Machine learning predicts cardiovascular events in patients with diabetes: The Silesia Diabetes-Heart Project.

We aimed to develop a machine learning (ML) model for predicting cardiovascular (CV) events in patients with diabetes (DM). This was a prospective, observational study where clinical data of patients with diabetes hospitalized in the diabetology center in Poland (years 2015 - 2020) were analyzed using ML. The occurrence of new CV events following discharge was collected in the follow-up time for up to 5 years and 9 months. An end-to-end ML technique which exploits the neighborhood component analysis for elaborating discriminative predictors, followed by a hybrid sampling/boosting classification algorithm, multiple logistic regression, or unsupervised hierarchical clustering was proposed. In 1735 patients with diabetes (53% female), there were 150 (8.65%) ones with a new CV event in the follow-up. Twelve most discriminative patients' parameters included coronary artery disease, heart failure, peripheral artery disease, stroke, diabetic foot disease, chronic kidney disease, eosinophil count, serum potassium level, and being treated with clopidogrel, heparin, proton pump inhibitor, and loop diuretic. Utilizing those variables resulted in the area under the receiver operating characteristic curve (AUC) ranging from 0.62 (95% Confidence Interval [CI] 0.56-0.68, p<0.01) to 0.72 (95%CI 0.66-0.77, p<0.01) across five non-overlapping test folds, whereas multiple logistic regression correctly determined 111/150 (74.00%) high-risk patients, and 989/1585 (62.40%) low-risk patients, resulting in 1100/1735 (63.40%) correctly classified patients (AUC: 0.72, 95%CI 0.66-0.77). ML algorithms can identify patients with diabetes at a high risk of new CV events based on a small number of interpretable and easy-to-obtain patients' parameters

Adverse Events and Clinical Correlates in Asian Patients with Atrial Fibrillation and Diabetes Mellitus: A Report from Asia Pacific Heart Rhythm Society Atrial Fibrillation Registry

Aims. To evaluate the adverse events (and its clinical correlates) in a large prospective cohort of Asian patients with atrial fibrillation (AF) and diabetes mellitus (DM). Material and Methods. We recruited patients with atrial fibrillation (AF) from the Asia-Pacific Heart Rhythm Society (APHRS) AF Registry and included those for whom the diabetic mellitus (DM) status was known. We used Cox-regression analysis to assess the 1-year risk of all-cause death, thromboembolic events, acute coronary syndrome, heart failure and major bleeding. Results. Of 4058 patients (mean age 68.5 ± 11.8 years; 34.4% females) considered for this analysis, 999 (24.6%) had DM (age 71 ± 11 years, 36.4% females). Patients with DM had higher mean CHA2DS2-VASc (2.3 ± 1.6 vs. 4.0 ± 1.5, p < 0.001) and HAS-BLED (1.3 ± 1.0 vs. 1.7 ± 1.1, p < 0.001) risk scores and were less treated with rhythm control strategies compared to patients without DM (18.7% vs. 22.0%). After 1-year of follow-up, patients with DM had higher incidence of all-cause death (4.9% vs. 2.3%, p < 0.001), cardiovascular death (1.3% vs. 0.4%, p = 0.003), and major bleeding (1.8% vs. 0.9%, p = 0.002) compared to those without DM. On Cox regression analysis, adjusted for age, sex, heart failure, coronary and peripheral artery diseases and previous thromboembolic event, DM was independently associated with a higher risk of all-cause death (HR 1.48, 95% CI 1.00–2.19), cardiovascular death (HR 2.33, 95% CI 1.01–5.40), and major bleeding (HR 1.91, 95% 1.01–3.60). On interaction analysis, the impact of DM in determining the risk of all-cause death was greater in young than in older patients (p int = 0.010). Conclusions. Given the high rates of adverse outcomes in these Asian AF patients with DM, efforts to optimize the management approach of these high-risk patients in a holistic or integrated care approach are needed

Aktywność przeciwgrzybowa bakterii z rodzaju Bacillus wobec Alternaria sp.

The aim of the study was to assess the fungistatic activity of cell-free supernatants (CFS) obtained from 4, 6, 8, 10 and 24-hour culture of Bacillus KF2 and Bacillus BK2 against Alternaria sp. The antagonistic activity of bacterial exometabolites was determined by the dual-culture technique both on Czapek and PDA media. Plates were incubated at 28ºC for 13 days and the fungal growth was measured every 2 days. The antagonistic activity of these strains was evaluated as the growth rate index. The growth of Alternaria sp. was 4-fold and 5-fold slower after application of CFS obtained from Bacillus KF2 (respectively on PDA and Czapek media) than in control. In case of 10-hour culture and 4-hour culture maximum antifungal activity of this strain was observed on PDA and Czapek media, respectively. This strain reduced the growth rate of Alternaria sp. from 72 to 80%. However, inhibition of Alternaria sp. by Bacillus BK2 was markedly less than that by Bacillus KF2. An increase in age of culture of Bacillus BK2 correspondent to an increase in the percent of inhibition up to 24-hour culture from 16% to 22% on PDA and Czapek media, respectively. Supernatants obtained from the culture of both strains showed fungistatic activity against Alternaria sp., depending on the age of the culture and the composition of the medium, although the Bacillus KF2 showed a stronger effect than Bacillus BK2. The experimental results exhibit the fungistatic activity of Bacillus strains and indicate the possibility of using theirs, especially Bacillus KF2, as antifungal agents against Alternaria sp.Celem podjętych badań była ocena aktywności fungistatycznej supernatantów otrzymanych z 4-, 6-, 8-, 10- i 24-godzinnych hodowli Bacillus KF2 i Bacillus BK2 wobec Alternaria sp. Na podstawie indeksu tempa wzrostu określono aktywność fungistatyczną szczepów Bacillus sp. na podłożach PDA i Czapka. Wyniki badań wskazują, że tempo wzrostu Alternaria sp. na tych podłożach było 4-krotnie oraz 5-krotnie wolniejsze po zastosowaniu supernatantów uzyskanych z hodowli Bacillus KF2 niż w próbce kontrolnej. Maksymalną aktywność tego szczepu zanotowano po zastosowaniu 10-godzinnej i 4-godzinnej hodowli odpowiednio na podłożach PDA i Czapka. Natomiast aktywność przeciwgrzybowa szczepu Bacillus BK2 była znacznie mniejsza niż Bacillus KF2. Wraz ze wzrostem wieku hodowli Bacillus BK2 do 24 h obserwowano wzrost hamowania tempa wzrostu na obu podłożach (od 16 do 22%). Supernatanty otrzymane z hodowli obu szczepów wykazały działanie fungistatyczne wobec Alternaria sp., przy czym silniejszy wpływ wykazał Bacillus KF2, redukując tempo wzrostu o ok. 70-80% w zależności od wieku hodowli. Uzyskane wyniki badań potwierdzają aktywność fungistatyczną szczepów Bacillus sp. i wskazują na możliwość wykorzystania ich, szczególnie szczepu Bacillus KF2, jako środków przeciwgrzybicznych wobec Alternaria sp

Aktywność przeciwgrzybowa bakterii z rodzaju Pseudomonas wobec Alternaria sp.

The aim of the research was to determine a fungistatic activity of bacteria Pseudomonas against Alternaria sp. The antagonistic properties of metabolites were assessed with a culture-plate method on Czapek and PDA growth media for Pseudomonas sp. cultures after 4, 6, 8, 10 and 24 hours of culturing. The culturing process was conducted at 22ºC for 14 days. The fungistatic activity of Pseudomonas sp. strains was determined against the growth rate index. As proved by the results obtained, the strain of Alternaria sp. under study showed sensitivity to supernatants of Pseudomonas sp. The linear growth of the mycelium of Alternaria sp. was inhibited most actively by Pseudomonas sp. strain BK1. The highest decrease, amounting 76%, in the value of the growth rate index was obtained after 10 hours of culturing on Czapek medium. In case of Pseudomonas sp. strain marked KF1, the highest reduction in the growth rate index was noted for the 24-hour culture on PDA medium and amounted to only 18%. Conducted research confirms fungistatic activity of Pseudomonas sp. strains against Alternaria sp. and proves that the growth inhibition of mycelium depends not only on the metabolites types produced by a specific bacterial strain but also on the length of culturing process.Celem badań było określenie aktywności fungistatycznej bakterii z rodzaju Pseudomonas wobec Alternaria sp. Ocenę właściwości antagonistycznych metabolitów przeprowadzono metodą hodowlano-płytkową na podłożu Czapka oraz PDA dla 4-, 6-, 8-, 10- i 24-godzinnych hodowli Pseudomonas sp. Hodowlę prowadzono w temperaturze 22ºC przez 14 dni. Na podstawie indeksu tempa wzrostu określono aktywność fungistatyczną szczepów Pseudomonas sp. Wyniki doświadczenia wskazują, że badany szczep Alternaria sp. był wrażliwy na działanie supernatantów Pseudomonas sp. Największą inhibicję rozrostu liniowego grzybni Alternaria sp. powodował szczep Pseudomonas sp. BK1. W tym przypadku najwyższy 76% spadek indeksu tempa wzrostu grzybni uzyskano dla 10-godzinnej hodowli na podłożu Czapka. Natomiast dla szczepu Pseudomonas sp. KF1 największą redukcję indeksu tempa wzrostu odnotowano dla 24-godzinej hodowli na podłożu PDA, jednak wynosiła ona jedynie 18%. Przeprowadzone badania potwierdzają fungistatyczne działanie szczepów Pseudomonas sp. wobec Alternaria sp. Ponadto wykazują, że inhibicja wzrostu grzybni uzależniona jest nie tylko od rodzaju metabolitów wydzielanych przez dany szczep bakterii, ale również od wieku jej hodowli

Udział zewnątrzkomórkowych metabolitów bakteryjnych w zahamowaniu wzrostu grzybów

In the process of biological control of plants pathogens, special biological preparations containing cells of microorganisms or their metabolites are applied. The aim of conducted research was to assess the effect of Bacillus subtilis culture or its supernatant on the mycelial growth of Fusarium culmorum. The antagonistic properties of B. subtilis were assessed with the culture-plate method. The research was conducted on two different media, containing glucose or sucrose, in order to consider the effect of the source of carbon on the inhibitory process. The culturing process was conducted at 25±2ºC for 7 days and every 2-3 days the diameter of the mycelium was measured while the fungistatic activity of B. subtilis was determined against the mycelial growth rate index. The obtained results showed that the measured values of the growth rate index in the control trials were similar regardless of the carbon source in the medium. In tested trials no significant inhibition of the mycelial growth have been noted in the presence of glucose. Measured values of the growth rate index in tested trials were lower of 0.2-1.7 units compared with the control trials. The growth inhibition in the cultures on the medium with sucrose obtained 20% with an addition of the supernatant and 40% with an addition of B. subtilis culture.W metodach biologicznej walki z fitopatogenami roślin stosuje się między innymi biopreparaty, które jako substancję czynną zawierają żywe komórki mikroorganizmów lub ich metabolity. Celem przeprowadzonych badań było określenie wpływ hodowli bakteryjnej Bacillus subtilis oraz jego supernatantu na wzrost grzybni Fusarium culmorum. Ocenę właściwości antagonistycznych B. subtilis przeprowadzono metodą hodowlano-płytkową. Badania przeprowadzono na dwóch różnych podłożach, zawierających glukozę lub sacharozę, uwzględniając w ten sposób wpływ źródła węgla na proces inhibicji. Hodowle prowadzono w temperaturze 25±2ºC przez 7 dni, dokonując co 2-3 dni pomiaru średnicy grzybni, a aktywność fungistatyczną B. subtilis określono w oparciu o indeks tempa wzrostu grzybni. Na podstawie uzyskanych wyników stwierdzono, iż w próbach kontrolnych indeks tempa wzrostu był na zbliżonym poziomie niezależnie od źródła węgla zawartego w podłożu. W próbach badanych nie odnotowano znaczącego zahamowania wzrostu grzybni w obecności glukozy. Wartości indeksu tempa wzrostu dla prób badanych były niższe jedynie o 0,2-1,7 jednostki w porównaniu do prób kontrolnych. Natomiast w hodowlach prowadzonych na podłożu zawierającym sacharozę uzyskano około 20% zahamowanie po zastosowaniu supernatantu i ponad 40% w obecności hodowli bakteryjnej B. subtilis

Aktywność przeciwgrzybowa bakterii z rodzaju Bacillus spp. wobec Fusarium spp.

The aim of the study was to assess the fungistatic activity of supernatants obtained from 4, 6, 8, 10 and 24-hour culture of Bacillus KF2 and Bacillus BK2 against Fusarium spp. The antagonistic activity was evaluated on the basis the rate index of fungal growth on Czapek-Dox and PDA media. The rate index of Fusarium spp. growth on PDA medium was 5-fold and 3.5-fold slower than in the control, after application of supernatants obtained from the 24-hour culture (respectively for Bacillus KF2 and Bacillus BK2). Similarly, a high antifungal activity of the tested strains was observed on Czapek-Dox medium. The growth of Fusarium spp. was 6-fold and 3.5-fold slower after application of supernatants obtained from 6-hour culture, respectively, for Bacillus KF2 and Bacillus BK2. Supernatants obtained from the culture of both strains showed fungistatic activity against Fusarium spp., although the Bacillus KF2 strain showed a stronger impact than Bacillus BK2 strain. The inhibitory properties of Bacillus species was depended on the age of the bacterial culture and/or strains of Bacillus, and the composition of the medium. The experimental results exhibit the fungistatic activity of Bacillus strains and indicate the possibility of use their as antifungal agents against Fusarium spp.Celem podjętych badań była ocena aktywności fungistatycznej supernatantów otrzymanych z 4-, 6-, 8-, 10- i 24-godzinnych hodowli Bacillus KF2 i Bacillus BK2 wobec Fusarium spp. Ocenę właściwości antagonistycznych metabolitów bakteryjnych przeprowadzono metodą hodowlano-płytkową z zastosowaniem podłoży Czapka i PDA. Tempo wzrostu Fusarium spp. na podłożu PDA było 5-krotnie oraz 3,5-krotnie wolniejsze niż w próbce kontrolnej, po zastosowaniu supernatantów uzyskanych z 24-godzinnej hodowli, odpowiednio dla Bacillus KF2 i Bacillus BK2. Podobnie dużą aktywność przeciwgrzybową badanych szczepów stwierdzono na podłożu Czapka. Indeks tempa wzrostu Fusarium spp. był 6-krotnie oraz 3,5-krotnie wolniejszy po zastosowaniu supernatantów z 6-godzinnej hodowli, odpowiednio dla Bacillus KF2 i Bacillus BK2. Supernatanty otrzymane z hodowli obu szczepów wykazały działanie fungistatyczne wobec Fusarium spp. przy czym silniejszy wpływ wykazał Bacillus KF2. Stopień zahamowania wzrostu Fusarium spp. zależał od gatunku bakterii, wieku jej hodowli, rodzaju podłoża i czasu trwania hodowli. Uzyskane wyniki badań wykazały aktywność fungistatyczną szczepów Bacillus spp. i wskazują na możliwość wykorzystania ich jako środków przeciwgrzybiczych wobec Fusarium spp

Skuteczność przeciwgrzybowa Bacillus amyloliquefaciens wobec Alternaria sp.

The aim of the research was to assess a potential biological activity of B. amyloliquefaciens against Alternaria sp. In the conducted studies taken into account three factors: the bacterial cell density, the presence of the bacterial cells or the cell-free supernatant and the composition of the medium. The antagonistic properties were assayed with a dual culture plate method on PDA and Czapek media. The culturing process was conducted at 25 ±2°C for 14 days. The influence of the metabolites produced by B. amyloliquefaciens on the growth of Alternaria sp. was evaluate on the basis the growth rate index. Conducted studies have shown that the linear growth of Alternaria sp. was 6-fold and 5-fold slower after application of bacterial culture with the optical density equal 2.0, respectively on PDA and Czapek media, compared to the control tests. Furthermore, it was a slightly stronger inhibitory properties of B. amyloliquefaciens on PDA medium, wherein the carbon source was glucose than on Czapek medium where the carbon source was sucrose. This difference was about 1-3%. The linear growth of the fungus was inhibited more strongly by bacterial culture (approximately 2-3%), compared to the cell-free supernatant, regardless of the density of the cells and type of medium. Taking into account all the analyzed factors, the application of bacterial culture with a density of 2.0 on PDA medium, resulted in the slowest the growth of this fungus, approximately 83% compared with the control tests. B. amyloliquefaciens may find a wide range of application, in the process of plant protection against diseases caused by Alternaria sp.Celem przeprowadzonych badań była ocena właściwości przeciwgrzybowych B. amyloliquefaciens wobec Alternaria sp. W badaniach uwzględniono trzy parametry: gęstość komórek bakteryjnych, rodzaj podłoża oraz wpływ hodowli zawierającej komórki bakterii lub płyn pohodowlany. Ocenę właściwości antagonistycznych metabolitów bakteryjnych przeprowadzono metodą hodowlano-płytkową z zastosowaniem podłoży Czapka i PDA. Hodowlę prowadzono w temp. 25 ±2°C przez 14 dni. Na podstawie indeksu tempa wzrostu określono aktywność fungistatyczną B. amyloliquefaciens. Badania wykazały różnice w aktywności metabolicznej bakterii w zależności od analizowanych parametrów. Liniowy wzrost Alternaria sp. był prawie 6-kronie słabszy na podłożu PDA i 5-krotnie słabszy na podłożu Czapka po zastosowaniu hodowli bakterii o gęstości E = 2,0. Ponadto nieznacznie silniejsze właściwości hamujące B. amyloliquefaciens odnotowano na pożywce PDA, w której źródłem węgla była glukoza, niż na pożywce Czapka zawierającej sacharozę. Różnica ta wynosiła około 1-3%. Liniowy wzrost grzyba był również silniej hamowany o ok. 2-3% po zastosowaniu hodowli bakteryjnej w porównaniu do supernatantu, niezależnie od gęstości komórek i rodzaju pożywki. Biorąc pod uwagę wszystkie analizowane czynniki, zastosowanie hodowli bakteryjnej o gęstości 2,0 i pożywki PDA spowodowało zmniejszenie tempa wzrostu tego grzyba o około 83% w porównaniu do próby kontrolnej. B. amyloliquefaciens może znaleźć szerokie zastosowanie w procesie ochrony roślin przed chorobami wywołanymi przez Alternaria sp

Aktywność przeciwgrzybowa bakterii z rodzaju Pseudomonas

The aim of the research was to determine a fungistatic activity of bacteria Pseudomonas against Fusarium sp. The antagonistic properties were assessed with a culture-plate method on Czapek and PDA growth media for Pseudomonas sp. cultures after 4, 6, 8, 10 and 24 hours of culturing. The culturing process was conducted at 22ºC for 14 days. The fungistatic activity of Pseudomonas sp. strains was determined against the growth rate index. Obtained results proved that tested strain of Fusarium sp. was sensitive to supernatants of Pseudomonas spp. The linear growth of the mycelium of Fusarium sp. was inhibited most actively by Pseudomonas sp. strain BK1. The highest decrease, amounting 77%, in the value of the growth rate index was obtained after 10 hours of culturing on Czapek medium. The highest reduction of the growth rate index for Pseudomonas sp. strain KF1 was also noted for 10-hour culture, but it amounted only 42% in this case. Conducted research confirm fungistatic activity of Pseudomonas spp. strains against Fusarium sp. and prove that growth inhibition of the mycelium depends not only on the type of metabolites produced by a specific bacterial strain but also on time they were cultured for.Celem badań było określenie aktywności fungistatycznej bakterii z rodzaju Pseudomonas wobec Fusarium sp. Ocenę właściwości antagonistycznych metabolitów przeprowadzono metodą hodowlano-płytkową na podłożu Czapka oraz PDA dla 4-, 6-, 8-, 10- i 24-godzinnych hodowli Pseudomonas sp. Hodowle prowadzono w temperaturze 22ºC przez 14 dni. Na podstawie indeksu tempa wzrostu określono aktywność fungistatyczną szczepów Pseudomonas sp. Wyniki doświadczenia wskazują, że badany szczep Fusarium sp. był wrażliwy na działanie supernatantów Pseudomonas sp. Największą inhibicję rozrostu liniowego grzybni Fusarium sp. powodował szczep Pseudomonas sp. BK1. W tym przypadku najwyższy 77% spadek indeksu tempa wzrostu grzybni uzyskano w przypadku 10-godzinnej hodowli na podłożu Czapka. Natomiast dla szczepu Pseudomonas sp. KF1 największą redukcję indeksu tempa wzrostu odnotowano dla hodowli 10-godzinnej i wynosiła ona jedynie 42%. Przeprowadzone badania potwierdzają fungistatyczne działanie szczepów Pseudomonas sp. wobec Fusarium sp. Ponadto wykazują, że inhibicja wzrostu grzybni uzależniona jest nie tylko od rodzaju metabolitów wydzielanych przez dany szczep bakterii, ale również od wieku jej hodowli

Wpływ czynników fizycznych na aktywność amylolityczną Bacillus sp. wyizolowanych ze środowiska naturalnego

The influence of different factors on amylolytic activity Bacillus cereus (2 strains) and Bacillus mycoides (2 strains), isolated from soil samples and water of Turawa Lake has been studied. Effect of physiological (pH of reaction mixture in the range of 4.0–8.0, temperature of reaction from 30 to 60 oC) and nutritional parameters (the carbon sources and they concentration in medium) were examined spectophotometricaly for their effect on amylase production. The results obtained showed, that in view of all studied factors the least favorable value of pH was 5.0, while in most cases the most favourable for the process of amylase production were following values 7.0 and 8.0. Moreover, it has been stated that the lowest amount of amylase was noted at 30 oC, and the highest at 60 oC. In case of amylolytic activity, in view of all temperatures the most effective strain was B. mycoides A134 whereas the least B. mycoides G3. The best results of amylase production have been achieved for all remaining strains in two cases – on maltose and glucose medium at all tested temperatures. Additionally, soil occurring strains preferred lower concentration of potato starch (ie 1 %) when compared with water strains which favoured higher concentration (5 %).Celem badań była ocena wpływu różnych czynników na aktywność amylolityczną Bacillus cereus (2 szczepy) i Bacillus mycoides (2 szczepy) wyizolowanych z gleby i Jeziora Turawskiego. Metodą spektrofotometryczną badano wpływ pH mieszaniny reakcyjnej w zakresie od 5.0 do 8.0 i temperatury w zakresie od 30 oC do 60 oC oraz źródła węgla i jego koncentracji w podłożu na poziom produkowanych amylaz. Stwierdzono, iż najgorszą wartością pH do syntezy amylaz było 5.0, natomiast najlepszą, w większości przypadków pH 7.0. Uwzględniając zakres badanych temperatur, najwyższą aktywność uzyskano w temp. 60 oC, natomiast najniższą w temp. 30 oC dla wszystkich testowanych szczepów. Najbardziej aktywnym szczepem był B. mycoides A 134, natomiast najmniej B. mycoides G3