Evaluation of the primitive fraction by functional in vitro assays at the RNA and DNA level represents a novel tool for complementing molecular monitoring in chronic myeloid leukemia

Quantification of BCR-ABL1 mRNA levels in peripheral blood of chronic myeloidleukemia patients is a strong indicator of response to tyrosine-kinase inhibitors (TKI)treatment. However, additional prognostic markers are needed in order to better classify patients. The hypothesis of leukemic stem cells (LSCs) heterogeneity and persistence, suggests that their functional evaluation could be of clinical interest. In this work, we assessed the primitive and progenitor fractions in patients at diagnosis and during TKI treatment using functional in vitro assays, defining a ?functional leukemic burden? (FLB). We observed that the FLB was reduced in vivo in both fractions upon treatment. However, different FLB levels were observed among patients according to their response to treatment, suggesting that quantification of the FLB could complement early molecular monitoring. Given that FLB assessment is limited by BCR-ABL1 mRNA expression levels, we developed a novel detection method of primitive cells at the DNA level, using patient-specific primers and direct nested PCR in colonies obtained from functional in vitro assays. We believe that this methodcould be useful in the context of discontinuation trials, given that it is unknown whether the persistent leukemic clone represents LSCs, able to resume the leukemia upon TKI removal.Fil: Ruiz, María Sol. Fundación Cáncer. Centro de Investigaciones Oncológicas; ArgentinaFil: Sanchez, María Belén. Fundación Cáncer. Centro de Investigaciones Oncológicas; Argentina. Argenomics; ArgentinaFil: Gutierrez, Leandro German. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; Argentina. Instituto Alexander Fleming, Bs. As.; ArgentinaFil: Koile, Daniel Isaac. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Yankilevich, Patricio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Mosqueira, Celeste. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Cranco, Santiago. Fundaleu; ArgentinaFil: Custidiano, María del Rosario. Hospital Italiano de La Plata; ArgentinaFil: Freitas, Josefina. Provincia de Buenos Aires. Hospital Nacional Profesor A. Posadas; ArgentinaFil: Foncuberta, Cecilia. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Moiraghi, Beatriz. Fundación Cáncer. Centro de Investigaciones Oncológicas; ArgentinaFil: Pavlovsky, Carolina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Pérez, Mariel Ana. Fundación Cáncer. Centro de Investigaciones Oncológicas; ArgentinaFil: Ventriglia, Verónica. Provincia de Buenos Aires. Hospital Nacional Profesor A. Posadas; Argentina; ArgentinaFil: Sánchez Ávalos, Julio César Américo. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Mordoh, Jose. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fundación Cáncer. Centro de Investigaciones Oncológicas; ArgentinaFil: Larripa, Irene Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Córdoba. Centro de Investigaciones en Bioquímica Clínica e Inmunología; ArgentinaFil: Bianchini, Michele. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Fundación Cáncer. Centro de Investigaciones Oncológicas; Argentin

miRNome profiling of clonal stem cells in Ph+ CML

Chronic myeloid leukemia (CML) is a myeloid stem cell neoplasm characterized by an expansion of myeloid progenitor cells and the presence of BCR-ABL1 oncoprotein. Since the introduction of specific BCR-ABL1 tyrosine kinase inhibitors (TKI), overall survival has improved significantly. However, under long-term therapy patients may have residual disease that originates from TKI-resistant leukemic stem cells (LSC). In this work, we analyzed the miRNome of CML LSC, normal hematopoietic stem cells (HSC) obtained from the same CML patients, and stem and progenitor cells obtained from healthy donors (HD) by next-generation sequencing. We detected a global decrease of microRNA levels in LSC and HSC from CML patients, and decreased levels of microRNAs and snoRNAs from a genomic cluster in chromosome 14, suggesting a mechanism of silencing of multiple non-coding RNAs. Surprisingly, HSC from CML patients, despite the absence of BCR-ABL1 expression, showed an altered miRNome. In silico analysis revealed an association between validated microRNAs and multiple metabolic pathways, suggesting that these molecules may be mediators of the previously reported dysregulation of LSC metabolism. This is the first report of the LSC miRNome that distinguishes between BCR-ABL1+ LSC and their BCR-ABL1- counterparts, providing valuable data for future studies.Fil: Ruiz, María Sol. Fundación Cáncer. Centro de Investigaciones Oncológicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Sánchez, María Belén. Fundación Cáncer. Centro de Investigaciones Oncológicas; ArgentinaFil: Bonecker, Simone. Instituto Nacional de Câncer; BrasilFil: Furtado, Carolina. Instituto Nacional de Câncer; BrasilFil: Koile, Daniel Isaac. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Yankilevich, Patricio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Cranco, Santiago. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Custidiano, María del Rosario. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Freitas, Josefina. Hospital Nacional Profesor Alejandro Posadas; ArgentinaFil: Moiraghi, Beatriz. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Pérez, Mariel Ana. Gobierno de la Provincia de Buenos Aires. Ministerio de Salud. Hospital Interzonal General de Agudos "prof. Dr. Rodolfo Rossi".; ArgentinaFil: Pavlovsky, Carolina. Fundación Para Combatir la Leucemia; ArgentinaFil: Varela, Ana Inés. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Ventriglia, Verónica. Hospital Nacional Profesor Alejandro Posadas; ArgentinaFil: Sánchez Ávalos, Julio César Américo. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Larripa, Irene Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; ArgentinaFil: Zalcberg, Ilana. Instituto Nacional de Câncer; BrasilFil: Mordoh, Jose. Fundación Cáncer; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Valent, Peter. Medical University of Vienna; AustriaFil: Bianchini, Michele. Fundación Cáncer; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Autologous t-cell activation fosters ABT-199 resistance in chronic lymphocytic leukemia: Rationale for a combined therapy with SYK inhibitors and anti-CD20 monoclonal antibodies

Fil: Elías, Esteban Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; Argentina. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires; ArgentinaFil: Almejún, María Belén. Universidad de Buenos Aires; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Colado, Ana. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Cordini, Gregorio. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires; ArgentinaFil: Vergara Rubio, Maricef. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Podaza, Enrique Arturo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Risnik, Denise Mariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; Argentina. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires; ArgentinaFil: Cabrejo, María. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires; ArgentinaFil: Fernández Grecco, Horacio. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires; ArgentinaFil: Bezares, Raimundo Fernando. Universidad de Buenos Aires; ArgentinaFil: Custidiano, María Del Rosario. Sanatorio Municipal Dr. Julio Méndez; ArgentinaFil: Sánchez Ávalos, Julio César Américo. Sanatorio Municipal Dr. Julio Méndez; ArgentinaFil: Vicente, Ángeles. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Dr. Teodoro Álvarez"; ArgentinaFil: Garate, Gonzalo Martín. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Borge, Mercedes. Instituto Alexander Fleming; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Giordano, Mirta Nilda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; Argentina. Hospital Alemán; ArgentinaFil: Gamberale, Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; Argentina. Hospital Aleman; Argentin

Sphingosine Kinase 1 Participates In The Activation, Proliferation And Survival Of Chronic Lymphocytic Leukemia Cells

Sphingosine kinases (SKs) have received the most attention as important enzymes in cancer biology. They participate in the regulation of bioactive sphingolipid metabolism by producing sphingosine-1 phosphate (S1P) which mediates several biological functions, including cell growth, differentiation, cell survival, migration, and angiogenesis among other tasks.1 S1P generation depends on the conversion of sphingosine to S1P, in a reaction catalyzed by two isoforms of SKs, SK1 and SK2, and its levels are tightly controlled via a rapid degradation by intracellular S1P lyases (S1PL) or dephosphorylated by S1P phosphatases.1 Once produced, S1P may function as an intracellular second messenger and/or can be exported outside the cells, where it binds to specific S1P receptors (S1PRs) and initiates downstream signaling pathways, in a paracrine or autocrine manner, in a process known as “inside-out” signaling.Fil: Almejún, María Belén. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Borge, Mercedes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Colado, Ana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Elías, Esteban Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Podaza, Enrique Arturo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Risnik, Denise Mariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: de Brasi, Carlos Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Stanganelli, Carmen Graciela. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex"; ArgentinaFil: Slavutsky, Irma Rosa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Cabrejo, María. Ciudad Autónoma de Buenos Aires. Sanatorio Municipal "Dr. Julio Méndez"; ArgentinaFil: Fernández Grecco, Horacio. Ciudad Autónoma de Buenos Aires. Sanatorio Municipal "Dr. Julio Méndez"; ArgentinaFil: Bezares, Raimundo Fernando. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Dr. Teodoro Álvarez"; ArgentinaFil: Cranco, Santiago. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Burgos, Rubén Ángel. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Sánchez Ávalos, Julio César Américo. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Oppezzo, Pablo. Instituto Pasteur de Montevideo; UruguayFil: Giordano, Mirta Nilda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Gamberale, Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; Argentin

Expression of Fcγ receptors type II (FcγRII) in chronic lymphocytic leukemia B cells [4]

We have read with interest the paper from Damle et al analyzing the surface membrane phenotype of B lymphocytes in chronic lymphocytic leukemia (B-CLL). The authors stated that the leukemic cells from all B-CLL patients evaluated (irrespective of immunoglobulin heavy chain (IgVH) gene mutational status) bear the phenotype of antigen-experienced B cells based, among other features, on the very low expression of Fcγ receptors type IIb (FcγRIIb, CD32), which is the main isoform of FcγRII in B lymphocytes.Fil: Gamberale, Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Geffner, Jorge Raúl. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Sanjurjo, Julieta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Fernandez Calloti, Paula X.. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Arrosagaray, Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Sánchez Ávalos, Julio César Américo. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires; ArgentinaFil: Giordano, Mirta Nilda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; Argentin

The Effect Of Fludarabine On Interferon-Gamma Production By Lymphoid Cells From Healthy Donors And Patients With B-Cell Chronic Lymphocytic Leukemia

Fludarabine treatment in patients with B-cell chronic lymphocytic leukemia (B-CLL) can trigger or exacerbate the development of autoimmune hemolytic anemia (AHA) through a currently illdefined mechanism. We here show that exposure of peripheral blood lymphocytes from healthy donors and B-CLL patients to fludarabine increases in vitro production of interferon-g, a key cytokine in the pathogenesis of AHA.Fil: Gamberale, Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex"; ArgentinaFil: Fernández Calotti, Paula. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex"; ArgentinaFil: Sánchez Ávalos, Julio César Américo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Alberto, Maria Fabiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex"; ArgentinaFil: Geffner, Jorge Raúl. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex"; ArgentinaFil: Giordano, Mirta Nilda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex"; Argentin

Biallelic deletion 13q14.3 in patients with chronic lymphocytic leukemia: Cytogenetic, FISH and clinical studies

Background and objective: Monoallelic deletion of 13q14.3 (13q14x1) is the most common abnormality in chronic lymphocytic leukemia (CLL). As a sole alteration, it predicts a favorable outcome. Biallelic 13q14.3 (13q14x2) deletion or concomitant 13q14x1/13q14x2 has been scarcely evaluated in the literature. We present the clinical, cytogenetic and fluorescence in situ hybridization (FISH) analysis of six CLL patients with normal karyotypes and 13q14x2 and their comparison to cases with 13q14x1 as a single abnormality. Patients and methods: A total of 103 CLL patients were studied. Cytogenetic and FISH analysis were performed on stimulated peripheral blood lymphocytes. Specific fluorescence DNA probes for CLL were used. Results: Six out of 103 (5.8%) patients showed normal karyotypes and 13q14x2. It was observed as a single alteration in one patient and combined with 13q14x1 in five cases. Biallelic clones were larger than monoallelic ones in 3/5 patients (60%). The comparison of clinical and hematological data between 13q14x1 and 13q14x2 groups showed progression of the disease in all 13q14x2 patients respect to 12/32 (37.5%) cases with 13q14x1 (P = 0.008), significant differences in the distribution by Rai stage (P = 0.042) and a tendency of a higher lactate dehydrogenase level in 13q14x2 patients (P = 0.054). Treatment free survival for 13q14x2 group was 28.5 months, shorter than those observed in patients with 13q14x1 alone (49 months). Conclusions: Our data would suggest that 13q14x2 could represent a more aggressive FISH anomaly than 13q14x1 alone, probably as a consequence of clonal evolution and/or due to the complete inactivation of this critical region by mean of more complex mechanisms. © 2008 The Authors.Fil: Chena, Christian. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex"; ArgentinaFil: Sánchez Ávalos, Julio César Américo. Instituto ‘Alexander Fleming'; ArgentinaFil: Bezares, Raimundo F.. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Dr. Teodoro Álvarez"; ArgentinaFil: Arrossagaray, Guillermo. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex"; ArgentinaFil: Turdó, Karina. Hospital Aeronautico; ArgentinaFil: Bistmans, Alicia. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Slavutsky, Irma Rosa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Investigaciones Hematológicas "Mariano R. Castex"; Argentin

In vitro susceptibility of CD4+ and CD8+ T cell subsets to fludarabine

Administration of the adenosine analogue fludarabine (FLU) in vivo induces a profound and prolonged T lymphopenia which mainly affects CD4+ cells. To better understand the mechanistic basis underlying this preferential depletion, we analyzed the in vitro susceptibility of T cell subsets to FLU-induced apoptosis. Contrasting with observations in vivo, our results showed that treatment of peripheral blood mononuclear cells with FLU induced a higher level of apoptosis in CD8+ than in CD4+ T lymphocytes. This increased sensitivity of CD8+ T cells to FLU was observed in samples from both, healthy donors and B cell chronic lymphocytic leukemia patients, and resulted in higher CD4:CD8 ratios in FLU-treated than in untreated cultures (P<0.01). Expression of factors involved in FLU transport and metabolism was then evaluated by quantitative real time-PCR in normal T cell subsets. It was found that mRNA levels of human equilibrative nucleoside transporter-1 nucleoside transporter were higher whereas deoxycytidine kinase and IMP/GMP selective 5′-nucleotidase mRNA levels were lower in CD4 + cells. However the dCK/cN-II ratio was 2-fold greater in CD8 + than in CD4+ T lymphocytes, which could account for the higher apoptosis levels observed in the CD8+ subset. These results favor the view that decreased CD4:CD8 ratios in FLU-treated patients should be attributed to differences in cell recovery and/or homing between T cell subsets. © 2003 Elsevier Inc. All rights reserved.Fil: Gamberale, Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Invest. Hematologicas "Mariano R. Castex". Departamento de Inmunologia y Medicina Experimental. Div.de Inmunologia Oncologica; ArgentinaFil: Galmarini, Carlos Maria. Faculté de Médécine Rockefeller; FranciaFil: Fernández Calotti, Paula. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Invest. Hematologicas "Mariano R. Castex". Departamento de Inmunologia y Medicina Experimental. Div.de Inmunologia Oncologica; ArgentinaFil: Jordheim, Lars. Faculté de Médécine Rockefeller; FranciaFil: Sánchez Ávalos, Julio César Américo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Clínicas General San Martín; ArgentinaFil: Dumontet, Charles. Faculté de Médécine Rockefeller; FranciaFil: Geffner, Jorge Raúl. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Invest. Hematologicas "Mariano R. Castex". Departamento de Inmunologia y Medicina Experimental. Div.de Inmunologia Oncologica; ArgentinaFil: Giordano, Mirta Nilda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Invest. Hematologicas "Mariano R. Castex". Departamento de Inmunologia y Medicina Experimental. Div.de Inmunologia Oncologica; Argentin

miRNome profiling of LSC-enriched CD34+CD38−CD26+ fraction in Ph+ CML-CP samples from Argentinean patients: a potential new pharmacogenomic tool

Chronic myeloid leukemia (CML) is a myeloid stem cell neoplasm characterized by an expansion of myeloid progenitor cells and the presence of BCR-ABL1 oncoprotein. Since the introduction of specific BCR-ABL1 tyrosine kinase inhibitors (TKI), overall survival has improved significantly. However, under long-term therapy patients may have residual disease that originates from TKI-resistant leukemic stem cells (LSC). In this work, we analyzed the miRNome of LSC-enriched CD34+CD38−CD26+ and normal hematopoietic stem cells (HSC) fractions obtained from the same chronic phase (CP) CML patients, and stem and progenitor cells obtained from healthy donors (HD) by next-generation sequencing. We detected a global decrease of microRNA levels in LSC-enriched CD34+CD38−CD26+ and HSC fractions from CML-CP patients, and decreased levels of microRNAs and snoRNAs from a genomic cluster in chromosome 14, suggesting a mechanism of silencing of multiple non-coding RNAs. Surprisingly, HSC from CML-CP patients, despite the absence of BCR-ABL1 expression, showed an altered miRNome. We confirmed by RT-qPCR that the levels of miR-196a-5p were increased more than nine-fold in CD26+ (BCR-ABL1+) vs. CD26− (BCR-ABL1−) CD34+CD38− fractions from CML-CP patients at diagnosis, and in silico analysis revealed a significant association to lipid metabolism and hematopoiesis functions. In the light of recent descriptions of increased oxidative metabolism in CML LSC-enriched fractions, these results serve as a guide for future functional studies that evaluate the role of microRNAs in this process. Metabolic vulnerabilities in LSCs open the road for new therapeutic strategies. This is the first report of the miRNome of CML-CP CD34+CD38− fractions that distinguishes between CD26+ (BCR-ABL1+) and their CD26− (BCR-ABL1-) counterparts, providing valuable data for future studies.Fil: Ruiz, María Sol. Fundación Cáncer. Centro de Investigaciones Oncológicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Sánchez, María Belén. Fundación Cáncer. Centro de Investigaciones Oncológicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Bonecker, Simone. Instituto Nacional de Cancer; BrasilFil: Furtado, Carolina. Instituto Nacional de Cancer; BrasilFil: Koile, Daniel Isaac. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Yankilevich, Patricio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigación en Biomedicina de Buenos Aires - Instituto Partner de la Sociedad Max Planck; ArgentinaFil: Cranco, Santiago. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Custidiano, María del Rosario. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Freitas, Josefina. Hospital Nacional Profesor Alejandro Posadas; ArgentinaFil: Moiraghi, Beatriz. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Pérez, Mariel Ana. Provincia de Buenos Aires. Ministerio de Salud. Hospital Interzonal de Agudos "Eva Perón"; ArgentinaFil: Pavlovsky, Carolina. Fundación Para Combatir la Leucemia; ArgentinaFil: Varela, Ana Inés. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; ArgentinaFil: Ventriglia, Verónica. Hospital Nacional Profesor Alejandro Posadas; ArgentinaFil: Sánchez Ávalos, Julio César Américo. Instituto Alexander Fleming; ArgentinaFil: Larripa, Irene Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Medicina Experimental. Academia Nacional de Medicina de Buenos Aires. Instituto de Medicina Experimental; ArgentinaFil: Zalcberg, Ilana. Instituto Nacional de Câncer; BrasilFil: Mordoh, Jose. Instituto Alexander Fleming; Argentina. Fundación Cáncer; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; ArgentinaFil: Valent, Peter. Universidad de Viena; AustriaFil: Bianchini, Michele. Fundación Cáncer; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin