Diversidade genética de populações de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis em mandioca por meio de marcadores rep-PCR e VNTRs

The objective of this work was to evaluate the genetic diversity of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) from eight populations from five cassava producing states in Brazil, through the rep-PCR (BOX-PCR and ERIC-PCR) and variable number of tandem repeat (VNTR) markers. Cassava leaves with symptoms of cassava bacterial blight were collected in eight municipalities, and the Xpm isolates were identified by amplification with primers specific for these isolates. The identity of the Xpm isolates was confirmed with the BOX-PCR, ERIC-PCR, and VNTR markers. The observed selection pressure, together with the mode of reproduction and the mechanisms that increase genetic variability, allows of the pathogen populations to adapt according to microclimate variation, contributing to a differentiated reproductive success. ERIC-PCR and VNTRs are the best markers for evaluating the genetic variability in the eight studied Xpm populations. However, ERIC-PCR is the marker that best separated the groups by population and presented a higher similarity between the isolates of the same population. The study of the genetic diversity of Xpm is key to improve disease monitoring and management strategies in cassava crops.O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de Xanthomonas phaseoli pv. manihotis (Xpm) de oito populações de cinco estados produtores de mandioca no Brasil, por meio de marcadores rep-PCR (BOX-PCR e ERIC-PCR) e variable number of tandem repeats (VNTRs). Folhas de mandioca com sintomas de crestamento bacteriano foram coletadas em oito municípios, e os isolados Xpm foram identificados por amplificação com iniciadores específicos para esses isolados. A identidade dos isolados Xmp foi confirmada com os marcadores BOX-PCR, ERIC-PCR e VNTRs. A pressão de seleção observada, junto com o modo de reprodução e os mecanismos que aumentam a variabilidade genética, permite que as populações do patógeno se adaptem de acordo com a variação dos microclimas, o que contribui para o sucesso reprodutivo diferenciado. ERIC-PCR e VNTRs são os melhores marcadores para avaliar a variabilidade genética das oito populações Xpm estudadas. No entanto, ERIC-PCR é o marcador que melhor separou os grupos por população e apresentou maior similaridade entre os isolados de uma mesma população. O estudo da diversidade genética de Xpm é fundamental para delinear estratégias de manejo e monitoramento de doenças na cultura da mandioca

Genetic dissimilarity between castor bean cultivars using RAPD markers

O objetivo deste trabalho foi identificar cultivares geneticamente divergentes de mamoneira (Ricinus communis) com uso de marcadores RAPD. Um total de 58 iniciadores RAPD foi usado na genotipagem de 15 cultivares. A dissimilaridade genética entre as cultivares foi calculada a partir do índice de Jaccard, tendo-se utilizado o método da média aritmética não ponderada (UPGMA). Foram identificados 552 fragmentos, sendo 311 polimórficos (56,3%). As cultivares foram agrupadas em cinco grupos, evidência de que há divergência genética entre elas. Os marcadores moleculares do tipo RAPD são eficientes no estudo da dissimilaridade em mamoneira.The objective of this work was to identify genetically different cultivars of castor bean (Ricinus communis) using RAPD markers. A total of 58 RAPD primers were used to genotype 15 cultivars. The genetic dissimilarity between cultivars was calculated by Jaccard’s index, using the unweighted pair‑group method with arithmetic mean (UPGMA). Five hundred and fifty‑two fragments were identified, of which 311 were polymorphic (56.3%). The cultivars were clustered in five groups, evidence that there is genetic difference among them. RAPD markers are efficient in the study of genetic dissimilarity in castor bean

Morphology and viability of castor bean genotypes pollen grains

ABSTRACT. The objective of this work was to characterize the morphology and viability of the pollen of 15 genotypes of castor bean (Ricinus communis L.) and to generate information that can assist in the selection of highly promising male parents for future use in genetic improvement programs aimed at producing seeds for oil extraction. Acetolysis and scanning electron microscopy was used to characterize the morphology of the pollen. The viability of the pollen grains was estimated by in vitro germination and colorimetric analysis (acetocarmine 2% and 2, 3, 5-triphenyltetrazolium chloride 1%). For the in vitro germination, pollen grains were grown in 10 types of solidified culture medium consisting of different concentrations of sucrose, boric acid, calcium nitrate, magnesium sulfate and potassium nitrate. The pollen grains had the following characteristics: medium size, isopolar and subspheroidal shape, radial symmetry, circular ambit, 3-colporate, elongated endoapertures, tectate exine and granulated sexine. The acetocarmine dye overestimated pollen viability. The media M5 and M8 were the most efficient at promoting the germination of pollen grains. The studied genotypes had high levels of viability and can therefore be used as male parents in genetic improvement programs

Dissimilaridade genética entre cultivares de mamoneira por meio de marcadores RAPD Genetic dissimilarity between castor bean cultivars using RAPD markers

O objetivo deste trabalho foi identificar cultivares geneticamente divergentes de mamoneira (Ricinus communis) com uso de marcadores RAPD. Um total de 58 iniciadores RAPD foi usado na genotipagem de 15 cultivares. A dissimilaridade genética entre as cultivares foi calculada a partir do índice de Jaccard, tendo-se utilizado o método da média aritmética não ponderada (UPGMA). Foram identificados 552 fragmentos, sendo 311 polimórficos (56,3%). As cultivares foram agrupadas em cinco grupos, evidência de que há divergência genética entre elas. Os marcadores moleculares do tipo RAPD são eficientes no estudo da dissimilaridade em mamoneira.The objective of this work was to identify genetically different cultivars of castor bean (Ricinus communis) using RAPD markers. A total of 58 RAPD primers were used to genotype 15 cultivars. The genetic dissimilarity between cultivars was calculated by Jaccard's index, using the unweighted pair‑group method with arithmetic mean (UPGMA). Five hundred and fifty‑two fragments were identified, of which 311 were polymorphic (56.3%). The cultivars were clustered in five groups, evidence that there is genetic difference among them. RAPD markers are efficient in the study of genetic dissimilarity in castor bean

Toxicidade do alumínio e efeito do ácido giberélico em linhas quase isogênicas de trigo com o caráter permanência verde e maturação sincronizada

O objetivo deste trabalho foi avaliar linhas quase isogênicas de trigo com o caráter permanência verde e de maturação sincronizada quanto à tolerância ao alumínio e à sensibilidade ao ácido giberélico (AG3). O experimento foi conduzido no Laboratório de Duplo-haplóides e Hidroponia da FAEM/UFPel, em delineamento de blocos ao acaso, com parcelas subdivididas com três repetições, através do teste simultâneo utilizando solução nutritiva com concentrações de 10mg L-1 de Al3+ e 100mg L-1 de AG3. Foram determinados: a inserção da 1feminine folha, o comprimento da 1feminine folha, a inserção da 2feminine folha, comprimento da 2feminine folha, diferença da inserção entre a 1feminine e 2feminine folha, estatura de plântula, estatura de planta, área foliar, área radicular e o crescimento de raiz. Os caracteres estatura da plântula, inserção da 1feminine folha e comprimento da 2feminine folha foram os mais expressivos para a seleção de indivíduos com estatura reduzida através da reação do AG3. O grupo do caráter permanência verde apresentou maior insensibilidade à ação do AG3, enquanto o grupo de plantas sincronizadas proporcionou maior tolerância ao Al3+. Contudo, existe possibilidade de selecionar linhas quase isogênicas dentro do grupo permanência verde com tolerância ao Al3+ e insensibilidade ao AG3 através da técnica de cultivo hidropônico com solução nutritiva em ambiente controlado

Dissimilaridade genética entre cultivares de mamoneira por meio de marcadores RAPD

O objetivo deste trabalho foi identificar cultivares geneticamente divergentes de mamoneira (Ricinus communis) com uso de marcadores RAPD. Um total de 58 iniciadores RAPD foi usado na genotipagem de 15 cultivares. A dissimilaridade genética entre as cultivares foi calculada a partir do índice de Jaccard, tendo-se utilizado o método da média aritmética não ponderada (UPGMA). Foram identificados 552 fragmentos, sendo 311 polimórficos (56,3%). As cultivares foram agrupadas em cinco grupos, evidência de que há divergência genética entre elas. Os marcadores moleculares do tipo RAPD são eficientes no estudo da dissimilaridade em mamoneira