OIE training workshop on epidemiology, in particular of HPAI and TADs in the Philippines, in collaboration with CIRAD and Bureau of Animal Industry : Mission report, 29 January - 2 February 2007. Philippines

Cet atelier a été organisé par l'OIE en collaboration avec le CIRAD et le Bureau of Animal Industry des Philippines. L'objectif visé était de former des agents des bureaux régionaux et nationaux des services vétérinaires à l'épidémiologie des maladies animales, notamment de l'influenza aviaire hautement pathogène et des maladies transfrontalières. La formation reposait sur l'utilisation de deux outils d'apprentissage sur ordinateur: l'un nommé RANEMA, visant à une remise à niveau en épidémiologie des maladies animales et développé par le CIRAD et l'Ecole Nationale Vétérinaire d'Alfort; l'autre nommé RANEMA FLU, version préliminaire d'un nouveau module de RANEMA développé par le CIRAD et s'intéressant à l'influenza aviaire. L'atelier a rassemblé 25 participants du Bureau of Animal Industry et de ses antennes régionales. Il a permis d'améliorer significativement les connaissances en épidémiologie des participants et de passer en revue différents aspects de la surveillance de l'influenza aviaire hautement pathogène, notamment la définition de cas, l'échantillonnage, et l'analyse de risque. La grande motivation des participants ainsi que leur participation active aux activités du cours ont contribué à la réussite de l'atelier et ont permis de couvrir l'intégralité du programme prévu. Les discussions organisées lors des groupes de travail ont permis de passer en revue et de faire une lecture critique des plans nationaux de surveillance des Philippines pour l'influenza aviaire hautement pathogène et la fièvre aphteuse. (Résumé d'auteur

Surveillance model for Avian Influenza in 4 pilot provinces in Vietnam, second phase mission, May - December 2007, Hanoi, Vietnam. Final technical report OSRO/RAS/602/JPN

Dans le cadre d'un projet financé par le Gouvernement Japonais et mis en oeuvre par la FAO, le CIRAD est intervenu pour effectuer une mission d'expertise relative à la surveillance de la grippe aviaire hautement pathogène. Cette mission avait pour objectif de proposer des activités permettant de renforcer le niveau de surveillance actuel de la maladie dans les 4 provinces pilotes du projet. Il a été demandé au consultant, lors d'une première mission, de faire une revue des systèmes existants et de proposer un modèle de surveillance peu coûteux qui après avoir été testé à une petite échelle, pourrait être proposé au Gouvernement pour extension éventuelle. La deuxième mission, devait permettre de mettre en oeuvre les activités de surveillance active et d'assurer leur suivi et une partie de leur évaluation. (Résumé d'auteur

Workshop to deliver epidemiology and laboratory training for HPAI diagnostic network

Suite à la menace croissante du virus H5N1 de la grippe aviaire qui a entraîné à ce jour l'élimination de plus de 140 millions de poulets en Asie, la FAO a mis en place une série de trois projets du Programme de Coopération Technique (TCP/RAS/3008, TCP/RAS/3007 et TCP/RAS/3006) en Asie du Sud, de l'Est et du Sud-est intitulés "Coordination des laboratoires de diagnostic et des réseaux de surveillance pour le contrôle et la prévention de la grippe aviaire". Ces projets ont une approche multidisciplinaire, au niveau national et régional et ont pour but d'améliorer la surveillance et le suivi épidémiologique de la maladie. Cet atelier de formation a été réalisé à la demande de la FAO. Il répond au besoin de renforcer les connaissances de base en épidémiologie et en épidémiosurveillance des pays qui bénéficient de ces PCT, et de favoriser une bonne collaboration régionale en établissant des contacts entre les différents centres épidémiologiques et les laboratoires de diagnostic des différents pays. La formation a réunit 18 participants, occupants des postes à responsabilités dans les services Vétérinaires ou dans les laboratoires de diagnostic, originaires de 10 pays (Cambodge, Timor Est, Indonésie, Laos PDR, Malaisie, Myanmar, Papouasie Nouvelle Guinée, Philippines, Thaïlande et Vietnam). Il a été constaté une motivation importante des participants et une participation active favorisant les échanges d'expériences entre des pays dont les réseaux de surveillance sont à des niveaux d'efficacité différents. Une version légèrement modifiée de cette formation, suite aux recommandations notées dans ce rapport, sera reconduite à Beijing en septembre 2005 pour 12 autres pays (Afghanistan, Bangladesh, Bhutan, République de Chine, Inde, République Démocratique de Corée; République de Corée, Maldives, Mongolie, Népal, Pakistan, Sri lanka). Les conclusions de ces deux ateliers serviront à mettre en évidence les points faibles des différents systèmes de surveillance et à élaborer des plans de formations spécifiques répondant aux besoins de chaque pays. (Résumé d'auteur

Surveillance model for Avian Influenza in 4 pilot provinces in Vietnam, October - December 2006, Hanoi, Vietnam. Final technical report OSRO/RAS/602/JPN

Dans le cadre d'un projet financé par le Gouvernement Japonais et mis en oeuvre par la FAO, le CIRAD est intervenu pour effectuer une mission d'expertise relative à la surveillance de la grippe aviaire hautement pathogène. Cette mission avait pour objectif de proposer des activités permettant de renforcer le niveau de surveillance actuel de la maladie dans les 4 provinces pilotes du projet. Il a été demandé au consultant de faire une revue des systèmes existants et de proposer un modèle de surveillance peu coûteux qui après avoir été testé à une petite échelle, pourrait être proposé au Gouvernement pour extension éventuelle. Sur la base d'une revue documentaire et de mission de terrain, une analyse du système de surveillance actuelle a pu être réalisée. Une approche en 3 étapes a été ensuite proposée: - Renforcer le système de surveillance passive en introduisant notamment une définition de cas suspect plus sensible devant ainsi limiter la sous déclaration et tenter de lever certaines contraintes techniques et politique à la notification des cas. - Renforcer les capacités en terme d'investigation des foyers et proposer un outil d'aide à la décision simple qui permettrait aux vétérinaires de terrain de juger du niveau de risque face à un cas suspect de grippe et de proposer des actions adéquates aux responsables politiques. - Introduire un programme de surveillance active ayant pour but de palier les insuffisances du système de déclaration passif. Ce programme comprend une composante visant à la certification des élevages semi-commerciaux vaccinés et une seconde composante qui introduit la notion de surveillance participative dans des villages sentinelles sélectionnés selon le risque d'introduction et de diffusion de la grippe. (Résumé d'auteur

FAO Training Workshop on "Epidemiology, surveillance, outbreaks investigation and training engineering in epidemiological field", U Choice Hotel, Lunming - China, 29th june-9th july 2009 : Mission report

Cet atelier a été organisé par la FAO en collaboration avec le CIRAD et les services vétérinaires chinois. La formation a été divisée en deux parties distinctes: la première avait pour objectif de renforcer les capacités des agents des services provinciaux en matière d'épidémiologie des maladies animales et plu

O.D.D.: a promising but incomplete formalism for individual-based model specification

In this paper we introduce the ODD protocol, proposed in ecology for easing the communication and replication of Individual Based Models (IBM). First, we use it to describe a realistic model in epidemiology, which deals with the local determinants of the propagation of the H5N1 virus. From this description we first point out the advantages of ODD. Then we focus on its weaknesses, the major ones being its ambiguity and its inability to attain replication. Finally, we propose several improvements for this protocol in terms of re-organization, better specifications (adapted from existing software engineering methodologies) and the addition of a section dedicated to experimentations. (Résumé d'auteur

Systèmes de surveillance formels et informels : comment construire des ponts ?

Dans le contexte de la surveillance de la grippe aviaire au Vietnam, des interviews ont été conduits auprès d'éleveurs de volailles et d'acteurs locaux de la santé animale dans 2 communes du Delta du Fleuve Rouge afin d'identifier la circulation d'information sanitaire concernant les volailles (contenu de l'information ; mode, rayon et rapidité de circulation ; acteurs impliqués ; actions déclenchées par les informations reçues ; incitations économiques et sociales à la diffusion ou à la rétention d'information,). Les principaux résultats montrent que (1) des réseaux de surveillance " informels " actifs existent, (2) les niveaux d'alerte sont variables et que les mesures appliquées par les éleveurs sont diverses et souvent éloignées des recommandations officielles, et que (3) le vétérinaire de commune constitue une articulation entre les systèmes informel et formel. (Résumé d'auteur

Contraintes hygiéniques et sanitaires de la filière lait dans le district de Mbarara en Ouganda. Etude et propositions d'actions pour la maîtrise de la qualité du lait

Ce travail, sur les contraintes hygiéniques et sanitaires de la production laitière, a été réalisé dans le cadre d'un projet plus vaste d'étude de la production laitière dans le district de Mbarara en Ouganda, région qui supporte l'essentiel de la production nationale. Trois axes d'études ont été choisis. Tout d'abord une étude des contraintes hygiéniques et technologiques de la production laitière qui a permis de cerner, par une approche essentiellement qualitative, le niveau de connaissance moyen des éleveurs en matière d'hygiène de la traite et de gestion des mammites. Une partie des observations ont également porté sur l'aval de la filière. Le deuxième axe de travail fut la réalisation d'une pré-enquête de prévalence, dans la zone, concernant deux zoonoses transmissibles par le lait, la tuberculose et la brucellose. Les résultats montrent que la tuberculose est implantée dans la région de façon assez uniforme et avec un taux de prévalence supérieur à 10 %, alors que la brucellose semble atteindre les troupeaux de manière plus irrégulière. Pour la brucellose, un effet pratique d'élevage a pu être mis en évidence. Notre dernier axe d'étude est composé de deux éléments : la restitution des informations collectées, accompagnées de conseils visant à limiter la détérioration de la qualité du lait, et des propositions pour la mise en place d'un réseau local de contrôle de cette qualité. Ainsi, la récolte des résultats des deux études précédentes a servi de base à l'élaboration d'un guide, à destination des éleveurs, exposant les étapes à suivre et les gestes à éviter pour garantir d'une traite hygiénique et d'une non détérioration du lait. Un chapitre du guide traite également des mammites. La diffusion du guide devait être la plus large possible. Un autre type de restitution n'a concerné cette fois que les éleveurs ayant participé à l'étude de prévalence et traitait des conditions de transmission dans le troupeau, mais aussi à l'Homme de la tuberculose et de la brucellose. Enfin, à la suite de diverses rencontres et échanges avec différents acteurs ougandais, deux propositions de coopération ont pu être élaborées. L'une encadre la création d'un laboratoire de contrôle de la qualité du lait et l'autre vise à poursuivre l'étude de prévalence de la tuberculose et de la brucellose. (Résumé d'auteur