Api-calc 1.0: a computer program for calculating the average probability of identity allowing for substructure, inbreeding and the presence of close relatives

Individual identification via DNA profiling is important in molecular ecology, particularly in the case of noninvasive sampling. A key quantity in determining the number of loci required is the probability of identity (PIave), the probability of observing two copies of any profile in the population. Previously this has been calculated assuming no inbreeding or population structure. Here we introduce formulae that account for these factors, whilst also accounting for relatedness structure in the population. These formulae are implemented in API-CALC 1.0, which calculates PIave for either a specified value, or a range of values, for F-IS and F-ST

Les facteurs déterminants du bien-être des chiens et des chats : comportement, élevage, et modes de vie des propriétaires

The changing role of companion animals, accompanied by changes in human lifestyle and demands, places them at risk of poor welfare. They are increasingly subjected to stressors that prevent the adequate expression of normal behaviour. Fear and anxiety often go unrecognised, leading to behavioural disorders that are accompanied by negative affective states and poor welfare. Irresponsible breeding practices result in increased incidences of inherited defects in pets, which adversely affect physical and mental aspects of welfare, either directly, through the anomaly itself, or indirectly, due to secondary effects. Increased urbanisation has resulted in smaller living spaces, higher population densities and longer working hours, all factors that affect the well-being of pets. A better understanding of animal behaviour by both pet owners and professionals, to more effectively meet the needs of dogs and cats and recognise their problems, should inform the formulation of objective welfare assessments to ensure a better quality of life for the animals. Responsible breeding practices that increase genetic diversity and select for traits that help dogs and cats fill their niche in a changing world should be based on evidence to minimise welfare risk.La evolución del papel de los animales de compañía, aunada a la transformación de los modos de vida y expectativas de las personas, pone en peligro el bienestar de esos animales, sujetos cada vez más a factores de estrés que les impiden la expresión adecuada de un comportamiento normal. A menudo el miedo y la ansiedad pasan desapercibidos, lo que induce trastornos de conducta que se acompañan de estados afectivos negativos y de condiciones deficientes de bienestar. Las prácticas reproductivas irresponsables inducen una creciente incidencia de defectos hereditarios en las mascotas, lo que repercute negativamente en los aspectos físicos y psíquicos del bienestar, ya sea directamente, en razón de la propia anomalía, o indirectamente, a resultas de efectos secundarios. La creciente urbanización ha traído consigo una merma del espacio vital, densidades de población más elevadas y horarios de trabajo más prolongados, factores todos ellos que afectan al bienestar de las mascotas. Es preciso que profesionales y propietarios entiendan mejor la conducta animal para poder así responder con más eficacia a las necesidades de perros y gatos, detectar sus problemas y, sobre todo, utilizar ese conocimiento como base para evaluar objetivamente el bienestar de los animales y ofrecerles mayor calidad de vida. Para reducir al mínimo los posibles riesgos de bienestar hay que aplicar prácticas reproductivas responsables, que deben reposar en criterios científicos, deparar una mayor diversidad genética y seleccionar rasgos que ayuden a los perros y gatos a ocupar el nicho que les corresponde en un mundo en plena transformación.L’évolution du rôle dévolu aux animaux de compagnie, parallèlement aux changements des modes de vie et des valeurs chez l’être humain ne vont pas sans comporter un certain risque pour le bien-être de ces animaux. En effet, ceux-ci sont de plus en plus soumis à des facteurs de stress qui les empêchent d’exprimer leur comportement normal. La crainte et l’anxiété sont rarement prises en compte en tant que telles, ce qui entraîne des troubles du comportement s’accompagnant d’états affectifs négatifs et de mauvaises conditions de bien-être. Des pratiques d’élevage irresponsables ont pour effet d’augmenter l’incidence des défauts héréditaires chez les animaux de compagnie, ce qui détériore les conditions physiques et mentales du bien-être, aussi bien directement du fait de l’anomalie elle-même qu’indirectement par ses effets secondaires. En raison de l’urbanisation croissante, les habitats sont de plus en plus petits, les densités de population plus élevées et les journées de travail plus longues, autant de facteurs qui affectent le bien-être des animaux de compagnie. Si les professionnels et les propriétaires d’animaux de compagnie comprenaient mieux le comportement animal, cela les aiderait à répondre plus efficacement aux besoins des chiens et des chats et à identifier les problèmes, et permettrait également de réaliser en connaissance de cause des évaluations objectives du bien-être de ces animaux afin de leur offrir une meilleure qualité de vie. Les pratiques d’élevage responsables devraient chercher à minimiser les risques pour le bien-être animal, tout en essayant d’accroître la diversité génétique et de sélectionner des traits susceptibles d’aider les chiens et les chats à occuper la place qui leur revient dans un monde en pleine mutation.http://www.oie.int/en/publications-and-documentation/scientific-and-technical-review-free-accesshb201

Proceedings of the Third International Congress on Veterinary Behavioural Medicine Vancouver, BC, Canada 7-8 August 2001

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