Construction of a genetic database to characterize the argentine soybean germplasm

Argentina es actualmente el primer exportador mundial de aceites y harinas de soja y el tercer productor mundial de semillas de soja. El objetivo de este trabajo fue desarrollar un banco de datos genéticos basado en marcadores moleculares de SSR (Repeticiones de Secuencia Simple, o Microsatélites) y AFLP (polimorfismos en el largo de los fragmentos amplificados) para caracterizar el germoplasma argentino de soja, facilitar la identificación de variedades y asistir al mejoramiento genético. Se estudiaron 51 loci SSR y 15 combinaciones de cebadores AFLP en los 86 cultivares de soja más utilizados en Argentina. Los SSR revelaron en promedio 5 alelos por locus, con una diversidad génica media de 0,523. Los AFLP detectaron en promedio 17 bandas polimórficas por combinación de oligonucleótidos, con una diversidad génica media de 0,1924. Los 86 cultivares estudiados mostraron coeficientes de similitud genética medios de 0,292 y 0,921 para SSR y AFLP, respectivamente. La base de datos de SSR se validó en forma exitosa a través de la identificación de muestras incógnitas remitidas al laboratorio. Además, se seleccionó un subconjunto de 20 marcadores SSR altamente informativos que permite discriminar cualquier accesión del banco de manera simple y eficiente, y que pueden ser utilizados en estudios rápidos de identificación o diferenciación de nuevos cultivares. Los marcadores AFLP produjeron dendrogramas basados en la distancia genética donde los materiales agruparon de acuerdo al obtentor. Estos resultados sugieren que los marcadores AFLP reflejan fielmente las relaciones de parentesco entre las variedades, resultando apropiados para seleccionar materiales genéticamente divergentes.Argentina is currently the leading country in terms of soybean oil and flour exports, and ranks third in soybean seed production. The aim of this work was to develop a genetic database based on SSR (Simple Sequence Repeats, or Microsatellites) and AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphisms) markers, in order to characterize the argentine soybean germplasm, allow cultivar identification and provide assistance to breeding. Fifty-one SSR loci and 15 AFLP primer combinations were analyzed on the 86 soybean cultivars most used in Argentina. The SSR markers revealed an average of 5 alleles per locus and a genic diversity of 0.523. The AFLP markers showed an average of 17 polymorphic bands per primer combination and a genic diversity of 0.1924. The 86 cultivars under analysis showed coefficients of mean genetic similarities of 0.292 and 0.921 for SSR and AFLP, respectively. The SSR database was successfully validated for the identification of unknown samples. A subset of 20 highlyinformative SSR markers was selected to achieve an effective discrimination of any databank accession by means of a simple and efficient procedure, in order to be used for rapid identification analysis and differentiation of new cultivars. The AFLP markers produced dendrograms based on genetic distance in which the plant materials grouped according to the identity of the breeder. These results suggest that AFLP markers accurately reflect the parentage relationship among cultivars, and are appropriate to the selection of genetically divergent materials.Fil: Olsina, Cesar. Bolsa de Comercio de Rosario; ArgentinaFil: Cairo, Carlos Alberto. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Pessino, Silvina Claudia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentin

Construction of a genetic database to characterize the argentine soybean germplasm

Argentina es actualmente el primer exportador mundial de aceites y harinas de soja y el tercer productor mundial de semillas de soja. El objetivo de este trabajo fue desarrollar un banco de datos genéticos basado en marcadores moleculares de SSR (Repeticiones de Secuencia Simple, o Microsatélites) y AFLP (polimorfismos en el largo de los fragmentos amplificados) para caracterizar el germoplasma argentino de soja, facilitar la identificación de variedades y asistir al mejoramiento genético. Se estudiaron 51 loci SSR y 15 combinaciones de cebadores AFLP en los 86 cultivares de soja más utilizados en Argentina. Los SSR revelaron en promedio 5 alelos por locus, con una diversidad génica media de 0,523. Los AFLP detectaron en promedio 17 bandas polimórficas por combinación de oligonucleótidos, con una diversidad génica media de 0,1924. Los 86 cultivares estudiados mostraron coeficientes de similitud genética medios de 0,292 y 0,921 para SSR y AFLP, respectivamente. La base de datos de SSR se validó en forma exitosa a través de la identificación de muestras incógnitas remitidas al laboratorio. Además, se seleccionó un subconjunto de 20 marcadores SSR altamente informativos que permite discriminar cualquier accesión del banco de manera simple y eficiente, y que pueden ser utilizados en estudios rápidos de identificación o diferenciación de nuevos cultivares. Los marcadores AFLP produjeron dendrogramas basados en la distancia genética donde los materiales agruparon de acuerdo al obtentor. Estos resultados sugieren que los marcadores AFLP reflejan fielmente las relaciones de parentesco entre las variedades, resultando apropiados para seleccionar materiales genéticamente divergentes.Argentina is currently the leading country in terms of soybean oil and flour exports, and ranks third in soybean seed production. The aim of this work was to develop a genetic database based on SSR (Simple Sequence Repeats, or Microsatellites) and AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphisms) markers, in order to characterize the argentine soybean germplasm, allow cultivar identification and provide assistance to breeding. Fifty-one SSR loci and 15 AFLP primer combinations were analyzed on the 86 soybean cultivars most used in Argentina. The SSR markers revealed an average of 5 alleles per locus and a genic diversity of 0.523. The AFLP markers showed an average of 17 polymorphic bands per primer combination and a genic diversity of 0.1924. The 86 cultivars under analysis showed coefficients of mean genetic similarities of 0.292 and 0.921 for SSR and AFLP, respectively. The SSR database was successfully validated for the identification of unknown samples. A subset of 20 highlyinformative SSR markers was selected to achieve an effective discrimination of any databank accession by means of a simple and efficient procedure, in order to be used for rapid identification analysis and differentiation of new cultivars. The AFLP markers produced dendrograms based on genetic distance in which the plant materials grouped according to the identity of the breeder. These results suggest that AFLP markers accurately reflect the parentage relationship among cultivars, and are appropriate to the selection of genetically divergent materials.Fil: Olsina, Cesar. Bolsa de Comercio de Rosario; ArgentinaFil: Cairo, Carlos Alberto. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Pessino, Silvina Claudia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentin

Genetic characterization of Paspalum notatum accessions by AFLP markers

Paspalum notatum Flügge is a warm-season forage grass with sexual diploid and apomictic tetraploid races. Genetic improvement was achieved in out-breeding diploids. The acquisition of artificial sexual tetraploids has raised the possibility of performing crosses and plant improvement at the tetraploid level. The objective of our study was to obtain a genetic and cytoembryological characterization of a germplasm collection of P. notatum, including 31 accessions from seven countries of America and 11 experimentally obtained genotypes. Morphology of mature gametophytes was observed to assess the mode of reproduction of the accessions. A total of 1342 AFLP fragments were generated across the 42 genotypes and from two reference taxa: P. urvillei and P. procurrens. AFLP data were converted into a binary matrix and similarity relationships were established. The genetic distance among all the accessions showed a maximum value of 0.36. In addition, eleven AFLP fragments were observed exclusively in apomictic plants, which could be linked to genomic regions implicated in the control of aposporyFil: Espinoza, Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Daurelio, Lucas Damian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Pessino, Silvina Claudia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Valle, Estela Marta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; ArgentinaFil: Quarin, Camilo Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; Argentin

Development of a modified transformation platform for apomixis candidate genes research in Paspalum notatum (bahiagrass)

Abstract The aim of this work was to improve existing transformation protocols and to transform specific genotypes of Paspalum notatum (bahiagrass) for functional analyses of candidate genes involved in reproduction. Three different explants were assayed for in vitro plant regeneration: mature seeds, mature embryos, and shoot meristems. Plant regeneration was achieved with all explant types, but mature seeds produced the optimal rate (78.0%) and were easiest to manipulate. A method based on serial re-induction of calli from meristems of the regenerated lines was also developed, which could be useful in plant breeding strategies pursuing somaclonal variation. Transient transformation experiments were performed on calli obtained from mature seeds using a compressed helium gene gun. Transient transformation constructs included anthocyanin-synthesis genes cloned under the CAMV 35S promoter and an enhanced green fluorescent protein gene (egfp) driven by the rice actin1 (act1) promoter. Selection curves for ammonium glufosinate were developed in order to determine the optimal selective pressure for stable transformation (1.0 mg/L). Stable co-transformation experiments were carried out with two different constructs containing: (1) the reporter egfp gene cloned under the rice act1 promoter and (2) the selector bar gene driven by the ubiquitin promoter. A total of 27 (64.2%) transgenic plants out of 42 resistant plants analyzed were obtained. The presence of the transgenes in regenerated plants was confirmed by polymerase chain reaction and DNA gel blot analysis. Gene expression was demonstrated by eGFP fluorescence detection and in vivo assays for ammonium glufosinate tolerance. This platform is being used to generate transgenic plants of P. notatum to analyze the function of apomixis-associated candidate genes.Fil: Mancini, Micaela. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Laboratorio de Biología Molecular; ArgentinaFil: Woitovich Valetti, Nadia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Laboratorio de Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnológico Rosario; ArgentinaFil: Permingeat, Hugo Raúl. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Laboratorio de Biología Molecular; ArgentinaFil: Podio, Maricel. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Laboratorio de Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); ArgentinaFil: Siena, Lorena Adelina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Laboratorio de Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnológico Rosario; ArgentinaFil: Ortiz, Juan Pablo Amelio. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Laboratorio de Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); ArgentinaFil: Pessino, Silvina Claudia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Laboratorio de Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnológico Rosario; ArgentinaFil: Felitti, Silvina Andrea. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Laboratorio de Biología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Cientifico Tecnológico Rosario; Argentin

Characterization and expression analysis of Somatic Embryogenesis Receptor Kinase (SERK) genes in sexual and apomictic Paspalum notatum

The Somatic Embryogenesis Receptor Kinase (SERK) gene plays a fundamental role in somatic embryogenesis of angiosperms, and is associated with apomixis in Poa pratensis. The objective of this work was to isolate, characterize and analyze the expression patterns of SERK genes in apomictic and sexual genotypes of Paspalum notatum. A conserved 200-bp gene fragment was amplified from genomic DNA with heterologous primers, and used to initiate a chromosomal walking strategy for cloning the complete sequence. This procedure allowed the isolation of two members of the P. notatum SERK family; PnSERK1, which is similar to PpSERK1, and PnSERK2, which is similar to ZmSERK2 and AtSERK1. Phylogenetic analyses indicated that PnSERK1 and PnSERK2 represent paralogous sequences. Southern-blot hybridization indicated the presence of at least three copies of SERK genes in the species. qRT-PCR analyses revealed that PnSERK2 was expressed at significantly higher levels than PnSERK1 in roots, leaves, reproductive tissues and embryogenic calli.Moreover, in situ hybridization experiments revealed that PnSERK2 displayed a spatially and chronologically altered expression pattern in reproductive organs of the apomictic genotype with respect to the sexual one. PnSERK2 is expressed in nucellar cells of the apomictic genotype at meiosis, but only in the megaspore mother cell in the sexual genotype. Therefore, apomixis onset in P. notatum seems to be correlated with the expression of PnSERK2 in nucellar tissue.Fil: Podio, Maricel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina; Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Cs.agrarias. Laboratorio de Biologia Molecular; Argentina;Fil: Felitti, Silvina Andrea. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Cs.agrarias. Laboratorio de Biologia Molecular; Argentina;Fil: Siena, Lorena Adeli. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Cs.agrarias. Laboratorio de Biologia Molecular; Argentina;Fil: Delgado Benarroch, Luciana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina; Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina;Fil: Mancini, Micaela. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Cs.agrarias. Laboratorio de Biologia Molecular; Argentina;Fil: Seijo, Jose Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina;Fil: Gonzalez, Ana María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina;Fil: Pessino, Silvina Claudia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Cs.agrarias. Laboratorio de Biologia Molecular; Argentina;Fil: Ortiz, Juan Pablo Amelio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina; Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina; Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Cs.agrarias. Laboratorio de Biologia Molecular; Argentina

Temporal and spatial expression of genes involved in DNA methylation during reproductive development of sexual and apomictic Eragrostis curvula

Recent reports in model plant species have highlighted a role for DNA methylation pathways in the regulation of the somatic-to-reproductive transition in the ovule, suggesting that apomixis (asexual reproduction through seeds) likely relies on RdDM downregulation. Our aim was therefore to explore this hypothesis by characterizing genes involved in DNA methylation in the apomictic grass Eragrostis curvula. We explored floral transcriptomes to identify homologs of three candidate genes, for which mutations in Arabidopsis and maize mimic apomixis (AtAGO9/ZmAGO104, AtCMT3/ZmDMT102/ZmDMT105, and AtDDM1/ZmCHR106), and compared both their spatial and temporal expression patterns during reproduction in sexual and apomictic genotypes. Quantitative expression analyses revealed contrasting expression patterns for the three genes in apomictic vs sexual plants. In situ hybridization corroborated these results for two candidates, EcAGO104 and EcDMT102, and revealed an unexpected ectopic pattern for the AGO gene during germ line differentiation in apomicts. Although our data partially support previous results obtained in sexual plant models, they suggest that rather than an RdDM breakdown in the ovule, altered localization of AtAGO9/ZmAGO104 expression is required for achieving diplospory in E. curvula. The differences in the RdDM machinery acquired during plant evolution might have promoted the emergence of the numerous apomictic paths observed in plants.Fil: Selva, Juan Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Biología, Bioquímica y Farmacia; ArgentinaFil: Siena, Lorena Adelina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; ArgentinaFil: Rodrigo, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; ArgentinaFil: Garbus, Ingrid. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias de la Salud; ArgentinaFil: Zappacosta, Diego Carlos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; ArgentinaFil: Romero, José Rodolfo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; ArgentinaFil: Ortiz, Juan Pablo Amelio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; ArgentinaFil: Pessino, Silvina Claudia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; ArgentinaFil: Leblanc, O.. Universidad de Montpellier; AlemaniaFil: Echenique, Carmen Viviana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentin

Construcción de un mapa genético preliminar de yerba mate (Ilex paraguariensis): construction of a preliminary genetic linkage map of yerba mate (Ilex paraguariensis)

Las hojas de la yerba mate se utilizan para la preparación del mate, una infusión de profunda raigambre histórica, social y cultural en sudamérica. Su cultivo reviste importancia estratégica para varios países de la región, especialmente Argentina, Brasil y Paraguay. Nuestro objetivo fue establecer una población segregante y construir un mapa de ligamiento genético preliminar de esta especie para facilitar la futura identificación de loci asociados con caracteres de interés agronómico. Dos genotipos genéticamente divergentes con comportamiento contrastante respecto a la tolerancia a sequía se seleccionaron como progenitores femenino y masculino. Mediante cruzamientos controlados y rescate de embriones, se estableció una población F tipo 1 ?pseudo-test cross? de 700 individuos, con potencial para extenderse hasta 1900. Un subgrupo de 117 plantas fue empleado para construir un mapa genético marco. Se ensayaron 5 combinaciones de cebadores de AFLP y 16 cebadores de RAPDs, para generar 119 marcadores informativos, de los cuales el 68,9% se ajustó a los valores de segregación mendeliana esperados. El análisis de ligamiento se realizó con el programa JoinMap 3.0. Los marcadores originados en cada progenitor se analizaron independientemente para generar un mapa femenino formado por 11 grupos de ligamiento y otro masculino con 16 grupos. Las distancias genéticas cubiertas por los mismos fueron de 223 cM y 678 cM, respectivamente. Este trabajo permitió establecer una progenie de mapeo segregante para yerba mate y construir un mapa genético preliminar que podrá usarse como base para la futura identificación de marcadores ligados a genes de interés agronómico.The “yerba mate” leaves are used to make an infusion named “mate tea”, which is deeply rooted in the historical, social and cultural tradition of South America. Its sustainable use is of strategic significance to several countries of this region, particularly Argentina, Brazil and Paraguay. Our objective was to establish a segregating population and build a framework genetic map, in order to contribute to the future identification of loci associated with desirable traits. Two genetically divergent genotypes with contrasting drought tolerance capacity were selected as female and male parents. A “pseudo-test cross” F1 population of 700 individuals, with potential to be extended to 1900 individuals, was produced after controlled crossing followed by embryo rescue. A subset of 117 plants was used to produce a framework genetic map. Five AFLP primer combinations and 16 RAPD primers generated 119 informative markers, out of which 68.9% showed the expected Mendelian segregation values. Linkage analyses were carried out by using Joinmap 3.0. Markers originated from each progenitor were independently evaluated to generate a female map including 11 linkage groups and a male one with 16 linkage groups. Total genetic distances covered by the female and male maps were 223 cM and 678 cM, respectively. This work allowed the establishment of a yerba mate segregating population and the construction of a preliminary genetic map, which will be used as a framework for the future identification of markers linked to genes of interest.Fil: Stein, Juliana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Luna, Claudia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); ArgentinaFil: Espasandin, Fabiana Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); ArgentinaFil: Sartor, Maria Esperanza. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); ArgentinaFil: Espinoza, Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); ArgentinaFil: Ortiz, Juan Pablo Amelio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Sansberro, Pedro Alfonso. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste (i); ArgentinaFil: Pessino, Silvina Claudia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentin

Increased apomixis expression concurrent with genetic and epigenetic variation in a newly synthesized Eragrostis curvula polyploid

Eragrostis curvula includes biotypes reproducing through obligate and facultative apomixis or, rarely, full sexuality. We previously generated a ‘‘tetraploid-dihaploid-tetraploid’’ series of plants consisting of a tetraploid apomictic plant (T), a sexual dihaploid plant (D) and a tetraploid artificial colchiploid (C). Initially, plant C was nearly 100% sexual. However, its capacity to form non-reduced embryo sacs dramatically increased over a four year period (2003–2007) to reach levels of 85–90%. Here, we confirmed high rates of apomixis in plant C, and used AFLPs and MSAPs to characterize the genetic and epigenetic variation observed in this plant in 2007 as compared to 2003. Of the polymorphic sequences, some had no coding potential whereas others were homologous to retrotransposons and/or protein-coding-like sequences. Our results suggest that in this particular plant system increased apomixis expression is concurrent with genetic and epigenetic modifications, possibly involving transposable elements.Fil: Zappacosta, Diego Carlos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida(i); Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; ArgentinaFil: Ochogavía, Ana Claudia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Rodrigo, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida(i); ArgentinaFil: Romero, José Rodolfo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida(i); ArgentinaFil: Meier, Mauro Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida(i); ArgentinaFil: Garbus, Ingrid. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida(i); ArgentinaFil: Pessino, Silvina Claudia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; ArgentinaFil: Echenique, Carmen Viviana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida(i); Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentin

Construction of a preliminary genetic linkage map of yerba mate (Ilex paraguariensis)

Las hojas de la yerba mate se utilizan para la preparación del mate, una infusión de profunda raigambre histórica, social y cultural en Sudamérica. Su cultivo reviste importancia estratégica para varios países de la región, especialmente Argentina, Brasil y Paraguay. Nuestro objetivo fue establecer una población segregante y construir un mapa de ligamiento genético preliminar de esta especie para facilitar la futura identificación de loci asociados con caracteres de interés agronómico. Dos genotipos genéticamente divergentes con comportamiento contrastante respecto a la tolerancia a sequía se seleccionaron como progenitores femenino y masculino. Mediante cruzamientos controlados y rescate de embriones, se estableció una población F tipo 1 “pseudo-test cross” de 700 individuos, con potencial para extenderse hasta 1900. Un subgrupo de 117 plantas fue empleado para construir un mapa genético marco. Se ensayaron 5 combinaciones de cebadores de AFLP y 16 cebadores de RAPDs, para generar 119 marcadores informativos, de los cuales el 68,9% se ajustó a los valores de segregación mendeliana esperados. El análisis de ligamiento se realizó con el programa JoinMap 3.0. Los marcadores originados en cada progenitor se analizaron independientemente para generar un mapa femenino formado por 11 grupos de ligamiento y otro masculino con 16 grupos. Las distancias genéticas cubiertas por los mismos fueron de 223 cM y 678 cM, respectivamente. Este trabajo permitió establecer una progenie de mapeo segregante para yerba mate y construir un mapa genético preliminar que podrá usarse como base para la futura identificación de marcadores ligados a genes de interés agronómico.Fil: Stein, Juliana. Universidad Nacional de Rosario; ArgentinaFil: Luna, Claudia Verónica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Espasandin, Fabiana Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Sartor, Maria Esperanza. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Espinoza, Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Ortiz, Juan Pablo Amelio. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Sansberro, Pedro Alfonso. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Pessino, Silvina Claudia. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentin

Structure, target-specificity and expression of PN_LNC_N13, a long non-coding RNA differentially expressed in apomictic and sexual Paspalum notatum

Key message: ncRNA PN_LNC_N13 shows contrasting expression in reproductive organs of sexual and apomictic Paspalum notatum genotypes. Abstract: Apomictic plants set genetically maternal seeds whose embryos derive by parthenogenesis from unreduced egg cells, giving rise to clonal offspring. Several Paspalum notatum apomixis related genes were identified in prior work by comparative transcriptome analyses. Here, one of these candidates (namely N13) was characterized. N13 belongs to a Paspalum gene family including 30–60 members, of which at least eight are expressed at moderate levels in florets. The sequences of these genes show no functional ORFs, but include segments of different protein coding genes. Particularly, N13 shows partial identity to maize gene BT068773 (RESPONSE REGULATOR 6). Secondary structure predictions as well as mature miRNA and target cleavage detection suggested that N13 is not a miRNA precursor. Moreover, N13 family members produce abundant 24-nucleotide small RNAs along extensive parts of their sequences. Surveys in the GREENC and CANTATA databases indicated similarity with plant long non-coding RNAs (lncRNAs) involved in splicing regulation; consequently, N13 was renamed as PN_LNC_N13. The Paspalum BT068773 predicted ortholog (N13TAR) originates floral transcript variants shorter than the canonical maize isoform and with possible structural differences between the apomictic and sexual types. PN_LNC_N13 is expressed only in apomictic plants and displays quantitative representation variation across reproductive developmental stages. However, PN_LNC_N13-like homologs and/or its derived sRNAs showed overall a higher representation in ovules of sexual plants at late premeiosis. Our results suggest the existence of a whole family of N13-like lncRNAs possibly involved in splicing regulation, with some members characterized by differential activity across reproductive types.Fil: Ochogavía, Ana Claudia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; ArgentinaFil: Galla, Giulio. Università di Padova; ItaliaFil: Seijo, José Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: González, Ana María. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Botánica del Nordeste. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Botánica del Nordeste; ArgentinaFil: Bellucci, Michele. Consiglio Nazionale delle Ricerche; ItaliaFil: Pupilli, Fulvio. Consiglio Nazionale delle Ricerche; ItaliaFil: Barcaccia, Gianni. Università di Padova; ItaliaFil: Albertini, Emidio. Università di Perugia; ItaliaFil: Pessino, Silvina Claudia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario; Argentin