A Krónikus Chlamydia Fertőzés Transzkriptom Alapú Diagnózisa és Kezelése - ChlamyTrans - = Transcriptome-based Monitoring and Eradication of Chronic Chlamydial Infection - ChlamyTrans -

A ChlamyTrans project keretében sikerült kidolgoznunk egy új típusú, PCR amplifikáción alapuló Chlamydiális mRNS amplifikációs módszert. A módszer szenzitivitását és specificitását részletesen teszteltük QPCR módszerrel. Az amplifikációs módszert Chlamydia pneumoniae-val fertőzött egértüdőben lezajló bakteriális génexpresszió monitorozására használtuk fel. Több olyan gént-géncsoportot azonosítottunk, amelyek in vivo a baktérium aktív vagy perzisztens növekedésében szerepet játszhatnak. A bakteriális génexpresszió kutatása mellett a Chlamydia fertőzés hatására bekövetkezett gazdasejti génexpressziót is monitoroztuk. Olyan géneket azonosítottunk, amelyek szerepet játszhatnak a Chlamydia fertőzések által indukált szöveti pathológia kialakításában. Végezetül olyan módszerfejlesztésekben is részt vettünk, amelyekkel a Chlamydia fajok funkcionális genetikáját lehet részletesen tanulmányozni. | In the framework of ChlamyTrans project, we developed a novel PCR-based Chlamydial mRNA amplification method. The sensitivity and specificity of the method was extensively tested using the QPCR method. The amplification was used to monitor Chlamydial gene expression in Chlamydia pneumoniae infected mouse lung tissue. The gene expression screen identified Chlamydial genes that were involved in the active and persistent growth of C. pneumoniae in vivo. Besides Chlamydial gene expression profiling we monitored the host gene expression during Chlamydia infection. We could identify host genes that could potentially participate in Chlamydia-indued tissue pathology. Finally, we developed two methods with which we can characterize the functional genetics of Chlamydiae

Chlamydia pneumoniae fertőzés szerepe a makula degeneráció kialakulásában angiográfiával igazolt koszorúérbetegekben = The role of chlamydia pneumoniae infection in the pathogenesis of age-related macular degeneration in patients with proven coronary artery disease

Célul tűztük ki, hogy megvizsgáljuk: - a Chlamydia pneumoniae fertőzöttség mértékét AMD-ben (age related macular degeneration) szenvedő és koszorúér betegeken. - a cytokinek kiválasztását pathologias human könnymintákban (1. postoperativ állapotnál (cataracta és PKP [perforáló keratoplastica] műtét), 2. corneális idegentest kapcsán, 3. bakteriális conjunctivitisben). Az IL-6 koncentráció mellett meghatároztuk az IL-6 release-t is. - AION-ban (anterior ischaemiás opticus neuropathia) milyen arányban fordul elő a ma egyik leggyakoribb thrombosist okozó kockázati tényező, az APC-rezisztencia és az ezt előidéző FV (Leiden)-mutáció. Új eredmények: • Chlamydia titer vizsgálataink alapján a kontrollcsoportban észlelt alacsonyabb szeropozitivitási arány alátámasztja a Chlamydia pneumoniae pathológiás szerepét az AMD és a coronaria betegség kialakulásában. Mindezek alapján feltételezzük, hogy a Chlamydia pneumoniae az egyéb rizikótényezők hatását fokozva, együttesen hajlamosíthat az AMD kialakulására. • Az IL-6 nemcsak a szemfelszíni gyulladásokban, hanem postoperatív állapotokban is fontos szerepet játszik az inflammatorikus folyamatokban. Az IL-6 release korai markere a gyulladásos folyamatoknak. • AION-ban szenvedő betegek jelentős részénél igazoltuk az aktivált protein-C rezisztencia és a Leiden-mutáció jelenlétét. Feltételezzük, hogy ezen betegeknél a thrombophil állapot hozzájárult a vascularis opticus neuropathia kialakulásához. | Aims of the study were as follows: - to find correlation among chronic Chlamydia pneumoniae infection and age-related macular degeneration, AMD) in patients with coronary heart disease (CAD). - to determine the secretion kinetics of interleukin-6 (IL-6) in human tears collected from patients with different eye diseases (1. penetrating keratoplasty /PKP/ or cataract operation, 2. corneal foreign body and 3. acute bacterial conjunctivitis). The total IL-6 amount and release were calculated. - to examine the prevalence of APC resistance and Leiden mutation in patients with non-arteric ischaemic optic neuropathy (NAION). The resistance of coagulation factor V (FV) to activated protein C (APC), mostly due to FV Leiden mutation, is a common cause of inherited thombophilia. New results • Our result supports the assumption that chronic Chlamydia pneumoniae infection plays a role in the development of AMD, and CAD. • The release of IL-6 into the tears is enhanced not only in various anterior segment eye inflammations, but also in postoperative conditions. IL-6 seems to be a sensitive indicator of the different types of irritative eye diseases, especially in postoperative PKP condition. • APC resistance and Leiden mutation were found significantly more frequenently among patients with NAION than in control group members with similar risk factors. FV Leiden mutation may play an important role in the development of the disease

Vírusok és molekuláris genetikai alterációk szerepe conjunctivalis, colorectalis, és anogenitalis elváltozások carcinogenezisében = The role of viruses and molecular genetic alterations in conjunctival, colorectal and anogenital carcinogenesis

Colorectalis daganatok miatt eltávolított biopszia mintákból Magyarországon először nukleinsav hybridizációs próbával mutattuk ki a human papillomavirusokat (HPV). 802 cervix mintából 432 esetben mutattunk ki nukleinsav hybridizációs próbával HPV-t. Randomszerűen 105 mintát választottunk ki consensus PCR és "short" fragmenteket amplifikáló módszerrel a HPV-k kimutatására. Összesen 41 mintából mutattunk ki HPV-t. RFLP módszert alkalmaztunk a HPV típus meghatározására. Mindkét módszert adaptáltuk real-time PCR (RT-PCR) módszerhez. 191 tünetmentes páciens cervix mintáiból consensus HPV PCR amplifikáció után kiválasztottuk a pozitív mintákat, melyeket az ún. "short" fragmenteket amplifikáló PCR módszerrel (az eredeti mintákat felhasználva) amplikonokat állítottunk elő. Linear array módszerrel meghatároztuk a HPV típusokat. A HPV-k kimutatására és egyidejűleg történő vírustípus kimutatására microchip módszert terveztünk. | Biopsy samples from operated colorectal carcinomas were used for the detection of human papillomaviruses (HPVs) by the nucleic acid hybridization probe, for the first time in Hungary. 432 of 802 cervix samples were positive by the nucleic acid hybridization probe. Randomly, 105 of the 432 samples were determined by both consensus and short fragment PCR methods. HPVs were detected in 41 samples. The HPV types were determined by the RFLP method. Both methods were adapted to the real-time PCR (RT-PCR) method. Cervix samples from asymptomatic patients (N = 191) were amplified with the consensus PCR method. In the event of positivity, the short fragment PCR method was performed to determine the HPV types by the linear array method. Simultaneously, a microchip method was designed for the detection of HPVs and determination of the HPV types