Guide d'identification des differentes especes ou varietes de Fusarium rencontrees en France sur la pomme de terre et dans son environnement

Il est fréquent d’isoler sur pomme de terre, des champignons du genre Fusarium dont l’identification n’est pas toujours aisée. Les Fusarium isolés à partir de la pomme de terre sont nombreux : on en rapporte au moins 7 espèces ou variétés. Le guide d’identification des différentes espèces ou variétés de Fusarium rencontrées en France sur la pomme de terre et dans son environnement repose sur un système déductif à trois niveaux croissants de complexité, depuis l’observation morphologique des colonies sur les milieux d’isolement jusqu’à l’observation microscopique permettant une description précise des spores. Cette identification est réalisée soit directement à partir du milieu d’isolement (milieu gélosé à base d’extrait de malt), soit après repiquage des espèces ou variétés à déterminer sur des milieux spécifiques (milieux PDA et TANAKA). Si, pour certaines espèces ou variétés de Fusarium (F. oxysporum, F. solani var. coeruleum, F. roseum var. sambucinumJ, la simple observation des colonies sur le milieu d’isolement permet d’arriver à une identification (niveau 1 de la détermination), pour d’autres, il sera nécessaire de réaliser les observations après un repiquage sur les milieux spécifiques. Dans ce cas, l’identification pourra avoir lieu soit par observation de la morphologie des colonies sur ces milieux (niveau II de la détermination lors duquel F. roseum var. arthrosporioides est identifié), soit par observation microscopique des spores (niveau III de la détermination ; c’est le cas des 3 variétés de F. roseum : graminearum, culmorum et type X). Il est proposé dans ce guide, une description complète des caractéristiques des différentes espèces ou variétés de Fusarium rencontrées sur pomme de terre, ainsi qu’une discussion sur certaines d’entre elles (notamment F. roseum var. arthrosporioides et F. roseum type X pour lequel il est proposé F. roseum var. gibbosum forme compactum). Dans la conclusion, il est fait état de l’évolution de la flore fusarienne et de sa dynamique durant la culture et la conservation de la pomme de terre.Fungi of the genus Fusarium are commonly isolated from potato plants and tubers. Their identification is not always easy and at least 7 species or varieties have been recorded from potatoes. This guide to the identification of the species and varieties of Fusarium which have been found in France on the potato plant, both from the tuber and its immediate soil or store environment, depends on an identification system with three levels of complexity. These range from observations on colony morphology on the isolation medium, to a precise description of the spores under the microscope. Identification can be carried out either directly on the isolation medium (e.g. malt extract agar) or after transfer to a more specific medium (e.g. PDA, TANAKA). Although for certain species and varieties (Fusarium oxysporum, F, solani var. coeruleum, F. roseum var. sambucinum) simply observing the culture on its isolation medium will allow it to be identified (first level of identification), for others it is necessary to study it after transfer to a specific medium. In this case, the identification can be made either by observing the morphology of the colony on the medium (second level of identification, by which F. roseum var. arthrosporioides can be recognized) or by looking at the spores under the microscope (third level of identification, appropriate for three varieties of F. roseum :graminearum, culmorum and type X). The guide gives a complete description of the characteristics of the different species and varieties of Fusarium from the potato, and the taxonomy of some of them is discussed (particulary F. roseum var. arthrosporioides and F. roseum type X ; for the latter, the name F. roseum var. gibbosum forme compactum is proposed). Conclusions are made concerning the development of the fungal flora of the Fusarium group and its population dynamics during the growth and storage of the potato

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Guide d'identification des différentes espèces ou variétés de Fusarium rencontrées en France sur la pomme de terre et dans son environnement

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Guide d'identification des differentes especes ou varietes de Fusarium rencontrees en France sur la pomme de terre et dans son environnement

National audienceFungi of the genus Fusarium are commonly isolated from potato plants and tubers. Their identification is not always easy and at least 7 species or varieties have been recorded from potatoes. This guide to the identification of the species and varieties of Fusarium which have been found in France on the potato plant, both from the tuber and its immediate soil or store environment, depends on an identification system with three levels of complexity. These range from observations on colony morphology on the isolation medium, to a precise description of the spores under the microscope. Identification can be carried out either directly on the isolation medium (e.g. malt extract agar) or after transfer to a more specific medium (e.g. PDA, TANAKA). Although for certain species and varieties (Fusarium oxysporum, F, solani var. coeruleum, F. roseum var. sambucinum) simply observing the culture on its isolation medium will allow it to be identified (first level of identification), for others it is necessary to study it after transfer to a specific medium. In this case, the identification can be made either by observing the morphology of the colony on the medium (second level of identification, by which F. roseum var. arthrosporioides can be recognized) or by looking at the spores under the microscope (third level of identification, appropriate for three varieties of F. roseum :graminearum, culmorum and type X). The guide gives a complete description of the characteristics of the different species and varieties of Fusarium from the potato, and the taxonomy of some of them is discussed (particulary F. roseum var. arthrosporioides and F. roseum type X ; for the latter, the name F. roseum var. gibbosum forme compactum is proposed). Conclusions are made concerning the development of the fungal flora of the Fusarium group and its population dynamics during the growth and storage of the potato.Il est fréquent d’isoler sur pomme de terre, des champignons du genre Fusarium dont l’identification n’est pas toujours aisée. Les Fusarium isolés à partir de la pomme de terre sont nombreux : on en rapporte au moins 7 espèces ou variétés. Le guide d’identification des différentes espèces ou variétés de Fusarium rencontrées en France sur la pomme de terre et dans son environnement repose sur un système déductif à trois niveaux croissants de complexité, depuis l’observation morphologique des colonies sur les milieux d’isolement jusqu’à l’observation microscopique permettant une description précise des spores. Cette identification est réalisée soit directement à partir du milieu d’isolement (milieu gélosé à base d’extrait de malt), soit après repiquage des espèces ou variétés à déterminer sur des milieux spécifiques (milieux PDA et TANAKA). Si, pour certaines espèces ou variétés de Fusarium (F. oxysporum, F. solani var. coeruleum, F. roseum var. sambucinumJ, la simple observation des colonies sur le milieu d’isolement permet d’arriver à une identification (niveau 1 de la détermination), pour d’autres, il sera nécessaire de réaliser les observations après un repiquage sur les milieux spécifiques. Dans ce cas, l’identification pourra avoir lieu soit par observation de la morphologie des colonies sur ces milieux (niveau II de la détermination lors duquel F. roseum var. arthrosporioides est identifié), soit par observation microscopique des spores (niveau III de la détermination ; c’est le cas des 3 variétés de F. roseum : graminearum, culmorum et type X). Il est proposé dans ce guide, une description complète des caractéristiques des différentes espèces ou variétés de Fusarium rencontrées sur pomme de terre, ainsi qu’une discussion sur certaines d’entre elles (notamment F. roseum var. arthrosporioides et F. roseum type X pour lequel il est proposé F. roseum var. gibbosum forme compactum). Dans la conclusion, il est fait état de l’évolution de la flore fusarienne et de sa dynamique durant la culture et la conservation de la pomme de terre

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