Evolution of Total and Integrated HIV-1 DNA and Change in DNA Sequences in Patients with Sustained Plasma Virus Suppression

AbstractBlood samples from patients with plasma HIV-1 RNA <20 copies/ml for more than 2 years were studied. Significant decreases in total and integrated HIV-1 DNA were observed during the first 15 months of suppressive therapy before the concentrations became stable. Clonal analysis of HIV-1 pol demonstrated that the proportions of resistance mutations in DNA sequences after 2 years were lower than those in baseline DNA and RNA sequences. The changes in the clonal composition of HIV-1 env populations in three patients with evidence of changes in HIV-1 pol populations indicated a shift from predominantly R5-like viruses to predominantly X4-like viruses in two patients and the persistence of predominantly X4-like viruses in the third. Our analyses indicate the reemergence of ancestral sequences from long-lived cells or the residual production of wild-type virus from anatomic sites with limited access to antiretroviral drugs and the preferential infection of cells expressing CXCR4

HIV-1 Residual Viremia Correlates with Persistent T-Cell Activation in Poor Immunological Responders to Combination Antiretroviral Therapy

BACKGROUND:The clinical significance and cellular sources of residual human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) production despite suppressive combination antiretroviral therapy (cART) remain unclear and the effect of low-level viremia on T-cell homeostasis is still debated. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS:We characterized the recently produced residual viruses in the plasma and short-lived blood monocytes of 23 patients with various immunological responses to sustained suppressive cART. We quantified the residual HIV-1 in the plasma below 50 copies/ml, and in the CD14(high) CD16(-) and CD16+ monocyte subsets sorted by flow cytometry, and predicted coreceptor usage by genotyping V3 env sequences. We detected residual viremia in the plasma of 8 of 10 patients with poor CD4+ T-cell reconstitution in response to cART and in only 5 of 13 patients with good CD4+ T-cell reconstitution. CXCR4-using viruses were frequent among the recently produced viruses in the plasma and in the main CD14(high) CD16(-) monocyte subset. Finally, the residual viremia was correlated with persistent CD4+ and CD8+ T-cell activation in patients with poor immune reconstitution. CONCLUSIONS:Low-level viremia could result from the release of archived viruses from cellular reservoirs and/or from ongoing virus replication in some patients. The compartmentalization of the viruses between the plasma and the blood monocytes suggests at least two origins of residual virus production during effective cART. CXCR4-using viruses might be produced preferentially in patients on cART. Our results also suggest that low-level HIV-1 production in some patients may contribute to persistent immune dysfunction despite cART

Expériences quantitatives et symétries du champ magnétique

National audienceLa plupart des smartphones sont équipés de capteurs à effet Hall 3D. Ils permettentde mettre facilement en évidence les symétries singulières du champ magnétique et rendentpossibles des positionnements précis et des mesures que l’on peut comparer quantitativementà des modèles analytiques. Nous considérons tout d’abord l’expérience historique d’Ørsted. Lesmesures sont très bien décrites par le modèle du fil infini. Nous étudions ensuite la spire carréedont le champ possède une expression analytique dans tout l’espace. En fonction de la distanced du capteur au côté de la spire, on passe progressivement du modèle du fil infini à celui dudipôle magnétique ce que l’on vérifie expérimentalement sur l’intensité du champ qui passe d’unedécroissance en 1/d à 1/d^3

Pendule à la maison avec un smartphone

International audienceDans le contexte sanitaire particulier du premier confinement relatif à la Covid-19 au printemps 2020, l’usage des smartphones s’est répandu pour pratiquer la physique expérimentale à la maison [1-2]. Nous avons ainsi proposé à des étudiants de première année de CPGE (Classe préparatoire aux grandes écoles) l’étude a priori très classique d’un pendule. Notre objectif était toutefois ambitieux du point de vue pédagogique et visait à initier les étudiants à une démarche expérimentale approfondie. En effet, l’abondance et la qualité des données permettent une analyse quantitative poussée sous Python qui permet de discuter des effets au-delà de l’approximation harmonique. Après une présentation du dispositif, de sa modélisation et des différentes données du problème, nous détaillerons l’exploitation progressivement raffinée des mesures que nous avons mise en place. Dans une seconde partie, nous proposons une réflexion critique sur ce qui fut pour nous une première expérience en pédagogie expérimentale à distance ainsi que les progrès réalisés l’année suivante dans un contexte moins contraint

Expériences quantitatives et symétries du champ magnétique

National audienceLa plupart des smartphones sont équipés de capteurs à effet Hall 3D. Ils permettentde mettre facilement en évidence les symétries singulières du champ magnétique et rendentpossibles des positionnements précis et des mesures que l’on peut comparer quantitativementà des modèles analytiques. Nous considérons tout d’abord l’expérience historique d’Ørsted. Lesmesures sont très bien décrites par le modèle du fil infini. Nous étudions ensuite la spire carréedont le champ possède une expression analytique dans tout l’espace. En fonction de la distanced du capteur au côté de la spire, on passe progressivement du modèle du fil infini à celui dudipôle magnétique ce que l’on vérifie expérimentalement sur l’intensité du champ qui passe d’unedécroissance en 1/d à 1/d^3

Pendule à la maison avec un smartphone

International audienceDans le contexte sanitaire particulier du premier confinement relatif à la Covid-19 au printemps 2020, l’usage des smartphones s’est répandu pour pratiquer la physique expérimentale à la maison [1-2]. Nous avons ainsi proposé à des étudiants de première année de CPGE (Classe préparatoire aux grandes écoles) l’étude a priori très classique d’un pendule. Notre objectif était toutefois ambitieux du point de vue pédagogique et visait à initier les étudiants à une démarche expérimentale approfondie. En effet, l’abondance et la qualité des données permettent une analyse quantitative poussée sous Python qui permet de discuter des effets au-delà de l’approximation harmonique. Après une présentation du dispositif, de sa modélisation et des différentes données du problème, nous détaillerons l’exploitation progressivement raffinée des mesures que nous avons mise en place. Dans une seconde partie, nous proposons une réflexion critique sur ce qui fut pour nous une première expérience en pédagogie expérimentale à distance ainsi que les progrès réalisés l’année suivante dans un contexte moins contraint

Expériences quantitatives et symétries du champ magnétique

National audienceLa plupart des smartphones sont équipés de capteurs à effet Hall 3D. Ils permettentde mettre facilement en évidence les symétries singulières du champ magnétique et rendentpossibles des positionnements précis et des mesures que l’on peut comparer quantitativementà des modèles analytiques. Nous considérons tout d’abord l’expérience historique d’Ørsted. Lesmesures sont très bien décrites par le modèle du fil infini. Nous étudions ensuite la spire carréedont le champ possède une expression analytique dans tout l’espace. En fonction de la distanced du capteur au côté de la spire, on passe progressivement du modèle du fil infini à celui dudipôle magnétique ce que l’on vérifie expérimentalement sur l’intensité du champ qui passe d’unedécroissance en 1/d à 1/d^3

Expériences quantitatives et symétries du champ magnétique

National audienceLa plupart des smartphones sont équipés de capteurs à effet Hall 3D. Ils permettentde mettre facilement en évidence les symétries singulières du champ magnétique et rendentpossibles des positionnements précis et des mesures que l’on peut comparer quantitativementà des modèles analytiques. Nous considérons tout d’abord l’expérience historique d’Ørsted. Lesmesures sont très bien décrites par le modèle du fil infini. Nous étudions ensuite la spire carréedont le champ possède une expression analytique dans tout l’espace. En fonction de la distanced du capteur au côté de la spire, on passe progressivement du modèle du fil infini à celui dudipôle magnétique ce que l’on vérifie expérimentalement sur l’intensité du champ qui passe d’unedécroissance en 1/d à 1/d^3

Études quantitatives des accélérations d'inertie avec un smartphone. Partie 1: accélération de Coriolis.

International audienceLa mécanique en référentiel non galiléen avec l'introduction des forces d'inertie est un point délicat des premières années post-baccalauréat. Le smartphone, objet du quotidien présentant un indéniable attrait auprès des étudiants peut être détourné de son usage habituel pour être utilisé comme instrument de mesure de grandeurs physiques variées. Dans cet article en deux parties, nous proposons deux expériences permettant la mesure quantitative des accélérations de Coriolis et d'entraînement en utilisant simultanément plusieurs capteurs des smartphones. Cette première étude présente une expérience originale permettant une mesure de l'accélération de Coriolis

Études quantitatives des accélérations d'inertie avec un smartphone Partie 2 : accélération d'entraînement

Après un premier article sur la mesure de l'accélération de Coriolis, nous décrivons dans cette deuxième partie une étude expérimentale de l'accélération d'entraînement. Cet article propose une expérience quantitative mesurant à la fois la composante radiale et, ce qui est plus original, la composante orthoradiale de l'accélération d'entraînement