4 research outputs found
EDUCATION AND GREEN CHEMISTRY
Chemists, scientists and teachers of the Ural Federal University and chemical institutes of the Ural branch of the Russian Academy of Sciences suggest increasing the level of knowledge in the chemistry for pupils and students. Besides support of youth chemists which are the future of our science and industry is the main aim of our Β«Green ChemistryΒ» project. One way to achieve this goal was the idea of creation of the charity Fund "Green chemistry". Work in this direction help to increase the interest of youth to chemistry, physics and engineering Sciences
Π’Π΅Ρ Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ Π±Π°Π· Π΄Π°Π½Π½ΡΡ . ΠΠ²ΠΎΠ΄Π½ΡΠΉ ΠΊΡΡΡ: ΡΡΠ΅Π±Π½ΠΎΠ΅ ΠΏΠΎΡΠΎΠ±ΠΈΠ΅
ΠΠ°Π½Π½ΠΎΠ΅ ΠΈΠ·Π΄Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΡΠΊΡΡΠ²Π°Π΅Ρ ΡΠ΅ΡΠΈΡ ΠΏΡΠ±Π»ΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΠΉ, ΠΏΠΎΡΠ²ΡΡΠ΅Π½Π½ΡΡ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠΌ Π±Π°Π· Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
ΠΈ ΠΎΡΠΈΠ΅Π½ΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡΡ Π½Π° ΡΡΡΠ΄Π΅Π½ΡΠΎΠ² Π±Π°ΠΊΠ°Π»Π°Π²ΡΠΈΠ°ΡΠ° ΠΈ ΡΠΏΠ΅ΡΠΈΠ°Π»ΠΈΡΠ΅ΡΠ° Π²ΡΠ·ΠΎΠ², ΠΎΡΡΡΠ΅ΡΡΠ²Π»ΡΡΡΠΈΡ
Π±Π°Π·ΠΎΠ²ΡΡ ΠΏΠΎΠ΄Π³ΠΎΡΠΎΠ²ΠΊΡ Π²ΡΠΏΡΡΠΊΠ½ΠΈΠΊΠΎΠ² Π² ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡΠΈ ΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΠΎΠ½Π½ΡΡ
ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΉ, ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΠ±Π΅ΡΠΏΠ΅ΡΠ΅Π½ΠΈΡ Π²ΡΡΠΈΡΠ»ΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΈΠΊΠΈ ΠΈ Π°Π²ΡΠΎΠΌΠ°ΡΠΈΠ·ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Π½ΡΡ
ΡΠΈΡΡΠ΅ΠΌ, ΠΏΡΠΎΠ³ΡΠ°ΠΌΠΌΠ½ΠΎΠΉ ΠΈΠ½ΠΆΠ΅Π½Π΅ΡΠΈΠΈ ΠΈ Π΄ΡΡΠ³ΠΈΡ
ΡΠΌΠ΅ΠΆΠ½ΡΡ
ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡΠ΅ΠΉ ΠΏΡΠΎΡΠ΅ΡΡΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ Π΄Π΅ΡΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΡΡΠΈ. Π£ΡΠ΅Π±Π½ΠΎΠ΅ ΠΏΠΎΡΠΎΠ±ΠΈΠ΅ ΠΏΡΠ΅Π΄Π½Π°Π·Π½Π°ΡΠ΅Π½ΠΎ Π΄Π»Ρ ΡΡΡΠ΄Π΅Π½ΡΠΎΠ² Π²ΡΡΡΠΈΡ
ΡΡΠ΅Π±Π½ΡΡ
Π·Π°Π²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΠΉ, ΠΎΠ±ΡΡΠ°ΡΡΠΈΡ
ΡΡ ΠΏΠΎ Π½Π°ΠΏΡΠ°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΡΠΌ ΠΏΠΎΠ΄Π³ΠΎΡΠΎΠ²ΠΊΠΈ: 1.01.03.02 Β«ΠΡΠΈΠΊΠ»Π°Π΄Π½Π°Ρ ΠΌΠ°ΡΠ΅ΠΌΠ°ΡΠΈΠΊΠ° ΠΈ ΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΠΊΠ°Β» (ΡΡΠΎΠ²Π΅Π½Ρ 3) (ΠΊΠ²Π°Π»ΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΡ Β«Π±Π°ΠΊΠ°Π»Π°Π²ΡΒ»); 1.02.03.02 Β«Π€ΡΠ½Π΄Π°ΠΌΠ΅Π½ΡΠ°Π»ΡΠ½Π°Ρ ΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΠΊΠ° ΠΈ ΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΠΎΠ½Π½ΡΠ΅ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈΒ» (ΡΡΠΎΠ²Π΅Π½Ρ 3) (ΠΊΠ²Π°Π»ΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΡ Β«Π±Π°ΠΊΠ°Π»Π°Π²ΡΒ»); ΡΠΊΡΡΠΏΠ½Π΅Π½Π½ΠΎΠΌΡ Π½Π°ΠΏΡΠ°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΡ ΠΏΠΎΠ΄Π³ΠΎΡΠΎΠ²ΠΊΠΈ 2.09.00.00 Β«ΠΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΠΊΠ° ΠΈ Π²ΡΡΠΈΡΠ»ΠΈΡΠ΅Π»ΡΠ½Π°Ρ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΈΠΊΠ°Β» (ΡΡΠΎΠ²Π΅Π½Ρ 3) (ΠΊΠ²Π°Π»ΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΡ Β«Π±Π°ΠΊΠ°Π»Π°Π²ΡΒ»); 5.38.03.05 Β«ΠΠΈΠ·Π½Π΅Ρ-ΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΠΊΠ°Β» (ΡΡΠΎΠ²Π΅Π½Ρ 3) (ΠΊΠ²Π°Π»ΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΡ Β«Π±Π°ΠΊΠ°Π»Π°Π²ΡΒ»); 2.15.03.04 Β«ΠΠ²ΡΠΎΠΌΠ°ΡΠΈΠ·Π°ΡΠΈΡ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΡ
ΠΏΡΠΎΡΠ΅ΡΡΠΎΠ² ΠΈ ΠΏΡΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΡΡΠ²Β» (ΡΡΠΎΠ²Π΅Π½Ρ 3) (ΠΊΠ²Π°Π»ΠΈΡΠΈΠΊΠ°ΡΠΈΡ Β«Π±Π°ΠΊΠ°Π»Π°Π²ΡΒ») ΠΈ ΡΠΎΠΎΡΠ²Π΅ΡΡΡΠ²ΡΠ΅Ρ Π΄Π΅ΠΉΡΡΠ²ΡΡΡΠΈΠΌ Π³ΠΎΡΡΠ΄Π°ΡΡΡΠ²Π΅Π½Π½ΡΠΌ ΠΎΠ±ΡΠ°Π·ΠΎΠ²Π°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΡΠΌ ΡΡΠ°Π½Π΄Π°ΡΡΠ°ΠΌ. ΠΠ½ΠΈΠ³Π° ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ Π±ΡΡΡ ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π½Π° ΡΠΈΡΠΎΠΊΠΎΠΌΡ ΠΊΡΡΠ³Ρ ΡΠΈΡΠ°ΡΠ΅Π»Π΅ΠΉ, ΠΈΠ½ΡΠ΅ΡΠ΅ΡΡΡΡΠΈΡ
ΡΡ Π΄Π°Π½Π½ΠΎΠΉ ΡΠ΅ΠΌΠ°ΡΠΈΠΊΠΎΠΉ. ΠΠ»Ρ ΠΎΡΠ²ΠΎΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΌΠ°ΡΠ΅ΡΠΈΠ°Π»Π° Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ
ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΡ ΠΌΠΈΠ½ΠΈΠΌΠ°Π»ΡΠ½ΡΠ΅ Π·Π½Π°Π½ΠΈΡ ΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΠΊΠΈ ΠΈ Π½Π°Π²ΡΠΊΠΈ ΡΠ°Π±ΠΎΡΡ Ρ ΠΊΠΎΠΌΠΏΡΡΡΠ΅ΡΠΎΠΌ. Π ΡΠΎΠ²ΡΠ΅ΠΌΠ΅Π½Π½ΠΎΠΌ ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΡΠ°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΠΈ, ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²ΠΎΠΉ ΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ ΡΠ΅Ρ
Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ ΡΠ²Π»ΡΡΡΡΡ Π΄Π°Π½Π½ΡΠ΅, ΠΊΠΎΡΠΎΡΡΠ΅ ΡΡΠ°Π½ΡΡΠΎΡΠΌΠΈΡΡΡΡΡΡ Π² ΠΈΠ½ΡΠΎΡΠΌΠ°ΡΠΈΡ (Π² ΠΈΡΡ
ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΌ Π·Π½Π°ΡΠ΅Π½ΠΈΠΈ ΡΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΡ, ΡΠΎΠΎΠ±ΡΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΎ ΠΊΠ°ΠΊΠΎΠΌ-Π»ΠΈΠ±ΠΎ ΡΠ°ΠΊΡΠ΅, ΡΠΎΠ±ΡΡΠΈΠΈ, Π΄Π΅ΡΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΡΡΠΈ ΠΈ Ρ.Π΄.), Ρ.Π΅. ΠΏΠΎΠ»Π΅Π·Π½ΡΠ΅ Π΄Π»Ρ ΠΊΠΎΠ³ΠΎ-ΡΠΎ ΡΠ²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΡ. Π‘ ΡΠ΅Π»ΡΡ Π°Π΄Π΅ΠΊΠ²Π°ΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΎΡΠΎΠ±ΡΠ°ΠΆΠ΅Π½ΠΈΡ ΡΠ΅Π°Π»ΡΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΌΠΈΡΠ° Π΄Π°Π½Π½ΡΠ΅ Π΄ΠΎΠ»ΠΆΠ½Ρ Π±ΡΡΡ ΡΡΡΡΠΊΡΡΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Ρ ΠΈ ΠΎΠΏΠΈΡΠ°Π½Ρ. ΠΠ΄Π½ΠΈΠΌ ΠΈΠ· ΡΠΏΠΎΡΠΎΠ±ΠΎΠ² ΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·Π°ΡΠΈΠΈ ΡΠ°Π±ΠΎΡΡ ΡΠ²Π»ΡΡΡΡΡ Π±Π°Π·Ρ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
. ΠΠ°ΡΡΠΎΡΡΠ΅Π΅ ΠΏΠΎΡΠΎΠ±ΠΈΠ΅ ΠΊΡΠ°ΡΠΊΠΎ ΠΎΡΠ²Π΅ΡΠ°Π΅Ρ ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π½ΡΠ΅ ΠΏΠΎΠ½ΡΡΠΈΡ Π±Π°Π· Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
, ΡΡΠ°ΠΏΡ ΡΠ°Π·Π²ΠΈΡΠΈΡ ΠΈ Π±Π°Π·ΠΎΠ²ΡΠ΅ Π²ΠΎΠΏΡΠΎΡΡ Π°ΡΡ
ΠΈΡΠ΅ΠΊΡΡΡΠ½ΠΎΠΉ ΠΎΡΠ³Π°Π½ΠΈΠ·Π°ΡΠΈΠΈ ΡΠΈΡΡΠ΅ΠΌ ΡΠΏΡΠ°Π²Π»Π΅Π½ΠΈΡ Π±Π°Π·Π°ΠΌΠΈ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
(Π‘Π£ΠΠ), ΡΠΎΠ΄Π΅ΡΠΆΠΈΡ ΡΠΆΠ°ΡΠΎΠ΅ ΠΈΠ·Π»ΠΎΠΆΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΎΡΠ½ΠΎΠ² ΡΠ΅Π»ΡΡΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
, ΠΎΠΏΠΈΡΠ°Π½ΠΈΠ΅ ΡΠΈΠ½ΡΠ°ΠΊΡΠΈΡΠ° ΡΡΡΡΠΊΡΡΡΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΡΠ·ΡΠΊΠ° Π·Π°ΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² SQL β ΡΡΠ΅Π΄ΡΡΠ²Π° ΠΎΠΏΠΈΡΠ°Π½ΠΈΡ Π΄ΠΎΡΡΡΠΏΠ° ΠΊ ΡΠ΅Π»ΡΡΠΈΠΎΠ½Π½ΡΠΌ Π±Π°Π·Π°ΠΌ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
, ΡΠ²Π»ΡΡΡΠ΅Π³ΠΎΡΡ ΡΡΠ°Π½Π΄Π°ΡΡΠΎΠΌ ΠΈΠ½ΡΠ΅ΡΡΠ΅ΠΉΡΠ° Ρ ΡΠ΅Π»ΡΡΠΈΠΎΠ½Π½ΡΠΌΠΈ Π‘Π£ΠΠ. Π ΠΊΠ½ΠΈΠ³Π΅ ΠΏΡΠ΅Π΄ΡΡΠ°Π²Π»Π΅Π½Ρ ΠΏΡΠ°ΠΊΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠ΅ ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅ΡΡ ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΡ ΠΊΠΎΠ½ΡΡΡΡΠΊΡΠΈΠΉ ΡΠ·ΡΠΊΠ° SQL Π΄Π»Ρ ΠΏΠΎΡΡΡΠΎΠ΅Π½ΠΈΡ ΠΌΠΎΠ΄ΠΈΡΠΈΡΠΈΡΡΡΡΠΈΡ
Π·Π°ΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² ΠΊ Π±Π°Π·Π΅ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
, Π·Π°ΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² Π½Π° Π²ΡΠ±ΠΎΡΠΊΡ ΡΠ°Π·Π»ΠΈΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΠ»ΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡΠΈ Ρ ΠΌΠ΅ΡΠΎΠ΄ΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠΌΠΈ ΠΏΠΎΡΡΠ½Π΅Π½ΠΈΡΠΌΠΈ. ΠΠ° ΡΠΎΠ΄Π΅ΡΠΆΠ°ΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΠΌ ΡΡΠΎΠ²Π½Π΅ ΠΈΠ·Π»ΠΎΠΆΠ΅Π½Ρ ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Ρ ΡΠ΅Π»ΡΡΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ Π°Π»Π³Π΅Π±ΡΡ β ΡΠΎΡΠΌΠ°Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΠΈΡΡΠ΅ΠΌΡ ΠΌΠ°Π½ΠΈΠΏΡΠ»ΠΈΡΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ ΠΎΡΠ½ΠΎΡΠ΅Π½ΠΈΡΠΌΠΈ Π² ΡΠ΅Π»ΡΡΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ Π΄Π°Π½Π½ΡΡ
. Π Π°ΡΡΠΌΠΎΡΡΠ΅Π½Ρ ΠΏΡΠ°ΠΊΡΠΈΡΠ΅ΡΠΊΠΈΠ΅ ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅ΡΡ ΠΏΡΠΈΠΌΠ΅Π½Π΅Π½ΠΈΡ ΡΠ΅Π»ΡΡΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ Π°Π»Π³Π΅Π±ΡΡ. Π ΡΠΎΡΡΠ°Π² ΠΈΠ·Π΄Π°Π½ΠΈΡ Π²ΠΊΠ»ΡΡΠ΅Π½ ΠΏΠ΅ΡΠ΅ΡΠ΅Π½Ρ Π²ΠΎΠΏΡΠΎΡΠΎΠ² Π΄Π»Ρ ΡΠ°ΠΌΠΎΠΏΡΠΎΠ²Π΅ΡΠΊΠΈ, Π½Π°Π±ΠΎΡ ΡΠΏΡΠ°ΠΆΠ½Π΅Π½ΠΈΠΉ ΠΈ ΠΈΠ½Π΄ΠΈΠ²ΠΈΠ΄ΡΠ°Π»ΡΠ½ΡΡ
Π·Π°Π΄Π°Π½ΠΈΠΉ Π΄Π»Ρ ΡΠ°ΠΌΠΎΡΡΠΎΡΡΠ΅Π»ΡΠ½ΠΎΠΉ Π²Π½Π΅Π°ΡΠ΄ΠΈΡΠΎΡΠ½ΠΎΠΉ ΡΠ°Π±ΠΎΡΡ
Proteomic dataset: Profiling of cultivated Echerichia coli isolates from Crohn's disease patients and healthy individuals
One of the dysbioses often observed in Crohn's disease (CD) patients is an increased abundance of Escherichia coli (10β100 fold compared to healthy individuals) (Gevers etΒ al., 2014). The data reported is a large-scale proteome profile for E. coli isolates collected from CD patients and healthy individuals. 43 isolates were achieved from 30 CD patients (17 male, 12 female, median age 30) and 19 isolates from 7 healthy individuals (7 male, median age 19). Isolates were cultivated on LB medium at aerobic conditions up to medium log phase. Protein extraction was performed with sodium deoxycholate (DCNa) and urea, alcylation with tris(2-carboxyethyl)phosphine and iodacetamide. Protein trypsinolysis was performed as described in (Matyushkina etΒ al., 2016). Total cell proteomes were analysed by shotgun proteomics with HPLC-MS/MS on aΒ maXis qTOF mass-spectrometer. The data including HPLC-MS/MS raw files and exported Mascot search results was deposited to the PRIDE repository project accession: PXD010920, project https://doi.org/10.6019/PXD010920. Keywords: E. coli, Proteome, Crohn's disease, HPLC-MS/M