Pseudomonas fluorescentes associadas à olerícolas sob sistema de produção orgânico.

Avaliou-se a diversidade de populações de Pseudomonas spp. fluorescentes associadas à alface, cenoura e pepino, cultivados em sistema orgânico. O delineamento experimental foi de blocos inteiramente casualizados, com três repetições. Foi incorporado ao solo anterior ao plantio, 20 t/ha de esterco bovino curtido e 1,5 t/ha de termofosfato. As amostras de solo foram separadas em ectorizosfera, rizoplano, endorizosfera e filoplano por olerícola. Os isolados bacterianos que apresentaram fluorescência sob luz UV foram selecionados e caracterizados conforme a morfologia de suas colônias, sendo que um isolado, de cada um dos grupos mais representativos quantitativamente, foi identificado pelo Sistema API 20NE. Foram selecionados 25 isolados, identificados como P. putida, das culturas de alface e cenoura para caracterização por RAPD. A análise fenotípica permitiu a identificação de alguns grupos de isolados associados à alface, cenoura e pepino. Existe uma alta diversidade de estirpes, revelada pela caracterização fenotípica e genotípica, associada às olerícolas estudadas, sob sistema orgânico de produção

Genetic variability among peanut accessions

O objetivo deste trabalho foi avaliar a variabilidade genética entre 29 acessos de amendoim (Arachis hypogaea L.), por meio de marcadores moleculares randômicos (DNA polimórfico amplificado ao acaso – RAPD). O ensaio molecular foi realizado com 31 iniciadores, dos quais 12 (39%) mostraram polimorfismo. Observou-se o total de 145 fragmentos amplificados, dos quais 35 (24%) foram polimórficos, com média de 4,67 fragmentos por iniciador e 1,13 fragmento polimórfico por iniciador. Pelo dendrograma, observou-se que os acessos foram separados em dois grupos com 89% de similaridade. Esta distribuição mostra a variabilidade existente entre os acessos das diferentes variedades botânicas, uma vez que acessos da subespécie fastigiata estão presentes nos dois grupos principais, e os acessos da subespécie hypogaea estão distribuídos pelos subgrupos A e B do grupo II do dendograma.The objective of this study was to evaluate the genetic variability among 29 accessions of peanut (Arachis hypogaea L.) by means of random molecular markers (random amplified polimorphic DNA – RAPD). The molecular assay was performed with 31 primers, of which 12 (39%) revealed polymorphism. It was observed a total of 145 amplified fragments, of which 35 (24%) were polymorphic, with an average of 4.67 fragments by primer and 1.13 polymorphic fragment by primer. It was observed through the dendrogram that the accessions were separated into two groups with 89% of similarity. This distribution shows the variability among the accessions of the different botanical varieties, since the accessions of subspecie fastigiata are present in two principal groups, and the accessions of subspecie hypogaea are distributed in subgroups A and B from dendrogram group II

Rhizosphere bacterial communities of potato cultivars evaluated through PCR-DGGE profiles

O objetivo deste trabalho foi determinar as alterações nos perfis de PCR-DGGE das comunidades bacterianas associadas à rizosfera de cultivares de batata, para obter informações para futuros estudos de avaliação de risco ambiental de plantas de batatas geneticamente modificadas. Foi conduzido experimento em casa de vegetação com cinco cultivares de batata (Achat, Bintje, Ágata, Monalisa e Asterix), cultivadas em vasos com solo de um sistema integrado de produção agroecológica. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso, em parcelas subdivididas, com cinco cultivares, três períodos amostrais e cinco repetições. As amostras de rizosfera foram coletadas em três diferentes épocas durante o desenvolvimento das plantas. O DNA dos microrganismos associados à rizosfera foi extraído, amplificado por PCR com uso de iniciadores universais para bactérias e analisados por DGGE. Foram observadas alterações, relacionadas à cultivar e à idade da planta, nos perfis das comunidades bacterianas associadas à rizosfera das diferentes cultivares. As diferenças entre as comunidades bacterianas foram maiores na fase inicial do crescimento das plantas, com tendência a diminuir no estágio final de desenvolvimento. Essa variação foi detectada na comunidade bacteriana das cinco cultivares estudadas. A caracterização da microbiota do solo pode ser parte de programas de melhoramento de plantas a ser utilizada em estudos de avaliação de risco ambiental de batatas geneticamente modificadas.The objective of this work was to determine the shifts on the PCR-DGGE profiles of bacterial communities associated to the rhizosphere of potato cultivars, in order to generate baseline information for further studies of environmental risk assessment of genetically modified potato plants. A greenhouse experiment was carried out with five potato cultivars (Achat, Bintje, Agata, Monalisa and Asterix), cultivated in pots containing soil from an integrated system for agroecological production. The experiment was conducted in a split plot randomized block design with five cultivars, three sampling periods and five replicates. Rhizosphere samples were collected in three sampling dates during plant development. DNA of rhizosphere microorganisms was extracted, amplified by PCR using bacterial universal primers, and analyzed through DGGE. Shifts on the rhizosphere bacterial communities associated to rhizosphere of different cultivars were related to both cultivar and plant age. Differences among rhizosphere bacterial communities were clearest at the earliest plant age, tending to decrease in later stages. This variation was detected among bacterial communities of the five tested cultivars. The characterization of soil microbial communities can be part of plant breeding programs to be used on studies of environmental risk assessment of genetically modified potatoes

Cowpea genetic variability analyzed by RAPD markers

O conhecimento da variabilidade genética e da relação entre diferentes acessos de caupi é importante para maximizar o uso dos recursos genéticos disponíveis. Esse trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genética em 45 acessos de caupi (Vigna unguiculata (L.) Walp.) oriundos do Brasil, EUA e Nigéria, por meio de marcadores RAPD. Foram encontrados 8 iniciadores polimórficos e um total de 48 bandas informativas. De acordo com os perfis polimórficos obtidos, foi observada a formação de quatro grupos genotípicos. Houve uma tendência de agrupamento em razão da origem dos acessos. A maioria dos acessos de variedades locais brasileiras pertence apenas a um grupo, o que sugere uma limitação da base genética. Vale ressaltar que nesse grupo não estavam presentes acessos da Nigéria considerados portadores de características agronômicas superiores, como, por exemplo, alta produtividade. RAPD é uma ferramenta eficiente, capaz de auxiliar a seleção de genótipos de caupi adaptados às diferentes condições edafo-climáticas brasileiras, com vistas ao aumento da produtividade e melhoria de outras características que atendam aos interesses regionais específicos.The knowledge on genetic variability and the relationship among different cowpea accesses is important to maximize resource use represented by available cowpea genotypes. The objective of this work was to determine the genetic variability among 45 cowpea (Vigna unguiculata (L.) Walp.) accesses from Brazil, USA and Niger, characterized by RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers. Eight polymorphic primers were identified, comprehending a total of 48 informative bands. Based on the obtained polymorphic profiles, four major clusters were formed. Clustering was mainly influenced by the genotype origin. Most accesses from Brazilian landraces belong to just one cluster, suggesting a limited genetic basis. It is worth noting that none of the genotypes from Niger considered as possessing superior agronomical traits, such as high productivity, was present in this cluster. RAPD shows to be an efficient tool, capable of assisting cowpea genotype selection adapted to Brazilian edaphoclimatic conditions, aiming at increasing productivity and improving other desirable characteristics to meet the needs of specific regional demands

Bacterial community as an indicator of genetically modified common bean effect on nontarget organisms

O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito do feijoeiro geneticamente modificado quanto à resistência ao Bean Golden Mosaic Vírus, BGMV (Olathe M1-4), sobre organismos não alvo. De um experimento implantado no campo, em delineamento inteiramente casualizado, com dois tratamentos (Olathe Pinto e evento elite Olathe M1-4), dois períodos amostrais (estádio V4 e R6) e dez repetições, obtiveram-se células bacterianas cultivadas e não cultivadas da rizosfera e do solo não rizosférico, para as quais se procedeu à extração de DNA total. A região V6–V8 do 16S rDNA foi amplificada para a comunidade bacteriana total, e também realizou-se amplificação com iniciadores específicos para o subgrupo alfa (α) do filo Proteobacteria a partir de cÚlulas nÒo cultivadas. Foram obtidos dendrogramas comparativos entre a variedade Olathe Pinto (convencional) e o evento elite Olathe M1-4 (geneticamente modificado) utilizando-se o coeficiente de Jaccard e o mÚtodo UPGMA (Unweighted pair-group method with arithmetic mean). Osáagrupamentos obtidos dos perfis de 16S rDNA PCR-DGGE indicam alteraþ§es na comunidade bacteriana da rizosfera em funþÒo da transformaþÒo das plantas sÒo mais notßveis nos perfis obtidos para alfa-proteobacteria. A origem das amostras e o estßgio de desenvolvimento das plantas afetam a comunidade bacteriana.The objective of this work was to evaluate the effect of genetically modified common bean for Bean Golden Mosaic Virus, BGMV, resistance (Olathe M1-4) on nontarget organisms. In a field experiment established in a completely randomized design with two treatments (Olathe Pinto cultivar and M1-4 Olathe elite event), two sampling periods (V4 and R6 stages) and ten replicates, cultivated and non-cultivated bacterial cells from rhizosphere soil and bulk soil were obtained, and their total DNA was extracted. The V6-V8 region of 16S rDNA was amplified for the whole bacterial community, and primers specific for the alpha (α) subgroup of the Proteobacteria phylum were obtained from uncultured cells and used for amplification. Using the Jaccard coefficient and UPGMA (Unweighted pair-group method with arithmetic mean), dendrograms comparing the conventional Olathe Pinto and the elite event Olathe M1-4 transgenic varieties were obtained. The clusters obtained from the 16S rDNA PCR-DGGE profiles indicate changes in the rhizosphere bacterial community in genetically modified plants, being more notable in the profiles obtained for alphaproteobacteria. Sample origin and plant development stages affect bacterial community profiles

Polymers as carriers for rhizobial inoculant formulations

O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência de misturas poliméricas de carboximetilcelulose (CMC) e amido, como veículos de inoculante para rizóbios, quanto à sua capacidade de manter células rizobianas viáveis e promover a nodulação em feijão-caupi (Vigna unguiculata). O delineamento experimental foi completamente casualizado, com três repetições. Quarenta diferentes composições poliméricas de carboximetilcelulose (CMC) e amido, compatibilizadas ou não com proporções de MgO ou ZnO, foram inicialmente avaliadas quanto à sua capacidade de manter células rizobianas viáveis pelo período de um mês. Posteriormente, veículos de inoculantes selecionados foram avaliados quanto à capacidade de manter células rizobianas viáveis pelo período de 165 dias, e seu desempenho como veículos de inoculantes foi comparado com os de inoculantes turfosos, em casa de vegetação. Células rizobianas sobreviveram melhor em misturas com 50–60% de CMC. Os agentes compatibilizantes não aumentaram a sobrevivência das células rizobianas após 30 dias de estocagem. A nodulação do feijão-caupi com o uso das misturas poliméricas não diferiu estatisticamente da nodulação com o uso da turfa. As misturas de CMC/amido, quando compatibilizadas com MgO (1%), são veículos eficientes para inoculantes rizobianos por até 165 dias de armazenamento.The aim of this work was to evaluate the efficiency of carboxymethyl cellulose (CMC) and starch blends as carrier materials of rhizobial inoculants regarding their capacity to maintain viable cells and promote cowpea (Vigna unguiculata) nodulation. The experimental design adopted was completely randomized, with three replicates. Forty different compositions of carboxymethyl cellulose (CMC) with starch, compatibilized or not with different proportions of MgO or ZnO, were evaluated regarding their ability of maintaining rhizobial viable cells during the storage period of one month at room temperature, in an initial screening. Thereafter, selected inoculant carrier blends were evaluated regarding their ability to maintain viable rhizobial cells for a period of 165 days, and their performance as inoculant carriers was compared to a peat-based inoculant carrier under greenhouse conditions. Rhizobial cells were better maintained in blends containing 50–60% CMC. Compatibilizing agents did not increase survival of rhizobial cells for 30 days of storage. The cowpea nodulation of polymer blends was statistically the same of peat-based inoculants. CMC/starch polymer blends are efficient carriers to rhizobial inoculants for up to 165 days of storage, when compatibilized with MgO (1%)

Agronomic efficiency of rhizobia strains in cowpea cultivated in the Pre‑Amazon region, in Maranhão state

O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência agronômica de estirpes de rizóbio para inoculação em campo, da cultivar BRS Guariba de feijão‑caupi. Os experimentos foram realizados em duas áreas em Santa Luzia do Paruá, MA, na região de Pré‑Amazônia, em 2009. Foram testadas as estirpes de Bradyrhizobium BR 3299, BR 3262, e INPA 03‑11B, um controle absoluto e um tratamento nitrogenado (80 kg ha-1 de N). As  avaliações foram realizadas aos 30 e 50  dias após a emergência (DAE) das plantas. Aos 65  DAE, foi avaliada a produtividade de grãos. Foram avaliados número e massa de matéria seca de nódulos, massa de matéria seca da parte aérea, eficiência relativa e acúmulo de N na parte aérea. As estirpes proporcionaram maior número e massa de matéria seca de nódulos, bem como maior produtividade em comparação ao controle absoluto, sem inoculação e sem ureia, nas duas áreas. Para massa de matéria seca da parte aérea, eficiência relativa e acúmulo de N na parte aérea, a estirpe BR  3299 diferiu significativamente do controle absoluto, aos 30 DAE, em uma das propriedades. O feijão‑caupi responde positivamente à inoculação com as estirpes, especialmente a BR 3299.     The  objective  of  this  work  was  to  evaluate  the  agronomic  efficiency  of rhizobia strains for inoculation, in field conditions, of the cowpea BRS Guariba cultivar. Experiments were carried out in two areas in Santa Luzia do Paruá, Maranhão state, Brazil, in the Pre‑Amazon region, in 2009. The BR  3299, BR 3262, INPA 03‑11B Bradyrhizobium strains, an absolute control, and a nitrogen treatment (80 kg ha-1 N) were tested. At 30 and 50 days after emergence (DAE) of plants assesments were made. At 65 DAE, grain yield was evaluated. The number and dry weight of nodules, shoot dry mass, relative efficiency, and N accumulation in shoots were evaluated. All strains provided higher values for number and dry weight of nodules, and higher productivity in comparsion to the absolute control, without inoculation and urea, in the two areas. Regarding shoot dry matter, relative efficiency, and N accumulation in shoots, BR 3299 differed significantly from the absolute control, at 30 DAE, in one of the farms. Cowpea yield responds positively to inoculation with strains, especially strain BR 3299

Evaluation of biosolid fed by municipal waste-water sludge as a fertilizer in kale

O objetivo deste trabalho foi avaliar o biossólido e proveniente da estação de tratamento de águas servidas domiciliares, como adubo no cultivo da couve (Brassica oleraceae var. acephala, grupo Georgia). O trabalho foi em delineamento de blocos ao acaso, com três tratamentos de adubação, esterco bovino, biossólido e uréia, com quatro repetições. Amostras de solo de cada tratamento foram analisadas quanto a parâmetros químicos, microbiológicos e parasitológicos. Os níveis de metais pesados encontravam-se abaixo dos permitidos pela legislação internacional. Após 54 dias da incorporação do biossólido ao solo, os coliformes fecais eram praticamente nulos e, a partir dos 60 dias, não foram mais encontradas amostras positivas com ovos de helmintos, apesar do alto grau de contaminação inicial. As plantas adubadas com biossólido, na maior dose, comparadas ao esterco, apresentaram maior produtividade e menores teores de N total nas folhas. O biossólido foi classificado como B, pela concentração de coliformes fecais apresentada, tornando-o impróprio para aplicação em culturas de contato primário como as hortaliças. Os resultados indicam a importância de selecionar indicadores de sanidade que permitam o uso seguro deste adubo.This work aimed to evaluate the biosolid from the municipal waste-water treatment, as fetilizer in kale (Brassica oleraceae var. acephala, group Georgia). The experiment was in a randomized complete block design with three fertilization treatments, cattle manure, biosolid and urea, and four replications. Soil samples from each treatment were chemically, microbiologically and parasitologically analyzed. The heavy metal levels were below those recommended by the international legislation. After 45 days of incorporation of the biosolid into the soil, the fecal coliforms were almost undetectable. After 60 days, none of the samples showed the presence of eggs of parasitic worms, despite the high initial number. The plants fertilized with biosolid, at the higher level, showed greater productivity and lower N content in leaf tissue than those fertilized with cattle manure. The biosolid was classified as Class B, according to concentration of fecal coliforms, and is not appropriate for cultures with primary contact, as vegetables. The results show the importance to select indicators of sanity which provide biosolid safety use

Agronomic efficiency of rhizobia strains in cowpea cultivated in the Pre‑Amazon region, in Maranhão state

O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência agronômica de estirpes de rizóbio para inoculação em campo, da cultivar BRS Guariba de feijão‑caupi. Os experimentos foram realizados em duas áreas em Santa Luzia do Paruá, MA, na região de Pré‑Amazônia, em 2009. Foram testadas as estirpes de Bradyrhizobium BR 3299, BR 3262, e INPA 03‑11B, um controle absoluto e um tratamento nitrogenado (80 kg ha-1 de N). As  avaliações foram realizadas aos 30 e 50  dias após a emergência (DAE) das plantas. Aos 65  DAE, foi avaliada a produtividade de grãos. Foram avaliados número e massa de matéria seca de nódulos, massa de matéria seca da parte aérea, eficiência relativa e acúmulo de N na parte aérea. As estirpes proporcionaram maior número e massa de matéria seca de nódulos, bem como maior produtividade em comparação ao controle absoluto, sem inoculação e sem ureia, nas duas áreas. Para massa de matéria seca da parte aérea, eficiência relativa e acúmulo de N na parte aérea, a estirpe BR  3299 diferiu significativamente do controle absoluto, aos 30 DAE, em uma das propriedades. O feijão‑caupi responde positivamente à inoculação com as estirpes, especialmente a BR 3299.     The  objective  of  this  work  was  to  evaluate  the  agronomic  efficiency  of rhizobia strains for inoculation, in field conditions, of the cowpea BRS Guariba cultivar. Experiments were carried out in two areas in Santa Luzia do Paruá, Maranhão state, Brazil, in the Pre‑Amazon region, in 2009. The BR  3299, BR 3262, INPA 03‑11B Bradyrhizobium strains, an absolute control, and a nitrogen treatment (80 kg ha-1 N) were tested. At 30 and 50 days after emergence (DAE) of plants assesments were made. At 65 DAE, grain yield was evaluated. The number and dry weight of nodules, shoot dry mass, relative efficiency, and N accumulation in shoots were evaluated. All strains provided higher values for number and dry weight of nodules, and higher productivity in comparsion to the absolute control, without inoculation and urea, in the two areas. Regarding shoot dry matter, relative efficiency, and N accumulation in shoots, BR 3299 differed significantly from the absolute control, at 30 DAE, in one of the farms. Cowpea yield responds positively to inoculation with strains, especially strain BR 3299