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Estudo genético-quantitativo de características de crescimento na raça Tabapuã A genetic-quantitative study of growth traits in Tabapuã cattle
Estimaram-se os componentes de variância e covariância e as herdabilidades para os efeitos direto e materno, as correlações entre os efeitos direto e materno e a fração de ambiente permanente na variação total, utilizando-se o aplicativo MTDFREML, para os pesos ao nascer (PN), à desmama ajustado para 205 dias (P205), aos 365 (P365) e 550 (P550) dias de idade na raça Tabapuã, para avaliar o efeito materno e a associação dos efeitos direto e materno sobre características de crescimento. Os dados, provenientes do programa de controle ponderal da raça, foram registrados na fazenda Água Milagrosa, município de Tabapuã, São Paulo, no período de 1978 a 2002. As herdabilidades direta e materna foram: 0,32, 0,10; 0,20, 0,17; 0,21, 0,06 e 0,16; 0,03, para os pesos ao nascer, à desmama, aos 365 e 550 dias, respectivamente. As correlações entre os efeitos direto e materno para a mesma seqüência de pesos foram: -0,10; -0,20; -0,11 e -0,15. As frações do efeito de meio permanente na variância total foram: 1,41x10-6; 2,5x10-7; 2,4x10-7 e 4,0x10-6. Recomenda-se a inclusão do efeito materno nos esquemas de seleção de características de crescimento na raça Tabapuã.The variance and covariance components, heritability for direct and maternal effects, correlations between direct and maternal effects and permanent environmental component of variance were estimated, using the REML methodology for birth weight (BW), weaning weight adjusted for 205 days (W205), weights at 365 (W365) and at 550 (W550) days of age in Tabapuã animals. Maternal effect and the association between direct and maternal effects on growth traits were estimated. Animal records from 1978 to 2002 are from Fazenda Água Milagrosa, located at São Paulo State. The direct and maternal heritability were, respectively, 0.32, 0.10; 0.20, 0.17; 0.21, 0.06 and 0.16; 0.03, for birth weight, weaning weight, weights at 365 and at 550 days of age. The correlations between direct and maternal effects for the same sequence of weights were -0.10; -0.20; -0.11 and -0.15. The fractions of permanent environmental of the phenotypic variance were 1.41x10-6; 2.5x10-7; 2,4x10-7 and 4.0x10-6. The inclusion of maternal effect is recommended for growth traits evaluation of Tabapuã animals for selection purpose
Efeitos da origem e da linhagem do DNA mitocondrial sobre características produtivas e reprodutivas de bovinos leiteiros da raça Gir Effects of origin and lineage of mitochondrial DNA on productive and reproductive traits of Gir dairy cattle
Avaliou-se a influência do DNA mitocondrial sobre características de produção e reprodução em rebanho Gir. Foram analisados, segundo a origem mitocondrial (indicus ou taurus) e linhagem citoplasmática (fêmeas fundadoras), 3385 registros de produção total de leite (PT), produção de leite até os 305 dias de lactação (P305) e de período de lactação (PL); 2394 registros de intervalo de parto (IP) e de produção de leite por dia de intervalo de partos (PIP) e 618 registros de idade ao primeiro parto (IPP). A origem mitocondrial foi incluída no modelo como efeito fixo para a idade ao primeiro parto, por ter, em análise prévia, demonstrado ser significativa somente para essa característica. A estimação dos componentes de variância e parâmetros genéticos bem como a predição dos valores genéticos foram realizadas a partir de dois modelos animais; com e sem a inclusão da variável aleatória, linhagem citoplasmática, com o programa MTDFREML, pelo método da máxima verossimilhança restrita com algoritmo livre de derivadas. A linhagem citoplasmática explicou 1,6%; 1,5%; 1,2%, 0%, 0% e 0%, da variância fenotípica das características PT, P305, PL, IP, PIP e IPP, não obstante não se mostrou significativa no teste de razão de máxima verossimilhança. As correlações de postos entre os valores genéticos obtidos a partir dos modelos com e sem a inclusão da linhagem citoplasmática foram próximas à unidade para todas as características. O modelo que não incluiu a linhagem citoplasmática viesou apenas as tendências genéticas das características PT, P305 e PL. A origem mitocondrial, indicus ou taurus, somente foi significativa (PThis study was carried out to evaluate the mitochondrial DNA effect on production and reproduction traits of Gir breed. A total of 3,385 records of milk production (MP), 305-day milk production (305-MP), and lactation length (LL); and 2,394 records of calving interval (CI), milk production per day of calving interval (MPPDCI), and age at first calving (AFC) were analyzed according to mitochondrial DNA origin (indicus or taurus) and cytoplasmatic lineages (foundation cows). The mitochondrial DNA origin was considered as fixed effect for age at first calving analysis. Genetic parameter estimates and predicted breeding values were obtained by restricted maximum likelihood derivative free algorithm using two different animal models (including or not cytoplasmatic lineage effect). Maximum likelihood ratio test showed a non significant effect of cytoplasmatic lineages on all analyzed traits. Cytoplasmatic lineages accounted not significantly for 1.6%, 1.5%, 1.2%, 0%, and 0% of the total phenotypic variance of MP, 305-MP, LL, MPPDCI and AFC. Ranks correlation among breeding values from both models were close to one for all analyzed traits. No mitochondrial lineage model biased upward only estimates of genetic trends of MP, 305-MP, and LL traits. Mitochondrial origin (taurus or indicus) significantly accounted (P<0.05) only for total variation of age at first calving. Cytoplasmatic lineages did not account significantly for the phenotypic variation of any of the studied traits
Efeito da covariância genética aditivo-materna sobre estimativas de parâmetros genéticos e em avaliações genéticas de características de crescimento de animais Tabapuã Effect of additive genetic-maternal covariance on genetic parameter estimates and on genetic evaluation of growth traits of Tabapuã Zebu breed
Avaliou-se o efeito da covariância genética aditiva direto-materna sobre estimativas de parâmetros genéticos e sobre a predição e a ordenação de valores genéticos de animais da raça Tabapuã. Os parâmetros genéticos foram estimados com base em 19646, 14276, 10663 e 6172 registros de pesos ao nascimento e ajustados para 205, 365 e 550 dias de idade em análises unicaracterística, utilizando o programa computacional MTDREML, pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivadas por modelos animal com ou sem a inclusão da covariância. As estimativas da covariância genética aditiva direto-materna foram, respectivamente, -0,08; -0,22; -0,10 e 0,34, para os pesos ao nascer e ajustados para 205, 365 e 550 dias de idade. As herdabilidades diretas e maternas obtidas sob modelo com a inclusão da covariância genética direto-materna foram, respectivamente, 0,31 e 0,10; 0,20 e 0,17; 0,20 e 0,06 e 0,17 e 0,01, para os mesmos pesos, enquanto sem a inclusão foram, respectivamente, 0,31 e 0,09; 0,18 e 0,14; 0,20 e 0,05 e 0,18 e 0,02. Os valores de correlação de posto entre os valores genéticos preditos pelos modelos com e sem a inclusão foram 0,999; 0,992; 0,999 e 0,998. As correlações de posto entre os valores genéticos maternos foram 0,999; 0,985; 0,992 e 0,771. A inclusão da covariância genética aditiva direto-materna não influenciou as estimativas dos parâmetros genéticos e teve efeito inexpressivo na ordenação dos valores genéticos dos pesos de animais da raça Tabapuã.<br>This study was carried out to evaluate the effect of additive genetic-maternal covariance on estimates of genetic parameters and on the prediction and ranking of breeding values of Tabapuã animals. Records of 19,646, 14,276, 10,663, and 6,176 birth weights and weights at 205, 365, and 550 days of age were used in univariate animal model analysis using MTDFREML software, including or not the additive genetic-maternal covariance in the models. The additive genetic-maternal covariance estimates were, respectively, -0.08, -0.22, -0.10, and 0.34 for birth weight and weights at 205, 365, and 550 days of age. The direct and maternal heritability estimates including the additive direct-maternal covariance were, respectively, 0.31, and 0.10; 0.31 and 0.20, and 0.17; and 0.20 and 0.06; and 0.17 and 0.01 for birth weight and weights at 205, 365, and 550 days of age, while without the additive direct-maternal covariance those values were, respectively, 0.31 and 0.09; 0.18 and 0.14; 0.20 and 0.05; .18 and 0.02. Rank correlation between predicted breeding values from two models for birth weight and weights at 205 and 550 days of age were, respectively, 0.999, 0.992, 0.999, and 0.998. For maternal genetic values, these estimated rank correlations were, respectively, 0.995, 0.985, 0.992, and 0.771. The inclusion of additive genetic-maternal covariance in the analysis did not affect genetic parameter estimates and had a very small effect on breeding values ranking of Tabapuã animals
Análise genética de características ponderais e reprodutivas de fêmeas bovinas Tabapuã Genetics analysis of growth and reproduction traits in a herd of Tabapuã females
Foram estudadas 1251 informações referentes aos pesos às idades-padrão de 205 (P205), 365 (P365) e 550 (P550) dias e idade ao primeiro parto (IPP) e primeiro intervalo de partos (IEP1) de fêmeas bovinas da raça Tabapuã. As médias, desvios-padrão e coeficientes de variação foram respectivamente: P205 - 173,9kg, 16,0kg e 9,2%; P365 - 225,7kg, 28,7kg e 12,7%; P550 - 277,0kg, 36,7kg e 13,3%; IPP - 1125,5 dias, 106,6 dias e 9,5% e IEP1 - 522,2 dias, 106,2 dias e 20,7%. As estimativas de componentes de (co)variância e de parâmetros genéticos foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança restrita, utilizando-se o software MTDFREML. Para cada característica as estimativas de herdabilidade foram de 0,16, 0,25, 0,29, 0,03 e 0,01, na mesma ordem de citação acima. As correlações genéticas entre as características ponderais e reprodutivas foram: -0,67 (P205×IPP); -0,07 (P365×IPP); -0,41 (P550×IPP); 0,19 (P205×IEP1); 0,79 (P365×IEP1) e 0,64 (P550×IEP1).<br>Records on weaning, yearling and 550-day weights, age at first calving and first calving interval from 1251 Tabapuã females, born between 1987 and 1999, were used to estimate variance components and genetic parameters. Statistical analyses were performed and components of (co)variance and genetic parameters were estimated by the derivative-free algorithm based on an animal model. The heritability estimates for weaning, 365 and 550 day weights, age at first calving and first calving interval were: 0.16, 0.25, 0.29, 0.03 and 0.01, respectively. The genetic correlations between weight at those ages and age at first calving were: -0,67; -0,07; -0,41, respectively, and between weights (at weaning, 365 and 550 days) and first calving interval were: 0.19, 0.79 and 0.54, respectively. These results showed a genetic antagonism between weight at different ages with first calving interval, but not with age at first calving
Tabapuã breed in Northeastern Brazil: genetic progress and population structure
The objective of this study was to evaluate the history of the Tabapuã breed in Northeastern Brazil by determining its population structure and genetic progress. Pedigree information from animals born in the period between 1965 and 2006 and weight-adjusted data at 205 (W205), 365 (W365) and 550 (W550) days of age for bovines born between 1975 and 2006 were used. The (co)variance components and genetic value were estimated using the application MTDFREML. Also, the software ENDOG was used for pedigree analysis and parameter estimation based on the probabilities of gene origin, inbreeding and average generation interval. The heritability coefficients for direct genetic effects were 0.21±0.03, 0.26±0.04 and 0.36±0.05 for W205, W365 and W550, respectively. During the first 20 years studied, the observed effective size was small. The generation intervals by gametic pathway were: 7.7±3.4 (sire-son), 7.8±3.7 (sire-daughter), 6.9±3.3 (dam-son), 6.8 ± 3.1 (dam-daughter), and mean interval of 7.3±3.4 years. The studied population showed moderate heritability coefficients, whereas the genetic gains based on the studied traits may be higher than those estimated by genetic tendencies. Reduced generation interval, increased effective size and continuous mating control of relatives are important strategies for the genetic progress of the Tabapuã breed in the region