397 research outputs found

    HIV-2: Testing Specificities

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    Improving estimates of water demand at scheme level using knowledge on farmers' practices

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    International audienceAccurate estimation of water demand at the irrigation scheme scale is a key requirement for water management, which is made difficult by the large diversity of crops and production systems. The main objective of this study was to estimate irrigation water demand at the farm scale, taking different types of knowledge into account: (i) database study, where water demand is supposed to be the supply (L0); (ii) actual cropping pattern (L1),; (iii) actual irrigation techniques and cropping pattern (L2); and (iv) actual irrigation practices, actual irrigation techniques, and cropping pattern (L3). Farm typology makes easy this estimation as it takes into account various farm characteristics. Firstly, a farm typology was established based on 115 farms surveyed in the irrigation scheme of Borj Toumi Toungar (Tunisia), selected for the study. Secondly, climatic crop water irrigation requirements were estimated using the agro-meteorological water balance model Pilote. Typology results were used to estimate water demand at the scale of family farms taking into account different levels of knowledge Six classes of farming areas were identified based on irrigation subsystems, cropping pattern (fruit tree area, cropping vegetable area and field crop area), intensification crop level and cropped surface. Results showed that supply could not entirely cover the climatic water demand. However, it could nearly meet actual water demand at the farm scale. According to the water demand estimation at different levels, results showed that there were few changes in water demand at farm scale when moving from L1 to L2. At the opposite, actual water demand (L3) represented about half the climatic water demand (L2). Calculations based on farm classes highlighted the importance of actual farm practices. Within the same class, the difference between water demand estimation at different levels of knowledge was remarkable. Network rehabilitation is thus necessary to enable farmers to increase water delivered to crops and limit water stress; the collective network was conceived to deliver a flow of 0.34 l/s/ha in this sector. Given changes in farming and varietal choices, this flow proved insufficient to face the climatic water demand

    Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) proviral DNA load in purified CD4+ cells by LightCycler(® )Real-time PCR

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    BACKGROUND: The human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) proviral DNA persists in infected cells, even after prolonged successful HAART. In the present study, a relative quantification assay of HIV-1 proviral DNA by LightCycler(® )real-time PCR based on SYBR Green I detection was developed in comparison to the number of purified CD4+ cells as estimated by the quantification of the β-globin gene. METHODS: The ability of the designed gag primers to quantify HIV-1 Group M and the PCR efficiency were assessed on HIV-1 reference isolate subtypes A, B, C and D. The 8E5 cell line containing a single defective copy of HIV-1 proviral DNA was used as a standard for both the HIV-1 target gene and the β-globin reference gene. The assay was applied on thirty consecutive patient samples received for RNA viral load determinations and on retrospective samples from fifteen patients undergoing 2 years of structured treatment interruption (STI). RESULTS: The lower limit of quantification was 50 HIV-1 DNA proviral copies per CD4+ cell sample. The dynamic range was from 50 to 10(6 )HIV-1 DNA copies per CD4+ cell sample with intra- and inter-assay coefficients of variability ranging from 3.1% to 37.1%. The β-globin reference gene was quantified down to a limit of 1.5 pg of DNA/μl (approximately 5 cells) with intra- and interassay coefficients of variability ranging from 1.8% to 21%. DNA proviral load varies widely among HIV-1 infected patients. Proviral load and plasma viral load rebound were high in STI patients who took longer to achieve an undetectable plasma viral load under therapy. A statistically significant correlation was observed between DNA proviral load and RNA steady state viral load in STI patients (p-value = 0,012). CONCLUSION: We have developed a fast, sensitive and specific relative quantification assay of HIV-1 proviral DNA in purified CD4+ cells. The assay enables the monitoring of HIV-1 proviral load, which may be useful to monitor therapy efficacy especially in patients with undetectable plasma RNA viral load, and allows the exploration of viral reservoirs

    Link between New Versions of the Hierarchical Reference Theory of Liquids and of the Non Perturbative Renormalization Group in Statistical Field Theory

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    I propose a new version of the Hierarchical Reference Theory of liquids. Two formalisms, one in the grand canonical ensemble, the other in the framework of statistical field theory are given in parallel. In the latter the theory is an avatar of a new version of the non perturbative renormalization group (J. Phys. A : Math. Gen. \textbf{42}, 225004 (2009)). The flow of the Wilsonian action as well as that of the effective average action of Wetterich are derived and a simple relation between the two functionals is established. The standard Hierarchical Reference Theory for liquids (\textit{Adv. Phys.} \textbf{44}, 211 (1995)) is recovered for a sharp infra-red cut-off of the propagato

    Le SIG, un outil de gestion de l'eau dans un périmètre irrigué: cas du secteur S7 au Gharb, Maroc

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    International audienceDepuis un siècle, la création de réseaux collectifs d'irrigation a été un moyen au service de la puissance publique pour atteindre ses objectifs de politique agricole et d'aménagement du territoire. En 1961, l'office national des irrigations s'est fixé une doctrine de l'intervention en matière de développement hydro agricole : priorité à la grande hydraulique, création de grands périmètres irrigués, mise au point d'un modèle d'aménagement, introduction des cultures sucrières et du contrat de cultures entre l'Etat et les agriculteurs, création de structures locales d'intervention plus proches des agriculteurs (les centres de mise en valeur). Ce modèle technique de l'aménagement hydro-agricole, notamment dans le périmètre irrigué du Gharb, résolvait, avec élégance, le problème majeur de l'articulation et de la gestion de nombreuses données dans un aménagement intégré : satisfaction des besoins en eau, disposition des cultures et des propriétés de façon à permettre le respect de l'assolement préconisé et la distribution des doses d'eau appropriées aux besoins des cultures. Le début des années1990 a été marqué par le désengagement de l'Etat du suivi de la gestion des périmètres irrigués et la libéralisation des assolements. Ainsi, libres dans leurs choix de production, les agriculteurs ont transformé leur système de production pour faire face à la nouvelle conjoncture économique (signature des accords de libre échange avec l'Europe et les USA, etc.). Dans ce nouveau contexte, le rôle des offices régionaux de mise en valeur agricole (Ormva) s'est limité à la prestation du service de vente de l'eau d'irrigation, de la gestion du réseau d'irrigation et de l'encadrement des agriculteurs. Les Ormva, se sont trouvés incapables de suivre la quasi-totalité des agriculteurs faisant partie de leur zone d'action. Cela est dû d'une part, à l'immensité des périmètres irrigués et, d'autre part, au manque de moyens humains et logistiques mis à la disposition des Ormva. La représentation cartographique reste le meilleur outil de la présentation de l'espace, mais pour la rendre dynamique, et en faire un outil de la création de dialogue entre les acteurs il faut lui donner un caractère dynamique. Une première analyse du système d'information de l'Ormva du Gharb a montré l'existence de nombreuses informations sur les cultures pratiquées, les consommations en eau qui peuvent générer de la connaissance sur ce qui se passe réellement sur le périmètre, mais ces informations sont dispersées dans les différents services, entre lesquels la circulation de ces données est presque inexistante. Ces données ne sont pas exploitées, ni vérifiées à cause de la difficulté de l'outil de gestion des données mis en place par l'Ormva et de l'immensité de l'effectif des détenteurs de codes (agriculteurs). Pour faire face à cette situation, la mise en place d'un dispositif d'observation territorial demeure une démarche indispensable pour la gestion des périmètres irrigués. Pour surmonter le problème d'accès à l'information, il est préconisé de mettre en place une cellule d'observation, qui sera formée des agents de plusieurs départements de l'Ormva, ce qui facilitera la disponibilité, la fluidité, le traitement des données et la circulation de l'information
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