Rôle des acides aminés dans la production d'amines biogènes chez Oenococcus oeni

Dans le vin, les amines biogènes sont essentiellement d'origine microbienne, et sont produitesnotamment par les bactéries lactiques Oenococcus oeni, principal agent responsable de lafermentation malolactique, possède de nombreuses auxotrophies vis-à-vis des acides aminés.Aucune étude n'a été menée sur la relation entre l auxotrophie vis-à-vis d un acide aminé et leniveau de l amine correspondante. 80 souches de Oenococcus oeni ont été isolées de vinsrouges. Leurs auxotrophies vis-à-vis d acides aminés précurseurs d amines biogènes (Arg,Tyr, His et Phe) ainsi que la présence de gènes codant des enzymes impliquées dans lasynthèse des amines ont été étudiées. Aucune relation entre auxotrophie et niveau deproduction d amines ne peut être établie pour les souches testées. La présence de gènes codantdes enzymes impliquées dans la synthèse d amines n est pas non plus corrélée avec laproduction effective d amines. Nous montrons pour la première fois que Oenococcus oeni estun producteur d agmatine. Cette production est étroitement liée à la souche bactérienne. Lasouche la plus adaptée au milieu acide est celle qui consomme le plus l arginine et enproportions équivalentes par les 2 voies : voie de l arginine déiminase et voie de l argininedécarboxylase. L effet d une addition d agmatine dans des vins montre une atténuation del effet boisé du Chardonnay sans doute par formation de base de Schiff ente les composésd arôme et cette amineIn wine biogenic amines (BA) are mainly of microbial origin, Oenococcus oeni, the mainresponsible for malolactic fermentation, has been identified as a BA producer from nitrogenprecursors. Oenococcus oeni possess numerous amino acid auxotrophies that are precursors ofbiogenic amines. No study has been done so far to look at the relationship betweenauxotrophy for amino acids precursors of BA and the level of BA in the medium. In order todo so, 80 Oenococcus oeni strains were isolated from red wines. The detection of genesencoding the different decarboxylases responsible for BA synthesis has been realised. Inparallel, the auxotrophy for the four amino acids (Arg, Tyr, His, Phe) precursors of BA hascharacterized. Our results demonstrate that there is not direct correlation between auxotrophyand the accumulation of the corresponding BA as well as between the presence ofdecarboxylase gene and the accumulation of the corresponding BA. High levels of agmatineproduced from arginine decarboxylation by Oenococcus oeni is reported for the first time.Agmatine production is strain dependant. the most adapted to acidic environment is the strainwhith use arginine in higher level with same proportion for ADI pathway and argininedecarboxylase. Agmatine addition in wines reduce woody aroma probably by formation ofsciff bases between aromla compounds and amineDIJON-BU Doc.électronique (212319901) / SudocSudocFranceF

PCR ITS-RFLP for Penicillium Species and Other Genera

[ISBN : 978-1-4939-6705-6]International audienceAmong numerous molecular methodologies developed for highly specific identification of filamentous fungi isolates, here we describe restriction digestion analysis of the ITS products as an easy method to identify isolates of filamentous fungi. This technique is a rapid and reliable method appropriate for routine identification of filamentous fungi. This can be used to screen large numbers of isolates from various environments in a short time. The use of different endonucleases allowed generating individual restriction profiles. The individual profiles obtained were combined into composite restriction patterns characteristic of a species. Eleven different genera can be differentiated and among them 41 different species

Incidence de la clarification des moûts de raisin sur les fermentescibilltés alcoolique et malolactique

Des essais de débourbage en vinification en blanc, réalisés de 1988 à 1992, mettent en évidence le rôle important joué par la teneur en macromolécules solubles dans le moût de raisin. Les moûts de faible turbidité conduisent en effet à des fermentations alcooliques lentes en relation avec de faibles populations levuriennes. Il est également confirmé que la libération de polysaccharides exocellulaires par les levures au cours de la fermentation alcoolique est d'autant plus élevée que le moût de départ a été fortement appauvri en colloïdes de raisin. Par contre, ce sont dans les lots les plus clarifiés que l'on observe la meilleure fermentescibilité malolactique

Les grands types de sols viticoles de Pomerol et Saint-Emilion

Les vins les plus réputés de la région viticole de Pomerol et Saint-Emilion sont produits sur des sols foncièrement différents, dérivant de roches mères présentant une grande diversité. Les variations que l'on peut noter d'un cru à l'autre sont liées, non pas aux caractéristiques chimiques de ces sols, mais surtout à leurs propriétés physiques (texture, structure, porosité, perméabilité) avec leurs conséquences sur le mode et la profondeur de l'enracinement. +++ The most famous wines from the wine-growing region of Pomerol and Saint-Emilion are produced on fundamentally different soils, derived from mother rocks presenting a great diversity. The variations which can be noted from one growth to another are linked, not to the chemical characteristics of these soils, but above all to their physical properties (texture, structure, porosity, permeability) with their consequences on the manner and depth of the rooting

Influence des facteurs naturels sur la maturation du raisin, en 1979, à Pomerol et Saint-Emilion

Les vignobles de Pomerol et Saint-Emilion sont implantés sur des sols dérivant de roches-mères variées; ils produisent des vins de haute qualité mais différents suivant leur origine géologique. Dans les meilleurs crus, nous avons pu vérifier que les variations mésoclimatiques sont très faibles et ont peu d'influence sur les caractères des vins. Par contre, en 1979, une relation a été mise en évidence entre les conditions de l'alimentation en eau de la vigne (étroitement liées aux propriétés physiques des sols) et la constitution des raisins à maturité (V. vinifera var. Merlot noir). +++ The vineyards of Pomerol and Saint-Emilion (France) are established on soils derived from different parent materials; they produce wines of high quality, which differ according to the geological origin of the soil. In the better vineyards, variations in the mesoclimates are small and have little influence on the characters of the wines. But, in 1979, a relationship was established betwen the conditions of wateruptake by Vitis vinifera (var. Merlot noir) and the composition or the grape at maturity

Ecologie des moisissures présentes sur les baies de raisin

La microflore des raisins est importante d un point de vue technologique car elle conditionne en partie la qualité du vin. Or, la diversité des flores fongiques présentes sur baies de raisin ainsi que leur potentiel de contamination du produit final ne sont pas encore pleinement connus. Dans ce cadre, la caractérisation des flores fongiques cultivables présentes sur baies de raisin a été réalisée par PCR ITS-RFLP. 41 espèces de moisissures différentes sur les 43 étudiées appartenant à 11 genres différents ont été caractérisées de façon fiable. Seules les espèces Penicillium thomii et Penicillium glabrum ont présenté le même profil. Ainsi 96.3% des souches étudiées ont été caractérisées avec au maximum 4 enzymes de restriction et 41.5% des souches ont pu l être avec seulement 2 enzymes de restriction. Ces résultats ont permis d enrichir les bases de données, moyennement pourvues en séquences ITS caractéristiques de genres ou d espèces de moisissures présentes sur baies de raisin. De plus, une étude exhaustive des moisissures présentes sur baies de raisin en Bourgogne a permis, par PCR ITS-RFLP, d identifier 199 souches au niveau de l espèce et ce quelque soit le genre. Penicillium spinulosum est l espèce majoritaire isolée pour le millésime 2008 en Bourgogne. Parallèlement, la quantification de Botrytis cinerea, choisi comme micro-organisme modèle, a été réalisée par qPCR. La technique qPCR décrite dans ce travail présente (i) une bonne sensibilté avec une limite de détection de 6.4 pg d ADN correspondant à 540 spores, (ii) l originalité de travailler en échantillons naturellement contaminés et la fiabilité d utiliser un standard interne. L évaluation de l efficacité de différentes stratégies de traitements anti-Botrytis a confirmé l importance de la prophylaxie (effeuillage) dans la lutte contre Botrytis cinerea.Microbial population of grapes is important from a technological point of view because it determines the quality of wine. But few studies have focused on fungal populations of grapes. A better knowledge of the fungal diversity on grapes, particularly as concerns species responsible for wine defects, may help efforts to control their development.We report the development of a PCR ITS-RFLP method as a fast and easy technique for identifying species of fungal genera present on grapes. By this methode, 41 different fungal species among 43 studied species belonging to 11 genera were characterized at the species level. Only P. thomii remained indistinguishable from P. glabrum. Using this PCR-ITS-RFLP, 96.3% strains tested could be differentiated to the species level with only four enzymes and 41.5% only with two enzymes. Moreover this work has contributed to the enriching of the database of fungal ITS sequences.Thus 199 isolated strain were on grapes in Burgundy vineyard were chacacterized at species level indepdantly of the genus by this method. P. spinolusum was the most frequently isolated species of Penicillium in Burgundy for 2008 vintage. Paralelly, the quantification of Botrytis cinerea, used as model, was developped by qPCR. The assay contained an internal amplification control to compensate for variations in DNA extraction and the various compounds from grapes, had high efficiency and the limit of detection was estimated to be 6.3 pg DNA (corresponding to 540 spores). This method was applied to assess the effects of various treatment strategies against Botrytis in the vineyard and demonstrates the importance of the prophylactic method.DIJON-BU Doc.électronique (212319901) / SudocSudocFranceF

Application of flow cytometry to wine microorganisms

International audienceFlow cytometry (FCM) is a powerful technique allowing detection and enumeration of microbial populations in food and during food process. Thanks to the fluorescent dyes used and specific probes, FCM provides information about cell physiological state and allows enumeration of a microorganism in a mixed culture. Thus, this technique is increasingly used to quantify pathogen, spoilage microorganisms and microorganisms of interest. Since one decade, FCM applications to the wine field increase greatly to determine population and physiological state of microorganisms performing alcoholic and malolactic fermentations. Wine spoilage microorganisms were also studied. In this review we briefly describe FCM principles. Next, a deep revision concerning enumeration of wine microorganisms by FCM is presented including the fluorescent dyes used and techniques allowing a yeast and bacteria species specific enumeration. Then, the last chapter is dedicated to fluorescent dyes which are used to date in fluorescent microscopy but applicable in FCM. This chapter also describes other interesting "future" techniques which could be applied to study the wine microorganisms. Thus, this review seeks to highlight the main advantages of the flow cytometry applied to wine microbiology

La cytométrie appliquée aux mircoorganismes du vin

International audienceFlow cytometry (FCM) is a powerful technique allowing detection and enumeration of microbial populations in food and during food process. Thanks to the fluorescent dyes used and specific probes, FCM provides information about cell physiological state and allows enumeration of a microorganism in a mixed culture. Thus, this technique is increasingly used to quantify pathogen, spoilage microorganisms and microorganisms of interest. Since one decade, FCM applications to the wine field increase greatly to determine population and physiological state of microorganisms performing alcoholic and malolactic fermentations. We will describe FCM principles and the available techniques allowing quantification of wine microorganisms by FCM using fluorescent dyes. Different examples of FCM analysis regarding monitoring of alcoholic fermentation, malolactic fermentation (total population, viable population, physiological state), specific detection and quantification of spoilage microorganisms like Brettanomyces will be presented

La cytométrie appliquée aux mircoorganismes du vin

Flow cytometry (FCM) is a powerful technique allowing detection and enumeration of microbial populations in food and during food process. Thanks to the fluorescent dyes used and specific probes, FCM provides information about cell physiological state and allows enumeration of a microorganism in a mixed culture. Thus, this technique is increasingly used to quantify pathogen, spoilage microorganisms and microorganisms of interest. Since one decade, FCM applications to the wine field increase greatly to determine population and physiological state of microorganisms performing alcoholic and malolactic fermentations. We will describe FCM principles and the available techniques allowing quantification of wine microorganisms by FCM using fluorescent dyes. Different examples of FCM analysis regarding monitoring of alcoholic fermentation, malolactic fermentation (total population, viable population, physiological state), specific detection and quantification of spoilage microorganisms like Brettanomyces will be presented