A search for homologues of plant photoreceptor genes and their signaling partners in the sugarcane expressed sequence tag (Sucest) database

A search in the sugarcane expressed sequence tag (SUCEST) database for homologues of plant genes involved in photo-sensory mechanisms was carried out using the basic local alignment tool (BLAST). Our results shown that known elements (phytochromes, cryptochromes and phototoprin) present in Arabidopsis and other higher plants were detected with low e-values. We also searched for proteins interacting with photoreceptors in primary or downstream signaling events. One putative homologue for a protein postulated to be a primary element in phytochrome signaling pathways was identified, as were other candidates for downstream interacting factors.<br>A partir dos dados do projeto de sequenciamento de Ests da Cana de Açúcar (Sucest/FAPESP) e utilizando BLAST (tblastn) como ferramenta, foi realizada uma busca de genes homólogos aos elementos envolvidos nos processos de foto-recepção e já descritos para outras plantas, principalmente Arabidopsis. Foram obtidas altas identidades para os fitocromos A, B e C assim como para os criptocromos 1, 2 e a fototropina. Diversos elementos identificados como reguladores primários ou secundários na transdução de sinal de foto-receptores também foram identificados com baixos valores de E-value