Estimates of genomic heritability and genome-wide association study for fatty acids profile in Santa Inês sheep

Background: Despite the health concerns and nutritional importance of fatty acids, there is a relative paucity of studies in the literature that report genetic or genomic parameters, especially in the case of sheep populations. To investigate the genetic architecture of fatty acid composition of sheep, we conducted genome-wide association studies (GWAS) and estimated genomic heritabilities for fatty acid profile in Longissimus dorsi muscle of 216 male sheep. Results: Genomic heritability estimates for fatty acid content ranged from 0.25 to 0.46, indicating that substantial genetic variation exists for the evaluated traits. Therefore, it is possible to alter fatty acid profiles through selection. Twenty-seven genomic regions of 10 adjacent SNPs associated with fatty acids composition were identified on chromosomes 1, 2, 3, 5, 8, 12, 14, 15, 16, 17, and 18, each explaining ≥0.30% of the additive genetic variance. Twenty-three genes supporting the understanding of genetic mechanisms of fat composition in sheep were identified in these regions, such as DGAT2, TRHDE, TPH2, ME1, C6, C7, UBE3D, PARP14, and MRPS30. Conclusions: Estimates of genomic heritabilities and elucidating important genomic regions can contribute to a better understanding of the genetic control of fatty acid deposition and improve the selection strategies to enhance meat quality and health attributes

Estimation of sanity of a stand of Pinus taeda L. after the attack of Sapajus nigritus Kerr (1972) using vegetation index.

Essa pesquisa objetivou ajustar modelos de regressão e classificação utilizando os índices de vegetação (IV) mais robustos derivados a partir de imagens digitais de Sentinel-2/MSI para a detecção de áreas atacadas por Sapajus nigritus. Os dados de campo foram obtidos em um povoamento de Pinus taeda L. localizado em Bocaina do Sul, estado de Santa Catarina. Foram alocadas 46 parcelas, nas quais os indivíduos arbóreos foram classificados de acordo com a intensidade do ano em: I: sem dano, II: moderado, III: severo e IV: morto. Foram utilizadas três imagens orbitais da constelação Sentinel-2/MSI em datas coincidentes ao pré ataque, ataque e pós ataque. Por meio de Análise de Componentes Principais, foram selecionados os índices de vegetação como variáveis regressoras para o desenvolvimento de modelos de regressão por Stepwise, Support Vector Machine (SVM) e Random Forest (RF) para a estimativa do percentual das classes de ataque por parcela. A seleção de melhor modelo foi baseada em estatísticas de ajuste de modelos de regressão. Os índices mais robustos foram o MCARI, NDI45 e NDVIRR, os quais estimaram para as classes um percentual de ataque de S. nigritus por parcela com R2 ajustado de 0,80, 0,46, 0,88 e 0,97; Syx de 13,49, 61,42, 15,11 e 8,69 (% 0,045 ha-1) e RMSE de 1,95, 4,49, 2,11 e 0,32 (% 0,045 ha1). Foi possível estimar/identificar áreas atacadas por esse primata no povoamento avaliado, destacando a modelagem Stepwise, seguida por SVM e RF. Entretanto, recomenda-se testar imagens digitais de alta/ultra alta resolução espacial para corroborar com tal metodologia