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Uso de marcadores SSR para identificaci\uf3n de germoplasma de papa en el programa de mejoramiento de INIA de Chile
Molecular markers based on Simple Sequence Repeats (SSR) are a very
efficient tool for potato ( Solanum tuberosum L. ) genotype
identification and can be very useful for germplasm conservation and
management. With the purpose of incorporate this technology into the
potato breeding program of the National Institute of Agricultural
Research (INIA) Chile, a set of 26 SSR markers was evaluated on a
sample of 71 potato genotypes. Each marker was characterized for number
and combinations of alleles, scoring quality, polymorphic information
content (PIC) and discrimination power (D). From the total, only 21 SSR
markers showed up scoreable products and the allele number ranged
between 2 and 17. The observed allelic combinations among the different
potato genotypes ranged from 2 to 47; however, unique genotypes
detected by each SSR marker ranged from 0 to 38. The observed (Do) and
expected (Dj) discriminatory power ranged from 0.23 to 0.98 and from
0.43 to 0.92, respectively. The seven SSR markers which showed the
highest Do scores were STM1009 (0.98), STM1020 (0.97), STM0031 (0.97),
STM2013 (0.96), STM1008 (0.94), STM1052 (0.93) and STM0019 (0.91). The
STM1009, STM1020 and STM1008 markers are multi-loci SSR, where each one
amplifies more than one locus of the potato genome. The utilization of
the multi-loci type of marker, or combinations of several SSR markers
in either PCR-multiplex or pseudo-multiplex reactions, are good options
to increase the speed and reduce the cost of SSR markers application.Los marcadores moleculares basados en Secuencias Simples Repetidas
(SSR) constituyen una herramienta altamente eficaz para la
identificaci\uf3n de genotipos de papa ( Solanum tuberosum L. ) y
pueden ser de gran utilidad en la conservaci\uf3n y manejo de
germoplasma. Con el prop\uf3sito de incorporar esta tecnolog\ueda
al Programa de Mejoramiento de Papa del Instituto de Investigaciones
Agropecuarias (INIA) de Chile, se evalu\uf3 un grupo de 26 marcadores
SSR sobre una muestra de 71 genotipos de papa. Cada marcador se
caracteriz\uf3 seg\ufan su n\ufamero de alelos y sus respectivas
combinaciones, calidad de lectura, contenido de informaci\uf3n
polim\uf3rfica (PIC) y poder discriminatorio (D). Del total s\uf3lo
21 marcadores SSR mostraron productos legibles con un n\ufamero de
alelos que vari\uf3 entre 2 y 17. Las combinaciones al\ue9licas
observadas variaron desde 2 a 47; sin embargo, los genotipos
\ufanicos detectados por cada marcador fueron desde 0 a 38. El poder
discriminatorio observado (Do) y esperado (Dj) estuvo entre 0,23 a 0,98
y entre 0,43 a 0,92, respectivamente. Los siete marcadores que
presentaron mayor Do fueron STM1009 (0,98), STM1020 (0.97), STM0031
(0,97), STM2013 (0,96), STM1008 (0,94), STM1052 (0,93) y STM0019
(0,91). Los marcadores STM1009, STM1020 y STM1008 corresponden a SSR
multi-loci, donde cada uno amplifica m\ue1s de un locus desde
distintas regiones del genoma de la papa. La utilizaci\uf3n de este
tipo de marcadores multi-loci, o de combinaciones de varios SSR en
reacciones de PCR-m\ufaltiplex o pseudos-m\ufaltiplex son una buena
alternativa para aumentar rapidez y disminuir costo en la
aplicaci\uf3n de marcadores SSR