Active skeleton for bacteria modeling

The investigation of spatio-temporal dynamics of bacterial cells and their molecular components requires automated image analysis tools to track cell shape properties and molecular component locations inside the cells. In the study of bacteria aging, the molecular components of interest are protein aggregates accumulated near bacteria boundaries. This particular location makes very ambiguous the correspondence between aggregates and cells, since computing accurately bacteria boundaries in phase-contrast time-lapse imaging is a challenging task. This paper proposes an active skeleton formulation for bacteria modeling which provides several advantages: an easy computation of shape properties (perimeter, length, thickness, orientation), an improved boundary accuracy in noisy images, and a natural bacteria-centered coordinate system that permits the intrinsic location of molecular components inside the cell. Starting from an initial skeleton estimate, the medial axis of the bacterium is obtained by minimizing an energy function which incorporates bacteria shape constraints. Experimental results on biological images and comparative evaluation of the performances validate the proposed approach for modeling cigar-shaped bacteria like Escherichia coli. The Image-J plugin of the proposed method can be found online at http://fluobactracker.inrialpes.fr.Comment: Published in Computer Methods in Biomechanics and Biomedical Engineering: Imaging and Visualizationto appear i

Particle detection and tracking in fluorescence time-lapse imaging: a contrario approach

This paper proposes a probabilistic approach for the detection and the tracking of particles in fluorescent time-lapse imaging. In the presence of a very noised and poor-quality data, particles and trajectories can be characterized by an a contrario model, that estimates the probability of observing the structures of interest in random data. This approach, first introduced in the modeling of human visual perception and then successfully applied in many image processing tasks, leads to algorithms that neither require a previous learning stage, nor a tedious parameter tuning and are very robust to noise. Comparative evaluations against a well-established baseline show that the proposed approach outperforms the state of the art.Comment: Published in Journal of Machine Vision and Application

Optimal Asymmetric Binary Quantization for Estimation Under Symmetrically Distributed Noise

Estimation of a location parameter based on noisy and binary quantized measurements is considered in this letter. We study the behavior of the Cramer-Rao bound as a function of the quantizer threshold for different symmetric unimodal noise distributions. We show that, in some cases, the intuitive choice of threshold position given by the symmetry of the problem, placing the threshold on the true parameter value, can lead to locally worst estimation performance.Comment: 4 pages, 5 figure

L'élaboration d'un modèle de référence en encadrement des étudiants

Comprend des références bibliographiques.Cet article porte sur l’élaboration et l’implantation d’un modèle de référence en matière d'encadrement des étudiants pour tous les programmes d'études du Cégep de Sherbrooke. Il décrit notamment la démarche empruntée par l’équipe chargée de la modélisation du système d’encadrement et dont le but était d’élaborer un guide qui balise l’encadrement dans les programmes d’études, qui définit de façon explicite ses différentes composantes et leurs liens fonctionnels. Le modèle de référence élaboré précise les éléments auxquels les programmes d’études doivent se conformer, les décisions qui appartiennent à ces derniers, les personnes qui doivent les prendre et le cadre dans lequel elles doivent être prises. Décrivant les différents enjeux dont l’équipe a tenu compte ainsi que les définitions sur lesquelles elle s’est appuyée et les facteurs aidant à l’implantation d’un tel modèle d’encadrement, l’auteur mentionne certains effets positifs observés depuis sa récente mise en œuvre, entre autres le fait que le rôle du responsable d’encadrement soit plus clair et mieux compris, un recadrage des interventions à effectuer en priorité, un soutien plus structuré, des objectifs plus ciblés et plus facilement mesurables pour les plans d’encadrement et une sollicitation plus spontanée des conseillers pédagogiques par les responsables de l’encadrement

Technique contractuelle et gestion des risques dans les contrats internationaux : les cas de force majeure et d'imprévision

Une multitude d'événements peut perturber le déroulement d'une transaction internationale. La prévention et la répartition des risques revêtent donc une importance primordiale pour les parties au contrat. Les praticiens ont élaboré des clauses sophistiquées permettant d'adapter la relation contractuelle aux circonstances nouvelles. Parmi ces clauses, l'auteur analyse celles qui s'attachent à résoudre les problèmes d'exécution engendrés par les situations de force majeure et d'imprévision. L'insertion de telles clauses apparaît essentielle devant l'inadéquation des solutions juridiques nationales et internationales en la matière.Many events may upset an international transaction. The prevention and sharing of risks are therefore of primary importance for parties to the contract. Practitioners have developed sophisticated clauses to adapt contractual relations to new circumstances. The author analyses those applying to solving problems regarding performance that arise from acts of God and unforeseeable changes in circumstances. The insertion of such clauses appears to be essential owing to the inadequacies of national and international legal solutions in such matters