Influence of crop rotation and flutolanil on the diversity of fungi on peanut shells

Les agents pathogènes du sol qui affectent les arachides (Arachis hypogaea) survivent ou hivernent souvent sur les écales d'arachides laissées sur ou dans le sol. Les effets de diverses rotations de cultures sur la flore fongique des écales d'arachides ont été comparés par trois tests en champ menés en 1992 et en 1993. Dans deux des tests, les parcelles d'arachides cultivées de façon continue ont été traitées ou non traitées avec le fongicide flutolanil. Les pratiques de rotation ont varié avec la localisation, et les cultures en rotation avec les arachides étaient le coton (Gossypium hirsutum), le seigle (Secale céréale), l'herbe de Bahia (Paspalum notatum), et le maïs (Zea mays). Au total,31 genres de champignon ont été isolés des écales. Plus des deux tiers des isolats étaient des Deutéromycètes, suivis en fréquence par les Basidiomycètes, les Ascomycètes et les Phycomycètes. Les pratiques de rotation ont affecté l'incidence de plusieurs champignons pathogènes (par exemple, les Fusarium spp. et le Lasiodiplodia theobromae) sur les écales d'arachides, mais les résultats n'ont pas été cohérents entre les tests et les années. L'herbe de Bahia ou le maïs cultivés en rotation avec les arachides ont réduit la fréquence du Rhizoctonia solani AG-4 dans les écales. Le Rhizoctonia solani AG-2-2 et le Macrophomina phaseolina ont été isolés à des niveaux plus élevés dans la rotation herbe de Bahia-arachide. Quand les arachides étaient cultivées en rotation avec le coton avec ou sans une culture de couverture de seigle, les parcelles recouvertes de seigle avaient des taux d'isolement moindres pour les champignons totaux en 1992 que les parcelles sans seigle, mais aucune différence n'a été observée en 1993. De plus, plusieurs espèces de Fusarium ont été isolées plus fréquemment des écales provenant de parcelles en rotation avec le seigle. Le flutolanil a diminué significativement les taux d'isolement de plusieurs champignons, incluant le R. solani AG-4, dans un des essais en 1992. L'ensemble des champignons isolés (en combinant tous les isolats de champignon) sur les parcelles traitées au flutolanil étaient plus élevés en 1993, mais pas en 1992 sur un des sites. Les taux d'isolement pour les différents genres et espèces de champignon différaient sur les deux milieux utilisés (agar à l'extrait de malt et agar au sel de malt). En particulier, l’AIternaria alternata et des espèces de Fusarium ont été isolés plus fréquemment sur l'agar au sel de malt, tandis que L theobromae, R. solani AG-4 et Trichoderma spp. Étaient plus souvent rencontrés sur l'agar à l'extrait de malt.Soilborne pathogens of peanut (Arachis hypogaea) often survive or over winter on peanut shells left on or in the soil. The effects of different crop rotations on the peanut shell mycobiota were compared in three field trials in 1992 and repeated in 1993. In two of the trials, plots grown continuously to peanut were either treated with the fungicide flutolanil or left untreated. Rotation practices varied with location and the crops in rotation with peanut were cotton (Gossypium hirsutum), rye (Secale cereale), bahiagrass (Paspalum notatum), and corn (Zea mays). In total, 31 different gene of fungi were isolated from shells. Over two-thirds of the isolates were Deuteromycotina, followed in frequency by Basidiomycetes, Ascomycetes, and Phycomycetes. The rotation practices affected the incidence of several pathogenic fungi (e.g., Fusarium spp., and Lasiodiplodia theobromae) in the peanut shells, but the results were not consistent across trials or years. Bahiagrass or corn grown in rotation with peanut reduced the frequency of Rhizoctonia solani AG-4 in shells. Rhizoctonia solani AG-2-2 and Macrophomina phaseolina were isolated at a greater level in the bahiagrass-peanut rotation. Where peanut was rotated with cotton with or without a winter cover crop of rye, plots containing rye had lower isolation rates for total fungi in 1992 than those without rye, but there was no différence in 1993. Also, several species of Fusarium were isolated more frequently from shells from plots rotated with rye. Flutolanil significantly lowered isolation rates of several fungi, including R. solani AG-4, in one trial in 1992. Total fungi isolated (all fungal isolates combined) in the flutolanil-treated plots were greater in 1993, but not in 1992 at one site. Isolation rates for the different gene and species of fungi differed on the two media utilized (malt-extract agar and malt-salt agar). In particular, Alternaria alternata and species of Fusarium were isolated more frequently on malt-salt agar, whereas L theobromae, R. solani AG-4 and Trichoderma spp. were more common on malt-extract agar