Conserved and divergent arms of the antiviral response in the duplicated genomes of salmonid fishes

Funding Information: This work was funded by the European Union's Horizon 2020 research and innovation program under grant agreement No 817923 (AQUAFAANG), by ANR (ANR-21-CE35-0019, LipofishVac), by the Eranet ICRAD-Nucnanofish (ANR_13001498 and BBSRC_ICRAD BB/V019902/1), by the BBSRC Institutional strategic programme award (BBS/E/D/20002174) and by institutional grants from INRAE. We thank Drs Hugues Roest Crollius, Camille Berthelot, Alexandra Louis and Elise Parey for sharing synteny-based corrected data produced by SCORPiOs, and Louis du Pasquier for insightful discussions.Peer reviewedPublisher PD

UNDERSTANDING MOLECULAR MECHANISMS OF DISEASE RESISTANCE IN CONSTRASTED RAINBOW TROUT ISOGENIC LINES

International audienc

UNDERSTANDING MOLECULAR MECHANISMS OF DISEASE RESISTANCE IN CONSTRASTED RAINBOW TROUT ISOGENIC LINES

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Impact de la durée de stockage au froid des oeufs embryonnés de truite arc-en-ciel

International audienceL’objectif général du projet EpiCOOL est d’étudier les conséquences du stockage au froid (3°C) des œufs embryonnés de truite arc-en-ciel, l’espèce piscicole majeure de la filière française. En effet, des études récentes ont montré que l’exposition précoce à des stimuli environnementaux (tels que l’hypoxie ou la température) pouvait avoir un impact sur la physiologie, la croissance, le métabolisme et la nutrition des poissons à plus ou moins long terme. Plusieurs mécanismes peuvent être sous-jacents à cette programmation, parmi eux les modifications des patrons d’expression de gènes et les régulations épigénétiques comme par exemple la méthylation de l’ADN. Dans ce projet, nous testerons donc l’effet d’un passage des œufs au stade oeillé à basse température (3°C au lieu de 11°C) pendant 15 jours sur plusieurs caractères d’intérêt aquacole, à savoir les performances zootechniques (survie, croissance et malformations), le métabolisme intermédiaire, le développement du muscle et les qualités, ainsi que la résistance à des stress ultérieurs. Nous essaierons également de comprendre par quels mécanismes moléculaires l’exposition précoce au froid peut impacter la physiologie des poissons ultérieurement, en analysant les patrons d’expression génique et la méthylation de l’ADN (approches LUMA et RRBS). La finalité est d’utiliser la programmation précoce comme levier pour mieux maîtriser les performances des animaux à long terme. Ce projet se basera sur l’utilisation d’un modèle biologique tout à fait pertinent, deux lignées expérimentales divergentes pour la teneur en lipides du muscle : lignée grasse (LG) et lignée maigre (LM). En effet, elles ont montré une utilisation différente des aliments et possèdent un métabolisme intermédiaire et énergétique bien différencié. Il est donc possible qu’elles réagissent différemment à l’effet du froid pendant l’incubation. L’utilisation de ces deux lignées divergentes permettra de tester l’impact du fond génétique sur les réponses observées, et ainsi d’aboutir à une compréhension plus fine des mécanismes sous-jacents.Financement : FEAMP (Fonds Européen pour les Affaires Maritimes et la Pêche) – projet EpiCOOL numéro PFEA470018FA100001