23 research outputs found
ΠΠΊΠ»Π°Π΄ Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ²ΡΠ·ΡΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π² Π±ΠΈΠΎΠ΄ΠΎΡΡΡΠΏΠ½ΠΎΡΡΡ Π»Π΅ΠΊΠ°ΡΡΡΠ²: ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄Ρ Ρ Π΅ΠΌΠΎΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΠΊΠΈ
A review, based mainly on own publications, is devoted to methods of investigation of βstructure-bioavailabilityβ relationships. The first part of this review contains information about classification of hydrogen bond descriptors, original 2D hydrogen bond thermodynamic descriptors, program HYBOT, original 3D hydrogen bonding potentials, original hydrogen bond surface area descriptors. The second part includes the results of applications of the above mentioned of hydrogen bond descriptors for prediction of bioavailability components such as lipophilicity, solubility in water and in physiological fluids, absorption and blood-brain barrier permeability.ΠΠ±Π·ΠΎΡ, ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡΠΉ ΠΏΡΠ΅ΠΈΠΌΡΡΠ΅ΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΠΎ Π½Π° ΡΠΎΠ±ΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΡΡ
ΠΏΡΠ±Π»ΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΡΡ
, ΠΏΠΎΡΠ²ΡΡΡΠ½ Π²ΡΡΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΡ ΠΊΠΎΠ»ΠΈΡΠ΅ΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΡΡ
ΡΠ²ΡΠ·Π΅ΠΉ βΡΡΡΡΠΊΡΡΡΠ°-Π±ΠΈΠΎΠ΄ΠΎΡΡΡΠΏΠ½ΠΎΡΡΡβ. Π ΠΏΠ΅ΡΠ²ΠΎΠΉ ΡΠ°ΡΡΠΈ ΠΎΠ±Π·ΠΎΡΠ° ΠΎΠΏΠΈΡΡΠ²Π°Π΅ΡΡΡ ΡΡ
Π΅ΠΌΠ° ΠΊΠ»Π°ΡΡΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΠΈ Π΄Π΅ΡΠΊΡΠΈΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡΠΎΠ΄Π½ΡΡ
ΡΠ²ΡΠ·Π΅ΠΉ, ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΡΠΈΠ³ΠΈΠ½Π°Π»ΡΠ½ΡΡ
2D ΡΠ΅ΡΠΌΠΎΠ΄ΠΈΠ½Π°ΠΌΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
Π΄Π΅ΡΠΊΡΠΈΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡΠΎΠ΄Π½ΡΡ
ΡΠ²ΡΠ·Π΅ΠΉ, ΡΠ°Π·ΡΠ°Π±ΠΎΡΠΊΠ° ΠΊΠΎΠΌΠΏΡΡΡΠ΅ΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΡ HYBOT, ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΡΠΈΠ³ΠΈΠ½Π°Π»ΡΠ½ΡΡ
ΡΡΡΡ
ΠΌΠ΅ΡΠ½ΡΡ
ΠΏΠΎΡΠ΅Π½ΡΠΈΠ°Π»ΠΎΠ² Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡΠΎΠ΄Π½ΡΡ
ΡΠ²ΡΠ·Π΅ΠΉ ΠΈ HYBOT PSA Π΄Π΅ΡΠΊΡΠΈΠΏΡΠΎΡΠΎΠ². ΠΠΎ Π²ΡΠΎΡΠΎΠΉ ΡΠ°ΡΡΠΈ ΠΎΠ±Π·ΠΎΡΠ° ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΡΠ°Π²Π»Π΅Π½Ρ ΠΊΠΎΠ½ΠΊΡΠ΅ΡΠ½ΡΠ΅ ΡΠ΅Π·ΡΠ»ΡΡΠ°ΡΡ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π²ΡΡΠ΅ΡΠΊΠ°Π·Π°Π½Π½ΡΡ
Π΄Π΅ΡΠΊΡΠΈΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² ΠΏΡΠΈ ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π½ΠΈΠΈ QSAR ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»Π΅ΠΉ ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΈΡ ΡΠ²ΠΎΠΉΡΡΠ², ΡΠ²ΡΠ·Π°Π½Π½ΡΡ
Ρ Π±ΠΈΠΎΠ΄ΠΎΡΡΡΠΏΠ½ΠΎΡΡΡΡ: Π»ΠΈΠΏΠΎΡΠΈΠ»ΡΠ½ΠΎΡΡΠΈ, ΡΠ°ΡΡΠ²ΠΎΡΠΈΠΌΠΎΡΡΠΈ Π² Π²ΠΎΠ΄Π΅ ΠΈ ΡΠΈΠ·ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
ΡΡΠ΅Π΄Π°Ρ
, Π°Π±ΡΠΎΡΠ±ΡΠΈΠΈ ΠΈ ΠΏΡΠΎΠ½ΠΈΡΠ°Π΅ΠΌΠΎΡΡΠΈ Π»Π΅ΠΊΠ°ΡΡΡΠ² ΡΠ΅ΡΠ΅Π· Π³Π΅ΠΌΠ°ΡΠΎΡΠ½ΡΠ΅ΡΠ°Π»ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ Π±Π°ΡΡΠ΅Ρ
QSAR ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Π±Π»ΠΎΠΊΠ°Π΄Ρ NMDA ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠ° ΠΏΠΎΠ»ΠΈΡΠ°ΡΠΌΠ°ΠΊΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΠΌΠΈ ΡΠΎΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½ΠΈΡΠΌΠΈ Π½Π° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ ΠΏΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄Π½ΡΡ ΠΊΠ°ΡΠ±Π°Π·ΠΎΠ»Π° ΠΈ 1-Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Π΄Π°ΠΌΠ°Π½ΡΠ°Π½Π°
We investigated 14 compounds causing the NMDA receptor blockage. These polypharmacophoric compounds are conjugates of carbazole, tetrahydrocarbazole and 1-aminoadamantane derivatives. As a measure of biological activity of the compound tested, the IC50 (ΞΌM) value, reflecting 50% inhibition of [H3] MK-801 binding to the NMDA receptor, was used. The regression model with satisfactory statistical characteristics was obtained as a result of the QSAR modeling based on the Gaussian process.Π ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ΅ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½ ΡΡΠ΄ ΠΈΠ· 14 ΡΠΎΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½ΠΈΠΉ, Π²ΡΠ·ΡΠ²Π°ΡΡΠΈΡ
Π±Π»ΠΎΠΊΠ°Π΄Ρ NMDA ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠ°. ΠΡΠΈ ΠΏΠΎΠ»ΠΈΡΠ°ΡΠΌΠ°ΠΊΠΎΡΠΎΡΠ½ΡΠ΅ ΡΠΎΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½ΠΈΡ ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΡΠ°Π²Π»ΡΡΡ ΡΠΎΠ±ΠΎΠΉ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠ³Π°ΡΡ ΠΏΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄Π½ΡΡ
ΠΊΠ°ΡΠ±Π°Π·ΠΎΠ»Π°, ΡΠ΅ΡΡΠ°Π³ΠΈΠ΄ΡΠΎΠΊΠ°ΡΠ±Π°Π·ΠΎΠ»Π° ΠΈ 1-Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Π΄Π°ΠΌΠ°Π½ΡΠ°Π½Π°. Π ΠΊΠ°ΡΠ΅ΡΡΠ²Π΅ ΠΌΠ΅ΡΡ Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠΉ Π°ΠΊΡΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡΠΈ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ Π²Π΅Π»ΠΈΡΠΈΠ½Ρ IC50 (ΠΌΠΊΠ) β ΠΊΠΎΠ½ΡΠ΅Π½ΡΡΠ°ΡΠΈΡ, ΠΏΡΠΈ ΠΊΠΎΡΠΎΡΠΎΠΉ Π½Π°Π±Π»ΡΠ΄Π°Π΅ΡΡΡ 50% ΡΠΎΡΠΌΠΎΠΆΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΡΠ΅ΠΌΡΠΌ ΡΠΎΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ ΡΠ²ΡΠ·ΡΠ²Π°Π½ΠΈΡ [H3]MK-801 Ρ NMDA ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠΎΠΌ. Π ΡΠ΅Π·ΡΠ»ΡΡΠ°ΡΠ΅ ΠΏΡΠΎΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΡ QSAR ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π½Π° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ ΠΠ°ΡΡΡΠΎΠ²ΡΠΊΠΎΠ³ΠΎ ΠΏΡΠΎΡΠ΅ΡΡΠ° ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½Π° ΡΠ΅Π³ΡΠ΅ΡΡΠΈΠΎΠ½Π½Π°Ρ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»Ρ Ρ ΡΠ΄ΠΎΠ²Π»Π΅ΡΠ²ΠΎΡΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠΌΠΈ ΡΡΠ°ΡΠΈΡΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΌΠΈ Ρ
Π°ΡΠ°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΡΡΠΈΠΊΠ°ΠΌΠΈ
ΠΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ° HYBOT 3D MF ΠΈ Π΅Ρ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Π² CoMFA
The program βHYBOT 3D MFβ based on the potential β6-8β modified by using HYBOT hydrogen bonding factors has been developed. An integration with βQSAR and Advanced CoMFAβ module of the SYBYL-X is performed by set of macros written in SPL. A full working version of the program is available at http://www.ibmc.msk.ru/HYBOT3D. For a number of sets of chemical compounds having pronounced differences in groups with the hydrogen bonding potential, the use of HYBOT 3D MF fields makes it possible to improve the predictive power of models created by the CoMFA technology.ΠΠ° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ ΠΌΠΎΠ΄ΠΈΡΠΈΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ Ρ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ ΡΠ°ΠΊΡΠΎΡΠΎΠ² Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ²ΡΠ·ΡΠ²Π°Π½ΠΈΡ HYBOT ΠΏΠΎΡΠ΅Π½ΡΠΈΠ°Π»Π° β6-8β ΡΠ°Π·ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π½Π° ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ° βHYBOT 3D MFβ. ΠΠ»Ρ ΠΈΠ½ΡΠ΅Π³ΡΠ°ΡΠΈΠΈ ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΡ Ρ ΠΌΠΎΠ΄ΡΠ»Π΅ΠΌ βQSAR and Advanced CoMFAβ ΠΏΠ°ΠΊΠ΅ΡΠ° SYBYL-Π₯ ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π½ Π½Π°Π±ΠΎΡ ΠΌΠ°ΠΊΡΠΎΡΠΎΠ², Π½Π°ΠΏΠΈΡΠ°Π½Π½ΡΡ
Π½Π° SPL. ΠΠΎΠ»Π½ΠΎΡΠ΅Π½Π½Π°Ρ Π²Π΅ΡΡΠΈΡ ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΡ Π΄ΠΎΡΡΡΠΏΠ½Π° ΠΏΠΎ Π°Π΄ΡΠ΅ΡΡ http://www.ibmc.msk.ru/HYBOT3D. ΠΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΎ, ΡΡΠΎ Π΄Π»Ρ ΡΡΠ΄Π° Π½Π°Π±ΠΎΡΠΎΠ² Ρ
ΠΈΠΌΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
ΡΠΎΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½ΠΈΠΉ, ΠΈΠΌΠ΅ΡΡΠΈΡ
Π²ΡΡΠ°ΠΆΠ΅Π½Π½ΡΠ΅ ΡΠ°Π·Π»ΠΈΡΠΈΡ Π² ΡΠ°ΡΡΠΈ Π³ΡΡΠΏΠΏ Ρ ΠΏΠΎΡΠ΅Π½ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡΡΡ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠ²ΡΠ²Π°ΡΡ Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡΠΎΠ΄Π½ΡΠ΅ ΡΠ²ΡΠ·ΠΈ, ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠΎΠ»Π΅ΠΉ HYBOT 3D MF ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΠ΅Ρ ΡΠ»ΡΡΡΠΈΡΡ ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΠΊΠ°Π·Π°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΡ ΡΠΈΠ»Ρ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»Π΅ΠΉ, ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
ΠΏΠΎ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ CoMFA
MOLTRA-II. ΠΠΎΠ²ΡΠ΅ Π΄Π΅ΡΠΊΡΠΈΠΏΡΠΎΡΡ Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΡΠ²ΡΠ·ΠΈ
The program MOLTRA-II, created on the basis of the CHEmical Databases management system CHED, is supplemented by the possibility of calculating new descriptors based on the three-dimensional structure and hydrogen bond parameters. The program calculates PSA descriptors (Polar Surface Area), OSA (Optimal Structure Area) and energy of the hydrogen bond.ΠΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ° MOLTRA-II, ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π½Π½Π°Ρ Π½Π° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ ΡΠΈΡΡΠ΅ΠΌΡ ΡΠΏΡΠ°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΡ Ρ
ΠΈΠΌΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΌΠΈ Π±Π°Π·Π°ΠΌΠΈ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
CHED, Π΄ΠΎΠΏΠΎΠ»Π½Π΅Π½Π° Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡΡΡ ΡΠ°ΡΡΡΡΠ° Π½ΠΎΠ²ΡΡ
Π΄Π΅ΡΠΊΡΠΈΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² Π½Π° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ ΡΡΡΡ
ΠΌΠ΅ΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΡΡΡΠΊΡΡΡΡ ΠΈ ΠΏΠ°ΡΠ°ΠΌΠ΅ΡΡΠΎΠ² Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΡΠ²ΡΠ·ΠΈ. ΠΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ° ΡΠ°ΡΡΡΠΈΡΡΠ²Π°Π΅Ρ Π΄Π΅ΡΠΊΡΠΈΠΏΡΠΎΡΡ PSA (Polar Surface Area), OSA (Optimal Structure Area) ΠΈ ΡΠ½Π΅ΡΠ³ΠΈΡ Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΡΠ²ΡΠ·ΠΈ
ΠΠΎΠΌΠΏΡΡΡΠ΅ΡΠ½Π°Ρ ΠΎΡΠ΅Π½ΠΊΠ° ΡΠ΅Π»Π΅ΠΊΡΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡΠΈ ΠΈΠ½Π³ΠΈΠ±ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΌΡΡΠΊΠ°ΡΠΈΠ½ΠΎΠ²ΡΡ ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² M1-M4
A set of models for preliminary estimation of the inhibition constant values of potential ligands for the 4 acetylcholine muscarinic receptors M1-M4 was developed. The study uses an information about three-dimensional structure of human M1, M2 and M4 receptors, as well as the M3 receptor model, constructed by homology based on the structure of the rat M3 receptor. The Ki values for 42 compounds were obtained from the sources. Modeling of βprotein-ligandβ complexes was performed using molecular docking and molecular dynamics procedures. The component energy characteristics of the complexes were calculated from data obtained from simulation of molecular dynamics by the MM-PBSA/MM-GBSA methods. These characteristics were used as independent variables to construct the linear regression equations for pKi value predicting. The equations obtained for each receptors allow us to predict pKi with an average accuracy of 0.65 logarithmic units.Π Π°Π·ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π½ Π½Π°Π±ΠΎΡ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»Π΅ΠΉ Π΄Π»Ρ ΠΏΡΠ΅Π΄Π²Π°ΡΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΎΡΠ΅Π½ΠΊΠΈ Π·Π½Π°ΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠ°Π½ΡΡ ΠΈΠ½Π³ΠΈΠ±ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ (Ki) ΠΏΠΎΡΠ΅Π½ΡΠΈΠ°Π»ΡΠ½ΡΡ
Π»ΠΈΠ³Π°Π½Π΄ΠΎΠ² ΠΊ ΡΠ΅ΡΡΡΠ΅ΠΌ Π°ΡΠ΅ΡΠΈΠ»Ρ
ΠΎΠ»ΠΈΠ½ΠΎΠ²ΡΠΌ ΠΌΡΡΠΊΠ°ΡΠΈΠ½ΠΎΠ²ΡΠΌ ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠ°ΠΌ Π1-Π4. Π ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ΅ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½Ρ ΡΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΡ ΠΎ ΡΡΡΡ
ΠΌΠ΅ΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΡΡΡΠΊΡΡΡΠ΅ ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² ΡΠ΅Π»ΠΎΠ²Π΅ΠΊΠ° Π1, M2 ΠΈ Π4, Π° ΡΠ°ΠΊΠΆΠ΅ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»Ρ ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠ° Π3, ΠΏΠΎΡΡΡΠΎΠ΅Π½Π½Π°Ρ ΠΏΠΎ Π³ΠΎΠΌΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ Π½Π° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ ΡΡΡΡΠΊΡΡΡΡ ΠΊΡΡΡΠΈΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠ° Π3. ΠΠ½Π°ΡΠ΅Π½ΠΈΡ Ki Π΄Π»Ρ 42 ΡΠΎΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½ΠΈΠΉ Π²Π·ΡΡΡ ΠΈΠ· Π»ΠΈΡΠ΅ΡΠ°ΡΡΡΠ½ΡΡ
ΠΈΡΡΠΎΡΠ½ΠΈΠΊΠΎΠ². ΠΠ»Ρ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠΎΠ² βΠ±Π΅Π»ΠΎΠΊ-Π»ΠΈΠ³Π°Π½Π΄β ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ ΠΏΡΠΎΡΠ΅Π΄ΡΡΡ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π΄ΠΎΠΊΠΈΠ½Π³Π° ΠΈ ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΡΡΡΠ΅ΠΉ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎΠΉ Π΄ΠΈΠ½Π°ΠΌΠΈΠΊΠΈ. ΠΠ° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
, ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½Π½ΡΡ
Π² Ρ
ΠΎΠ΄Π΅ ΡΠΈΠΌΡΠ»ΡΡΠΈΠΈ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎΠΉ Π΄ΠΈΠ½Π°ΠΌΠΈΠΊΠΈ Ρ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠ² MM-PBSA/MM-GBSA, ΡΠ°ΡΡΡΠΈΡΠ°Π½Ρ ΠΏΠΎΠΊΠΎΠΌΠΏΠΎΠ½Π΅Π½ΡΠ½ΠΎ ΡΠ½Π΅ΡΠ³Π΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠ΅ Ρ
Π°ΡΠ°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΡΡΠΈΠΊΠΈ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠΎΠ², ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ Π±ΡΠ»ΠΈ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½Ρ Π² ΠΊΠ°ΡΠ΅ΡΡΠ²Π΅ Π½Π΅Π·Π°Π²ΠΈΡΠΈΠΌΡΡ
ΠΏΠ΅ΡΠ΅ΠΌΠ΅Π½Π½ΡΡ
Π΄Π»Ρ ΠΏΠΎΡΡΡΠΎΠ΅Π½ΠΈΡ ΡΡΠ°Π²Π½Π΅Π½ΠΈΠΉ Π»ΠΈΠ½Π΅ΠΉΠ½ΠΎΠΉ ΡΠ΅Π³ΡΠ΅ΡΡΠΈΠΈ Ρ ΡΠ΅Π»ΡΡ ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΈΡ Π²Π΅Π»ΠΈΡΠΈΠ½Ρ pKi. Π£ΡΠ°Π²Π½Π΅Π½ΠΈΡ, ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½Π½ΡΠ΅ Π΄Π»Ρ ΠΎΡΠ΄Π΅Π»ΡΠ½ΡΡ
ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠΎΠ², ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΡΡ ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΠΊΠ°Π·ΡΠ²Π°ΡΡ pKi ΡΠΎ ΡΡΠ΅Π΄Π½Π΅ΠΉ ΡΠΎΡΠ½ΠΎΡΡΡΡ 0.65 Π»ΠΎΠ³Π°ΡΠΈΡΠΌΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠΉ Π΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡΡ
ΠΠΈΠ½Π°ΡΠ½Π°Ρ ΠΊΠ»Π°ΡΡΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΡ ΡΠΎΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½ΠΈΠΉ, ΠΏΡΠΎΡ ΠΎΠ΄ΡΡΠΈΡ ΠΈ Π½Π΅ ΠΏΡΠΎΡ ΠΎΠ΄ΡΡΠΈΡ ΡΠ΅ΡΠ΅Π· Π³Π΅ΠΌΠ°ΡΠΎ-ΡΠ½ΡΠ΅ΡΠ°Π»ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ Π±Π°ΡΡΠ΅Ρ, ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π½Π½Π°Ρ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠΌ Π»ΠΎΠ³ΠΈΡΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠΉ ΡΠ΅Π³ΡΠ΅ΡΡΠΈΠΈ
Stable classification predictive models of 83 drugs with different blood-brain barrier penetration capacity have been constructed by the logistic regression method using physicochemical descriptors characterizing steric, electrostatic interactions and hydrogen bond energy. The models are balanced, with the prediction level of 75-80%.Π‘ΠΎΠ·Π΄Π°Π½Ρ ΡΡΡΠΎΠΉΡΠΈΠ²ΡΠ΅ ΠΊΠ»Π°ΡΡΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΠΎΠ½Π½ΡΠ΅ ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΠΊΠ°Π·Π°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠ΅ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ 83 Π»Π΅ΠΊΠ°ΡΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΡΡ
ΡΡΠ΅Π΄ΡΡΠ², ΠΏΡΠ΅ΠΎΠ΄ΠΎΠ»Π΅Π²Π°ΡΡΠΈΡ
ΠΈ Π½Π΅ ΠΏΡΠ΅ΠΎΠ΄ΠΎΠ»Π΅Π²Π°ΡΡΠΈΡ
Π³Π΅ΠΌΠ°ΡΠΎΡΠ½ΡΠ΅ΡΠ°Π»ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΉ Π±Π°ΡΡΠ΅Ρ, ΠΏΠΎΡΡΡΠΎΠ΅Π½Π½ΡΠ΅ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠΌ Π»ΠΎΠ³ΠΈΡΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠΉ ΡΠ΅Π³ΡΠ΅ΡΡΠΈΠΈ Ρ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ ΡΠΈΠ·ΠΈΠΊΠΎ-Ρ
ΠΈΠΌΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
Π΄Π΅ΡΠΊΡΠΈΠΏΡΠΎΡΠΎΠ², Ρ
Π°ΡΠ°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΠ·ΡΡΡΠΈΡ
ΡΡΠ΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠ΅ ΠΈ ΡΠ»Π΅ΠΊΡΡΠΎΡΡΠ°ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠ΅ Π²Π·Π°ΠΈΠΌΠΎΠ΄Π΅ΠΉΡΡΠ²ΠΈΡ ΠΈ ΡΠ½Π΅ΡΠ³ΠΈΡ Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΡΠ²ΡΠ·ΠΈ. ΠΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ ΡΠ±Π°Π»Π°Π½ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Ρ, ΠΈΡ
ΡΡΠΎΠ²Π΅Π½Ρ ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΠΊΠ°Π·Π°Π½ΠΈΡ ΡΠΎΡΡΠ°Π²ΠΈΠ» 75-80%
QSAR ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΡΡΡΠΎΠΉ ΠΎΡΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΠΎΠΊΡΠΈΡΠ½ΠΎΡΡΠΈ ΠΌΠ»Π΅ΠΊΠΎΠΏΠΈΡΠ°ΡΡΠΈΡ
7490 organic compounds exhibiting acute oral toxicity in mice were studied. Regression models with satisfactory statistical characteristics have been created using the original AMP (arithmetic mean property) approach. The best models using the training and test sets were characterized by the squared linear correlation coefficient and the standard deviation of 0.5 and 0.45 (in log(1/LD50) units).Π ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ΅ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½ ΡΡΠ΄ ΠΈΠ· 7490 ΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
ΡΠΎΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½ΠΈΠΉ, ΠΎΠ±Π»Π°Π΄Π°ΡΡΠΈΡ
ΠΎΡΡΡΠΎΠΉ ΠΎΡΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΠΎΠΊΡΠΈΡΠ½ΠΎΡΡΡΡ ΠΏΠΎ ΠΎΡΠ½ΠΎΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΊ ΠΌΡΡΠ°ΠΌ. Π‘ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ ΠΎΡΠΈΠ³ΠΈΠ½Π°Π»ΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΏΠΎΠ΄Ρ
ΠΎΠ΄Π° ΠΠ‘Π‘ (Π°ΡΠΈΡΠΌΠ΅ΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠ΅ ΡΡΠ΅Π΄Π½Π΅Π΅ ΡΠ²ΠΎΠΉΡΡΠ²ΠΎ) ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π½Ρ ΡΠ΅Π³ΡΠ΅ΡΡΠΈΠΎΠ½Π½ΡΠ΅ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ, ΠΎΠ±Π»Π°Π΄Π°ΡΡΠΈΠ΅ ΡΠ΄ΠΎΠ²Π»Π΅ΡΠ²ΠΎΡΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠΌΠΈ ΡΡΠ°ΡΠΈΡΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΌΠΈ Ρ
Π°ΡΠ°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΡΡΠΈΠΊΠ°ΠΌΠΈ. Π ΡΠ°ΡΡΠ½ΠΎΡΡΠΈ, Π² Π»ΡΡΡΠΈΡ
ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΡΡ
Ρ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ ΠΎΠ±ΡΡΠ°ΡΡΠ΅ΠΉ ΠΈ ΡΠ΅ΡΡΠΎΠ²ΠΎΠΉ Π²ΡΠ±ΠΎΡΠΎΠΊ ΠΊΠ²Π°Π΄ΡΠ°Ρ ΠΊΠΎΡΡΡΠΈΡΠΈΠ΅Π½ΡΠ° Π»ΠΈΠ½Π΅ΠΉΠ½ΠΎΠΉ ΠΊΠΎΡΡΠ΅Π»ΡΡΠΈΠΈ ΠΈ ΡΡΠ°Π½Π΄Π°ΡΡΠ½ΠΎΠ΅ ΠΎΡΠΊΠ»ΠΎΠ½Π΅Π½ΠΈΠ΅ (Π² Π΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡΠ°Ρ
log(1/LD50)) ΡΠΎΡΡΠ°Π²ΠΈΠ»ΠΈ 0.5 ΠΈ 0.45 ΡΠΎΠΎΡΠ²Π΅ΡΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΠΎ
QSAR ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΡΡΡΠΎΠΉ Π½Π΅ΠΉΡΠΎΡΠΎΠΊΡΠΈΡΠ½ΠΎΡΡΠΈ ΡΡΠ΄Π° ΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ ΡΠ°ΡΡΠ²ΠΎΡΠΈΡΠ΅Π»Π΅ΠΉ ΠΏΠΎ ΠΎΡΠ½ΠΎΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΊ Π³ΡΡΠ·ΡΠ½Π°ΠΌ
Using literature data analysis, the regression models of acute sublethal neurotoxicity of 47 organic solvents with respect to rats and mice have been developed. To construct the models, we used linear regression, random forest and support vector machines approaches. The linear regression equations were selected as the best models. They are designed on the basis of four molecular descriptors: polarizability, sum of positive atom charges, sum of proton acceptor descriptors and dipole moment. The developed models have good descriptive and predictive ability and clear physicochemical interpretation.ΠΠ° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° Π»ΠΈΡΠ΅ΡΠ°ΡΡΡΠ½ΡΡ
Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
ΡΠ°Π·ΡΠ°Π±ΠΎΡΠ°Π½Ρ ΡΠ΅Π³ΡΠ΅ΡΡΠΈΠΎΠ½Π½ΡΠ΅ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ ΠΎΡΡΡΠΎΠΉ ΡΡΠ±Π»Π΅ΡΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ Π½Π΅ΠΉΡΠΎΡΠΎΠΊΡΠΈΡΠ½ΠΎΡΡΠΈ 47 ΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
ΡΠ°ΡΡΠ²ΠΎΡΠΈΡΠ΅Π»Π΅ΠΉ ΠΏΠΎ ΠΎΡΠ½ΠΎΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΊ ΠΊΡΡΡΠ°ΠΌ ΠΈ ΠΌΡΡΠ°ΠΌ. ΠΠ»Ρ ΠΏΡΠΎΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΡ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½Ρ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄Ρ Π»ΠΈΠ½Π΅ΠΉΠ½ΠΎΠΉ ΡΠ΅Π³ΡΠ΅ΡΡΠΈΠΈ, ΡΠ»ΡΡΠ°ΠΉΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π»Π΅ΡΠ° ΠΈ ΠΎΠΏΠΎΡΠ½ΡΡ
Π²Π΅ΠΊΡΠΎΡΠΎΠ². ΠΠ°ΠΈΠ»ΡΡΡΠ°Ρ ΡΠΎΡΠ½ΠΎΡΡΡ ΠΈ ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΠΊΠ°Π·Π°ΡΠ΅Π»ΡΠ½Π°Ρ ΡΠΏΠΎΡΠΎΠ±Π½ΠΎΡΡΡ ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½Π° ΠΏΡΠΈ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ Π»ΠΈΠ½Π΅ΠΉΠ½ΡΡ
ΡΠ΅Π³ΡΠ΅ΡΡΠΈΠΎΠ½Π½ΡΡ
ΡΡΠ°Π²Π½Π΅Π½ΠΈΠΉ, Π²ΠΊΠ»ΡΡΠ°ΡΡΠΈΡ
Π² ΠΊΠ°ΡΠ΅ΡΡΠ²Π΅ Π½Π΅Π·Π°Π²ΠΈΡΠΈΠΌΡΡ
ΠΏΠ°ΡΠ°ΠΌΠ΅ΡΡΠΎΠ² ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠΈΠ·ΡΠ΅ΠΌΠΎΡΡΡ, ΡΡΠΌΠΌΡ ΠΏΠΎΠ»ΠΎΠΆΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΡ
Π°ΡΠΎΠΌΠ½ΡΡ
Π·Π°ΡΡΠ΄ΠΎΠ², ΡΡΠΌΠΌΡ ΠΏΡΠΎΡΠΎΠ½ΠΎΠ°ΠΊΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠ½ΡΡ
Π΄Π΅ΡΠΊΡΠΈΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² ΠΈ Π΄ΠΈΠΏΠΎΠ»ΡΠ½ΡΠΉ ΠΌΠΎΠΌΠ΅Π½Ρ. ΠΠ»Ρ Π²Ρ
ΠΎΠ΄ΡΡΠΈΡ
Π² ΡΡΠ°Π²Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠ°ΡΠ°ΠΌΠ΅ΡΡΠΎΠ² ΠΈΠΌΠ΅Π΅ΡΡΡ ΡΡΠ½Π°Ρ ΡΠΈΠ·ΠΈΠΊΠΎ-Ρ
ΠΈΠΌΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠ°Ρ ΠΈΠ½ΡΠ΅ΡΠΏΡΠ΅ΡΠ°ΡΠΈΡ
ΠΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Π² ΡΠ°ΡΡΠ²ΠΎΡΠ°Ρ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠΌ Π―ΠΠ
NMR spectroscopy has been used to study the complexation of organic ligands, that are of interest for biology and medicine, with ions of biologically significant metals (Li+, Na+, Ca2 +, Ga3+). The possibilities and advantages of NMR spectroscopy methods in the study of complex formation are shown. A high sensitivity of the NMR signal to the formation of a complex even with a very small natural concentration of the magnetic isotopes is detected. The formation of a complex with a low stability constanthas has been found by 43Ca NMR spectroscopy. The equilibrium constants of the complexes and the parameters of their NMR spectra are obtained. The possibility of using the 31P and 13C NMR method for initial testing of the complexation of cyclene derivatives with the cation Ga3+ in D2O is shown.ΠΠ΅ΡΠΎΠ΄Π°ΠΌΠΈ ΡΠΏΠ΅ΠΊΡΡΠΎΡΠΊΠΎΠΏΠΈΠΈ Π―ΠΠ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½Ρ ΠΏΡΠΎΡΠ΅ΡΡΡ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΡΠ°Π²Π»ΡΡΡΠΈΡ
ΠΈΠ½ΡΠ΅ΡΠ΅Ρ Π΄Π»Ρ Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ ΠΈ ΠΌΠ΅Π΄ΠΈΡΠΈΠ½Ρ ΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
Π»ΠΈΠ³Π°Π½Π΄ΠΎΠ² Ρ ΠΈΠΎΠ½Π°ΠΌΠΈ Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈ Π·Π½Π°ΡΠΈΠΌΡΡ
ΠΌΠ΅ΡΠ°Π»Π»ΠΎΠ² (Li+, Na+, Ca2+, Ga3+). ΠΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½Ρ Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡΠΈ ΠΈ ΠΏΡΠ΅ΠΈΠΌΡΡΠ΅ΡΡΠ²Π° ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠ² ΡΠΏΠ΅ΠΊΡΡΠΎΡΠΊΠΎΠΏΠΈΠΈ Π―ΠΠ ΠΏΡΠΈ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ. Π£ΡΡΠ°Π½ΠΎΠ²Π»Π΅Π½Π° Π²ΡΡΠΎΠΊΠ°Ρ ΡΡΠ²ΡΡΠ²ΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΡΡΡ Π―ΠΠ -ΡΠΈΠ³Π½Π°Π»Π° ΠΊ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠ° Π΄Π°ΠΆΠ΅ ΠΏΡΠΈ ΠΎΡΠ΅Π½Ρ ΠΌΠ°Π»ΠΎΠΉ ΠΏΡΠΈΡΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΠΊΠΎΠ½ΡΠ΅Π½ΡΡΠ°ΡΠΈΠΈ ΠΌΠ°Π³Π½ΠΈΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΈΠ·ΠΎΡΠΎΠΏΠ°. ΠΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠΌ Π―ΠΠ 43Ca Π·Π°ΡΠΈΠΊΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΎ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠ° Ρ Π½ΠΈΠ·ΠΊΠΎΠΉ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠ°Π½ΡΠΎΠΉ ΡΡΡΠΎΠΉΡΠΈΠ²ΠΎΡΡΠΈ. ΠΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½Ρ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠ°Π½ΡΡ ΡΠ°Π²Π½ΠΎΠ²Π΅ΡΠΈΡ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠΎΠ² ΠΈ ΠΏΠ°ΡΠ°ΠΌΠ΅ΡΡΡ ΠΈΡ
Π―ΠΠ -ΡΠΏΠ΅ΠΊΡΡΠΎΠ². ΠΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½Π° Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡΡ ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΡ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄Π° Π―ΠΠ 31P ΠΈ 13C Π΄Π»Ρ ΠΏΠ΅ΡΠ²ΠΈΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ΅ΡΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΏΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄Π½ΡΡ
ΡΠΈΠΊΠ»Π΅Π½Π° Ρ ΠΊΠ°ΡΠΈΠΎΠ½ΠΎΠΌ Ga3+ Π² D2O
ΠΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΊΠ°Π½Π°Π»ΡΠ½ΡΡ Π±Π»ΠΎΠΊΠ°ΡΠΎΡΠΎΠ² NMDA ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠ° Π² ΡΡΠ΄Ρ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠ³Π°ΡΠΎΠ² ΠΌΠ΅ΡΠΈΠ»Π΅Π½ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠΈΠ½Π΅Π³ΠΎ Ρ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ QSAR ΠΈ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ
29 conjugates of methylene blue and four chemical structures, including derivatives of carbazole, tetrahydrocarbazole, substituted indoles and Ξ³-carboline, combined with a 1-oxopropylene spacer have been studied as channel blockers of the NMDA receptor (binding site of MK-801) by using four QSAR methods (multiple linear regression, random forest, support vector machine, Gaussian process) and molecular docking. QSAR models have satisfactory characteristics. The analysis of regression models at the statistical level revealed an important role of the hydrogen bond in the complex formation. This was also confirmed by the study of modeled by docking complexes. It was found that the increase in the inhibitory activity of the part of compounds could be attributed to appearance of additional H bonds between the ligands and the receptor.Π‘ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ 4-Ρ
ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΎΠ² QSAR (ΠΌΠ½ΠΎΠΆΠ΅ΡΡΠ²Π΅Π½Π½Π°Ρ Π»ΠΈΠ½Π΅ΠΉΠ½Π°Ρ ΡΠ΅Π³ΡΠ΅ΡΡΠΈΡ, ΡΠ»ΡΡΠ°ΠΉΠ½ΡΠΉ Π»Π΅Ρ, ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ ΠΎΠΏΠΎΡΠ½ΡΡ
Π²Π΅ΠΊΡΠΎΡΠΎΠ², Π³Π°ΡΡΡΠΎΠ²ΡΠΊΠΈΠΉ ΠΏΡΠΎΡΠ΅ΡΡ) ΠΈ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ Π΄ΠΎΠΊΠΈΠ½Π³Π° ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½Ρ Π² ΠΊΠ°ΡΠ΅ΡΡΠ²Π΅ Π±Π»ΠΎΠΊΠ°ΡΠΎΡΠΎΠ² NMDA ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠ° (ΡΠ°ΠΉΡ ΡΠ²ΡΠ·ΡΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΠ-801) 29 ΠΊΠΎΠ½ΡΡΠ³Π°ΡΠΎΠ² ΠΌΠ΅ΡΠΈΠ»Π΅Π½ΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠΈΠ½Π΅Π³ΠΎ ΠΈ ΡΠ΅ΡΡΡΠ΅Ρ
ΡΠΈΠΏΠΎΠ² ΡΠΎΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½ΠΈΠΉ, Π²ΠΊΠ»ΡΡΠ°Ρ ΠΏΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄Π½ΡΠ΅ ΠΊΠ°ΡΠ±Π°Π·ΠΎΠ»Π°, ΡΠ΅ΡΡΠ°Π³ΠΈΠ΄ΡΠΎΠΊΠ°ΡΠ±Π°Π·ΠΎΠ»Π°, Π·Π°ΠΌΠ΅ΡΠ΅Π½Π½ΡΡ
ΠΈΠ½Π΄ΠΎΠ»ΠΎΠ² ΠΈ Ξ³-ΠΊΠ°ΡΠ±ΠΎΠ»ΠΈΠ½Π°, ΠΎΠ±ΡΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½Π½ΡΡ
1-ΠΎΠΊΡΠΎΠΏΡΠΎΠΏΠΈΠ»Π΅Π½ΠΎΠ²ΡΠΌ ΡΠΏΠ΅ΠΉΡΠ΅ΡΠΎΠΌ. ΠΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½Π½ΡΠ΅ QSAR ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ ΠΈΠΌΠ΅ΡΡ ΡΠ΄ΠΎΠ²Π»Π΅ΡΠ²ΠΎΡΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠ΅ Ρ
Π°ΡΠ°ΠΊΡΠ΅ΡΠΈΡΡΠΈΠΊΠΈ. ΠΠ° ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° ΡΠ΅Π³ΡΠ΅ΡΡΠΈΠΎΠ½Π½ΡΡ
ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»Π΅ΠΉ Π½Π° ΡΡΠ°ΡΠΈΡΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΎΠΌ ΡΡΠΎΠ²Π½Π΅ Π²ΡΡΠ²Π»Π΅Π½Π° Π²Π°ΠΆΠ½Π°Ρ ΡΠΎΠ»Ρ Π²ΠΎΠ΄ΠΎΡΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΡΠ²ΡΠ·ΠΈ ΠΏΡΠΈ ΡΠΎΡΠΌΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠ°. ΠΡΠΎ Π½Π°ΡΠ»ΠΎ ΠΏΠΎΠ΄ΡΠ²Π΅ΡΠΆΠ΄Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΡΠΈ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»Π΅ΠΉ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠΎΠ², ΠΏΠΎΠ»ΡΡΠ΅Π½Π½ΡΡ
ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡΠ»ΡΡΠ½ΡΠΌ Π΄ΠΎΠΊΠΈΠ½Π³ΠΎΠΌ. Π£ΡΡΠ°Π½ΠΎΠ²Π»Π΅Π½ΠΎ, ΡΡΠΎ ΡΠ²Π΅Π»ΠΈΡΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈΠ½Π³ΠΈΠ±ΠΈΡΡΡΡΠ΅ΠΉ ΡΠΏΠΎΡΠΎΠ±Π½ΠΎΡΡΠΈ ΡΠ°ΡΡΠΈ ΠΈΡΡΠ»Π΅Π΄ΡΠ΅ΠΌΡΡ
ΡΠΎΠ΅Π΄ΠΈΠ½Π΅Π½ΠΈΠΉ ΠΎΠ±ΡΡΠ»ΠΎΠ²Π»Π΅Π½ΠΎ ΠΏΠΎΡΠ²Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Π΄ΠΎΠΏΠΎΠ»Π½ΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΡ
Π-ΡΠ²ΡΠ·Π΅ΠΉ ΠΌΠ΅ΠΆΠ΄Ρ Π»ΠΈΠ³Π°Π½Π΄Π°ΠΌΠΈ ΠΈ ΡΠ΅ΡΠ΅ΠΏΡΠΎΡΠΎΠΌ