Exopolysaccharides et puce d’isolement : gluant, mais innovant!

Affiche présentée dans le cadre du Colloque de l'ARC, «Pour que la formation de la relève scientifique soit sur toutes les lèvres», dans le cadre du 87e Congrès de l'Acfas, Université du Québec en Outaouais (UQO), Gatineau, le 28 mai 2019.Les exopolysaccharides (EPS) sont des polymères de sucres sécrétés par les bactéries, régulièrement utilisés dans l’industrie cosmétique et alimentaire en tant qu’agents émulsifiants ou gélifiants. La recherche de producteurs bactériens d’EPS se fait croissante afin de découvrir des biopolymères aux propriétés nouvelles et mieux adaptées à certaines applications. L’objectif de notre projet est de trouver de nouveaux producteurs d’EPS en isolant des bactéries dites non cultivables retrouvées dans des échantillons environnementaux. Pour ce faire, des puces d'isolement ont été employées. Ces dispositifs miniatures contiennent des chambres de culture refermées par des membranes semi-perméables permettant aux microorganismes de croître en étant en contact avec leur environnement. Cette stratégie a pour effet d’augmenter la proportion des microorganismes pouvant s’adapter à la culture sur des milieux synthétiques. À ce jour, plus de 200 bactéries ont été isolées au moyen des puces d’isolement. Certaines semblent prometteuses en raison de leur aspect mucoïde et de leur réponse à un test de criblage. Le séquençage d’une région de leur ADN permettra leur identification, et des analyses visant la description de la composition et des propriétés des EPS seront poursuivies. Il est possible d’envisager que l’utilisation des puces d’isolement conduise à l’identification de producteurs d’EPS aux propriétés inédites pouvant être utilisés pour développer des bioproduits novateurs

Cross-validation of ELISA and a portable surface plasmon resonance instrument for IgG antibody serology with SARS-CoV-2 positive individuals.

We report on the development of surface plasmon resonance (SPR) sensors and matching ELISAs for the detection of nucleocapsid and spike antibodies specific to the novel coronavirus 2019 (SARS-CoV-2) in human serum, plasma and dried blood spots (DBS)

Le partenariat en sciences naturelles et génie au coeur de la résolution de la crise de la COVID 19

Affiche présentée dans le cadre du Colloque de l'ARC, «Le partenariat en recherche, sa nature, ses leviers et ses freins, ses limites et ses retombées», lors du 88e Congrès de l'Acfas, le 4 mai 2021.La pandémie de la COVID-19 a entraîné un niveau de collaboration sans précédent pour accélérer la mise au point d’outils diagnostiques, de vaccins et de produits pharmacologiques. Au cœur des solutions biotechnologiques se trouve la nécessité d’accéder rapidement aux protéines du coronavirus adaptées aux besoins des équipes de recherche. L’accès à ces protéines est une contrainte majeure. Grâce à des partenariats avec des chercheuses et chercheurs universitaires du Québec, le Centre national en électrochimie et en technologies environnementales (CNETE) a contribué à la mise au point de solutions innovantes. Des gènes synthétiques ont été développés, puis introduits dans des microorganismes. Les protéines recombinantes correspondantes ont été produites par culture en erlenmeyer ou en bioréacteur, selon les besoins des équipes de recherche, puis purifiées à l’aide de techniques chromatographiques. Ces protéines sont présentement au cœur de l’élaboration d’un test clinique visant le dépistage des personnes immunisées, ainsi que d’une méthode de détection du virus dans des spécimens médicaux et non médicaux. Elles sont aussi exploitées pour le développement d’inhibiteurs pharmacologiques et d’un vaccin contenant un adjuvant biologique. Ces exemples démontrent indéniablement que le partenariat entre des équipes de recherche collégiales et universitaires permet de relever des défis importants. Plus encore, ils soulignent la pertinence d’une science collaborative

Detection of Toxoplasma gondii antibodies in swine herds in Québec, Canada

Toxoplasmosis is a disease caused by the intracellular protozoan parasite Toxoplasma gondii. In human being, foodborne contamination is mostly associated to consumption and manipulation of raw or undercooked meat, unwashed vegetables and fruit or drinking water contaminated by oocystes. In Canada, very few recent prevalence studies are available to evaluate the human exposure to T. gondii by meat products.</p

À la recherche de l’âme-sœur moléculaire : protéine peu soluble recherche protéine soluble pour mieux s’exprimer

Affiche présentée dans le cadre du colloque de l'ARC "Nouveaux enjeux pour la recherche collégiale" lors du 89e Congrès de l’Acfas, en ligne, le lundi 9 mai 2022Actuellement, une majorité de protéines humaines d’intérêt médical sont produites à l’aide de souches de bactéries et de levures recombinantes. Ce mode de production remplaçant les techniques traditionnelles a accéléré le développement de médicaments de même que la recherche entourant l’élucidation de certains processus pathologiques. L’un des principaux problèmes relevés lors de l’expression de ces protéines recombinantes est une réduction de leur solubilité : elles ne se retrouvent pas dans les mêmes conditions que dans leur environnement naturel, ce qui cause un mauvais repliement ou une dégradation. Afin de résoudre ce problème, il est possible de coupler une protéine très soluble à la protéine qu’on désire produire. Cette fusion améliore non seulement la solubilité de la protéine désirée, mais aussi son expression et son repliement sous sa forme native, tout en conservant son activité. Au cours des dernières années, nous avons élaboré ce type de système dans la levure et produit des protéines humaines, ce qui aurait été impossible autrement. Le système s’est aussi avéré efficace pour maintenir les protéines sous leur forme soluble. L’étude de cette relation entre protéines peu solubles et protéines solubles permettra l’application du système dans divers projets fondamentaux (ex. : production de protéines pour la compréhension de maladies) et appliqués (ex. : mise à l’échelle de la production de protéines à intérêt industriel). (Acfas

Detection of Toxoplasma gondii antibodies in swine herds in Québec, Canada

Toxoplasmosis is a disease caused by the intracellular protozoan parasite Toxoplasma gondii. In human being, foodborne contamination is mostly associated to consumption and manipulation of raw or undercooked meat, unwashed vegetables and fruit or drinking water contaminated by oocystes. In Canada, very few recent prevalence studies are available to evaluate the human exposure to T. gondii by meat products

La contrefaçon virale comme outil de lutte aux épidémies

Affiche présentée dans le cadre du colloque de l'ARC "Nouveaux enjeux pour la recherche collégiale" lors du 89e Congrès de l’Acfas, en ligne, le lundi 9 mai 2022Ce projet a été rendu possible grâce au soutien financier du Ministère de l’Enseignement supérieur (MES) via le programme d'aide à la recherche et au transfert (PART), volet innovation technologique.Plusieurs virus à l’origine d’épidémies se caractérisent par leur niveau de biosécurité, leur manipulation exigeant des installations sécurisées. Or, l’accès à de telles installations est limité, ce qui ralentit le développement de connaissances et la mise au point de vaccins et de tests diagnostiques. Le recours à des virus synthétiques composés de protéines virales, mais exempts de matériel génétique, facilite l’accessibilité, puisqu’ils sont plus sécuritaires. Ces pseudovirions pourraient notamment servir de solutions de remplacement pour le SRAS-CoV-2, à l’origine de la pandémie de COVID-19. La levure Pichia pastoris représente un hôte de production idéal pour ces structures complexes. Pour le démontrer, les gènes codant trois protéines de structure du SRAS-CoV-2 en plus du gène d’une protéine fluorescente ont été introduits simultanément dans cette levure. Différents paramètres ont été adaptés pour optimiser la production des protéines virales (pH, température, souche recombinante), laquelle a été confirmée par l’observation de la fluorescence et par immunobuvardage de type Western. Des essais en cours permettront de développer une méthode de purification des pseudovirions par chromatographie sur colonne. Une simple levure pourrait donc représenter un outil inestimable de la lutte contre des virus tels que le SRAS-CoV-2. (Acfas

Cross-Validation of ELISA and a Portable Surface Plasmon Resonance Instrument for IgG Antibodies Serology with SARS-CoV-2 Positive Individuals

We report on the development of surface plasmon resonance (SPR) sensors and matching ELISAs for the detection of nucleocapsid and spike antibodies specific against the novel coronavirus 2019 (SARS-CoV-2) in human serum, plasma and dried blood spots (DBS). When exposed to SARS-CoV-2 or a vaccine against SARS-CoV-2, the immune system responds by expressing antibodies at levels that can be detected and monitored to identify the fraction of the population potentially immunized against SARS-CoV-2 and support efforts to deploy a vaccine strategically. A SPR sensor coated with a peptide monolayer and functionalized with various sources of SARS-CoV-2 recombinant proteins expressed in different cell lines detected human anti-SARS-CoV-2 IgG in the nanomolar range. Nucleocapsid expressed in different cell lines did not significantly change the sensitivity of the assays, whereas the use of a CHO cell line to express spike ectodomain led to excellent performance. This bioassay was performed on a portable SPR instrument capable of measuring 4 biological samples within 30 minutes of sample/sensor contact and the chip could be regenerated at least 9 times. Multi-site validation was then performed with in-house and commercial ELISA, which revealed excellent cross-correlations with Pearson’s coefficients exceeding 0.85 in all cases, for measurements in DBS and plasma. This strategy paves the way to point-of-care and rapid testing for antibodies in the context of viral infection and vaccine efficacy monitoring