La réalisation d'un fascicule d'images commentées : synergie entre la sécurité en laboratoire de chimie, l'informatique et le français : compte rendu d'innovation

Cet article présente un exercice multidisciplinaire proposé aux étudiants de première année dans un département de chimie d'Institut Universitaire de Technologie (IUT). Il implique la sécurité en laboratoire, l'expression française et la bureautique. Les difficultés rencontrées dans sa conception, sa réalisation et son évaluation sont décrites. Sa mise en oeuvre a apporté des éléments de réponse aux questions que se posaient les enseignants de ces disciplines. Cet exercice correspond aux exigences imposées par les projets tutorés en IUT

Réduire les fuites de nitrate au moyen de cultures intermédiaires : conséquences sur les bilans d'eau et d'azote, autres services écosystémiques

La présence de nitrate en excès dans les eaux de surface et les nappes phréatiques pose des problèmes de santé publique et de dégradation de l’environnement. C’est d’abord un enjeu de santé publique notamment pour les nappes phréatiques, avec la nécessité de distribuer une eau de boisson présentant une teneur inférieure à la norme de potabilité qui est de 50 mg de nitrate par litre. C’est aussi un enjeu de protection de l’environnement pour les eaux de surface, en particulier pour certains bassins versants proches de la mer, comme en Bretagne ; le transfert rapide du nitrate des zones agricoles vers la mer induit une eutrophisation des zones côtières

Réduire les fuites de nitrate au moyen de cultures intermédiaires : conséquences sur les bilans d'eau et d'azote, autres services écosystémiques : Synthèse du rapport d'étude

Synthèse du rapport d'étude. Le présent document constitue la synthèse de l’étude sollicitée conjointement par le Ministère de l'Ecologie, du Développement Durable et de l'Energie et le Ministère de l’Agriculture et de l’Agroalimentaire et subventionnée par le Ministère de l'Ecologie, du Développement Durable et de l'Energie (étude n° 2100450303). Son contenu n'engage que la responsabilité de ses auteurs. Le rapport d’étude, source de cette synthèse, a été élaboré par les experts scientifiques sans condition d’approbation préalable par les commanditaires ou l’INRA. La synthèse a été validée par les auteurs du rapport

Réduire les fuites de nitrate au moyen de cultures intermédiaires : conséquences sur les bilans d'eau et d'azote, autres services écosystémiques : Synthèse du rapport d'étude

Synthèse du rapport d'étude. Le présent document constitue la synthèse de l’étude sollicitée conjointement par le Ministère de l'Ecologie, du Développement Durable et de l'Energie et le Ministère de l’Agriculture et de l’Agroalimentaire et subventionnée par le Ministère de l'Ecologie, du Développement Durable et de l'Energie (étude n° 2100450303). Son contenu n'engage que la responsabilité de ses auteurs. Le rapport d’étude, source de cette synthèse, a été élaboré par les experts scientifiques sans condition d’approbation préalable par les commanditaires ou l’INRA. La synthèse a été validée par les auteurs du rapport

Pathometric relationships reveal epidemiological processes involved in carrot cavity spot epidemics

International audienceCarrot cavity spot (CCS) is one of the most important soilborne diseases affecting the carrot crop. The few epidemiological studies that have investigated the temporal and spatial dynamics of the disease have been based solely on diagrammatic scales or semi-quantitative indices. To reveal epidemiological processes involved in the development of CCS epidemics, we investigated pathometric relationships. To this end, standardised measurements were defined (disease incidence i, lesion density d, conditional lesion density cd, lesion size ls, and total diseased area tda). The evolution of a cohort of CCS lesions according to their size suggested that lesions can expand over time. Two pathometric relationships were tested: a first one, between i and tda, is given by the equation i=100(1−exp(−a(t)tda)), where t is thermal time, and a second one, between tda, d, and ls, is given by the equation tda=c(t)πd(ls/2)2. These relationships were validated for CCS epidemics in the case of field experiments, a survey in commercial fields, and a controlled-conditions experiment. The temporal linear decrease of the time-dependent parameter a(t) in the first relationship suggested that CCS epidemics followed classical epidemiological phases driven by successive processes: (1) the mobilisation of soil inoculum leading to primary infection, (2) the spread of disease to neighbouring taproots (alloinfection), and (3) the intensification of disease on the taproot (autoinfection). This is consistent with complementary experimental results which demonstrated that auto- and alloinfections occur in CCS epidemics

Demonstration of secondary infection by Pythium violae in epidemics of carrot cavity spot using root transplantation as a method of soil infestation

International audienceCavity spot of carrot (CCS), one of the most important soilborne diseases of this crop worldwide, is characterized by small sunken elliptical lesions on the taproot caused by a complex of pathogens belonging to the genus Pythium, notably P. violae. In most soilborne diseases the soil is the source of inoculum for primary infections, with diseased plants then providing inoculum for secondary infections (both auto- and alloinfection). Using fragments of CCS lesions to infest soil, it was demonstrated that CCS lesions on carrot residues can cause primary infection of healthy roots. Using a novel soil infestation method, in which an artificially infected carrot root (the donor plant) was placed close to healthy roots (receptor plants) the formation of typical CCS lesions were induced more efficiently than the use of classical soil inoculum and showed that CCS can spread from root to root by alloinfection from transplanted diseased roots. The method also demonstrated the polycyclic nature of a CCS epidemic caused by P. violae in controlled conditions. Secondary infections caused symptoms and reduced root weight as early as two weeks after transplantation of the diseased carrot. This reproducible method may be used for delayed inoculation and for studying the effect of cropping factors and the efficacy of treatments against primary and secondary cavity spot infections

Un couvert pour soigner le sol

National audienc

Evaluation of the Sss AgriStrip rapid diagnostic test for the detectionof Spongospora subterranea on potato tubers

International audienceSpongospora subterranea, f.sp. subterranea (Sss), which causes powdery scab, is mainly spread through infected seed tubers and survives in contaminated soil for many years. The visual assessment of tuber lots by inspectors carries the risk of misidentification due to the difficulty of distinguishing lesions caused by either Sss or Streptomyces spp.. To avoid this, the "Sss AgriStrip", a rapid and lab-independent test tool based on a lateral flow immunoassay has been developed, and we assessed its accuracy and sensitivity for detecting Sss. The Sss AgriStrip performed as well as other lab-based identification methods. The Sss AgriStrip, microscopy, ELISA, PCR, and real-time PCR techniques identified infection with S. subterranea in all tubers with typical powdery scab lesions. When lots with tubers showing a mixture of typical and atypical (suspicious) symptoms were tested, the presence of S. subterranea was confirmed in all lesions by all methods. The DNA content was generally lower in atypical than in typical lesions. Diverse and suspicious symptoms, which were difficult to assign to either powdery or common scab, tested negative with Sss AgriStrip and the other methods. This was despite microscopic observation of sporosori-like structures in some samples. Isolation and molecular identification confirmed that these lesions were mostly caused by Streptomyces spp. The Sss AgriStrip is as sensitive as DAS-ELISA with a detection limit between 1 and 10 sporosori per ml buffer. It is ideal for rapid and selective detection of Sss on farms and border inspection points to prevent spread of the pathogen