Эффективность различных методов компьютерной периметрии в диагностике первичной открытоугольной глаукомы. Часть 1

PURPOSE: To compare the diagnostic efficiency of 6 different computerized perimetric methods in patients with primary open-angle glaucoma (POAG) in an open comparative clinical research. METHODS: The study involved 52 patients (96 eyes) aged from 41 to 76 years old (average age 63 years) with POAG. Patients were divided into three groups depending on the stage of POAG: Group 1 included patients with mild (41 eyes), Group 2 - with moderate (36 eyes)and Group 3 -with advanced stages (19 eyes) of POAG. The control group consisted of 20 healthy persons (40 eyes) aged from 44 to 67 years old (average age 59 years). The patient examination included a standard ophthalmic assessment as well as computerized perimetry (CP) on Humphrey Visual Field Analyzer II (HFA II) 745i (Germany-USA), automated perimeters AP1000 («Tomey», Germany) and Pericom (Russian Federation), Micro-Perimeter MP-1 («Nidek Technologies», Japan), our modifications of Frequency Doubling Technology (FDT) perimetry and investigation of the multifocal Visual Evoked Potentials (mf VEP) as well as optical coherence tomography ОСТ RTVue-100 («Optovue», USA). RESULTS: FDT perimetry data demonstrated the same sensitivity (84%) as the HFA II ones (81%) and the greatest specificity (96%), the lowest variability of repeated results and the minimum testing time of one eye (1.5+0.04 min). Perimeters AP1000 and Pericom had lower levels of sensitivity (76/74%) and specificity (71/88%); the testing was longer (9.1+0.4 and 9.3+0.3 min). Data of MP-1 showed the high sensitivity (88%) and the lowest specificity (54%), the testing took place even longer (13.5+7.1 min.). The results of mf VEP had a quite high sensitivity (78%) and specificity (81%) and the maximum testing time of one eye (20.2+0.7 min.). CONCLUSION: To diagnose glaucoma, determine its stage and progression several methods of CP should be used. If it is impossible, it is necessary to repeat the same perimeter test a few times comparing perimetry data with the condition of the optic nerve head.ЦЕЛЬ. Сравнить диагностическую эффективность 6 методов компьютерной периметрии (КП) у пациентов с первичной открытоугольной глаукомой (ПОУГ) в рамках открытого сравнительного клинического исследования. МЕТОДЫ. В исследовании участвовали 52 больных (96 глаз) в возрасте от 41 года до 76 лет (средний возраст 63 года) с ПОУГ. В зависимости от стадии глаукомы пациентов разделили на 3 группы: 1-я - с начальной (41 глаз), 2-я - развитой (36 глаз) и 3-я - далекозашедшей (19 глаз) ПОУГ. В контрольную группу вошли 20 здоровых человек (40 глаз) в возрасте от 44 до 67 лет (средний возраст 59 лет). Наряду со стандартным офтальмологическим обследованием всем испытуемым проводили КП на анализаторе поля зрения Humphrey Visual Field Analyzer II (HFA II) 745i (Германия-США), автоматическом периметре AP1000 («Tomey», Германия), автоматическом статическом пери-графе Периком (Российская Федерация), микропериметре MP-1 («Nidek Technologies», Япония), а также наши модификации периметрии с технологией удвоения пространственной частоты - Frequency Doubling Technology (FDT) perimetry и исследования мультифокальных зрительных вызванных потенциалов (мфЗВП). Всем пациентам с ПОУГ выполняли оптическую когерентную томографию (ОСТ) на RTVue-100 («Optovue», США). РЕЗУЛЬТАТЫ. Данные FDT-периметрии, не уступая по уровню чувствительности HFA II (84/81%), показали самый высокий уровень специфичности (96%), наименьшую вариабельность повторных результатов и минимальное время тестирования одного глаза (1,5±0,04 мин.). AP-1000 и Периком имели более низкие уровни чувствительности (76/74%) и специфичности (71/88%) результатов, а тестирование было длительным (9,1±0,4 и 9,3±0,3 мин.). Данные МР-1 показали высокую чувствительность (88%) и самую низкую специфичность (54%), тестирование было еще более длительным (13,5±7,1 мин.). Результаты мфЗВП имели достаточно высокую чувствительность (78%) и специфичность (81%), длительность исследования одного глаза оказалась максимальной (20,2±0,7 мин.). ЗАКЛЮЧЕНИЕ. Для уточнения диагноза «глаукома», ее стадии, мониторинга заболевания следует при возможности использовать несколько методов КП, а при невозможности - неоднократно повторять имеющийся в наличии периметрический тест, сопоставляя данные периметрии с состоянием диска зрительного нерва

Эффективность различных методов компьютерной периметрии в диагностике первичной открытоугольной глаукомы. Часть 2

PURPOSE: To compare the diagnostic efficiency of 6 different computerized perimetric methods in patients with primary open-angle glaucoma (POAG) in an open comparative clinical research. METHODS: The study involved 52 patients (96 eyes) aged from 41 to 76 years old (average age 63 years) with POAG. Patients were divided into three groups depending on the stage of POAG: Group 1 included patients with mild (41 eyes), Group 2 - with moderate (36 eyes) and Group 3 - with advanced stages (19 eyes) of POAG. The control group consisted of 20 healthy persons (40 eyes) aged from 44 to 67 years old (average age 59 years). The patient examination included a standard ophthalmic assessment as well as computerized perimetry (CP) on Humphrey Visual Field Analyzer II (HFA II) 745i (Germany-USA), automated perimeters AP1000 («Tomey», Germany) and Pericom (Russian Federation), Micro-Perimeter MP-1 («Nidek Technologies», Japan), our modifications of Frequency Doubling Technology (FDT) perimetry and investigation of the multifocal Visual Evoked Potentials (mf VEP) as well as optical coherence tomography ОСТ RTVue-100 («Optovue», USA). RESULTS: FDT perimetry data demonstrated the same sensitivity (84%) as the HFA II ones (81%) and the greatest specificity (96%), the lowest variability of repeated results and the minimum testing time of one eye (1.5±0.04 min). Perimeters AP1000 and Pericom had lower levels of sensitivity (76/74%) and specificity (71/88%); the testing was longer (9.1±0.4 and 9.3±0.3 min). Data of MP-1 showed the high sensitivity (88%) and the lowest specificity (54%), the testing took place even longer (13.5±7.1 min.). The results of mf VEP had a quite high sensitivity (78%) and specificity (81%) and the maximum testing time of one eye (20.2±0.7 min.). CONCLUSION: To diagnose glaucoma, determine its stage and progression several methods of CP should be used. If it is impossible, it is necessary to repeat the same perimeter test a few times comparing perimetry data with the condition of the optic nerve head.ЦЕЛЬ. Сравнить диагностическую эффективность 6 методов компьютерной периметрии (КП) у пациентов с первичной открытоугольной глаукомой (ПОУГ) в рамках открытого сравнительного клинического исследования. МЕТОДЫ. В исследовании участвовали 52 больных (96 глаз) в возрасте от 41 года до 76 лет (средний возраст 63 года) с ПОУГ. В зависимости от стадии глаукомы пациентов разделили на 3 группы: 1-я - с начальной (41 глаз), 2-я - развитой (36 глаз) и 3-я - далекозашедшей (19 глаз) ПОУГ. В контрольную группу вошли 20 здоровых человек (40 глаз) в возрасте от 44 до 67 лет (средний возраст 59 лет). Наряду со стандартным офтальмологическим обследованием всем испытуемым проводили КП на анализаторе поля зрения Humphrey Visual Field Analyzer II (HFA II) 745i (Германия-США), автоматическом периметре AP1000 («Tomey», Германия), автоматическом статическом периграфе Периком (Российская Федерация), микропериметре MP-1 («Nidek Technologies», Япония), а также наши модификации периметрии с технологией удвоения пространственной частоты - Frequency Doubling Technology (FDT) perimetry и исследования мультифокальных зрительных вызванных потенциалов (мфЗВП). Всем пациентам с ПОУГ выполняли оптическую когерентную томографию (ОСТ) на RTVue-100 («Optovue», США). РЕЗУЛЬТАТЫ. Данные FDT-периметрии, не уступая по уровню чувствительности HFA II (84/81%), показали самый высокий уровень специфичности (96%), наименьшую вариабельность повторных результатов и минимальное время тестирования одного глаза (1,5±0,04 мин.). AP-1000 и Периком имели более низкие уровни чувствительности (76/74%) и специфичности (71/88%) результатов, а тестирование было длительным (9,1±0,4 и 9,3±0,3 мин.). Данные МР-1 показали высокую чувствительность (88%) и самую низкую специфичность (54%), тестирование было еще более длительным (13,5±7,1 мин.). Результаты мфЗВП имели достаточно высокую чувствительность (78%) и специфичность (81%), длительность исследования одного глаза оказалась максимальной (20,2±0,7 мин.). ЗАКЛЮЧЕНИЕ. Для уточнения диагноза «глаукома», ее стадии, мониторинга заболевания следует при возможности использовать несколько методов КП, а при невозможности - неоднократно повторять имеющийся в наличии периметрический тест, сопоставляя данные периметрии с состоянием диска зрительного нерва

The Case of X and Y Localization of Nucleolus Organizer Regions (NORs) in Tragulus javanicus (Cetartiodactyla, Mammalia)

There are differences in number and localization of nucleolus organizer regions (NORs) in genomes. In mammalian genomes, NORs are located on autosomes, which are often situated on short arms of acrocentric chromosomes and more rarely in telomeric, pericentromeric, or interstitial regions. In this work, we report the unique case of active NORs located on gonоsomes of a eutherian mammal, the Javan mouse-deer (Tragulus javanicus). We have investigated the position of NORs by FISH experiments with ribosomal DNA (rDNA) sequences (18S, 5.8S, and 28S) and show the presence of a single NOR site on the X and Y chromosomes. The NOR is localized interstitially on the p-arm of the X chromosome in close proximity with prominent C-positive heterochromatin blocks and in the pericentromeric area of mostly heterochromatic Y. The NOR sites are active on both the X and Y chromosomes in the studied individual and surrounded by GC enriched heterochromatin. We hypothesize that the surrounding heterochromatin might have played a role in the transfer of NORs from autosomes to sex chromosomes during the karyotype evolution of the Javan mouse-deer

Phylogenomics of the dog and fox family (Canidae, Carnivora) revealed by chromosome painting

Canid species (dogs and foxes) have highly rearranged karyotypes and thus represent a challenge for conventional comparative cytogenetic studies. Among them, the domestic dog is one of the best-mapped species in mammals, constituting an ideal reference genome for comparative genomic study. Here we report the results of genome-wide comparative mapping of dog chromosome-specific probes onto chromosomes of the dhole, fennec fox, and gray fox, as well as the mapping of red fox chromosome-specific probes onto chromosomes of the corsac fox. We also present an integrated comparative chromosome map between the species studied here and all canids studied previously. The integrated map demonstrates an extensive conservation of whole chromosome arms across different canid species. In addition, we have generated a comprehensive genome phylogeny for the Canidae on the basis of the chromosome rearrangements revealed by comparative painting. This genome phylogeny has provided new insights into the karyotypic relationships among the canids. Our results, together with published data, allow the formulation of a likely Canidae ancestral karyotype (CAK, 2n=82), and reveal that at least 6-24 chromosomal fission/fusion events are needed to convert the CAK karyotype to that of the modern canids

Tracking genome organization in rodents by Zoo-FISH

The number of rodent species examined by modern comparative genomic approaches, particularly chromosome painting, is limited. The use of human whole-chromosome painting probes to detect regions of homology in the karyotypes of the rodent index species, the mouse and rat, has been hindered by the highly rearranged nature of their genomes. In contrast, recent studies have demonstrated that non-murid rodents display more conserved genomes, underscoring their suitability for comparative genomic and higher-order systematic studies. Here we provide the first comparative chromosome maps between human and representative rodents of three major rodent lineages Castoridae, Pedetidae and Dipodidae. A comprehensive analysis of these data and those published for Sciuridae show (1) that Castoridae, Pedetidae and Dipodidae form a monophyletic group, and (2) that the European beaver Castor fiber (Castoridae) and the birch mouse Sicista betulina (Dipodidae) are sister species to the exclusion of the springhare Pedetes capensis (Pedetidae), thus resolving an enduring trifurcation in rodent higher-level systematics. Our results together with published data on the Sciuridae allow the formulation of a putative rodent ancestral karyotype (2n=50) that is thought to comprise the following 26 human chromosomal segments and/or segmental associations: HSA1pq, 1q/10p, 2pq, 2q, 3a, 3b/19p, 3c/21, 4b, 5, 6, 7a, 7b/16p, 8p/4a/8p, 8q, 9/11, 10q, 12a/22a, 12b/22b, 13, 14/15, 16q/19q, 17, 18, 20, X and Y. These findings provide insights into the likely composition of the ancestral rodent karyotype and an improved understanding of placental genome evolution