Virale Determinanten für eine präferenzielle Integration lentiviraler Vektoren auf der Basis des Affenimmundefizienzvirus

Eine präferentielle Integration in transkriptionell aktive Bereiche des Genoms wurde für retrovirale Vektoren die auf $\gamma$-Retroviren und Lentiviren basieren beobachtet. Allerdings ließen sich Unterschiede in der Präferenz für die Integrationsorte feststellen, die eventuell durch unterschiedliche virale Komponenten des Präintegrationskomplexes erklärt werden können. Bis jetzt konnten noch keine viralen Determinanten für eine präferenzielle Integration bestimmt werden. Deswegen wurden in der vorliegenden Arbeit die Integrationsorte von verschiedenen Vektoren die auf SIV basieren untersucht. Dabei entsprach ein Vektor dem wt-SIV, einem fehlten die aksessorischen Gene $\it vpr$, $\it vpx$ und $\it vif$ und dem dritten fehlten jegliche Promotor- und Enhancer-Elemente. Ein Unterschied in der präferenziellen Integration der verwendeten Vektoren ließ sich nicht feststellen. Weder die Promotor- und Enhancer-Elemente, noch die akzessorischen Proteine sind an der gerichteten Integration beteiligt.Preferential integration into transcriptional active regions of the genome has been observed for retroviral vectors based on gamma-retroviruses and lentiviruses. However, differences in the integration site preferences were detected, which might be explained by differing viral components of the preintegration complexes. Viral determinants of integration site preferences have not been defined. Therefore, integration sites of simian immunodeficiency virus-based vectors produced in the absence of accessory genes or lacking promoter and enhancer elements were compared. Similar integration site preferences of SIV vectors lacking accessory genes or promoter and enhancer elements suggest, that the function either resides in $\textit {gag-pol}$, $\it tat$, $\it rev$ or an unidentified element of the vector DNA

Viral Determinants of Integration Site Preferences of Simian Immunodeficiency Virus-Based Vectors

Preferential integration into transcriptionally active regions of genomes has been observed for retroviral vectors based on gamma-retroviruses and lentiviruses. However, differences in the integration site preferences were detected, which might be explained by differences in viral components of the preintegration complexes. Viral determinants of integration site preferences have not been defined. Therefore, integration sites of simian immunodeficiency virus (SIV)-based vectors produced in the absence of accessory genes or lacking promoter and enhancer elements were compared. Similar integration patterns for the different SIV vectors indicate that vif, vpr, vpx, nef, env, and promoter or enhancer elements are not required for preferential integration of SIV into transcriptionally active regions of genomes