Prevalence of Streptococcus pneumoniae in nasopharynx, oropharynx and gingival sulcus of adults in Brazil

Este estudo teve como objetivo avaliar a prevalência da colonização de S. pneumoniae em três locais diferentes em adultos saudáveis: nasofaringe, orofaringe e sulco gengival. Duzentos e sessenta e cinco adultos de 20 a 60 anos, com saúde bucal, atendidos na clínica odontológica de uma universidade pública (n = 106), na cidade de Niterói e de uma instituição militar (n = 159), na cidade do Rio de Janeiro, foram incluídos neste estudo. A detecção pneumocócica foi realizada por cultura direta (DC) e PCR para o gene lytA após uma etapa de enriquecimento do caldo. Os tipos capsulares foram determinados por PCR multiplex sequencial. Os fatores associados à colonização pneumocócica também foram avaliados. Identificamos 18 portadores pneumocócicos (6,8%) entre 265 adultos por PCR, mas apenas uma (0,4%) cepa pneumocócica foi isolada pelo método DC. Orofaringe (17, 6,4%) foi a principal fonte de S. pneumoniae. A colonização do sulco gengival e nasofaringe foi encontrada em quatro (1,5%) e dois (0,8%) adultos, respectivamente. Foram detectados nove tipos capsulares distintos de nove adultos e a co-colonização com dois sorotipos foi confirmada em quatro (1,5%). Os fatores associados à colonização foram: ser mulher, ter baixo nível de escolaridade, ser não militar e usar medicação regularmente. Observamos uma baixa (6,8%) prevalência de colonização pneumocócica, no entanto, amostras orofaríngeas produziram melhores resultados, especialmente pela metodologia de detecção baseada em PCR. O sulco gengival foi considerado um possível reservatório para S. pneumoniae independente da colonização da orofaringe ou nasofaringeThis study aimed to evaluate the prevalence of S. pneumoniae colonization in three different sites in healthy adults: nasopharynx, oropharynx and gingival sulcus. Two-hundred and sixty five adults aged 20-60 years with oral health who attended dental clinics in one public university (n=106) in Niterói city and one military institution (n=159) in Rio de Janeiro city were enrolled in this study. Pneumococcal detection was performed by direct culture (DC) and PCR for lytA gene after a broth enrichment step. Capsular types were determined by sequential multiplex PCR. Factors associated with pneumococcal carriage were also evaluated. We identified 18 (6.8%) pneumococcal carriers among 265 adults by PCR, but only one (0.4%) pneumococcal strain was isolated by the DC method. Oropharynx (17; 6.4%) was the main source of S. pneumoniae. Colonization of gingival sulcus and nasopharynx was found in four (1.5%) and two (0.8%) adults, respectively. Nine distinct capsular types were detected from nine adults and co-colonization with two serotypes was confirmed in four (1.5%) subjects. Factors associated with carriage were being females, having low level of schooling, being non-military and using medication regularly. We observed a low (6.8%) pneumococcal carriage prevalence, but oropharyngeal samples yielded more sensitive results, especially by the PCR-based detection methodology. Gingival sulcus was found to be a possible reservoir for S. pneumoniae independent of colonization of the oropharynx or nasopharynx55f