Validação da coleção núcleo de milho brasileira subgrupo endosperma dentado.

Este trabalho teve por objetivo validar a representatividade da varibilidade genética do subgrupo endosperma dentado da coleção núcleo de milho da Embrapa Milho e Sorgo. Foram avaliadas seis combinações de primers de AFLP, em amostras de 45 acessos de cada coleção, núcleo e base. Empregou-se o coeficiente de Jaccard para a similaridade genética e o método UPGMA para agrupamento dos acessos. A diversidade gênica para cada loco foi calculada pelo índice de Shannon e a diversidade total (HT), pelo índice de diversidade de Nei (dentro (HS) e entre populações (DST)). A proporção da diversidade genética devido à diferença entre coleções foi calculada pelo índice GST. As frequências alélicas foram estimadas admitindo-se o equilíbrio de Hardy-Weinberg. Considerando os 90 acessos de ambas coleções, foram obtidas 209 bandas, com média de 34,8 bandas polimórficas por combinação de primers. O número efetivo médio de alelos foi 1,5994 e a heterozigosidade (h) usada para avaliar índice de conteúdo polimórfico de cada loco foi 0,349. A proporção da diversidade (GST) entre coleções foi 20,52%. Esses resultados mostraram que 79,48% da varibilidade genética ocorre dentro das coleções de milho. A identidade genética de Nei foi alta (0,8061), mostrando frequências alélicas semelhantes entre as coleções. Por esses resultados, conclui-se que a coleção núcleo de milho subgrupo dentado é um subconjunto representativo da variabilidade genética da coleção total mantida pelo banco de germoplasma da Embrapa Milho e Sorgo

Avaliação agronômica e moleculares de acessos da coleção núcleo de milho, subgrupo endosperma duro.

Coleção núcleo é uma subamostra de acessos, composta por 10% da coleção ativa de germoplasma e representatividade de, pelo menos, 70% da diversidade genética. A eficiência de utilização dos acessos de germoplasma de milho que compõem a coleção núcleo pode ser incrementada ao se agregar valores de caracterização morfo-agronômica e molecular, fornecendo informações mais detalhadas sobre esses acessos. Este trabalho teve por objetivo valorar a coleção núcleo de milho, subgrupo endosperma duro da Embrapa Milho e Sorgo, por meio de descritores morfo-agronômicos e marcadores moleculares AFLP. Para isso, utilizaram-se 58 acessos, para os quais foram avaliados 32 caracteres morfo-agronômicos e seis combinações de primers AFLP para obtenção dos perfis genéticos. Os caracteres que mais contribuíram para divergência genética da coleção núcleo foram o peso de mil grãos (31,0%), a altura da espiga (21,7%) e o peso de espiga (16,4%). Pela análise dos componentes principais dos acessos da coleção núcleo, 70,57% da variância total pode ser explicada com três componentes, não havendo a formação de grupos entre os acessos. Foram geradas 207 bandas AFLP, com média de 32,8 bandas polimórficas por combinação de primer. Os dendrogramas, resultantes das distâncias genéticas morfo-agronômicas e molecular, foram semelhantes e apresentaram a formação de grupos a partir de 25% da maior distância entre grupos. O número médio de alelos observado foi 1,95, o número médio efetivo de alelos foi 1,47 e a heterozigosidade (h), (índice de diversidade genética de Nei), usada para avaliar o conteúdo polimórfico de cada loco, foi 0,28. A caracterização molecular propiciou uma nova informação acerca da estrutura genética da coleção núcleo, verificando-se alta variabilidade entre os acessos

Aspectos epidemiológicos da babesiose bovina na amazônia sul ocidental: avaliação molecular.

A babesiose bovina, causada pelos protozoários intraerotrocíticos Babesia bovis e B. bigemina tem como principal vetor Rhipicephalus (Boophilus) microplus, sendo este o único vetor biológico dos parasitas da família Babesiidae no Brasil. Clinicamente as babesioses caracterizam-se por febre, anemia, hemoglobinemia, hemoglobinúria e fraqueza, podendo evoluir para a morte em casos graves da doença, estando a gravidade da enfermidade diretamente relacionada à reação do hospedeiro frente à infecção. B. bovis e B. bigemina, espécies que ocorrem simultaneamente em várias regiões do mundo acompanhando a presença do vetor. As perdas ocasionadas pela babesiose bovina são atribuídas ao menor ganho de peso dos animais, decréscimo na produção de leite, infertilidade de touros, abortos e mortalidade, além das babesioses representarem um obstáculo à introdução de animais de áreas livres com o propósito de melhorar a qualidade genética dos rebanhos. O presente estudo buscou determinar a prevalência de B. bovis e B. bigemina em amostras de sangue provenientes de rebanhos bovinos criados em oito microrregiões de Rondônia e quatro microrregiões do Acre através da utilização de técnicas biomoleculares de diagnóstico utilizadas para amplificação de fragmentos de DNA específicos à cada uma das espécies. Verificou-se uma taxa de prevalência para B. bovis de 7,70% e de 5,33% para B. bigemina nas amostras provenientes de Rondônia e de 5,34% para B. bovis e de 1,18% para B. bigemina nas amostras provenientes do Acre. As taxas de prevalência diferiram entre as microrregiões analisadas caracterizando os estados de Rondônia e Acre como áreas de instabilidade endêmica para B. bovis e B. bigemina.bitstream/item/40510/1/Boletim46.pd

Aspectos epidemiológicos da babesiose bovina na amazônia sul ocidental: avaliação molecular.

A babesiose bovina, causada pelos protozoários intraerotrocíticos Babesia bovis e B. bigemina tem como principal vetor Rhipicephalus (Boophilus) microplus, sendo este o único vetor biológico da família Babesiidae no Brasil. A babesiose caracteriza-se por febre, anemia, hemoglobinemia, hemoglobinúria e fraqueza, onde alguns casos podem evoluir para a morte, estando a gravidade da enfermidade diretamente relacionada à reação do hospedeiro frente à infecção. As perdas ocasionadas pela babesiose bovina são atribuídas ao menor ganho de peso dos animais, decréscimo na produção de leite, infertilidade de touros, abortos e mortalidade, além das babesioses representarem um obstáculo à introdução de animais provenientes de áreas livres desses parasitas. O presente estudo buscou determinar a prevalência de B. bovis e B. bigemina em amostras de sangue provenientes de rebanhos bovinos criados em oito microrregiões de Rondônia e quatro microrregiões do Acre através da utilização de técnicas diagnósticas pela amplificação de fragmentos de DNA específicos a cada uma das espécies. Verificou-se uma taxa de prevalência para B. bovis de 9,00% e de 3,09% para B. bigemina nas amostras provenientes de Rondônia e de 7,20% para B. bovis e de 0,89% para B. bigemina nas amostras provenientes do Acre. As taxas de prevalência das em todas as microrregiões analisadas caracterizam os estados de Rondônia e Acre como áreas de instabilidade endêmica para B. bovis e B. bigemina, porém tal situação parece não ser a prevalecente nos rebanhos bovinos criados na Amazônia Sul Ocidental dada a abundancia do carrapato dos bovinos durante todo o ano, os quais são responsáveis pela manutenção da parasitemia por B. bovis e B. bigemina nos rebanhos.bitstream/CPAF-RO-2009-09/12213/1/bpd46_babesiose-bovina.pd

Epidemilogia molecular de anplasma marginal em bovinos criados na microrregião de Porto Velho do estado de Rondônia.

Anaplasma marginale é uma rickettsia intraeritrocitária, responsável pela anaplasmose bovina, transmitida principalmente pelo carrapato dos bovinos, Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Apresenta seis genes que codificam as principais proteínas principais (msps). A proteína de membrana MSP5 presente no genoma em copias simples é codificada pelo gene msp5 que está representado no genoma em cópia símples, altamente conservado entre diferentes cepas de A. marginale e suas seqüências têm sido utilizadas para a detecção de portadores do referido parasita pela técnica de PCR. Objetivos: Caracterizar a situação epidemiológica de A.marginale na microrregião de Porto Velho, estado de Rondônia Metodologia: Foram coletadas 309 amostras de sangue obtidas nos sete municípios que compõe a microrregião de Porto Velho, correspondentes a 117.979 da população bovina. A extração do DNA foi através da utilização do kit GFX. A Reação em Cadeia da Polimerase -PCR foi feita utilizando-se os primers msp5 F e msp5 R que amplificam um fragmento de aproximadamente 458pb como seqüência diagnóstica para A .marginale. Visualizaram-se os amplicons de A. marginale obtidos por PCR por eletroforese em gel de agarose á 1 % com o auxílio de marcador peso molecular de 100 pb. Resultado: Utilizando a técnica da PCR, foi observado que 98,7% das amostras analisadas advindas da microrregião de Porto Velho mostraram-se positivas. Conclusão: Os resultados demonstram que os animais vêm tendo contato sistemático com esta rickettsia na área estudada, devido à alta prevalência de A. marginale demonstrada nesta microrregião. Isto comprova à circulação do agente patogênico e a presença de vetores no ambiente, classificando esta zona como área de estabilidade enzoótica, ou seja, apresenta riscos mínimos de surtos exceto pela introdução de animais de áreas livres ou de zonas enzooticamente instáveis

Anaplasma marginale infection in cattle from southwestern Amazonia.

study provides the first epidemiological data regarding infection by Anaplasma marginale in cattle reared in south-western Brazilian Amazonia. One simple procedure was adapted for the extraction of DNA from blood clots collected in seven microregions of Rondônia State and two mesoregions of Acre State. PCR method was used to asses the frequency of A. marginale infections in 4 to12-month-old cattle. The cattle infection was investigated by polymerase chain reaction (PCR) using the specific primer ?msp5? for A. marginale. The DNA amplifications revealed that the mean frequency of A. marginale infection was 98.6% (1,627/1,650) in samples from Rondonia, and 92.87% (208/225) in samples from Acre. The high frequency of A. marginale infections in 4 to 12- month-old cattle indicate a situation of enzootic stability in the studied areas and are comparable to those detected by immunodiagnosis in different endemic regions in Brazil. The DNA extraction of clotted blood method described here can be used for epidemiological studies on anaplasmosis and other bovine hemoparasites

Avaliação de sorgo biomassa visando a produção de bioenergia.

O objetivo deste trabalho foi caracterizar o potencial agronômico de linhagens de sorgo biomassa visando à geração de energia. O ensaio foi implantado no ano agrícola de 2013/2014, em Sete Lagoas-MG, com semeadura realizada no final do mês de janeiro de 2014. O delineamento experimental foi em blocos casualizados, com 3 repetições e 10 genótipos de sorgo. As parcelas experimentais foram constituídas por 2 fileiras de cinco metros, espaçadas de 0,70m. As avaliações foram feitas em uma fileira central de cada parcela e as características avaliadas foram florescimento, altura de plantas (AP), produção de massa verde total (PMV), produção de massa seca total (PMS). Os dados de PMV e PMS foram convertidos para t.ha-1. Híbridos de sorgo biomassa, sensíveis ao fotoperíodo, apresentaram ciclo médio de seis meses e porte alto (superior a 4m) que refletiu em alto potencial produtivo de biomass

Extração de DNA a partir de coágulos sanguíneos bovinos.

Foi otimizada uma metodologia de extração de DNA genômico a partir de coágulo sanguíneo. Amostras de sangue com e sem anticoagulante EDTA para a obtenção dos coágulos sanguíneos foram coletadas em bovinos nos estados de Rondônia e Acre para pesquisa de Anaplasma marginale. Para a extração de DNA a partir do coágulo sanguíneo testaram-se dois tipos de tecido de nylon: no tratamento 1, o tecido utilizado apresentava diâmetro dos poros de 200 µm e no tratamento 2, tecido com poros de diâmetro de 1.200 µm. As amostras de sangue com anticoagulante representaram o tratamento 3, sendo este considerado como tratamento controle. Após a quebra mecânica, os coágulos sofreram centrifugação a 7.000 RPM por 15 minutos passando através das malhas dos tecidos utilizados nos tratamentos 1 e 2. A extração de DNA das amostras a partir do coágulo centrifugado e do sangue total se deu através da utilização de kit comercial para extração de DNA genômico. A quantificação do DNA obtido foi realizada através de espectrofotometria a 260 e 280 m, sendo sua integridade verificada através de eletroforese em gel de agarose. As amostras de DNA obtidas a partir dos diferentes protocolos foram utilizadas como molde para amplificação, por PCR, do gen msp5 de A. marginale. A quantidade de DNA obtida pelos tratamentos 1 e 2 foi semelhante a do sangue total (33,39 ± 1,17; 31,76 ± 0,663; 32,35 ± 0,676, respectivamente). A pureza do DNA nas amostras obtidas a partir dos tratamentos 1 e 2 foram semelhantes a do sangue total (A260/280 = 1,61 ± 0,068; 1,58 ± 0,035; 1,63 ± 0,028, respectivamente). A utilização de tecidos de organza ou tipo filó se mostrou como uma metodologia apta a ser incorporada como método de rotina para extração de DNA a partir de coágulo sanguíneo bovino por ser uma metodologia simples, rápida, barata e reproduzível para a obtenção de quantidades consideráveis de DNA de boa qualidade para utilização em estudos de epidemiologia molecular em patologias bovinas.bitstream/item/24667/1/bpd43-dnabovinos.pd