Genomic and structural features of 1 the Yellow Fever virus from the 2016-2017 Brazilian outbreak

Submitted by Sandra Infurna ([email protected]) on 2018-10-25T14:54:17Z No. of bitstreams: 1 RicardoL_oliveira_etal_IOC_2018.pdf: 5765668 bytes, checksum: 8aecf8d9f75ac85202a32f65d8b5289a (MD5)Approved for entry into archive by Sandra Infurna ([email protected]) on 2018-10-25T15:11:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RicardoL_oliveira_etal_IOC_2018.pdf: 5765668 bytes, checksum: 8aecf8d9f75ac85202a32f65d8b5289a (MD5)Made available in DSpace on 2018-10-25T15:11:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RicardoL_oliveira_etal_IOC_2018.pdf: 5765668 bytes, checksum: 8aecf8d9f75ac85202a32f65d8b5289a (MD5) Previous issue date: 2018Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ. Brasil / Instituto Federal do Norte de Minas Gerais. Salinas, MG, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Secretaria Estadual de Saúde. Superintendência de Vigilância Epidemiológica e Ambiental. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Secretaria Estadual de Saúde do Espírito Santo. Núcleo Especial de Vigilância Ambiental. Vitória, ES, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública Noel Nutels. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Laboratório Central de Saúde Pública Noel Nutels. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genética Molecular de Microorganismos. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Genômica Funcional e Bioinformática. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Programa de Computação Científica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Mosquitos Transmissores de Hematozoários. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ. Brasil.Brazil has been suffering a severe sylvatic epidemic of yellow fever virus (YFV) since late 2016. Analysis of full-length YFV genomes from all hosts involved in the Brazilian 2017 outbreak reveals that they belong to sub-lineage 1E within modern lineage, but display several unique amino acid substitutions in highly conserved positions at NS3 and NS5 viral proteins. Evolutionary analyses indicate that YFV carrying that set of amino acid substitution circulates in the Southern Brazilian region for several months before being detected in December 2016. Structural and selection analyses support tha some of these substitutions were under positive selection and could impact enzyme structure and function. Altogether, this evidence demonstrated that the current Brazilian YFV carries unique amino acid signatures in the non-structural proteins and support the hypothesis that those substitutions may be affecting the viral fitness and transmissibility