High relative expression of two genes of a melon near-isogenic line versus its parental during ripening

[SPA] Con el fin de comparar la expresión génica de una línea casi isogénica (NIL) SC10-2 de melón y su Piel de Sapo (PS) parental durante la maduración y para comprender los mecanismos de diferenciación, se realizó una secuenciación de transcriptoma. Los genes CmTCP15 (Factor de actividad de transcripción) y CmGDSL (actividad de la esterasa y la lipasa) tenían una alta expresión diferencial en el NIL SC10-2 en comparación con el PS debido a la introgresión en LG X. En consecuencia, algunos atributos de calidad de fruto como el aroma, dulzura y, probablemente otros pueden estar afectados por tales genes. [ENG] In order to compare the gene expression of a melon Near-isogenic Line (NIL) SC10-2 and its parental Piel de Sapo (PS) during ripening and to understand the differentiate mechanisms, a transcriptome sequencing was performed. CmTCP15 (Transcription factor activity) and CmGDSL (Esterase and lipase activity) genes were high differentially expressed in the NIL SC10-2 compared with PS due to the introgression in LG X. Consequently, some fruit quality traits such as aroma, sweetness and probably others can be affected by such genes.Financial support: Fundación Séneca de la Región de Murcia (11784/PI/09), MINECO & UE-FEDER funds (AGL2010-20858). Thanks for the technical assistance to P. Varó and his team in CIFEA-Torre Pacheco (Consejería de Agricultura, Región de Murcia), N. Dos-Santos, E. Cuadros, M. García-Gutiérrez, A. Hakmaoui (UPCT), M.J. Roca (SAIT-UPCT), and IRTA-CRAG for the seeds of the NIL

Lower relative differential expression of two genes is associated with delayed ripening in melon

[SPA] Con el fin de comparar la expresión génica de un melón cerca de la línea isogénica (NIL) SC10-2 y su parental Piel de Sapo (PS) durante la maduración y para comprender los mecanismos de diferenciación, se realizó una secuenciación transcriptoma. Dos genes de CmGGP (GDP-L-galactosa fosforilasa 1) y CmRAP2-11 (factor de transcripción sensible al etileno RAP2-11) mostraron menor expresión relativa en la NIL SC10 -2 versus PS debido a la introgresión en LG X. Sin embargo, no existieron diferencias en expresión de CmAP2-like X1 (factor de transcripción sensible al etileno, similar a AP2 TOE3 isoforma X1). En consecuencia, la expresión de genes que mapearon en el grupo de ligamiento X como un factor de transcripción de respuesta a etileno o del metabolismo del ácido ascórbico estuvieron probablemente asociados con el retraso de maduración. [ENG] The expression of selected genes during ripening was studied considering a melon Near-isogenic Line (NIL) SC10-2 and its parental “Piel de Sapo” (PS). The expression of CmGGP (GDP-L-galactose phosphorylase 1), CmAP2-like X1 (AP2-like ethylene-responsive transcription factor TOE3 isoform X1) and CmRAP2-11 (ethylene-responsive transcription factor RAP2-11) were differentially expressed in the NIL SC10-2 compared with PS. Consequently, expression of genes that mapped in LG X such as one ethylene response transcription factors or ascorbic acid metabolism gene were probably associated with delayed ripening.Financial support: Fundación Séneca de la Región de Murcia (11784/PI/09), MINECO & UE-FEDER funds (AGL2010-20858). Thanks for the technical assistance to P. Varó and his team in CIFEA-Torre Pacheco (Consejería de Agricultura, Región de Murcia) for crop management and IRTA-CRAG for the seeds of the NIL