Протеомный анализ магний-зависимых белков в системе «мать-плод-ребёнок»

Systems biology analysis of over 700 magnesium-dependent proteins in human proteome shown that these proteins affect (1) the embryonic development, (2) energy metabolism, (3) signal transduction processes from receptors, (4) neurological function, (5) support of connective tissue structure, (6) cardiovascular and (7) immunological roles. Magnesium deficiency during pregnancy will stimulate deveLopment of congential maLformations (skeletal defects, rickets, hernia of the diaphragm, facial defects, craniosynostosis, structural disorders of the retina and vision, brachydactyly). Magnesium deficiency at an early age is associated with sudden death syndrome in preschool and adolescence leads to impaired function of skeletal muscles and myocardium. Magnesium deficiency is also characterized by mitochondrial disorders, hyperinsulinemia, disorders of the skin structure and its appendages, tumors and diseases associated with impaired energy metabolism (including hypoparathyroidism and anemia). Effects of magnesium deficiency in children significantly heavier on the background of lack of vitamin B6 (pyridoxine). The results of proteomic analysis enable to point out the reLevant molecular and physiologicaL mechanisms of synergy between magnesium and pyridoxine. Overall, the results of the analysis indicate a very extensive area for the correction of magnesium and pyridoxine deficiency for the prevention and treatment of a wide range of diseases, from the period of fetal development and earLy chiLdhood through adolescence.Системно-биологический анализ более 700 магний-зависимых белков протеома человека указал на 7 важнейших направлений действия магния: (1) эмбриональное развитие; (2) энергетический метаболизм; (3) процессы передачи сигналов от рецепторов; (4) неврологические роли; (5) поддержка структуры соединительной ткани; (6) сердечно-сосудистые и (7) иммунологические роли. Дефицит магния во время беременности будет способствовать развитию пороков развития (скелетные дефекты, рахит, грыжа диафрагмы, лицевые пороки, краниосиностоз, нарушения строения ретины и зрения, брахидактилия). В раннем возрасте дефицит магния ассоциирован с синдромом внезапной смерти, в дошкольном и подростковом возрасте приводит к нарушениям функции мышц что, в случае миокарда, ассоциировано с нарушениями сократимости желудочков сердца и аритмией. Для дефицита магния также характерны митохондриальные нарушения, гиперинсулинемия, нарушения структуры кожи и её придатков, опухолевые заболевания и заболевания, ассоциированными с нарушениями энергетического метаболизма (в т. ч. гипопаратиреоз и анемия). Эффекты дефицита магния у плода и у детей существенно утяжеляются на фоне недостаточности витамина В6 (пиридоксин). Результаты протеомного анализа позволили указать на соответствующие молекулярно-физиологические механизмы синергизма магния и пиридоксина. В целом, результаты настоящего анализа указывают на весьма обширные области для коррекции недостаточности магния и пиридоксина с целью профилактики и терапии широкого круга заболеваний, начиная с периода внутриутробного развития и раннего детства до подросткового периода

Фармакоинформационный анализ молекул препарата Климактоплан

An analysis of an array of publications on naturaL extracts of tsimitsifuga, sepia, sanguinaria included in the preparation KLimaktoplan, showed that only the extracts of tsimitsifugi have more than 800 studies. The main active principles of the Klimaktoplan are synergistically interacting triterpene gLycosides, cymic acid derivatives of cymicifuge and naturaL pigments - brown melanin (sepia) and red sanguinarine (extract of Canadian sanguinaria). The results of fundamental and clinical studies of molecules of natural extracts in the KlimaktopLan indicate the following pharmacologicaL effects: anti-inflammatory, antidiabetic, vasodilator, hepatoprotective, spasmolytic, antiatherosclerotic, antitumor. Combination of components in the Klimaktoplan causes the effectiveness of the drug not onLy for the treatment of hot flashes, but a comorbid pathoLogy characteristic of the postmenopausal period. The possibility of combining extracts of Cimicifuga with other natural extracts (sepia, Canadian sanguinaria, etc.) is considered.Анализ массива публикаций по природным экстрактам цимицифуги, сепии, сангвинарии, входящим в состав препарата Климактоплан, показал, что только по экстрактам цимицифуги имеется более 800 исследований. Основными действующими началами Климактоплана являются синергидно взаимодействующие тритерпеновые гликозиды, производные кофеиновой кислоты цимицифуги и натуральных пигментов - коричневого меланина (сепия) и красного сангвинарина (экстракт сангвинарии канадской). Результаты фундаментальных и клинических исследований молекул экстрактов природного происхождения в Климактоплане указывают на следующие фармакологические эффекты - противовоспалительный, противодиабетический, вазодилататорный, гепатопротекторный, спазмолитический, антиатеросклеротический, противоопухолевый. Комбинирование компонентов в Климактоплане обуславливает эффективность препарата не только для лечения приливов, но коморбидной патологии, характерной для периода постменопаузы

МОРФОЛОГИЧЕСКИЕ ИЗМЕНЕНИЯ МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ И ЯИЧНИКОВ У МЫШЕЙ С ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНО ИЗМЕНЕННЫМ ТИРЕОИДНЫМ СТАТУСОМ

The frequency of breast tumors has been studied in inbreed C3H-A mice with affected thyroid status. It has been shown that frequency of breast tumors was significantly higher in the animals with hyperthyroid condition versus the hypothyroid group (рИсследовали частоту возникновения рака молочной железы у инбредных мышей линии С3Н-А с измененным тиреоидным статусом. Выявлено, что частота возникновения рака молочной железы была достоверно выше у животных с длительно протекающим гипертиреозом по сравнению с гипотиреоидной группой (

Virus-associated chronic endometritis: treatment options

Aim. To evaluate the effectiveness of Alloferon (Allokin-alfa) in the complex treatment of virus-associated chronic endometritis (CE) in patients with infertility, papillomavirus infection (PVI) persisting in the uterine cavity, and recurrent herpes-virus infection localized in the genital area. Materials and methods. A prospective (n=33) open randomized (2:1) study was conducted to assess the efficacy of Alloferon (Allokin-alfa) in the complex treatment of CE in patients with infertility, PVI, and recurrent herpes-virus infection, aged 25 to 37 years (median age 31 [29; 32.5] years). All patients received valacyclovir therapy at 500 mg once daily for 30 days from the day of randomization. Patients in the main group (n=21) simultaneously with the start of antiviral therapy received Allokin-alfa as 9 subcutaneous injections once every two days (one injection every other day). The uterine cavity microbiota of the patients was assessed 3 months after treatment, and histological and immunohistochemical studies of endometrial biopsy specimens were performed. Results. The microbiological data analysis showed HPV elimination in 71.4% vs 16.7% of patients in the alloferon and control groups, respectively (2 7.102, p=0.008). Also, in the main group, a significant decrease in the severity of CE (2 27.586, p0.001) and p16ink4a protein expression levels (2 6.17, p=0.013) were observed. Conclusion. In the treatment of virus-associated CE, the addition of alloferon to virus-suppressive therapy leads to higher rates of HPV elimination from the uterine cavity and significantly reduces the severity of CE

Анализ 19,9 млн публикаций базы данных PubMed/MEDLINE методами искусственного интеллекта: подходы к обобщению накопленных данных и феномен “fake news”

Introduction. The English-language databases PubMed/MEDLINE and Embase are valuable information resources for finding original publications in basic and clinical medicine. Currently, there are no artificial intelligence systems to evaluate the quality of these publications.Aim. Development and testing of a system for sentiment analysis (i.e. analysis of emotional modality) of biomedical publications.Materials and methods. The technique of analysis of the “Big data” of biomedical publications was formulated on the basis of the topological theory of sentiment analysis. Algorithms have been developed that allow for the classification of texts from 16 sentiment classes with 90% accuracy (manipulative speech, research without positive results, propaganda, falsification of results, negative personal attitude, aggressive text, negative emotional background, etc.). Based on the algorithms, a scale for assessing the sentiment quality of research (β-score) is proposed.Results. Abstracts of 19.9 million publications registered in PubMed/MEDLINE over the past 50 years (1970–2019) were analyzed. It was shown that publications with low sentiment quality (the value of the β-score of the text is less than zero, which corresponds to the prevalence of manipulative and negative sentiments in the text) comprise only 18.5% (3.68 out of 19.9 million). The greatest values of the β-score were characterized by publications on sports medicine, systems biology, nutrition, on the use of applied mathematics and data mining in medicine. The rubrication of the entire array of publications by 27,840 headings (MESH-system of PubMed/MEDLINE) indicated an increase in the β-score by years (i.e., the positive dynamics of sentiment quality of the texts of publications) for 27,090 of the studied headings. The most intense positive dynamics was found for research in genetics, physiology, pharmacology, and gerontology. 249 headings with sharply negative dynamics of sentiment quality and with a pronounced increase in the manipulative sentiments characteristic of the tabloid press were highlighted. Separate assessments of international experts are presented that confirm the patterns identified.Conclusion. The proposed artificial intelligence system allows a researcher to make an effective assessment of the sentiment quality of biomedical research papers, filtering out potentially inappropriate publications disguised as “evidence-based”.  Введение. Англоязычные базы данных PubMed/MEDLINE и Embase являются ценными информационными ресурсами для нахождения оригинальных публикаций по фундаментальной и клинической медицине. В настоящее время не существует систем искусственного интеллекта, позволяющих оценивать качество этих публикаций.Цель. Разработка и апробация системы для проведения сентимент-анализа (то есть анализа эмоциональной модальности) публикаций по биомедицине.Материалы и методы. Сформулирована методика анализа «больших данных» биомедицинских публикаций, основанная на топологической теории сентимент-анализа медицинских текстов. Разработаны алгоритмы, позволяющие с 90%-й точностью классифицировать тексты по 16 классам сентиментов (манипулятивные обороты речи, исследования без положительных результатов, пропаганда, подделка результатов, негативное личное отношение, агрессивность текста, негативный эмоциональный фон и др.). На основе алгоритмов предложена балльная шкала оценки сентимент-качества исследований (β-балл).Результаты. Проведен анализ текстов абстрактов 19,9 млн публикаций, зарегистрированных в PubMed/MEDLINE за последние 50 лет (1970–2019). Показано, что публикации с низким сентимент-качеством (значение β-балла текста меньше нуля, что соответствует преобладанию манипулятивных и негативных сентиментов в тексте) составляют всего 18,5% (3,68 из 19,9 млн).  Наибольшими значениями β-балла характеризовались публикации по спортивной медицине,  системной биологии, нутрициологии, по использованию методов прикладной математики и интеллектуального анализа данных в медицине. Рубрикация всего массива публикаций по 27840 рубрикам (MESH-система PubMed/MEDLINE) указала на повышение β-балла по годам (то есть на положительную динамику сентимент-качества текстов публикаций) для 27090 исследованных рубрик. Наиболее интенсивная положительная динамика найдена для исследований по генетике, физиологии, фармакологии и геронтологии. Выделены 249 рубрик с резко отрицательной  динамикой сентимент-качества и с выраженным нарастанием манипулятивных сентиментов,  характерных для «желтой» англоязычной прессы. Приведены отдельные оценки международных экспертов, которые подтверждают выявленные закономерности. Заключение. Разработанная система искусственного интеллекта позволяет проводить  эффективную оценку сентимент-качества биомедицинских исследований, отфильтровывая  потенциально неадекватные публикации, публикуемые под маской «доказательных». 

Компьютерный анализ эмоциональной модальности 20 млн публикаций в базе данных PUBMED указывает на пути повышения эффективности фармакотерапии посредством идентификации псевдонаучных публикаций, направленных на негативную эмоциональную «накачку» врачей

The search for original publications on fundamental and clinical medicine that would produce results of the highest scientific quality represents an urgent need for every medical researcher. Such publications are essential, in particular, for the development of reliable treatment standards. The Englishlanguage resources PUBMED and EMBASE are essential to help in solving this problem. However, there is an obvious problem in assessing the quality of the studies found. The paper formulates a method for analyzing the texts of biomedical publications, which is based on an algorithmic assessment of the emotional modality of medical texts (so-called sentiment analysis). The use of the topological theory of data analysis made it possible to develop a set of high-precision algorithms for identifying 16 types of sentiments (manipulative turns of speech, research without positive results, propaganda, falsification of results, negative personal attitude, aggressiveness of the text, negative emotional background, etc.). On the basis of the developed algorithms, a point scale for assessing the sentiment quality of research was obtained, which we called the "β-score": the higher the β-score, the less the evaluated text contains manipulative language constructions. As a result, the ANTIFAKE system (http://antifake-news.ru) was developed to analyze the sentiment-quality of Englishlanguage scientific texts. An analysis of ~ 20 million abstracts from PUBMED showed that publications with low sentiment quality (β-score <0, that is, that the prevalence of manipulative constructions over meaningful ones) is only 19 %. In the overwhelming majority of thematic headings (27,090 out of 27,840 headings of the MESH system PUBMED), a positive dynamics of sentiment quality of the texts of publications is shown by years). At the same time, as a result of the study, 249 headings were identified with sharply negative dynamics of sentiment quality and with a pronounced increase in manipulative sentiments characteristic of the "yellow" English-language press. These headings include tens of thousands of publications in peer-reviewed journals, which are aimed at (1) legalizing ethically unacceptable practices (euthanasia, perversions, so-called "population control", etc.), (2) discrediting psychiatry as a science, (3) media the war against micronutrients and (4) discrediting evidence-based medicine under the guise of developing the so-called "international standards of evidence-based medicine". In general, the developed system of artificial intelligence allows researchers to filter out pseudoscientific publications, the text of which is overloaded with emotional manipulation and which are published under the guise of "evidence-based standards".Поиск оригинальных публикаций по фундаментальной и клинической медицине наивысшего научного качества – насущная необходимость для каждого врача-исследователя. Такие публикации принципиально необходимы, в частности, для разработки надёжных стандартов лечения. Существенной подмогой в решении этой задачи являются англоязычные ресурсы PUBMED и EMBASE. Однако существует очевидная проблема оценки качества находимых исследований. В работе сформулирована методика анализа текстов биомедицинских публикаций, в основе которой лежит алгоритмическая оценка эмоциональной модальности медицинских текстов (т. н. сентимент-анализа). Применение топологической теории анализа данных позволило разработать комплекс высокоточных алгоритмов для выявления 16 типов сентиментов (манипулятивные обороты речи, исследования без положительных результатов, пропаганда, подделка результатов, негативное личное отношение, агрессивность текста, негативный эмоциональный фон и др.). На основе разработанных алгоритмов получена балльная шкала оценки сентимент-качества исследований, которую мы назвали «β-баллом»: чем выше β-балл, тем в меньшей степени оцениваемый текст содержит манипулятивные языковые конструкции. В результате разработана и апробирована система ANTIFAKE (http://antifake-news.ru), предназначенная для анализа сентимент-качества англоязычных научных текстов. Анализ ~20 млн абстрактов из PUBMED показал, что публикации с низким сентимент-качеством (β-балл которые направлены на (1) легализацию этически порочных практик (эвтаназия, т. н. «контроль популяций» и т. п.), (2) дискредитацию психиатрии как науки, (3) медийную войну против микронутриентов и (4) дискредитацию доказательной медицины под видом разработки т. н. «международных стандартов доказательной медицины». В целом, разработанная система искусственного интеллекта позволяет отфильтровывать псевдонаучные публикации, текст которых перегружен эмоциональной манипуляцией и которые публикуются под маской «доказательных стандартов»

Proteomic analysis of magnesium-dependent proteins and children’s health

Systems biology analysis of over 700 magnesium-dependent proteins in human proteome shown that these proteins affect (1) the embryonic development, (2) energy metabolism, (3) signal transduction processes from receptors, (4) neurological function, (5) support of connective tissue structure, (6) cardiovascular and (7) immunological roles. Magnesium deficiency during pregnancy will stimulate development of congential malformations (skeletal defects, rickets, hernia of the diaphragm, facial defects, craniosynostosis, structural disorders of the retina and vision, brachydactyly). Magnesium deficiency at an early age is associated with sudden death syndrome in preschool and adolescence leads to impaired function of skeletal muscles and myocardium. Magnesium deficiency is also characterized by mitochondrial disorders, hyperinsulinemia, disorders of the skin structure and its appendages, tumors and diseases associated with impaired energy metabolism (including hypoparathyroidism and anemia). Effects of magnesium deficiency in children significantly heavier on the background of lack of vitamin B6 (pyridoxine). The results of proteomic analysis enable to point out the relevant molecular and physiological mechanisms of synergy between magnesium and pyridoxine. Overall, the results of the analysis indicate a very extensive area for the correction of magnesium and pyridoxine deficiency for the prevention and treatment of a wide range of diseases, from the period of fetal development and early childhood through adolescence

Justification of the efficacy of antibacterial therapy for the treatment of chronic endometritis

A review of studies on chronic endometritis enables the authors to conclude that bacterially contaminated endometrium is the reason causing reduced fertility in case of confirmed subclinical inflammation. Chronic subclinical inflammation of the endometrium is often associated with genital endometriosis, which apparently leads to abnormal uterine bleedings. The identification of a microbial agent in case of endometritis in the routine outpatient practice is not mandatory because global experience including high-level evidence-based studies confirms the expediency of an empirical therapy based on minimum clinical criteria; otherwise, there may be irreversible consequences for the reproductive system. A preventive antibacterial therapy during the pre-conception period in infertile patients suffering from recurrent miscarriages is an efficient method to prevent reproductive losses

Hypo- and hyperthyroidism and survival of ovarian cancer patients

Background. The non-genomic effects of thyroid hormones, mediated through exposure to the membrane receptor CD51/CD61, are expressed in the activation of atypical cell proliferation, stimulation of tumor angiogenesis and cell migration. In connection with these cellular effects, the thyroid status of cancer patients can have prognostic value.The aim of study: to assess the effect of thyroid status on disease-free survival of patients with stage III ovarian cancer (OC).Materials and methods. Prospective trial with eligibility criteria for the inclusion and exclusion of participants was conducted. The study included 128 patients with stage III OC aged 45 to 70 years. All patients before treatment was determined thyroid status by examining the serum levels of thyroid hormones and performing an ultrasound examination of the thyroid gland. All patients received a comprehensive treatment of OC, including surgery and chemotherapy, and have complete remission following after treatment. After confirming the recurrence of the disease and/or death of the patient, the duration of the disease-free survival was determined.Results. Medians disease-free survival were 13.5 months, 17.8 months and 11.1 months for the euthyroid, hypothyroid and hyperthyroid groups, respectively, while significant differences in the medians disease-free survival occurred between the euthyroid and hypothyroid groups (p = 0.0206) and between the hypo- and hyperthyroid groups (p = 0.0156).Conclusions. Patients with hypothyroidism before the treatment of advanced OC have better disease-free survival. Thyroid status is independent favorable prognostic factor for survival in OC

Antibody to Marinobufagenin Reverses Placenta-Induced Fibrosis of Umbilical Arteries in Preeclampsia

Background: Previous studies implicated cardiotonic steroids, including Na/K-ATPase inhibitor marinobufagenin (MBG), in the pathogenesis of preeclampsia (PE). Immunoneutralization of heightened MBG by Digibind, a digoxin antibody, reduces blood pressure (BP) in patients with PE, and anti-MBG monoclonal antibody lessens BP in a rat model of PE. Recently, we demonstrated that MBG induces fibrosis in cardiovascular tissues via a mechanism involving inhibition of Fli-1, a nuclear transcription factor and a negative regulator of collagen-1 synthesis. Objectives and Methods: We hypothesized that in PE, elevated placental MBG levels are associated with development of fibrosis in umbilical arteries. Eleven patients with PE (mean BP 124 ± 4 mmHg; age 29 ± 2 years; 39 weeks gest. age) and 10 gestational age-matched normal pregnant subjects (mean BP 92 ± 2 mmHg; controls) were enrolled in the clinical study. Results: PE was associated with a higher placental (0.04 ± 0.01 vs. 0.49 ± 0.11 pmol/g; p < 0.01) and plasma MBG (0.5 ± 0.1 vs. 1.6 ± 0.5 nmol/L; p < 0.01), lower Na/K-ATPase activity in erythrocytes (2.7 ± 0.2 vs. 1.5 ± 0.2 µmol Pi/mL/hr; p < 0.01), 9-fold decrease of Fli-1 level and 2.5-fold increase of collagen-1 in placentae (p < 0.01) vs. control. Incubation of umbilical arteries from control patients with 1 nmol/L MBG was associated with four-fold decrease in Fli-1 level and two-fold increase in collagen-1 level vs. those incubated with placebo (p < 0.01), i.e., physiological concentration of MBG mimicked effect of PE in vitro. Collagen-1 abundance in umbilical arteries from PE patients was 4-fold higher than in control arteries, and this PE-associated fibrosis was reversed by monoclonal anti-MBG antibody ex vivo. Conclusion: These results demonstrate that elevated placental MBG level is implicated in the development of fibrosis of the placenta and umbilical arteries in PE