Comment produire un inoculum de Fusarium graminearum en grande quantité pour le criblage de nouvelles sources de résistance à la fusariose de l’épi au champ ?

La fusariose de l’épi ou FHB est une maladie d’origine fongique qui affecte le rendement et la qualité sanitaire des céréales. Elle est causée par un complexe d’espèces, appartenant principalement au genre Fusarium, l’agent principal étant Fusarium graminearum. À ce jour, on ne connait pas de résistance totale à la maladie. Les méthodes de lutte les plus efficaces associent donc variétés partiellement résistantes, traitements antifongiques et pratiques culturales. Ces méthodes s’avèrent toutefois incapables de contrôler la maladie en cas de fortes pressions parasitaires. Il est donc indispensable d’identifier de nouvelles sources de résistance plus efficaces et plus durables en passant par le criblage de collections et panels de variétés. Cela repose sur notre capacité à mettre en place des essais « maladie » de grande ampleur au champ ou en tunnel, et donc de disposer d’inoculum infectieux de Fusarium graminearum en grande quantité. Cet article décrit une méthodologie de production de macroconidies de Fusarium graminearum, permettant d’obtenir de façon régulière et pour différentes souches de F. graminearum, plus de 20 L d’inoculum à une concentration de 105 spores / mL par semaine. Développée à partir d’un protocole utilisé en routine au laboratoire pour de petites productions de spores d’espèces de Fusarium diverses (F. graminearum, F. poae, F. culmorum, F. tricinctum), elle est potentiellement applicable à d’autres espèces

Does in vitro selection of biocontrol agents guarantee success in planta? A study case of wheat protection against Fusarium seedling blight by soil bacteria

International audienceBiological control is a great hope for reducing the overutilization of pesticides in agricultural soils. It often involves microorganisms or molecules produced by microorganisms that will be able to interact with either a plant or pathogens of this plant to reduce the growth of the pathogen and limit its negative impact on the host plant. When new biocontrol products are developed, strains were mostly selected based on their ability to inhibit a pathogen of interest under in vitro conditions via antagonistic effects. Strains with no in vitro effect are often discarded and not tested in planta. But is the in vitro selection of bacterial agents according to their antagonism activities towards a plant pathogen the best way to get effective biocontrol products? To answer this question, we used wheat and the fungal pathogen Fusarium graminearum as a study pathosystem model. A library of 205 soil bacteria was screened in 2 types of in vitro growth inhibition tests against F. graminearum, and in an in planta experiment. We find strains which do not have inhibition phenotypes in vitro but good efficacy in planta. Interestingly, some strains belong to species (Microbacterium, Arthrobacter, Variovorax) that are not known in the literature for their ability to protect plants against fungal pathogens. Thus, developing a biocontrol product against F. graminearum must be preferentially based on the direct screening of strains for their protective activity on wheat plants against fungal diseases, rather than on their in vitro antagonistic effects on fungal growth