Molecular docking study of Zingiber officinale Roscoe compounds as a mumps virus nucleoprotein inhibitor

Background: Mumps virus (MuV) can trigger severe infections, such as parotitis, epididymo-orchitis, and meningitis. The effectiveness of MuV vaccine administration has been proven, but current outbreaks warrant the development of antivirals against MuV. Zingiber officinale var. Roscoe or ginger is often used as an alternative remedy. Currently, there are no known in vitro or in vivo studies that investigate ginger as an MuV antiviral. Purpose: This study aims to evaluate the antiviral potency of the bioactive compounds in Zingiber officinale var. Roscoe against MuV. Methods: Antiviral activity screening was conducted by druglikeness analysis, antiviral probability, molecular docking, and molecular dynamic simulation. Results: As an antiviral, 6-shogaol from Zingiber officinale var. Roscoe has potency against MuV. It has a good binding affinity and can establish interactions with the binding domain of the target protein by forming hydrogen, Van der Waals, and alkyl bonds. Conclusion: The complex of 6-shogaol_NP was predicted to be volatile but stable for triggering inhibitory activity. However, these results must be proved by in vivo and in vitro approaches to strengthen the scientific evidence

Aktivitas Antikanker Ekstrak Alang-Alang (Imperata Cylindrica) Terhadap Sel T-47d Secara In-Vitro Dan In-Silico

kedua di dunia. Alang-alang (Imperata cylindrica) adalah tumbuhan yang memiliki kandungan antikanker yang dapat menekan pertumbuhan sel kanker pada sel kanker kolorektal sehingga penting dilakukan penelitian ini untuk menguji ekstrak alang-alang sebagai antikanker untuk kanker payudara. Tujuan dari penelitian ini adalah menguji efek pada toksisitas, apoptosis, dan siklus sel terhadap sel T-47D yang diberikan perlakuan menggunakan ekstrak alang-alang serta menganalisa interaksi antara protein MAPK8 dengan ligan Caffeic Acid yang terdapat pada ekstrak alang-alang. Uji sitotoksisitas dilakukan dengan reagen WST dan dibaca dengan ELISA Reader, uji apoptosis dengan reagen PI-Annexin V dan uji siklus sel dengan reagen PI lalu dianalisis dengan flowcytometer. Docking dilakukan antara protein MAPK8/JNK-1 dengan ligan Caffeic Acid dengan software Autodock 4.2 pada PyRx. Simulasi molecular dynamics dilakukan dengan software YASARA dengan pengaturan suhu 37oC, pH 7,4, dan waktu 20000 picosecond. Ekstrak air alang-alang memiliki IC50 sebesar 1782 μg/ml dan termasuk kedalam kategori tidak toksik. Ekstrak air alang-alang dapat menginduksi terjadinya apoptosis namun dalam jumlah kecil dan cell cycle arrest pada fase G0/G1 dan S. Ligan Caffeic Acid memiliki pengikatan yang berbeda dengan ligan kontrol Raddeanin A sehingga Caffeic Acid tidak berpotensi sebagai enhancer dari MAPK8/JNK-1. Nilai RMSD dari Caffeic Acid tidak stabil dibandingkan dengan ligan kontrol serta hasil RMSF tidak stabil pada kedua kompleks. Ekstrak air alang-alang tidak memiliki potensi sebagai antikanker pada sel T-47D