Seasonal dynamics and alternate hosts of thrips transmitted Iris yellow spot virus in Kenya

Thrips-transmitted Iris yellow spot virus (IYSV) (Family Tospoviridae, Genus Orthotospovirus) is a major constraint to onion ( Allium cepa L.) production in Kenya. Determining seasonal patterns of the vector and alternate hosts of the virus could help onion farmers plan Integrated Pest Management strategies; while allowing them to move away from calendar-based applications of insecticides. The objective of this study was to determine the distribution, seasonal variations and alternate hosts of vector and IYSV. For distribution, a survey was carried out on a network of farms in all onion growing areas in Kenya; while for seasonality, surveys were done in two areas; Loitoktok and Naivasha. Data were collected on IYSV incidence, thrips population and alternate hosts. Results showed IYSV was widely distributed in all onion growing areas; with incidence varying from 26 to 72%. Highest IYSV incidence was recorded during the cool-dry season, and varied from 56.5 to 71%; while lowest IYSV incidence in onions was observed during the cool and wet season (29.9 to 32.2%). Iris yellow spot disease incidence positively correlated with the number of onion thrips in Loitokitok (r = 0.659; P<0.0001) and Naivasha (r = 0.623; P<0.0001). Identified alternate hosts for IYSV were leeks, chives, shallots, lambsquarters, redroot pigweed, Chinese lantern and black nightshade.Occurrence of thrips on onions, which is grown all year round calls for urgent integrated pest management strategies that includes host plant resistance, field sanitation, forecasting and use of beneficial insects and parasitoids to reduce impact of the pest and disease. Plant health adherence through removal of alternate weeds hosts around the cultivated fields, would be useful in minimising IYSV incidence.Le virus Iris de la tache jaune (IYSV) transmis par les thrips (Famille Tospoviridae, Genre Orthotospovirus) est une contrainte majeure de la production de l\u2019oignon ( Allium cepa L) au Kenya. D\ue9terminer la distribution saisonni\ue8re du vecteur et les h\uf4tes alternatives des virus pourrait aider les producteurs d\u2019oignon \ue0 mettre en place des strat\ue9gies de gestion int\ue9gr\ue9e des pestes, en vue de leur permettre d\u2019\ue9viter les applications des insecticides sur la base du calendrier. L\u2019objectif de cette \ue9tude \ue9tait de d\ue9terminer la distribution, les variations saisonni\ue8res et les h\uf4tes alternatives du vecteur et de IYSV. Pour la distribution, une enqu\ueate a \ue9t\ue9 conduite sur un r\ue9seau de champs dans toutes les zones productrices d\u2019oignon du Kenya\ua0; alors que pour la saisonnalit\ue9, des enqu\ueates ont \ue9t\ue9 conduites dans deux zones\ua0; Loitoktok et Naivasha. Les donn\ue9es ont \ue9t\ue9 collect\ue9es sur l\u2019incidence d\u2019IYSV, la population de thrips et les h\uf4tes alternatives. Les r\ue9sultats ont montr\ue9 que IYSV \ue9tait largement distribu\ue9 dans toutes les zones de production d\u2019oignon\ua0; avec l\u2019incidence variant de 26 \ue0 72%. La plus grande incidence d\u2019IYSV a \ue9t\ue9 obtenue pendant la saison s\ue8che et froide, et varie de 56,5 \ue0 71% alors que la plus faible incidence de l\u2019IYSV sur les oignons a \ue9t\ue9 observ\ue9e pendant la saison humide et froide (29,9 \ue0 32,2%). L\u2019incidence de la maladie de la tache jaune de Iris \ue9tait positivement corr\ue9l\ue9e avec le nombre de thrips des oignons \ue0 Loitokitok (r = 0,659; P<0,0001) et Naivasha (r = 0,623; P<0,0001). Les h\uf4tes alternatives identifi\ue9es pour l\u2019IYSV \ue9taient des poireaux, les ciboulettes, les \ue9chalotes, les ambsquarters, les amarantes \ue0 racine rouge, la lanterne chinoise et la morelle noire. L\u2019occurrence des thrips des oignons produits toute l\u2019ann\ue9e appelle \ue0 des strat\ue9gies urgentes de gestion int\ue9gr\ue9e des pestes qui comprennent la r\ue9sistance de la plante h\uf4te, l\u2019assainissement du champ, pr\ue9vision, et l\u2019usage des insectes b\ue9n\ue9fiques et parasito\uefdes pour r\ue9duire l\u2019impact de la peste et de la maladie. Le respect de la sant\ue9 de la plante \ue0 travers l\u2019enl\ue8vement des adventices, les h\uf4tes alternatives dans les champs cultiv\ue9s, serait b\ue9n\ue9fique en minimisant l\u2019incidence de l\u2019IYSV