Comparison and combination of a hemodynamics/biomarkers-based model with simplified PESI score for prognostic stratification of acute pulmonary embolism: findings from a real world study

Background: Prognostic stratification is of utmost importance for management of acute Pulmonary Embolism (PE) in clinical practice. Many prognostic models have been proposed, but which is the best prognosticator in real life remains unclear. The aim of our study was to compare and combine the predictive values of the hemodynamics/biomarkers based prognostic model proposed by European Society of Cardiology (ESC) in 2008 and simplified PESI score (sPESI).Methods: Data records of 452 patients discharged for acute PE from Internal Medicine wards of Tuscany (Italy) were analysed. The ESC model and sPESI were retrospectively calculated and compared by using Areas under Receiver Operating Characteristics (ROC) Curves (AUCs) and finally the combination of the two models was tested in hemodinamically stable patients. All cause and PE-related in-hospital mortality and fatal or major bleedings were the analyzed endpointsResults: All cause in-hospital mortality was 25% (16.6% PE related) in high risk, 8.7% (4.7%) in intermediate risk and 3.8% (1.2%) in low risk patients according to ESC model. All cause in-hospital mortality was 10.95% (5.75% PE related) in patients with sPESI score ≥1 and 0% (0%) in sPESI score 0. Predictive performance of sPESI was not significantly different compared with 2008 ESC model both for all cause (AUC sPESI 0.711, 95% CI: 0.661-0.758 versus ESC 0.619, 95% CI: 0.567-0.670, difference between AUCs 0.0916, p=0.084) and for PE-related mortality (AUC sPESI 0.764, 95% CI: 0.717-0.808 versus ESC 0.650, 95% CI: 0.598-0.700, difference between AUCs 0.114, p=0.11). Fatal or major bleedings occurred in 4.30% of high risk, 1.60% of intermediate risk and 2.50% of low risk patients according to 2008 ESC model, whereas these occurred in 1.80% of high risk and 1.45% of low risk patients according to sPESI, respectively. Predictive performance for fatal or major bleeding between two models was not significantly different (AUC sPESI 0.658, 95% CI: 0.606-0.707 versus ESC 0.512, 95% CI: 0.459-0.565, difference between AUCs 0.145, p=0.34). In hemodynamically stable patients, the combined endpoint in-hospital PE-related mortality and/or fatal or major bleeding (adverse events) occurred in 0% of patients with low risk ESC model and sPESI score 0, whilst it occurred in 5.5% of patients with low-risk ESC model but sPESI ≥1. In intermediate risk patients according to ESC model, adverse events occurred in 3.6% of patients with sPESI score 0 and 6.65% of patients with sPESI score ≥1.Conclusions: In real world, predictive performance of sPESI and the hemodynamic/biomarkers-based ESC model as prognosticator of in-hospital mortality and bleedings is similar. Combination of sPESI 0 with low risk ESC model may identify patients with very low risk of adverse events and candidate for early hospital discharge or home treatment.

Analisi preliminari per il monitoraggio di specie animali nel bacino del fiume Serchio tramite protocolli molecolari

Il mutamento delle condizioni ambientali, così come le misure di salvaguardia adottate per far fronte a tali cambiamenti, hanno sollevato la necessità di strumenti capaci di fornire risposte veloci ed efficaci per la valutazione dello stato di aree di rilievo naturalistico, rispettando obiettivi ambientali e climatici prioritari. Il progetto “Quello che l’occhio non vede ma il DNA ambientale sì” si propone di indagare le specie legate al bacino idrologico del fiume Serchio, attraverso tecniche molecolari come il metabarcoding di DNA ambientale e monitoraggio tradizionale, con particolare attenzione alla batracofauna e decapodi di acqua dolce, per aggiornare la distribuzione di specie presenti nelle liste della Direttiva 92/43/CEE ed annotare la presenza di specie aliene e/o invasive. Il presente progetto di tesi comprende le attività preliminari svolte in tale studio. Da febbraio 2021 sono stati raccolti dati bibliografici sulla presenza di specie target all’interno del bacino idrografico del fiume Serchio. In seguito, sono stati programmati ed effettuati transetti per acquisire dati puntuali di presenza, georeferenziati tramite dispositivo Garmin eTrex® 30 e software OruxMaps®. In parallelo, sono stati raccolti campioni di tessuto da cui è stato estratto DNA. Tali estratti sono stati quantificati ed utilizzati per comporre una mock community su cui validare in vitro un set di primer per 3 marcatori (12S, COI e 18S), precedentemente selezionati tramite screening bibliografico e testati in silico per svolgere analisi metabarcoding. A seguito del perfezionamento del protocollo di amplificazione, i prodotti di PCR sono stati inviati alla ditta GENEWIZ Inc. (Germania) per sequenziamento Novaseq 250 bp paired-end. Per valutare l’output di sequenziamento, le reads ottenute sono state elaborate tramite pipeline di Qiime2, filtrate e raggruppate in ASV (Amplicon Sequence Variants) e confrontate con database di riferimento per ogni marcatore fino all’assegnazione tassonomica. Durante i monitoraggi svolti da marzo ad ottobre 2021, sono stati effettuati transetti su 59 torrenti all’interno del bacino del fiume Serchio e raccolti 254 waypoints. Per la composizione della mock community, sono stati utilizzati 30 ng di DNA da ogni estratto (29 specie di metazoi in totale). Dall’ amplificazione, sequenziamento ed analisi delle reads ottenute con i primer per i marcatori molecolari selezionati, il 12S e la COI risultano i migliori per il riconoscimento tassonomico delle ASV fino al livello di specie, mentre il 18S mostra una minore risoluzione tassonomica

Supplementary methods and results from Trans-generational immunization in the acrobat ant <i>Crematogaster scutellaris</i>

Supplementary methods for lethal dosage assessments and supplementary result

Queen data from Trans-generational immunization in the acrobat ant <i>Crematogaster scutellaris</i>

Survival data for number of queens and number of immature offspring produc

Worker data from Trans-generational immunization in the acrobat ant <i>Crematogaster scutellaris</i>

Survival data for worker

R script from Trans-generational immunization in the acrobat ant <i>Crematogaster scutellaris</i>

R scripts for statistical analyse

Worker data from Trans-generational immunization in the acrobat ant <i>Crematogaster scutellaris</i>

Survival data for worker

Queen data from Trans-generational immunization in the acrobat ant <i>Crematogaster scutellaris</i>

Survival data for number of queens and number of immature offspring produc