Biodiversity of rhizobia associated with cowpea cultivars in soils of the lower half of the São Francisco River Valley Biodiversidade de rizóbio associado a cultivares de feijão-caupi em solos do submédio do Vale do São Francisco

The biodiversity of rhizobium in soils of the São Francisco Valley is unknown and can be studied using cowpea as trap plants. The objective of this study was to verify the diversity of diazotrophic bacteria that nodulate cowpea in soils of the lower half of the São Francisco River Valley by morphological and genotypic characterization. Seven soil samples (A1, A2, A3, A4, C1, C2 and MC) were collected to capture bacteria associated to five cowpea cultivars (IPA 206, BRS Pujante, BRS Marataoã, Canapu Roxo, and Sempre Verde), in a 5x7 factorial design with three replications. Thirty days after plant emergence, the nodules were collected and the bacteria isolated and analyzed in relation to their growth characteristics in YMA medium. The 581 isolates were grouped in 49 morphologic groups. Of this total, 62.3 % formed colonies in up to three days, 33.4 % grew from the 6th day on, and 4.3 % began to grow 4 to 5 days after incubation. Regarding the formation of acids and alkalis, 63 % acidified the medium, 12 % made it alkaline and 25 % maintained the medium at neutral pH. The highest diversity was observed in the A3 sample and in isolates associated with the cultivars Canapu Roxo and BRS Pujante. Thirty-eight representative isolates were chosen for the genotypic characterization, clustered in four groups based on the restriction analysis of 16s rDNA. This grouping was strongly correlated with the sampling site; 13 rhizobium isolates had an electrophoretic profile distinct from the standard rhizobium strains used in this study.<br>A biodiversidade de rizóbio de solos do Vale do São Francisco é desconhecida e pode ser estudada utilizando feijão-caupi como planta-isca. Este trabalho teve por objetivo verificar a diversidade de bactérias diazotróficas que nodulam feijão-caupi em solos do Submédio do Vale do São Francisco por meio da caracterização morfológica e genotípica. Sete amostras de solos (A1, A2, A3, A4, C1, C2 e MC) foram coletadas para a captura de bactérias, utilizando cinco cultivares de feijão-caupi (IPA 206, BRS Pujante, BRS Marataoã, Canapu Roxo e Sempre Verde), perfazendo um fatorial 5 x 7 com três repetições. Aos 30 dias após a emergência das plantas, os nódulos foram coletados e as bactérias isoladas e analisadas quanto às características culturais em meio YMA. Foram obtidos 581 isolados, que se agruparam em 49 grupos morfológicos. Desse total, 62,3 % formaram colônias em até três dias, 33,4 % cresceram a partir do sexto dia e 4,3 % cresceram entre quatro e cinco dias após a incubação. Quanto à formação de ácido e álcalis, 63 % acidificaram o meio de cultura, 12 % alcalinizaram e 25 % mantiveram o pH do meio neutro. As maiores diversidades foram encontradas nas amostras A3 e nos isolados associados às cultivares Canapu Roxo e BRS Pujante. Escolheram-se 38 isolados representativos para a caracterização genotípica, em que foram obtidos quatro grupos a partir da análise de restrição do 16s rDNA. Este agrupamento teve forte correlação com o local de origem dos isolados, mostrando 13 deles com perfil eletroforético distinto das estirpespadrão de rizóbios utilizadas no estudo