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Analysis of Respiratory Syncytial Virus in Clinical Samples by Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Reaction Restriction Mapping
Principales limitantes y soluciones para la producción de alimentos: Contribución del Programa de Innovación en Matanzas, Cuba
Se realizó una investigación con el objetivo de identificar las limitantes para la producción de alimentos, así como sus causas y posibles soluciones, en 25 fincas de los municipios Perico, Martí, Colón y Jagüey Grande (provincia Matanzas, Cuba) involucradas en el Programa de Innovación Agrícola Local (PIAL); las cuales se identificaron y construyeron, de manera conjunta, con productores, propietarios o usufructuarios de dichas fincas. El diagnóstico se hizo de forma participativa, desde los puntos de vista social, económico y ambiental, teniendo en cuenta los métodos recomendados por el CATIE de Costa Rica. Las principales limitantes identificadas fueron: la insuficiente base alimentaria para los animales; los elevados precios de los insumos agropecuarios respecto al precio de los productos; la ineficiente cadena productiva, con incumplimientos tanto de proveedores como de receptores; la falta de conocimiento agrícola de algunos propietarios o usufructuarios de reciente incorporación; así como la baja calidad genética de los animales. Estas limitantes afectan fundamentalmente la producción de leche, la cual constituye el rubro comercial de la mayoría de las fincas estudiadas, que a su vez se encuentran afectadas por la inadecuada cobertura del suelo debido al sobrepastoreo. Los resultados indicaron que los recursos obtenidos por diversas vías se debían dirigir hacia aquellos aspectos de mayor prioridad para las fincas, lo cual fue discutido durante la planificación con las familias campesinas y con las juntas directivas de las cooperativas. Esto agilizaría la elaboración de proyectos y esclarecería la dirección de las inversiones
Analysis of respiratory syncytial virus in clinical samples by reverse transcriptase-polymerase chain reaction restriction mapping
The aim of this study was to develop a polymerase chain reaction (PCR)
for the detection of respiratory syncytial virus (RSV) genomes. The
primers were designed from published sequences and selected from
conserved regions of the genome encoding for the N protein of subgroups
A and B of RSV. PCR was applied to 20 specimens from children admitted
to the respiratory ward of "William Soler" Pediatric Hospital in Havana
City with a clinical diagnosis of bronchiolitis. The PCR was compared
with viral isolation and with an indirect immunofluorescence technique
that employs monoclonal antibodies of subgroups A and B. Of 20
nasopharyngeal exudates, 10 were found positive by the three assayed
methods. In only two cases, samples that yielded positive RNA-PCR were
found negative by indirect immunofluorescence and cell culture.
Considering viral isolation as the "gold standard" technique, RNA-PCR
had 100% sensitivity and 80% specificity. RNA-PCR is a specific and
sensitive technique for the detection of the RSV genome. Technical
advantages are discussed
Detección de adenovirus en lavados broncoalveolares de pacientes cubanos infectados por el VIH
Introduction. The significance of AdV infection
in immunocompromised patients has been firmly
established. These infections have the potential to cause disseminated disease with high mortality
rates, and the clinical management of infected
patients is a major problem.
Objective. To research the role of Adenovirus
in Respiratory Infections in HIV-infected Cuban
patients, and to characterize the isolates obtained
in species and serotypes using Molecular Biology
techniques.
Materials and Methods. 21 samples of bronchoalveolar
lavage fluid from HIV-positive patients with
respiratory symptoms of prolonged evolution with
uncertain etiology, in which there was a predominance
of chronic pneumonia were researched. In
spite of antibiotic therapy, their problems remained
unresolved. The initial diagnoses were performed
by PCR and viral cultures. The identification and
typing of AdV isolates were achieved by PCR.
Other respiratory pathogens, such as bacteria and
fungi were also investigated.
Results. In 10 (48%) out of the 21 samples the
presence of AdV was detected, and the virus was
isolated in 7 of them (70%). Pneumonia was the
predominant clinical manifestation (50 % of the
cases).The AdV found belonged to species B
(28%) and C (71%), type 3 and types 1 and 2,
respectively. In 80% of the cases, only AdV was
found, and in 20% AdV was found together with
bacteria.
Conclusions. Adenoviruses were identified as
causative for respiratory infections in HIV-positive
patients, particularly the B and C species. For that
reason, including them in diagnostic testing would
be useful in treating and managing HIV patients
with respiratory infections. The combination of
classical and molecular techniques proved very
effective in diagnosing, identifying and characterizing
adenoviruses.Introducción. La significación de la infección
por Adenovirus (AdV) en pacientes inmunocomprometidos
ha sido firmemente establecida. Estas
infecciones tienen el potencial de causar enfermedad
diseminada, con altos índices de mortalidad, y
son consideradas un gran problema en el cuidado
de estos pacientes.
Objetivo. Investigar el papel de los adenovirus en
las infecciones respiratorias en pacientes cubanos
infectados por el VIH y caracterizar los aislamientos
obtenidos en especies y serotipos, utilizando
técnicas de biología molecular.
Materiales y Métodos. Fueron investigadas
prospectivamente 21 muestras de líquidos broncoalveolares
de pacientes seropositivos al VIH,
con síntomas respiratorios de larga evolución, de
etiología no precisada, dentro de los cuales predominaba
la neumonía a repetición que, a pesar
de la terapia antibiótica, permanecían sin resolver.
El diagnóstico inicial fue realizado mediante PCR
y aislamiento viral. La identificación y caracterización
en serotipos de los aislamientos fue realizada
por métodos de PCR. Fueron investigados,
además, otros patógenos respiratorios tales como
bacterias y hongos.
Resultados. De las 21 muestras, en 10 de ellas
(48%) fue detectada la presencia de AdV y el
virus fue aislado en siete (70%). La neumonía
fue la manifestación clínica predominante en el 50% de los casos positivos. Los AdV encontrados
pertenecieron a las especies B (28%) y C (71%),
serotipo 3 y serotipos 1 y 2, respectivamente. En
el 80% de los casos, AdV fue encontrado como
único patógeno y en 2 (20%) fue detectado junto
con bacterias.
Conclusiones. Se identificaron a los adenovirus
como causantes de infección respiratoria en pacientes
seropositivos al VIH, particularmente las
especies B y C; por lo que su inclusión en los complementarios
de rutina sería útil para el manejo
y tratamiento del paciente VIH con infección
respiratoria. La combinación de técnicas clásicas
y moleculares, introducidas en el laboratorio, resultaron
útiles para el diagnóstico, la identificación
y la caracterización de este grupo viral
Fortalecimiento del diagnóstico molecular para la vigilancia de virus respiratorios en Cuba
Introduction. Influenza, the most contagious of the Acute Respiratory Infections (ARIs) is
considered an emergent and re-emergent disease due to a wide range of variants among the world population. Since 1997 Avian Influenza virus (H5N1) is reported in the human population of various countries and the apparent endemic feature of this Southeast Asian virus type will continue to be a risk for the world public health. The international community needs to be committed and prepared to improve and strengthen ahead some of the deficiencies of surveillance and control systems at national level. One of the main issues to be considered is the detection of new virus variants before the pandemic this will allow
time of preparation for the proper response.
Materials and Methods. A total of 309 samples from patients with clinical diagnosis of ARI were processed during 2005-2006 using a scheme of molecular diagnosis. Four RT-PCR assays were implemented for the virological diagnosis of ARI caused by influenza virus.
Results. Samples distribution was, 65.6% of the samples belonged to patients under 18 years old, 21.35% were from ambulatory patients, 18.4% from hospitalized patients and 60.1% from units belonging to the sentinel network. Of the total of the processed
samples, 13 (4.2 %) were positive to influenza virus type B, 6 (1.9 %) to influenza virus type A and 4 (1.2 %) to influenza virus C. Three (50.0 %) of the positive samples to influenza type A were H3/N2 subtype virus and three could not be subtyped (50.0 %).
Discussion. The advances in the molecular biology have revolutionized the biological sciences. At present, those tools are applied in studies of influenza virus to try to identify the frequent causes of lethal influenza epidemics. Reference laboratories worldwide have implemented the powerful tools of molecular biology for surveillance and control strategies, our laboratory is one to them. During 2005-2006 the influenza virus type B showed predominance of frequent circulation in Cuba. The results of this study show that the National Influenza Centre of Cuba has advanced diagnostic tools to cope with the surveillance of the ARIs at current conditions and is prepared to give response to the threatening influenza pandemic. However; it is necessary to continue to strengthen the national surveillance systems in order to increase the knowledge of the circulating virus in tropical countries.Introducción. La Influenza, la más contagiosa de las Infecciones Respiratorias Agudas (IRAs), se considera actualmente como una enfermedad emergente y re-emergente, debido a la amplia circulación de variantes antiguas y nuevas entre la población mundial. A partir de 1997, se comienzan a detectar y reportar los brotes de Influenza Aviar (H5N1) en humanos, en varios países del mundo, y la aparente endemicidad de este subtipo en el Sudeste Asiático constituye y continuará siendo un riesgo para la Salud Pública a nivel mundial. Por
otra parte, está la preparación y el compromiso de la comunidad científica internacional en mejorar tempranamente algunas deficiencias y obtener logros importantes en los Sistemas Nacionales de Vigilancia; uno de los primordiales lo constituye el hallazgo o detección de nuevos virus antes del comienzo de la pandemia, que permitirá
disponer de tiempo para organizar una respuesta adecuada.
Materiales y Métodos. Se procesaron un total de 309 muestras clínicas respiratorias de pacientes con diagnóstico clínico de IRA, durante la temporada 2005-2006, por medio de un esquema de diagnóstico molecular. Se introdujeron cuatro ensayos de Transcriptasa Reversa/Reacción en Cadena de la Polimerasa (RT/PCR) para el diagnóstico virológico de las IRAs producidas por los virus influenza.
Resultados. El 65.6% de las muestras pertenecían a pacientes menores de 18 años de edad. 21.35% procedentes de pacientes ambulatorios, 18.4% de pacientes hospitalizados y 60.1% de unidades pertenecientes a la Red centinela. Del total de las muestras procesadas, 13 fueron positivas al tipo B de los virus influenza (4.2%), 6 al virus influenza A (1.9%) y 4 al virus influenza C (1.2%). Tres de las muestras positivas a influenza A fueron subtipificadas como H3/N2 (50%) y tres no pudieron ser subtipificadas (50%).
Discusión. Los avances en la biología molecular han revolucionado a las ciencias biológicas; se aplican en la actualidad a los estudios de los virus influenza y se emplean, entre otras cosas, para tratar de dilucidar las causas de las frecuentes y, a menudo, letales epidemias de Influenza. Algunos Laboratorios de Referencia han incorporado las poderosas herramientas de biología molecular en las actividades de vigilancia y control y el nuestro es uno de ellos. Durante la temporada 2005-2006, los virus influenza B demostraron un predominio en la circulación en Cuba. Los resultados de este estudio muestran que el Laboratorio Nacional de Referencia de los Virus Influenza en Cuba cuenta con herramientas diagnósticas de avanzada para enfrentar la vigilancia virológica de las IRAs
en las condiciones actuales y dar respuesta a la amenazante Influenza pandémica. Sin embargo, resulta imprescindible continuar perfeccionando nuestros sistemas actuales de vigilancia para incrementar el conocimiento de la circulación de estos virus en los países tropicales
Niveles de protección contra la hemaglutinina del virus de influenza A/Johannesburg/82/96(H1N1) en un hogar de ancianas
La vacunación anual contra la influenza es una acción estratégica fundamental para reducir la morbilidad, la mortalidad y las complicaciones ocasionadas por esta enfermedad. Su aplicación se recomienda en los grupos de riesgo, sobre todo en los ancianos con peligro de desarrollar una influenza severa o complicada. Atendiendo a esta condición se evaluó, después de aplicar una dosis única (0,5 mL por vía intramuscular) de la vacuna Agrippal S1/Chiron, recomendada por la OMS para la temporada 1997-1998, la respuesta inmune humoral antihemaglutinina en 38 mujeres con una edad ³ a 65 años, todas pertenecientes a un hogar de ancianas (institución estatal) de La Habana, Cuba. Para ello se utilizó la técnica de inhibición de la hemaglutinación en muestras de suero, obtenidas a partir de la sangre extraída en tres etapas: prevacunación (inmediatamente antes de su aplicación), posvacunación (30 días después) y un año después de la inmunización durante la temporada de influenza 1997-1998. Al aplicar el test de Student en los resultados obtenidos se observó que al comparar los niveles de anticuerpos protectores detectados en la etapa posvacunal (78,94%) y al año de la inmunización (42,11%), con los identificados en la etapa prevacunal, existían diferencias estadísticamente significativas (p=0,0094 y p=0,0018), respectivamente. La comparación de los porcentajes de positividad detectados en las tres etapas investigadas (28,94%; 97,36% y 86,84%) fue también significativo mediante el test de Chi cuadrado (p<0,00001). La respuesta a la inmunización antigripal obtenida en este grupo de riesgo apoya la política de revacunación en los ancianos, individuos donde se observan las mayores tasas de mortalidad por influenza y neumonía
From technology transfer to innovation-based rural development: A necessary turn at the Indio Hatuey experimental station
The collapse of the socialist bloc in the early 1990s led to a severe economic crisis in Cuba, unleashing various processes of change to confront the situation. One such process involved taking a new look at the role of the scientific sector in the management and development of science, technology and innovation, and moving from a reductionist approach to a holistic, endogenous and territorial one. This article describes a process of change that occurred at the Indio Hatuey Experimental Station for Pasture and Forage, or EEPFIH, an experimental station for research and education in Matanzas province, Cuba. This article also presents environmental outcomes obtained on farms as a result of this new approach, and institutional outcomes such as the creation of new structures making it possible to address issues such as food security and sovereignty, sustainable agriculture, and climate change at the local and provincial levels. These transformations allow the EEPFIH to respond effectively to the demands of Cuban society in collaboration with other institutions, implementing practices that stimulate these institutions to play a central role in managing their development. More horizontal spaces for exchange and innovation have been opened up, and new mechanisms for management established, consolidating alliances and connections among actors at different levels. 'Please refer to Supplementary Materials', DOI: https://doi.org/10.1525/elementa.325.s1, 'for a full text Spanish version of this article.' El derrumbe del campo socialista a principios de los años 90 provocó una crisis económica severa en Cuba que desencadenó varios procesos de cambio para enfrentar la problemática. Uno de estos fue repensar el rol del sector científico en la gestión y desarrollo de la ciencia, tecnología e innovación, y llevarlo desde un enfoque reduccionista a un enfoque holístico, endógeno y territorial. Este artículo describe el proceso de cambio que se produjo en la Estación Experimental de Pastos y Forrajes de Indio Hatuey (EEPFIH), estación experimental de investigación y docencia en la provincia de Matanzas en Cuba. Además, presenta resultados ecológicos obtenidos en fincas producto del nuevo enfoque de trabajo y resultados institucionales como la creación de nuevas estructuras, que permiten enfrentar problemáticas de seguridad y soberanía alimentaria, agricultura sostenible y cambio climático a nivel local y territorial. Las transformaciones logradas permitieron a la EEPFIH responder eficazmente a demandas de la sociedad cubana en integración con otras instituciones mediante la implementación de prácticas que estimulan el protagonismo de estas instituciones en la gestión de su desarrollo. Se abrieron espacios de intercambio e innovación más horizontales y se establecieron nuevos mecanismos de gestión que consolidan las alianzas y vínculos entre actores a distintos niveles. 'La versión en español de este artículo se puede encontrar en Materiales Suplementarias,' DOI: https://doi.org/10.1525/elementa.325.s1