Filogenia molecular e genética da conservação de Philcoxia P.Taylor & V.C.Souza (Plantaginaceae)

Orientador: André Olmos SimõesDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: Philcoxia é um gênero recentemente descrito, composto por quatro espécies reconhecidas e uma nova espécie, endêmicas das formações arenosas do Cerrado e Caatinga. Por conta de sua raridade e da vulnerabilidade de seu habitat, o gênero pode ser considerado criticamente ameaçado de extinção. Recentes evidências filogenéticas sustentam a inclusão do gênero na tribo Gratioleae (Plantaginaceae). Entretanto, as relações de Philcoxia dentro da tribo continuam controversas desde sua descrição. Apresentamos, aqui, estudos filogenéticos de Gratioleae, focados no teste do monofiletismo de Philcoxia, suas relações interespecíficas e seu posicionamento. As análises filogenéticas foram feitas pelos métodos de Máxima Parcimônia e inferência Bayesiana. Sequências dos íntrons rpl16, rps16 e trnL e do espaçador trnL-trnF, todas do DNA cloroplastidial, foram analisadas, incluindo 31 amostras, entre as quais quatro espécies de Philcoxia, 23 outras espécies de Gratioleae e mais quatro táxons (grupo externo) de Plantaginaceae. As espécies de Philcoxia formam um clado fortemente sustentado, irmão de Stemodia stellata. Philcoxia minensis é mais próxima de P. rhizomatosa e P. bahiensis é mais próxima de P. tuberosa. O clado que inlcui Philcoxia e S. stellata é relacionado aos clados formados por Achetaria, Scoparia e alguns representantes de Stemodia. Realizamos, também, o desenvolvimento e caracterização de marcadores microssatélites inéditos para estudos em genética de populações voltados para conservação de P. minensis. Pares de iniciadores foram desenhados para 27 locos de microssatélites e testados em 30 indivíduos de uma população de P. minensis e em quatro indivíduos de P. bahiensis. Dezessete locos foram amplificados com sucesso, doze dos quais se mostraram polimórficos. Os 12 marcadores polimórficos serão usados em futuros estudos relacionados ao sistema de reprodução e à diversidade genética de P. minensis e são potenciais ferramentas para esses estudos com P. bahiensis. Além disso, a nova espécie Philcoxia rhizomatosa é descrita e ilustrada. Ela apresenta folhas maiores que outras espécies do gênero e também possui um rizoma bastante conspícuo e ramificado. Esta nova espécie é aparentemente endêmica de um areal em Botumirim, Minas Gerais, em vegetação de transição entre Cerrado e Caatinga. Testes de carnivoria positivos sugerem que P. rhizomatosa é uma planta carnívoraAbstract: Philcoxia is a recently described genus, composed of four currently recognized species and one additional new species, endemic to the Brazilian sandy formations of the Cerrado and Caatinga. Due to its rarity and the vulnerability of the formation where it occurs, this genus could be treated as critically endangered. Recent evidences from molecular phylogenetics support the inclusion of the genus within the tribe Gratioleae (Plantaginaceae). The affinities of Philcoxia within the tribe, however, have been controversial since it was first described. Here, we present a phylogenetic analysis of Gratioleae, focusing on the test of the monophyly of Philcoxia, its interspecific relationships and its placement. Phylogenetic analyses were conducted using Maximum Parsimony and Bayesian approaches. Sequence data from rpl16, rps16 and trnL introns and trnL-trnF intergenic spacer were analysed, including 31 samples representing four species of Philcoxia, 23 additional Gratioleae species and four outgroup taxa from Plantaginaceae. Philcoxia species form a strongly supported clade, sister of Stemodia stellata. Philcoxia minensis is closely related to P. rhizomatosa and P. bahiensis is closer to P. tuberosa. The clade Philcoxia plus S. stellata is related to clades formed by Achetaria, Scoparia and Stemodia representatives. We also developed and characterized new microsatellite markers as tools for further studies in population genetics aiming the conservation of P. minensis. Primer pairs were developed for 27 microsatellite loci and validated in 30 individuals of P. minensis from a natural population and tested in four idivividuals from a natural population of P. bahiensis. Seventeen loci successfully amplified, twelve of which were polymorphic. The 12 polymorphic markers are suitable for studies concerning mating system and genetic diversity of P. minensis and also may be usefull tools to study similar issues regarding its related species, P. bahiensis. In addition, the new species Philcoxia rhizomatosa is described and illustrated. It has bigger leaves than other species in the genus and presents a conspicuous and branched rhizome. This new taxa is possibly endemic to a sand patch in the transition vegetation between the Cerrado and the Caatinga in Botumirim, Minas Gerais, Brazil. Tests for carnivory were performed and showed activity of phosphatase, suggesting that P. rhizomatosa is a carnivorous plantMestradoBiologia VegetalMestre em Biologia Vegeta

Sistemática de Gratioleae (Plantaginaceae) : redefinindo "Stemodia" L.

Orientador: André Olmos SimõesTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: Nas últimas três décadas, as Angiospermas sofreram rearranjos drásticos em sua classificação em vários níveis hierárquicos devido à implementação de estudos filogenéticos baseados em dados moleculares na sistemática. Embora uma aparente estabilidade tenha sido alcançada nos níveis de Ordem e Família, as circunscrições genéricas ainda estão longe de serem completamente avaliadas a partir de uma perspectiva filogenética. Gratioleae é uma tribo predominantemente tropical das Plantaginaceae, apresentando alta diversidade morfológica e ecológica. "Stemodia sensu lato" é um dos gêneros mais diversificados e heterogêneos das Gratioleae (Plantaginaceae), sendo tradicionalmente definido pelo cálice com sépalas iguais a subiguais e quatro estames férteis com duas tecas, separadas por um conectivo 2-braquiado, em cada antera. O gênero apresenta distribuição pantropical e abrange ca. 60 espécies. Estudos filogenéticos recentes em Gratioleae indicam que "Stemodia", como atualmente circunscrito, é um gênero polifilético. Neste estudo, investigamos a filogenia de Gratioleae, com ênfase em "Stemodia s.l.", baseada em sequências de três regiões do cpDNA (introns rps16 e trnL e espaçador intergênico trnL-trnF) e um do nrDNA (espaçador ITS1); usamos tanto a parcimônia quanto a inferência bayesiana para reconstruir a filogenia. Testamos o monofiletismo do gênero e seu posicionamento na tribo e, com base nisso, propomos uma nova circunscrição e delimitação morfológica de um grupo monofilético denominado "Stemodia sensu stricto". Como aqui proposto, "Stemodia s.s." engloba 26 espécies e é caracterizado pelo hábito ereto, folhas claramente sésseis com base geralmente auriculada, flores bi-bracteoladas, não-ressupinadas e geralmente curto-pediceladas e concentradas no ápice dos ramos, além do cálice bem dividido em cinco sépalas iguais e do androceu composto por quatro estames férteis com duas tecas iguais e glabras, separadas pelo conectivo 2-braquiado. Além disso, propomos Lapaea como o novo gênero segregado de "Stemodia s.s." para acomodar as espécies do chamado grupo "S. stellata"; descrevemos e ilustramos uma nova espécie notável de flor vermelha, pertencente a este grupo; testamos o monofiletismo do novo gênero descrito e avaliamos suas relações interespecíficas; e apresentamos uma sinopse taxonômica das espécies reconhecidas no novo gênero, fornecendo uma chave de identificação, fotos e notas sobre sua morfologia, distribuição geográfica, habitat, ecologia e estado de conservaçãoAbstract: In the past three decades, the Angiosperms have undergone drastic rearrangements in their classification at various hierarchic levels due to the implementation of phylogenetic studies based on molecular. Although an apparent stability has been achieved at Ordinal and Familial levels, generic circumscriptions are still far from being completely assessed from a phylogenetic perspective. Gratioleae is a mainly tropical tribe of Plantaginaceae presenting high morphological and ecological diversity. "Stemodia sensu lato" is one of the most diverse and heterogeneous genera in Gratioleae, being traditionally defined by the calyx with equal to subequal sepals and four fertile stamens with two thecae, separated by a 2-brachiate connective, in each anther. It has pantropical distribution and encompasses ca. 60 species. Recent phylogenetic studies in Gratioleae indicate that "Stemodia", as traditionally circumscribed, is a polyphyletic genus. In this study, we investigate the phylogeny of Gratioleae with emphasis on "Stemodia s.l." based on sequences of three regions from cpDNA (rps16, and trnL introns and the trnL-trnF intergenic spacer) and one from nrDNA (ITS1 spacer); we used both parsimony and Bayesian inference to reconstruct the phylogeny. We tested the monophyly of the genus and its placement within the tribe and, based on that, proposed a new circumscription and morphological delimitation of a monophyletic group here called "Stemodia sensu stricto". As herein proposed, "Stemodia s.s." encompasses 26 species and is characterized by the erect habit, clearly sessile leaves with usually clasping base, bi-bracteolate, non-ressupinate and usually short-pedicellate flowers that are often concentrated at the apex of flowering branches, in addition to the calyx well-divided into five equal sepals and the androecium composed of four fertile stamens with two equal and glabrous thecae, separated by a 2-brachiate connective, in each anther. Furthermore, we propose Lapaea as new genus segregated from "Stemodia s.s." to accommodate species of the called "S. stellata" group; describe and illustrate a remarkable red-flowered new species, belonging to this group, based on morphological and micromorphological evidence; test the monophyly of the herein described new genus and assess its interspecific relationships; and present a synoptic revision of the species recognized in the new genus, providing an identification key, photos, and notes on their morphology, geographic distribution, habitat, ecology and conservation statusDoutoradoBiologia VegetalDoutor em Biologia Vegetal140345/2017-5CNP

Flora Of The Cangas Of The Serra Dos Carajás, Pará, Brazil: Linderniaceae

This is a taxonomic study of the species of Linderniaceae from the cangas of the Serra dos Carajás, state of Pará, Brazil. Three species of Lindernia were recorded: L. brachyphylla, L. crustacea and L. diffusa, the first being restricted to South America and the two others with pantropical distribution. Here we present detailed descriptions, illustrations, photographs and notes on morphology, distribution and phenology of these species.6751399140

Sistemática de Gratioleae (Plantaginaceae) : redefinindo "Stemodia" L.

Orientador: André Olmos SimõesTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de BiologiaResumo: Nas últimas três décadas, as Angiospermas sofreram rearranjos drásticos em sua classificação em vários níveis hierárquicos devido à implementação de estudos filogenéticos baseados em dados moleculares na sistemática. Embora uma aparente estabilidade tenha sido alcançada nos níveis de Ordem e Família, as circunscrições genéricas ainda estão longe de serem completamente avaliadas a partir de uma perspectiva filogenética. Gratioleae é uma tribo predominantemente tropical das Plantaginaceae, apresentando alta diversidade morfológica e ecológica. "Stemodia sensu lato" é um dos gêneros mais diversificados e heterogêneos das Gratioleae (Plantaginaceae), sendo tradicionalmente definido pelo cálice com sépalas iguais a subiguais e quatro estames férteis com duas tecas, separadas por um conectivo 2-braquiado, em cada antera. O gênero apresenta distribuição pantropical e abrange ca. 60 espécies. Estudos filogenéticos recentes em Gratioleae indicam que "Stemodia", como atualmente circunscrito, é um gênero polifilético. Neste estudo, investigamos a filogenia de Gratioleae, com ênfase em "Stemodia s.l.", baseada em sequências de três regiões do cpDNA (introns rps16 e trnL e espaçador intergênico trnL-trnF) e um do nrDNA (espaçador ITS1); usamos tanto a parcimônia quanto a inferência bayesiana para reconstruir a filogenia. Testamos o monofiletismo do gênero e seu posicionamento na tribo e, com base nisso, propomos uma nova circunscrição e delimitação morfológica de um grupo monofilético denominado "Stemodia sensu stricto". Como aqui proposto, "Stemodia s.s." engloba 26 espécies e é caracterizado pelo hábito ereto, folhas claramente sésseis com base geralmente auriculada, flores bi-bracteoladas, não-ressupinadas e geralmente curto-pediceladas e concentradas no ápice dos ramos, além do cálice bem dividido em cinco sépalas iguais e do androceu composto por quatro estames férteis com duas tecas iguais e glabras, separadas pelo conectivo 2-braquiado. Além disso, propomos Lapaea como o novo gênero segregado de "Stemodia s.s." para acomodar as espécies do chamado grupo "S. stellata"; descrevemos e ilustramos uma nova espécie notável de flor vermelha, pertencente a este grupo; testamos o monofiletismo do novo gênero descrito e avaliamos suas relações interespecíficas; e apresentamos uma sinopse taxonômica das espécies reconhecidas no novo gênero, fornecendo uma chave de identificação, fotos e notas sobre sua morfologia, distribuição geográfica, habitat, ecologia e estado de conservaçãoAbstract: In the past three decades, the Angiosperms have undergone drastic rearrangements in their classification at various hierarchic levels due to the implementation of phylogenetic studies based on molecular. Although an apparent stability has been achieved at Ordinal and Familial levels, generic circumscriptions are still far from being completely assessed from a phylogenetic perspective. Gratioleae is a mainly tropical tribe of Plantaginaceae presenting high morphological and ecological diversity. "Stemodia sensu lato" is one of the most diverse and heterogeneous genera in Gratioleae, being traditionally defined by the calyx with equal to subequal sepals and four fertile stamens with two thecae, separated by a 2-brachiate connective, in each anther. It has pantropical distribution and encompasses ca. 60 species. Recent phylogenetic studies in Gratioleae indicate that "Stemodia", as traditionally circumscribed, is a polyphyletic genus. In this study, we investigate the phylogeny of Gratioleae with emphasis on "Stemodia s.l." based on sequences of three regions from cpDNA (rps16, and trnL introns and the trnL-trnF intergenic spacer) and one from nrDNA (ITS1 spacer); we used both parsimony and Bayesian inference to reconstruct the phylogeny. We tested the monophyly of the genus and its placement within the tribe and, based on that, proposed a new circumscription and morphological delimitation of a monophyletic group here called "Stemodia sensu stricto". As herein proposed, "Stemodia s.s." encompasses 26 species and is characterized by the erect habit, clearly sessile leaves with usually clasping base, bi-bracteolate, non-ressupinate and usually short-pedicellate flowers that are often concentrated at the apex of flowering branches, in addition to the calyx well-divided into five equal sepals and the androecium composed of four fertile stamens with two equal and glabrous thecae, separated by a 2-brachiate connective, in each anther. Furthermore, we propose Lapaea as new genus segregated from "Stemodia s.s." to accommodate species of the called "S. stellata" group; describe and illustrate a remarkable red-flowered new species, belonging to this group, based on morphological and micromorphological evidence; test the monophyly of the herein described new genus and assess its interspecific relationships; and present a synoptic revision of the species recognized in the new genus, providing an identification key, photos, and notes on their morphology, geographic distribution, habitat, ecology and conservation statusDoutoradoBiologia VegetalDoutor em Biologia Vegetal140345/2017-5CNP

Flora of the cangas of Serra dos Carajás, Pará, Brazil: Plantaginaceae

Abstract This is a taxonomic study of the species of Plantaginaceae from the cangas of Serra dos Carajás, Pará, Brazil. We recorded five species, all members of the tribe Gratioleae: Bacopa monnierioides, B. myriophylloides, B. reflexa, Scoparia dulcis and Stemodia verticilata. All five species are widespread in Brazil, and B. myriophylloides is here cited for the first time for the State of Pará. We present detailed descriptions, illustrations, photographs and notes on morphology, distribution and phenology of these species

Flora of the cangas of the Serra dos Carajás, Pará, Brazil: Linderniaceae

Abstract This is a taxonomic study of the species of Linderniaceae from the cangas of the Serra dos Carajás, state of Pará, Brazil. Three species of Lindernia were recorded: L. brachyphylla, L. crustacea and L. diffusa, the first being restricted to South America and the two others with pantropical distribution. Here we present detailed descriptions, illustrations, photographs and notes on morphology, distribution and phenology of these species

Flora of the cangas of Serra dos Carajás, Pará, Brazil: Orobanchaceae

Abstract This is a taxonomic study of the representatives of Orobanchaceae from the cangas of Serra dos Carajás, Pará state, Brazil. We recorded Buchnera carajasensis and B. longifolia in Serra dos Carajás, but only the former occurs in areas of canga and will be treated in this work. Here we present a detailed description, photographs and notes on morphology, distribution and phenology of this species

Assessment of Matourea pratensis (Plantaginaceae: Gratioleae) reveals an older name for Achetaria

Matourea pratensis is a name published by Aublet in 1775 that has never been typified and whose identity has long been obscure. It was historically associated with Stemodia foliosa, as S. pratensis, a species with reported medical importance and wide distribution in the Neotropics. However, its morphology has also been interpreted as more similar to Achetaria, a genus widely distributed throughout the Neotropics and also with medicinal, ecological and economic value. After an extensive bibliographical survey, along with morphological study of type specimens of M. pratensis, S. foliosa, and Achetaria spp., we conclude that (1) S. foliosa and M. pratensis represent distinct taxa; and (2) M. pratensis is congeneric with Achetaria. As a result, we transfer the currently accepted species of Achetaria to Matourea, proposing eight new combinations (M. azurea, M. caparaoensis, M. crenata, M. erecta, M. latifolia, M. ocymoides, M. platychila, M. scutellarioides). Additionally, we designate lectotypes for M. pratensis, Tetraplacus platychilus f. longifolius, Otacanthus caparaoensis, O. fluminensis, and O. villosus, and a second-step lectotype for Beyrichia scutellarioides69613541360CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO - CNPQCOORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR - CAPES159924/2018-9Não te