Determinación de los motivos aminoacídicos presentes en los sitios de unión a los antígenos de los alelos del gen BoLA-DRB3 en una población Holstein de La Pampa y su asociación con mastitis /Determination of amino acid motifs present in the antigen-bind

The intensity of the immune responseis regulated by amino acid motifs in antigen recognitionsites (ARS) present in the pockets ofMajor Histocompatibility Complex molecules.The objective of this work was to study the associationbetween these motifs and resistance/susceptibility to mastitis measured by somaticcell counts (SCC) in milk from Holstein cattlefrom the province of La Pampa. The populationwas divided into: 1) case group with high SCCand presence of mastitis (≥ 250,000 cells/mlsusceptibility) and 2) control group under SCC(< 250,000 cells/ml resistant). From a sample of128 animals, 40 were genotyped for the secondexon of BoLA-BRB3 gene by direct sequencingtechnique, 20 cows for each group. A total of 24alleles were detected in the analyzed population.Gene frequencies of amino acid motifs ofthe five pockets (1, 4, 6, 7 and 9) from ARS inthe two groups of animals were calculated. TestOdds Ratio (OR) Woolf-Haldane was used tostudy the association. No significant differencesbetween amino acid motifs of pockets 1, 4, 7and 9 between groups with high and low SCCwere found. However, the T 11 Y 30 motif inpocket 6 (found in BoLA-DRB3 * 0601, * 0901and * 4401 alleles) showed a significant ORvalue = 0.11 (p = 0.03). This suggests an associationbetween this motif with a lower risk ofdeveloping mastitis. The role of amino acid motifT 11Y 30 in animal immune response should bevalidated in independent populationsLa intensidad de la respuesta inmune eregulada por los motivos aminoacídicos en los sitios de reconocimiento a antígenos (SRA) presentes en los bolsillos de las moléculas presentadoras del Complejo Principal de Histocompatibilidad. El objetivo del presente trabajo fue estudiar la asociación entre dichos motivos y la resistencia/susceptibilidad a mastitis medida a través del conteo de células somáticas (CCS) en leche de ganado Holstein de la provincia de La Pampa. La población se dividió en: 1) grupo caso con alto CCS y presencia de mastitis (*** 250.000 cel/ml, susceptible) y 2) grupo control con bajo CCS (< 250.000 cel/ml, resistente). De una muestra de 128 animales, se tipificaron 40 para el segundo exón del gen BoLA-BRB3 mediante la técnica de secuenciación directa; 20 vacas correspondientes a cada grupo. Se detectaron 24 alelos en la población analizada. Se calcularon las frecuencias génicas de los motivos aminoacídicos de los cinco bolsillos (1, 4, 6, 7 y 9) del SRA en los dos grupos de animales. Se utilizó el test Odds Ratio (OR) de Woolf-Haldane para estudiar la asociación. No se hallaron diferencias significativas entre los motivos aminoacídicos de los bolsillos 1, 4, 7 y 9 entre los grupos con alto y bajo CCS. Sin embargo, el motivo T11Y30 del bolsillo 6 (presente en los alelos BoLA-DRB3*0601, *0901 y *4401) evidenció un valor significativo de OR = 0,11 (p= 0,03). Esto sugiere una asociación entre dicho motivo con un menor riesgo a desarrollar mastitis. El rol del motivo aminoacídico T11Y30 en la respuesta inmune de los animales que lo poseen deberá ser validado en poblaciones independientes DOI:http://dx.doi.org/10.19137/cienvet2014161

Effects of cytoplasmic inheritance on preweaning traits of Hereford cattle

The influence of cytoplasmic inheritance on birth and weaning weight was evaluated in an experimental Hereford herd. Data on 1,720 records for birth and weaning weights from calves born between 1963 and 2002 were studied. Variance components were estimated using MTDFREML procedures and an animal model was fitted for each trait. Direct and maternal additive effects and permanent environment and maternal lineage effects were treated as random, while year and month of birth, age of dam and sex of the calf were treated as fixed. Identification of maternal lineages was based on pedigree information. The contribution to phenotypic variance of cytoplasmic lineages defined by pedigree information was negligible for both traits. Mitochondrial genotypes of cows present in the herd in 2002 were analyzed by single strand conformation polymorphism (SSCP) analysis. Only five different genotypes were identified among 23 maternal lineages. All the animals with records were assigned to maternal genotypes based on pedigree information. The statistical analysis was repeated, removing maternal lineage from the model and including mitochondrial genotype as a fixed effect. No evidence of genotype effects was detected. These results suggest a negligible effect of the mitochondrial genome on the preweaning traits of this Hereford herd

Effects of cytoplasmic inheritance on preweaning traits of Hereford cattle

The influence of cytoplasmic inheritance on birth and weaning weight was evaluated in an experimental Hereford herd. Data on 1,720 records for birth and weaning weights from calves born between 1963 and 2002 were studied. Variance components were estimated using MTDFREML procedures and an animal model was fitted for each trait. Direct and maternal additive effects and permanent environment and maternal lineage effects were treated as random, while year and month of birth, age of dam and sex of the calf were treated as fixed. Identification of maternal lineages was based on pedigree information. The contribution to phenotypic variance of cytoplasmic lineages defined by pedigree information was negligible for both traits. Mitochondrial genotypes of cows present in the herd in 2002 were analyzed by single strand conformation polymorphism (SSCP) analysis. Only five different genotypes were identified among 23 maternal lineages. All the animals with records were assigned to maternal genotypes based on pedigree information. The statistical analysis was repeated, removing maternal lineage from the model and including mitochondrial genotype as a fixed effect. No evidence of genotype effects was detected. These results suggest a negligible effect of the mitochondrial genome on the preweaning traits of this Hereford herd

Polimorfismos del exón 2 del gen BoLA-DRB3 asociados con resistencia / susceptibilidad a leucosis en ganado Holstein de La Pampa /Polymorphisms of BoLA-DRB3 gene and its association with resistance / susceptibility to Leucosis in Holstein cattle from La

EBL is a disease of adult cattle caused by the retrovirus, bovine leukemia. It can manifest: aleukemic an asymptomatic form, with a normal number of B lymphocytes in the blood; a form of permanent lymphocytosis, with an increase in the number of B lymphocytes and finally a lymphoproliferative tumor presenta­tion in the form of lymphosarcoma. The alleles of the genes of the Bovine Major Histocompatibility Complex (BoLA) have been associated with resistance and susceptibility to infectious dis­eases. The overall objective of this study was to associate poly­morphisms of the BoLA-DRB3.2 gene, defined by the technique of polymerase chain reaction technique and polymorphisms length of the restriction fragment (PCR-RFLP), with resistance / susceptibility to leucosis in Holstein cows of La Pampa. It relied on a case/control design, for which blood samples were taken to 150 animals in 3 opportunities with intervals of three months each. The case group comprised animals that were positive in the immunodiffusion agar animals test (DIDA) and whose blood lymphocyte count was ≥ 10.000 linf/μl and the control group included cows that ware negative for DIDA and present < 10.000 linf/μl of blood. Fisher’s Exact test and Odds Ratio (OR) of Woolf-Haldane were used to study the association between lym­phocyte count and DIDA results with allelic variants. In 82 ani­mals genotyped by PCR-RFLP, the DRB3.2*22 allele showed an OR = 5.332 (p = 0.0138) and DRB3.2*11 allele had a OR value of 0.11 (p=0.001) and were the most frequent in the control group and in the case group, respectively. These results would showed DRB3.2*22 allele and DRB3.2*11 allele a high risk of having leucosis (susceptibility) and low risk to suffer (resistance) re­spectively. The analysis of the relationship between alleles of the BoLA and resistance/susceptibility to leucosis could be im­proved with deep research on family lineages of dairy cows.  La leucosis bovina enzoótica es una enfermedad del ganado bo­vino adulto causada por el retrovirus de la leucemia bovina. Se puede manifestar como: una forma asintomática aleucémica, con un número normal de linfocitos B en sangre; una forma de linfocitosis permanente, con aumento del número de linfocitos B y como una presentación linfoproliferativa tumoral en forma de linfosarcoma. Los alelos de los genes del Complejo Principal de Histocompatibilidad Bovino (BoLA) han sido asociados con resistencia y susceptibilidad a enfermedades infecciosas. El ob­jetivo general del presente estudio consistió en asociar los poli­morfismos del exón 2 del gen BoLA-DRB3.2, definidos mediante la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa y la técnica de Polimorfismos de la Longitud de los Fragmentos de Restricción (PCR-RFLP), con resistencia/susceptibilidad a leucosis en vacas Holstein de La Pampa. Se basó en un diseño caso/control, para lo cual se tomó muestra de sangre a 150 animales en 3 opor­tunidades con intervalos de tres meses cada una. Los animales fueron incluidos en el grupo caso cuando dieron positivos en la prueba de inmunodeficiencia en agar (DIDA) y cuyo recuento linfocitario en sangre fue ≥ 10.000 linfocitos/μl y el grupo con­trol estuvo constituido con animales negativos en DIDA y que te­nían < 10.000 linfocitos/μl de sangre. Los tests Exacto de Fisher y Odds Ratio (OR) de Woolf-Haldane se utilizaron para estudiar la asociación entre recuento de linfocitos y resultados del DIDA con las variantes alélicas. En 82 animales genotipados por PCR-RFLP el alelo DRB3.2*22 evidenció un OR= 5,332 (p= 0,0138) y el alelo DRB3.2*11 mostró un OR= 0,11 (p=0,001) siendo más frecuentes en el grupo caso y en el grupo control, respectiva­mente. Estos resultados evidenciarían que vacas con el alelo DRB3.2*22 presentarían mayor riesgo a desarrollar leucosis y vacas con el alelo DRB3.2*11 un menor riesgo (resistencia). El análisis de la relación entre alelos del gen BoLA-DRB3.2 y resis­tencia/susceptibilidad a leucosis podría mejorarse con investi­gaciones profundas en linajes familiares de vacas lecheras  

Polimorfismo de la región promotora proximal del gen BOLA-DRB3 y su asociación con la resistencia/ susceptibilidad a leucosis en ganado holstein de la provincia de La Pampa

La Región Regulatoria Proximal (URR) de los genes de Clase II del Complejo Principal de Histocompatibilidad (MHC) es altamente conservada en mamíferos. Ha sido estudiada en humanos, ratones, equinos y bovinos, donde se describieron polimorfismos de la URR en los genes DQB y DRB. Dichos polimorfismos están localizados principalmente en el segundo exón y en menor medida en la URR y pueden tener como consecuencia diferencias en la expresión alélica y especificidad en tejidos de moléculas de Clases II afectando el nivel transcripcional y por lo tanto la respuesta inmune. El objetivo del presente estudio consistió en asociar los polimorfismos de la región URR del gen DRB3 del MHC de bovinos, definidos mediante la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa-Polimorfismos de la Longitud de los Fragmentos de Restricción (PCR-RFLP) y Secuenciación Directa (PCR-SBT), con resistencia/susceptibilidad a leucosis en vacas Holstein de la Provincia de La Pampa. Se basó en un dise- ño caso/control, para lo cual se tomó muestra de sangre a 150 animales, los que fueron agrupados en dos categorías según el resultado de la prueba de inmunodeficiencia en agar (DIDA) (positivos-susceptibles o negativos-resistentes) y en dos grupos según el recuento linfocitario en sangre (< 10.000 linfocitos/µl); ≥ 10.000 linfocitos/µl). En 33 animales genotipados por PCRSBT se detectaron 7 alelos en la URR y 23 del exón 2 del gen DRB3. Tres de los de la región URR fueron nuevos. Nuestros resultados pueden sugerir que no existe relación entre la URR y el exón 2 del gen BoLA-DRB3 (desequilibrio de ligamiento P > 0,05), probablemente debido a la recombinación a lo largo del tiempo. En 80 animales genotipados por PCR-RFLP el alelo más frecuente en el grupo con resultados en DIDA positivo y con ≥ 10.000 linfocitos/ µl (susceptible) fue el DRB3.*22 con un 19%. En tanto en el grupo con resultados a DIDA, negativo y con < 10.000 linfocitos/ µl (resistentes) el alelo DRB.3*23 apareció con una frecuencia del 25% y el DRB.3*11 con una frecuencia del 20%, coincidiendo con otros autores en cuanto a susceptibilidad y resistencia respectivamente. Nuestros resultados también sugieren que ambas regiones de genes de Clase II pueden ser incluidas en el desarrollo de nuevas técnicas de genotipificación, especialmente aquellas basadas en las tecnologías de Next Generation Sequencing (NGS)