Técnicas de Biología Molecular en el desarrollo de la investigación. Revisión de la literatura

Introducción: Epidemiología etimológicamente significa "ciencia que estudia enfermedades que afecta a las comunidades"; esta ha venido evolucionando a través de los siglos describiendo y explicando la dinámica de la salud poblacional; ha integrado nuevas ramas, como la epidemiología molecular definida como una disciplina en la cual se implementa técnicas moleculares para aportes científicos, de investigación y clínico. Objetivo: Presentar las técnicas con fundamento en biología molecular, que han aportado al desarrollo de la investigación. Material y Métodos: Se realizó revisión de artículos científicos durante los meses de agosto a octubre de 2016 y julio a septiembre de 2017, en inglés, portugués, francés y español en revistas científicas Pubmed, Scielo, Biomed Central, Free Medical Journals, LILACS, Redalyc, Inbiomed, Dialnet, usando términos DeCs descriptores de Ciencias de la Salud y MeSH; se emplearon artículos publicados en el período de 2012 a 2017, usando publicaciones de años anteriores como aporte a la historia del tema. Resultados: se presentan 05 técnicas de Biología molecular que han aportado a la investigación: RCP, Secuenciación, Hibridación de sondas de ADN, RAPD y RFLP. Conclusiones: Hoy en día el uso técnicas moleculares permite el estudio de genoma completo o secuencias específicas de  ADN  cortas o largas con el fin de detectar y analizar secuencias de interés para la investigación en las ciencias agronómicas, forenses, diagnóstico clínico e investigación básica, traslacional y aplicada; cada una de ellas se caracteriza por la confiabilidad y rapidez en la obtención del resultado, robustez, especificidad, sensibilidad y flexibilidad, comparado con métodos fenotípicos.Palabras claves: Epidemiología, reacción de cadena polimerasa, hibridación, secuenciación, RAPD, RFLP.<hr /

Biofilms de Pseudomonas aeruginosa como mecanismos de resistencia y tolerancia a antibióticos. Revisión narrativa

Biofilm-mediated antimicrobial tolerance is a serious problem, mainly in health care-associated infections, due to the different mechanisms expressed by biofilm such as: exopolysaccharides matrix, microenvironment alterations, persistent bacteria, quorum sensing(Q.S) signal, pores, efflow pumps, gene expression, membrane vesicles, extracellular DNA and enzymes. based on the above, the objective of this review is to identify the mechanisms and effects of Pseudomonas aeruginosa biofilm on antibiotic tolerance. For this, a review of the literature on the main tolerance mechanisms in antibiotics mediated by biofilms was carried out in different databases such as: Proquest, Science direct, Scielo, Pubmed and Google school with the descriptors MeSH and DeCS. Biofilms increase the tolerance of these bacteria to different types of antibiotics, since when exposed to minimum amounts of antibiotics it generates the expression of different genes that express mechanisms that decrease the penetration and destruction of antibiotics however, it is not well defined all the factors that generate this type of tolerance.La tolerancia antimicrobiana mediada por biofilms es un grave problema, principalmente en infecciones asociadas a la atención en salud, debido a los diferentes mecanismos que expresa el biofilm como: la matriz de exopolisacaridos, alteraciones del microambiente, bacterias persistentes, señal de quorum sensing(Q.S), porinas, bombas de eflujo, expresión de genes ,vesículas de membrana, ADN extracelular y enzimas. con base a lo anterior, el objetivo de esta revisión es identificar los mecanismos y efectos del biofilm de Pseudomonas aeruginosa en la resistencia a antibióticos .Para esto, se realizo una revisión de la literatura&nbsp; sobre los principales mecanismos de tolerancia en antibióticos mediada por biofilms en diferentes bases de datos como: Proquest, Science direct, Scielo , Pubmed y Google schoolar con los descriptores MeSH y DeCS. Los biofilms aumentan la tolerancia de estas bacterias a los diferentes tipos de antibióticos, ya que cuando se exponen a cantidades mínimas de este genera la expresión de diferentes genes que expresan mecanismos&nbsp; que disminuyen la penetración y destrucción de los antibióticos sin embargo, no está bien definidos todos los factores que generan este tipo de toleranci

Perfil de tolerância ao triclosan e detecção dos genes mexA, mexC, acrB e oqxA relacionados à expressão de bombas de expulsão em isolados clínicos do gênero Enterobacter aerogenes e Enterobacter cloacae

Introduction: Antimicrobial resistance and tolerance to biocides is given by common mechanisms, generated by the use of antimicrobial and biocidal substances in different environments, these mechanisms such as the expression of expulsion pumps present in bacteria of the Enterobacter genus circulating threatens the efficacy of antimicrobials by limiting antibiotic therapy options. Objective: to determine the triclosan tolerance profile and detection of genes associated with expulsion pumps in clinical isolates of Enterobacter aerogenes and Enterobacter cloacae. Materials and Methods: An observational, descriptive and the cross-sectional study was performed, triclosan tolerance profiles were determined by microdilution, antimicrobial susceptibility, phenotypic confirmation of resistance mechanisms, by the presence of polymerase chain reaction, the presence of genes that code for expulsion pumps. Results: The 17% corresponded to Enterobacter cloacae and 6% Enterobacter aerogenes. 93.7% of the clinical isolates of the genus Enterobacter presented the ESBL and AmpC resistance phenotype. In 81.3% of the isolates, the presence of at least one gene related to the expression of ejection pumps was obtained, with MexC and AcrB being frequent; did not identify the presence of the oqxA gene. conclusions: The resistance to different groups of antibiotics is identified in circulating Enterobacter species, as well as the presence of ESBL and AmpC enzymes, the presence of genes related to ejection pumps, and high tolerance to triclosan.Introducción: La resistencia a los antimicrobianos y la tolerancia a biocidas está dada por mecanismos comunes, generados por su uso en diferentes ambientes; mecanismos como la expresión de bombas de expulsión presentes en bacterias del género Enterobacter circulantes amenaza la eficacia de los antimicrobianos limitando las opciones de terapia antibiótica. Objetivos: Determinar el perfil de tolerancia al triclosán y detección de genes asociados a bombas de expulsión en aislados clínicos de Enterobacter aerogenes y Enterobacter cloacae. Materiales y Métodos: Se realizó un estudio observacional, descriptivo y de corte transversal, se determinaron perfiles de tolerancia al triclosán por microdilución, de susceptibilidad antimicrobiana, confirmación fenotípica de mecanismos de resistencia, por reacción en cadena de la polimerasa, se identificó la presencia de genes que codifican para bombas de expulsión. Resultados: El 17% correspondió a Enterobacter cloacae y el 6% Enterobacter aerogenes. El 93,7% de los aislados clínicos del género Enterobacter presentó el fenotipo de resistencia BLEE y AmpC. En el 81,3% de los aislamientos se obtuvo la presencia de al menos un gen relacionado con las expresión de bombas de expulsión, siendo frecuentes MexC y AcrB;&nbsp; no identificó presencia del gen oqxA. Conclusiones: La resistencia a diferentes grupos de antibióticos se identifica en especies de Enterobacter circulante, así la presencia de enzimas BLEE y AmpC, la presencia de genes relacionados con bombas de expulsión y la alta tolerancia al triclosán.Introdução.A resistência antimicrobiana e a tolerância a biocidas esta dada pelos mecanismos comuns&nbsp;gerados pelo uso em diferentes ambientes; mecanismos como a expressão de bombas de expulsão&nbsp;presentes em bactérias do gênero Enterobacter circulantes ameaza a eficácia das antimicrobiana limitando&nbsp; as opções de terapia antibiótica.&nbsp;Objetivos: Determinar o perfil de tolerância ao triclosan e detecção dos genes asociados a bombas de&nbsp;expulsão em isolados clínicos Enterobacter aerogenes e Enterobacter cloacae.&nbsp;Materiais e Métodos: Realizou-se um estudo observacional, descritivo e de corte transversal, determinaram-se perfiles de tolerância ao triclosan por microdiluição, de susceptibilidade antimicrobiana,&nbsp;confirmação de mecanismos de resistência fenotípica por reação em cadeia da polimerase, identificou-se a presença de genes que codificam para bombas de expulsão.&nbsp;Resultados: 17% correspondeu ao Enterobacter cloacae e 6% ao Enterobacter aerogenes. 93,7% em&nbsp;isolados clínicos do gênero Enterobacter presentou o fenótipo de resistência BLEE e AmpC. No 81%&nbsp;dos isolamentos se obteve a presença de pelo menos um gen relacionado à expressão de bombas de&nbsp;expulsão, sindo frequentes mexC e acrB; não se identificou a presença do gen oqxA.&nbsp;Conclusões: A resistência de diferentes grupos de antibióticos se identificou em espécies de&nbsp; Enterobacter circulante, assim a presença de enzimas BLEE e AmpC, a presença de genes relacionados com&nbsp;bombas de expulsão e a alta tolerância ao triclosan

Perfiles de susceptibilidad de grupos bacterianos aislados de productos cárnicos en Tunja, Boyacá

Introduction. Bacteria are found in different types of environments that act as reservoirs, among these consumer products derived from animals. Some of these bacteria are able to cause disease to humans and, it in turn, they have devolved generating antibiotics resistance, for that reason has become a public health problem worldwide. Objective. To describe susceptibility profiles of groups bacterium from meat products and derivatives, in two Tunja´s market. Materials and Methods. Descriptive cross-sectional study, they realized sampling meat´s products in meat sale zone and by-products in a three-month period in two Tunja´s market, which different cuts of meat products were taken, for further analysis. Results. From 160 meat samples collected from 32 outlets were isolated 333 bacterial strains, it found presence of Gram-negative and Gram-positive bacteria in 83.2% and 16.8% respectively. Furthermore, the profiles of antimicrobial susceptibility for these bacteria, it showed sensibility of 19,2% and 0,9% respectively to the six antibiotics used for each group in the study. Conclusions. It found a high presence of isolated bacterium from meat products, what oblige to improve od manipulation conditions and sale of these products, since, among the principal risks are the acquisition of strains resistant by means consume of these food contaminate.Introducción. Las bacterias son organismos que se encuentran en diferentes tipos de ambientes que actúan como reservorios, entre estos, los productos de consumo derivados de los animales. Algunas de estas bacterias son capaces de causar enfermedad a los humanos y, a su vez, han evolucionado generando resistencia a antibióticos, lo cual se ha convertido en un problema de salud pública a nivel mundial. Objetivo. Describir los perfiles de susceptibilidad de grupos bacterianos provenientes de productos cárnicos y derivados, de dos lugares de abasto de Tunja. Materiales y Métodos. Estudio descriptivo de corte transversal. Se realizó muestreo de productos cárnicos en los expendios de carne y derivados, en un periodo de tres meses, en dos lugares de abasto de la ciudad de Tunja, de los cuales se tomaron diferentes cortes de productos cárnicos para su posterior análisis. Resultados. A partir de 160 muestras cárnicas recolectadas de 32 puntos de venta, se aislaron 333 cepas bacterianas, encontrando presencia de bacterias Gram negativas y Gram positivas en un 83.2% y 16.8% respectivamente. Por otra parte, los perfiles de susceptibilidad antimicrobiano para estas bacterias mostraron sensibilidad del 19,2% y 0,9%, respectivamente, a los seis antibióticos utilizados para cada grupo en el estudio. Conclusiones. Se encontró una alta presencia de bacterias procedentes de los aislados de productos cárnicos, que obliga a la mejora de las condiciones de manipulación y expendio de estos productos, dado que, entre los principales riesgos se encuentra la adquisición de cepas resistentes mediante el consumo de alimentos contaminados

Diagnóstico molecular una alternativa para la detección de patógenos en alimentos

Introduction: Foodborne diseases constitute a health problem in the world, involving products of animal origin, vegetables, water sources, and foods ready for consumption.  The problem arises because of the inadequate manipulation of food and the possibility of transmission of pathogenic microorganisms, mainly of a bacterial type.Objective: To describe the different conventional and molecular diagnostic techniques used in the food industry.Material and Methods: A search was carried though the analysis of review articles, original articles, and theses during a period of three months; these articles were written in English, Portuguese and Spanish.  In their content, they demonstrated the use of conventional and molecular methodology for the identification of microorganisms in different types of food.Results: The conventional methods for the identification of these microorganisms make use of well-established protocols and norms, but require too much time for their identification and, in some cases, they provide low sensitivity and specificity. Molecular techniques are proposed as an alternative for the microbiological evaluation of food because they are fast, sensitive and reliable.Conclusions: Molecular techniques are proposed as a new and faster alternative for the detection of microorganisms, reducing the time for the emission of results from days to hours; identifying pathogenesis factors, virulence and drug resistance with only one assemblage, thus providing high sensitivity and specificity.Keywords: Pathogen, Diseases, Food, Transmission, Molecular Diagnostic Techniques.Introducción: Las enfermedades transmitidas por alimentos (ETA) constituyen un problema de salud pública, en ellas se ven implicados productos de origen animal, vegetal, fuentes de agua y alimentos listos para consumo, debido a su manipulación y posibilidad de trasmisión de microorganismos patógenos principalmente de tipo bacteriano.Objetivo: Describir las diferentes técnicas de diagnóstico convencional y molecular empleadas en la industria alimentaria.Material y Métodos: Se realizó una búsqueda de artículos de revisión, originales y tesis durante un periodo de tres meses en inglés, portugués y español que en su contenido mostrarán el uso de metodología convencional y molecular para la identificación de microorganismos en alimentosResultados: Los métodos convencionales para la identificación de estos microorganismos hacen uso de protocolos y normas que están bien establecidos, pero requieren demasiado tiempo para su identificación y aportan baja sensibilidad y especificidad en algunos casos; las técnicas moleculares se plantean como una alternativa para la evaluación microbiológica de los alimentos, al ser rápidas, sensibles y fiables.Conclusiones: las técnicas moleculares se proponen como una nueva y más rápida alternativa de detección de microorganismos, disminuyen el tiempo para la emisión de los resultados de días a horas, identifican factores de patogenia, virulencia y resistencia a fármacos con tan solo un montaje, lo que aporta alta sensibilidad y especificidad.Palabras claves: patógeno, enfermedad, alimentos, transmisión, técnicas de diagnóstico molecular

Antibiotic Resistance: Origins, evolution and healthcare-associated infections

El aumento en la incidencia de infecciones asociadas a la atención en salud causada por microorganismos multiresistentes a antibióticos, han incrementado la morbilidad, mortalidad y otros factores que afectan a paciente, familias e instituciones prestadoras de servicios de salud; por lo que se ha hecho necesario el estudio permanente del tema, para identificar posibles estrategias que contribuyan a disminuir la situación. Se realizó una revisión de la literatura sobre el origen de los antibióticos, la evolución de su respectiva resistencia, el impacto en la salud pública; desde una perspectiva histórica y actual. La búsqueda de la literatura se realizó en las bases de datos bibliográficas: Pubmed, Web of Science, Scopus, SciELO, The Cochrane Library y Lilacs. El análisis de la literatura mostró desde el punto de vista histórico, el descubrimiento de los antibióticos hasta los últimos antibióticos de última generación, y la rápida coevolución de los genes de resistencia a los antibióticos y su posterior diseminación a cientos de especies de microorganismos mediante la Transferencia Horizontal de Genes (THG). También es discutido como el incremento de la resistencia a los antibióticos (RAM) genera una serie de factores que potencian las infecciones asocia de las a los cuidados de la salud (IACS) y su impacto en la salud pública. La historia desde el descubrimiento, los cambios en el comportamiento de uso de los antibióticos y la respuesta de los microorganismos con la generación de la RAM poco tiempo después, es uno de los ejemplos más fantásticos de coevolución que existe en la naturaleza

Biodiversidad 2018. Reporte de estado y tendencias de la biodiversidad continental de Colombia

Las cifras y temáticas contenidos en el presente Reporte, aunque no son el panorama completo del estado del conocimiento de la biodiversidad en Colombia, son un compendio seleccionado de los temas que, desde el Instituto Humboldt, consideramos son relevantes y merecen ser discutidos por el público general. En muchos de los casos, las cifras no son esperanzadoras u son un llamado urgente a la acción. En otro casos son la evidencia de que se requieren acciones a nivel nacional, y más allá de esto, son muchas las iniciativas que están germinando desde los territorios, cada vez desde una mayor variedad de actores.Bogotá, D. C., Colombi