfants, on s'oriente vers une scolarisation plus inclusive, pour les adultes des dispositifs en vue d’une plus grande autonomie dans les choix de vie fondamentaux sont sporadiquement mis en place. Les contributions présentées dans cet ouvrage sont issues d’expériences de personnes concernées, de professionnel·le·s, de chercheur·e·s et d’étudiant·e·s de différents pays francophones (Suisse, France, Belgique, Canada) et offrent des pistes de réflexion et d’action en vue d’une concrétisation de l’égalité des droits