Evaluation per-opératoire de l'efficacité d'un savon antiséptique à base de chlorhexidine sur la desinfection des mains

Le lavage chirurgical des mains est un point fort de la prévention de la contamination chirurgien-patient. Le produit utilisé doit présenter des propriétés bactéricides ainsi qu’une bonne rémanence car le port de gants chirurgicaux accélère le développement de la flore cutanée. De plus, ces gants peuvent devenir poreux ou se déchirer au cours de l’intervention. L’objectif de cette étude est donc de démontrer les qualités bactéricides et de rémanence d’un savon antiseptique du Laboratoire Axience en prélevant la flore cutanée sur les mains de plusieurs chirurgiens avant et après lavage en différents temps opératoires. Les prélèvements bactériologiques réalisés juste après lavage ont révélé l’élimination totale de la flore cutanée. Les prélèvements suivants comportaient une faible contamination, d’autant plus faible que la durée du lavage augmente, par des bactéries de la flore résidente. L’utilisation de ce savon pour le lavage chirurgical des mains est donc possible

High-resolution in-depth imaging of optically cleared thick samples using an adaptive SPIM

Today, Light Sheet Fluorescence Microscopy (LSFM) makes it possible to image fluorescent samples through depths of several hundreds of microns. However, LSFM also suffers from scattering, absorption and optical aberrations. Spatial variations in the refractive index inside the samples cause major changes to the light path resulting in loss of signal and contrast in the deepest regions, thus impairing in-depth imaging capability. These effects are particularly marked when inhomogeneous, complex biological samples are under study. Recently, chemical treatments have been developed to render a sample transparent by homogenizing its refractive index (RI), consequently enabling a reduction of scattering phenomena and a simplification of optical aberration patterns. One drawback of these methods is that the resulting RI of cleared samples does not match the working RI medium generally used for LSFM lenses. This RI mismatch leads to the presence of low-order aberrations and therefore to a significant degradation of image quality. In this paper, we introduce an original optical-chemical combined method based on an adaptive SPIM and a water-based clearing protocol enabling compensation for aberrations arising from RI mismatches induced by optical clearing methods and acquisition of high-resolution in-depth images of optically cleared complex thick samples such as Multi-Cellular Tumour Spheroids

The SIB Swiss Institute of Bioinformatics' resources: focus on curated databases

The SIB Swiss Institute of Bioinformatics (www.isb-sib.ch) provides world-class bioinformatics databases, software tools, services and training to the international life science community in academia and industry. These solutions allow life scientists to turn the exponentially growing amount of data into knowledge. Here, we provide an overview of SIB's resources and competence areas, with a strong focus on curated databases and SIB's most popular and widely used resources. In particular, SIB's Bioinformatics resource portal ExPASy features over 150 resources, including UniProtKB/Swiss-Prot, ENZYME, PROSITE, neXtProt, STRING, UniCarbKB, SugarBindDB, SwissRegulon, EPD, arrayMap, Bgee, SWISS-MODEL Repository, OMA, OrthoDB and other databases, which are briefly described in this article

Micromirror structured illumination microscope for in-vivo drosophila brain imaging

Le développement des senseurs protéiques et des outils optogénétiques au cours des dernières années a donné une place particulière à la microscopie pour l’étude des processus moléculaires in-vivo. L’équipe « Nano-optique et physiologie intégrée » développe des montages optiques originaux pour exploiter ces nouveaux outils chez le petit animal vivant en collaboration avec des neurobiologistes. Nous nous intéressons en particulier à l’organisation cellulaire et à l’activité des réseaux neuronaux impliqués dans la mémorisation associative olfactive de la drosophile. En amont, mon travail de thèse a été de mettre en place un microscope grand champ, basé sur le principe de la microscopie à HiLo, permettant l’acquisition rapide de sections optiques et la reconstruction tridimensionnelle de réseaux neuronaux. Après avoir prouvé la pertinence de l’approche choisie lorsqu’elle est associée aux outils génétiques permettant un marquage sélectif des neurones, le cœur de mon travail fut le développement d’un montage original permettant d’atteindre les objectifs de résolution spatiale et de vitesse. Son originalité se situe dans l’utilisation de la technologie des matrices de micro-miroirs (DLP) pour structurer l’illumination. Ce système de micro-miroirs pilotables peut moduler le faisceau d’une source LED haute puissance à haute cadence. Dans une seconde partie, j’ai caractérisé ce microscope et réalisé de premières expériences in-vivo avec les développements spécifiques nécessaires à ces expériences. En particulier, en utilisant un rapporteur protéique calcique fluorescent, GCamP3, j’ai montré que l’on pouvait suivre, dans des régions ciblées du cerveau, la réponse à des stimulations physiologiques à cadence vidéo.In the last decades, optogenetic and protein reporter development have given a special place to optical microscopy for in-vivo investigation of biological molecular processes. Our team, “Nano-optics and integrated physiology”, develops optical set-ups to take advantage of these tools on small living animals, in collaboration with neurobiologists. We are particularly interested both in the cellular organization and neural activity involved in the olfactory memory formation in drosophila. Upstream to these investigations, my PhD research aimed at developing a new implementation for wide-field microscopy based on the HiLo concept. The new design took advantage of the micro-mirror array technology (DLP) to structure the illumination. This system can modulate the beam made by a high power LED illumination with high acquisition rates. I characterized this microscope and realized preliminary in-vivo experiments with specific developments made for physiological experiments under the microscope. Thus, I demonstrated both high spatial resolution imaging and a tenfold increase of speed with respect to confocal microscopy. I reached acquisition rates compatible with 3D monitoring of specific neural networks

Evaluation per-opératoire de l'efficacité d'un savon antiséptique à base de chlorhexidine sur la desinfection des mains

Le lavage chirurgical des mains est un point fort de la prévention de la contamination chirurgien-patient. Le produit utilisé doit présenter des propriétés bactéricides ainsi qu'une bonne rémanence car le port de gants chirurgicaux accélère le développement de la flore cutanée. De plus, ces gants peuvent devenir poreux ou se déchirer au cours de l'intervention. L'objectif de cette étude est donc de démontrer les qualités bactéricides et de rémanence d'un savon antiseptique du Laboratoire Axience en prélevant la flore cutanée sur les mains de plusieurs chirurgiens avant et après lavage en différents temps opératoires. Les prélèvements bactériologiques réalisés juste après lavage ont révélé l'élimination totale de la flore cutanée. Les prélèvements suivants comportaient une faible contamination, d'autant plus faible que la durée du lavage augmente, par des bactéries de la flore résidente. L'utilisation de ce savon pour le lavage chirurgical des mains est donc possible.TOULOUSE-EN Vétérinaire (315552301) / SudocTOULOUSE3-BU Santé-Centrale (315552105) / SudocSudocFranceF

Cocks-Pinch curves of embedding degrees five to eight and optimal ate pairing computation

Recent algorithmic improvements of discrete logarithm computation in special extension fields threaten the security of pairing-friendly curves used in practice. A possible answer to this delicate situation is to propose alternative curves that are immune to these attacks, without compromising the efficiency of the pairing computation too much. We follow this direction, and focus on embedding degrees 5 to 8; we extend the Cocks-Pinch algorithm to obtain pairing-friendly curves with an efficient ate pairing. We carefully select our curve parameters so as to thwart possible attacks by "special" or "tower" Number Field Sieve algorithms. We target a 128-bit security level, and back this security claim by time estimates for the DLP computation. We also compare the efficiency of the optimal ate pairing computation on these curves to k = 12 curves (Barreto-Naehrig, Barreto-Lynn-Scott), k = 16 curves (Kachisa-Schaefer-Scott) and k = 1 curves (Chatterjee-Menezes-Rodríguez-Henríquez)

RéfleCT/Xions autour d'une "installation d'ambiance"

Mise à disposition du document numérique avec l'aimable autorisation de l'éditeurInternational audienceL'interaction corps/environnement est une des voies privilégiées d'accès aux phénomènes d'ambiance. Le corps en action est un senseur capable de révéler une ambiance, et cela parce qu'il engendre ambiance et s'engendre dans l'ambiance. Le corps au singulier s'ouvre ainsi à l'extérieur en termes de corps en ambiance, voire même de corps d'ambiance. L'installation RéfleCT/Xions, présentée sur le site de la Bastille à Grenoble, durant la semaine Enactive07, a exploré les mécanismes primaires de cette interrelation de l'ambiance entre l'homme et l'environnement qu'il habite, en s'appuyant sur des principes de réflexion, d'amplification et de manipulation sensorielle des actions propre du corps. Le parcours qui était proposé devenait ainsi l'opportunité d'une prise de conscience de la perméabilité corps-environnement à travers l'altération des effets sensibles et des traits identitaires caractérisant une ambiance. Pour cela, la " mise en scène " proposée interagissait de manière active sur la réponse visuelle, sonore et tactile que le parcours offrait au visiteur. Le pas et la dynamique du corps à travers l'espace devenant les objets centraux de cette exploration

RéfleCT/Xions autour d'une "installation d'ambiance"

Mise à disposition du document numérique avec l'aimable autorisation de l'éditeurInternational audienceL'interaction corps/environnement est une des voies privilégiées d'accès aux phénomènes d'ambiance. Le corps en action est un senseur capable de révéler une ambiance, et cela parce qu'il engendre ambiance et s'engendre dans l'ambiance. Le corps au singulier s'ouvre ainsi à l'extérieur en termes de corps en ambiance, voire même de corps d'ambiance. L'installation RéfleCT/Xions, présentée sur le site de la Bastille à Grenoble, durant la semaine Enactive07, a exploré les mécanismes primaires de cette interrelation de l'ambiance entre l'homme et l'environnement qu'il habite, en s'appuyant sur des principes de réflexion, d'amplification et de manipulation sensorielle des actions propre du corps. Le parcours qui était proposé devenait ainsi l'opportunité d'une prise de conscience de la perméabilité corps-environnement à travers l'altération des effets sensibles et des traits identitaires caractérisant une ambiance. Pour cela, la " mise en scène " proposée interagissait de manière active sur la réponse visuelle, sonore et tactile que le parcours offrait au visiteur. Le pas et la dynamique du corps à travers l'espace devenant les objets centraux de cette exploration