Cenários futuros para cana-de-açucar no Estado de São Paulo.

Com a atual contribuição econômica e tecnológica alcançada pelo setor canavieiro no Brasil é de altíssima importância a preocupação sobre os cenários futuros na agricultura e avaliação do impacto gerado pelas mudanças climáticas. Sobre a vulnerabilidade dos sistemas agrícolas, conseqüentemente, torna se de grande utilidade para o planejamento de médio e longo prazo do setor no País, adaptando-se aos possíveis impactos e observando as diferenças regionais quanto aos efeitos da mudança no clima. Portanto a necessidade de estudos com modelagem e análise de dados visando à avaliação dos possíveis impactos das mudanças climáticas sobre atividades humanas, recursos naturais e, particularmente, sobre a agricultura brasileira contém enormes valores econômicos e sociais com grande potencial de impacto no desenvolvimento nacional.Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009

Criação automática de arvore hiperbólica para organização de banco de dados.

Durante a execução de um projeto de pesquisa, gera-se e necessita-se de uma grande massa de dados, o que, muitas vezes, dificulta a manipulação e a organização desse dados. Isso se repete em projetos de pesquisa e zoneamentos em geral, que tem como base arquivos shapefile e tabelas de diversos temas - solos, hidrologia, relevo, clima, entre outros para todos os Estados do Brasil. A fim de eliminar o trabalho repetitivo na geração e na busca por esses dados, foi criado um banco de dados chamado "Recursos Naturais", que reúne as diversas informações e está à disposição de todos os projetos interessados. Com o objetivo de nivelar uma base de dados para todos os projetos, utilizou-se a estrutura de árvore hiperbólica, que diminui o esforço repetitivo de busca ou geração por algum dado que já esteja disponível

Zoneamento agroclimático para cana-de-açúcar no continente africano.

O zoneamento agrícola da cana de açúcar tem como objetivo fornecer subsídios técnicos para formulação de políticas públicas à expansão e produção sustentável. Neste trabalho foi realizado o zoneamento de aptidão climática e pedológica para a cana-de-açúcar no continente africano, onde os principais indicadores considerados na elaboração foram a temperatura, a deficiência hídrica, a declividade e o tipo de solo. Foi possível identificar as áreas mais adequadas ao cultivo da cana-de-açúcar e as regiões onde há restrições para seu desenvolvimento. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a aptidão climática e pedológica da cana de açúcar no continente africano.Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009

Economic and climatic models for estimating coffee supply

O objetivo deste trabalho foi estimar a oferta cafeeira por meio da calibração de modelos estatísticos, com variáveis econômicas e climáticas, das principais regiões produtoras do Estado de São Paulo. As regiões estudadas foram Batatais, Caconde, Cássia dos Coqueiros, Cristais Paulista, Espírito Santo do Pinhal, Marília, Mococa e Osvaldo Cruz. Foram utilizados dados de oferta cafeeira, variáveis econômicas (crédito rural, crédito rural na agricultura e valor da produção) e variáveis climáticas (temperatura do ar, precipitação pluvial, evapotranspiração potencial, deficiência e excedente hídrico) de cada região, para o período de 2000–2014. Os modelos foram calibrados com uso de técnicas de regressão linear múltipla, e todas as combinações possíveis foram testadas para a seleção das variáveis. A oferta cafeeira foi a variável dependente, e as demais, as independentes. A acurácia e a precisão dos modelos foram analisadas pelo erro percentual médio e pelo coeficiente de determinação ajustado, respectivamente. As variáveis que mais influenciam a oferta cafeeira são o valor de produção e a temperatura do ar. É possível estimar a oferta cafeeira com regressões lineares múltiplas por meio de variáveis econômicas e elementos climáticos. Os modelos mais acurados são os calibrados para estimar a oferta cafeeira das regiões de Cássia dos Coqueiros e Osvaldo Cruz.The objective of this work was to estimate the coffee supply by calibrating statistical models with economic and climatic variables for the main producing regions of the state of São Paulo, Brazil. The regions were Batatais, Caconde, Cássia dos Coqueiros, Cristais Paulista, Espírito Santo do Pinhal, Marília, Mococa, and Osvaldo Cruz. Data on coffee supply, economic variables (rural credit, rural agricultural credit, and production value), and climatic variables (air temperature, rainfall, potential evapotranspiration, water deficit, and water surplus) for each region, during the period from 2000–2014, were used. The models were calibrated using multiple linear regression, and all possible combinations were tested for selecting the variables. Coffee supply was the dependent variable, and the other ones were considered independent. The accuracy and precision of the models were assessed by the mean absolute percentage error and the adjusted coefficient of determination, respectively. The variables that most affect coffee supply are production value and air temperature. Coffee supply can be estimated with multiple linear regressions using economic and climatic variables. The most accurate models are those calibrated to estimate coffee supply for the regions of Cássia dos Coqueiros and Osvaldo Cruz

Germline DNA copy number variation in familial and early-onset breast cancer

Introduction: Genetic factors predisposing individuals to cancer remain elusive in the majority of patients with a familial or clinical history suggestive of hereditary breast cancer. Germline DNA copy number variation (CNV) has recently been implicated in predisposition to cancers such as neuroblastomas as well as prostate and colorectal cancer. We evaluated the role of germline CNVs in breast cancer susceptibility, in particular those with low population frequencies (rare CNVs), which are more likely to cause disease." Methods: Using whole-genome comparative genomic hybridization on microarrays, we screened a cohort of women fulfilling criteria for hereditary breast cancer who did not carry BRCA1/BRCA2 mutations. Results: The median numbers of total and rare CNVs per genome were not different between controls and patients. A total of 26 rare germline CNVs were identified in 68 cancer patients, however, a proportion that was significantly different (P = 0.0311) from the control group (23 rare CNVs in 100 individuals). Several of the genes affected by CNV in patients and controls had already been implicated in cancer. Conclusions: This study is the first to explore the contribution of germline CNVs to BRCA1/2-negative familial and early-onset breast cancer. The data suggest that rare CNVs may contribute to cancer predisposition in this small cohort of patients, and this trend needs to be confirmed in larger population samples.Brazilian National Institute of Science and Technology in Oncogenomics [FAPESP 2008/57887-9, CNPq 573589/08-9, FAPESP (2009/00898-1)]Brazilian National Institute of Science and Technology in Oncogenomic

Global economic burden of unmet surgical need for appendicitis

Background: There is a substantial gap in provision of adequate surgical care in many low-and middle-income countries. This study aimed to identify the economic burden of unmet surgical need for the common condition of appendicitis. Methods: Data on the incidence of appendicitis from 170 countries and two different approaches were used to estimate numbers of patients who do not receive surgery: as a fixed proportion of the total unmet surgical need per country (approach 1); and based on country income status (approach 2). Indirect costs with current levels of access and local quality, and those if quality were at the standards of high-income countries, were estimated. A human capital approach was applied, focusing on the economic burden resulting from premature death and absenteeism. Results: Excess mortality was 4185 per 100 000 cases of appendicitis using approach 1 and 3448 per 100 000 using approach 2. The economic burden of continuing current levels of access and local quality was US $92 492 million using approach 1 and$73 141 million using approach 2. The economic burden of not providing surgical care to the standards of high-income countries was $95 004 million using approach 1 and$75 666 million using approach 2. The largest share of these costs resulted from premature death (97.7 per cent) and lack of access (97.0 per cent) in contrast to lack of quality. Conclusion: For a comparatively non-complex emergency condition such as appendicitis, increasing access to care should be prioritized. Although improving quality of care should not be neglected, increasing provision of care at current standards could reduce societal costs substantially