Réservoir extra-digestif d’entérobactéries productrices de bêtalactamase à spectre élargi chez des patients non infectés: étude à partir d’une recherche systématique dans les urines et d’autres prélèvements à visée diagnostique

Notre objectif était d’étudier le réservoir extra-digestif d’entérobactéries productrices de β-lactamases à spectre élargi (EBLSE) en les recherchant dans des prélèvements à visée diagnostique (PVD) pour lesquels les colonies bactériennes isolées sur les milieux de cultures utilisés ne sont pas obligatoirement analysées (identification bactérienne et antibiogramme) en routine. Pendant une période de 5 semaines, des identifications et des antibiogrammes ont été réalisés de manière systématique pour les colonies correspondant à des entérobactéries isolées dans certains PVD comme les urines, les prélèvements respiratoires, et un groupe de prélèvements appelé “divers”. Les prélèvements pour lesquels un antibiogramme a été réalisé conformément à la pratique de routine du laboratoire ont été considérés comme infectés. Les prélèvements pour lesquels les entérobactéries ont été recherchées et étudiées suivant le protocole de l’étude ont été considérés comme colonisés. Au cours de l’étude, 2 312 urines, 327 prélèvements respiratoires et 1 887 prélèvements divers ont été envoyés au laboratoire. Parmi les 114 urines colonisées par au moins une entérobactérie, 13 (11,4 %) comportaient une EBLSE, alors que cette proportion était de 5,1 % (35/682) dans les urines infectées (p < 0,01). Parmi les prélèvements respiratoires et divers, 3 EBLSE ont été isolées dans 55 prélèvements colonisés par au moins une entérobactérie. Au total, la recherche systématique d’EBLSE dans les PVD a permis une augmentation de 27,7 % du nombre de patients identifiés comme porteurs de ces bactéries. D’autres études pourraient être utiles pour évaluer l’intérêt de mettre en place une telle stratégie comme alternative au dépistage rectal habituellement pratiqué

Electrophilic RNA for Peptidyl-RNA Synthesis and Site-Specific Cross-Linking with tRNA-Binding Enzymes.

RNA functionalization is challenging due to the instability of RNA and the limited range of available enzymatic reactions. We developed a strategy based on solid phase synthesis and post-functionalization to introduce an electrophilic site at the 3' end of tRNA analogues. The squarate diester used as an electrophile enabled sequential amidation and provided asymmetric squaramides with high selectivity. The squaramate-RNAs specifically reacted with the lysine of UDP-MurNAc-pentapeptide, a peptidoglycan precursor used by the aminoacyl-transferase FemXWv for synthesis of the bacterial cell wall. The peptidyl-RNA obtained with squaramate-RNA and unprotected UDP-MurNAc-pentapeptide efficiently inhibited FemXWv . The squaramate unit also promoted specific cross-linking of RNA to the catalytic Lys of FemXWv but not to related transferases recognizing different aminoacyl-tRNAs. Thus, squaramate-RNAs provide specificity for cross-linking with defined groups in complex biomolecules due to its unique reactivity