Патогенетическая терапия у пациентов с COVID-19

The new coronavirus infection (COVID-19) has become a truly global challenge for all of humanity, and, above all, for the healthcare system. Among its most important aspects that require careful analysis are the clinical and laboratory features of the course of the disease, which make it possible to determine approaches to pathogenetic therapy in severe forms of the disease.Materials and methods. A retrospective analysis of the medical records of patients with severe COVID-19 who were hospitalized in St. Petersburg State Budgetary Infectious Diseases Clinical Hospital named after S.P. Botkin” in 20202022. Clinical and laboratory characteristics were assessed, including levels of C-reactive protein, interleukin-6, and fever dynamics. The criteria for prescribing drugs for pathogenetic therapy in patients with COVID-19 and their effectiveness were determined.Results. In the treatment of patients with COVID-19, it is necessary to carefully evaluate the clinical picture of the course of the disease, which is ahead of changes in laboratory parameters. The introduction of humanized antibody preparations leads to a regression of general infectious symptoms, subjective and objective manifestations of respiratory failure and, as a result, to a reduction in the length of stay of patients in the hospital. It is extremely important to timely preventive administration of drugs during the period of increasing “cytokine storm”. The optimal time for prescribing drugs is 1–3 days from the moment of receipt, until the patient is transferred to a ventilator.Новая коронавирусная инфекции (COVID-19) стала поистине глобальным вызовом для всего человечества, и, прежде всего, для системы здравоохранения. Среди её важнейших аспектов, требующих тщательного анализа, – клинико-лабораторные особенности течения заболевания, позволяющие определить подходы к патогенетической терапии при тяжелых формах заболевания.Материалы и методы. Проведен ретроспективный анализ медицинских карт больных COVID-19 тяжелого течения, находившихся на стационарном лечении в Клинической инфекционной больнице им. С.П. Боткина в 2020–2022 гг. Оценена клинико-лабораторная характеристика, включая уровни С-реактивного белка, интерлейкина-6, динамику лихорадки. Определены критерии назначения препаратов для патогенетической терапии у пациентов с COVID-19 и их эффективность.Результаты. При лечении пациентов с COVID-19 необходимо тщательно оценивать клиническую картину течения заболевания, которая опережает изменение лабораторных показателей. Введение препаратов гуманизированных антител приводит к регрессу общеинфекционной симптоматики, субъективных и объективных проявлений дыхательной недостаточности и, как следствие, к сокращению сроков нахождения пациентов в стационаре. Крайне важно своевременное упреждающее введение препаратов в период нарастания «цитокинового шторма». Время оптимального назначения препаратов – 1–3-й день от момента поступления до перевода пациента на ИВЛ

Особенности лабораторных исследований при диагностике краснухи у беременных

Introduction: Despite on mandatory vaccination against rubella, the amount of pregnant women without immunity to rubella may exceed 20%. These women represent a risk group for the rubella disease.Objectives: The goals of the presented work are to analyze the cases of anti-rubella IgM detection in pregnant women, and to develop an algorithm for management of such patients.Materials and Methods: Screening has been performed by ELISA test systems company Radim (Italy). In total 799 patients were examined for rubella in 2013, 56 of them were pregnant women.Results. Positive IgM antibodies to rubella in 2013 have been identified in 5 cases, including 4 pregnant women. A detailed analysis of medical history, clinical and laboratory data has been done. In none of these cases the diagnosis of rubella has been confirmed.Conclusions. The main criterion for the diagnosis of rubella in pregnant women with rubella markers in the absence of clinical symptoms must be a dynamic examination, including study on IgM- and IgG-antibodies to rubella virus. The study must be conducted in the same laboratory at intervals of 10–14 days. In most cases, determination of IgG-antibodies avidity helps to estimate the time of infection. In complicated cases it is recommended to use PCR and immunoblot.Актуальность: несмотря на введение обязательной вакцинации от краснухи, количество беременных, у которых отсутствуют защитные антитела, может превышать 20%. Эти женщины представляют группу риска по заболеванию краснухой.Цель работы: проанализировать случаи выявления IgM к краснухе у беременных и разработать алгоритм ведения таких пациенток.Материалы и методы: скрининг проводился методом иммуноферментного анализа на тест-системах фирмы Radim (Италия). В 2013 г. на антитела к краснухе было обследовано 799 пациентов, из них 56 беременных.Результаты. Положительные IgM антитела к краснухе были выявлены в 5 случаях, в том числе у 4 беременных. Проведен тщательный анализ анамнестических, клинических и лабораторных данных. Ни в одном из этих случаев диагноз краснухи не был подтвержден.Выводы. Основным критерием диагностики краснухи у беременных при обнаружении маркеров краснухи и отсутствии клинической симптоматики должно быть динамическое обследование беременной, включающее исследование на IgM- и IgG-антитела к вирусу краснухи. Исследование должно проводиться в одной лаборатории с интервалом 10–14 дней. Определение авидности IgG-антител помогает в большинстве случаев определить давность инфицирования. В сложных случаях необходимо использовать иммуноблот и ПЦР

Возможна ли перинатальная COVID-19: первые результаты

Among the problems associated with a new coronavirus infection, the possibility of its occurrence in pregnant women plays an important role. Until now, there is very little data on perinatal COVID-19, and there are no descriptions of structural changes in the afterbirth at all. Material and methods. A clinical and morphological analysis of 6 cases in which women with verified COVID-19 gave birth in an infectious hospital was performed. In all cases, the placenta was examined in detail morphologically using antibodies to the nucleoprotein and spike (S1 subunit spike protein) SARS-CoV-2. COVID-19 Results. It is shown that the clinical course of COVID-19 in pregnant women may be different, three were in the intensive care unit, including one was shown to be on a ventilator. 4 children were born at term, 2 children prematurely (at 31- 33 weeks of pregnancy). The condition of children in 5 nab. was assessed as satisfactory, only one child in serious condition was transferred to a children’s hospital. Intrauterine infection with the polymerase chain reaction documented in a single observation. When histological examination of the afterbirth in all observations, both in the maternal and fetal parts, changes characteristic of RNA viral infection was detected. Both of the studied antigens were found in moderate amounts in IHC. Conclusions. Intrauterine transplacental infection with a new coronavirus is certainly possible. Its frequency and clinical significance require further comprehensive study.Среди проблем, связанных c новой коронавирусной инфекцией, важную роль играет возможность её течения у беременных женщин. До настоящего времени данные о перинатальной инфекции SARS-CoV-2 крайне малочисленны, а описаний структурных изменений в последе найти не удалось. Материалы и методы. Проведен клинико-морфологический анализ 6 наблюдений, в которых женщины с COVID-19 рожали в условиях инфекционного стационара. Во всех случаях плаценты были детально исследованы морфологически с использованием антител к нуклеопротеину и белку капсида (S1 subunit spike protein) вируса SARS-CoV-2. Результаты. Показано, что клиническое течение COVID-19 у беременных женщин может быть различным, 3 находились в отделении интенсивной терапии, в том числе 1 на инвазивной вентиляции легких. 4 ребенка родились в срок, 2 детей преждевременно (на 31–33-й неделях беременности). Состояние детей в 5 случаях оценивалось как удовлетворительное, лишь 1 ребенок в тяжелом состоянии был переведен в детскую больницу. Внутриутробное инфицирование с помощью ПЦР документировано в 1 наблюдении. При гистологическом исследовании последов во всех наблюдениях, как в материнской, так и плодной частях, были выявлены изменения, характерные для РНК вирусной инфекции. При иммуногистохимическом исследовании были в умеренном количестве обнаружены оба исследованных антигена. Выводы. Внутриутробное трансплацентарное инфицирование новым коронавирусом, безусловно, возможно. Его частота и клиническая значимость требуют дальнейшего комплексного изучения

Вопросы патоморфогенеза новой коронавирусной инфекции (COVID-19)

Relevance of the problem of a new COVID-19 coronavirus infection is obvious. Among its most important aspects that require special study, are pathogenesis and morphological changes in severe forms of the disease.Material and methods. The analysis of 18 autopsy observations was carried out. Along with routine assessment of macro – and microscopic changes, immunohistochemical studies of lungs and other organs were performed using sera against antigens CD2,3,4,5,7, 20,31,34, 56,57,69; the presence of Fe2+ and Fe3+ was detected in the lungs and liver. Results. Structural changes in the lungs may be associated with cytopathic and cytoproliferative effects of the virus with damage to both the ciliary and alveolar epithelium, as well as the formation of hyaline membranes. Cellular infiltration is mainly represented by suppressor populations of T-lymphocytes and macrophages. Endothelial damage, vascular thrombosis of vessels of different calibers, and hemorrhages were detected. Many organs (lymph nodes, spleen, intestines, brain, adrenal glands) show changes that may indicate generalization of viral infection, and infiltrationof CD8+ lymphocytes in the kidneys, liver, adrenal glands, pericardium,and intestines indicates a probable autoimmune component of pathogenesis. In the liver and lungs deceased from COVID-19 only small clusters of Fe3+ and Fe2+ granules were detected, which can be associated (including in our control observation) with liver damage in malaria.  Новая коронавирусная инфекция (COVID-19) представляет собой глобальную проблему человечества. Среди её важнейших аспектов, требующих углублённого изучения, – патогенез и морфологические изменения при тяжелых формах заболевания.Материалы и методы. Проведен анализ 18 летально закончившихся случаев. Наряду с рутинной оценкой макро- и микроскопических изменений, проведено иммуногистохимическое исследование легких и других органов с использованием сывороток к СD 2, 3, 4, 5, 7, 20, 31, 34, 56, 57, 69, также в легких и печени выявлялось наличие Fe2+ и Fe3+.Результаты. Показаны характерные структурные изменения легких, которые могут быть связаны с цитопатическим и цитопролиферативным действием вируса с поражением как мерцательного, так и альвеолярного эпителия, а также формированием гиалиновых мембран. Клеточная инфильтрация представлена преимущественно супрессорными популяциями Т-лимфоцитов и макрофагами. Выявлены повреждения эндотелия, тромбоз сосудов разного калибра и кровоизлияния. Во многих органах (лимфатических узлах, селезенке, кишечнике, головном мозге, надпочечниках) обнаружены изменения, возможно, свидетельствующие о генерализации вирусной инфекции, а инфильтрация CD8+ лимфоцитами в почках, печени, надпочечниках, перикарде, кишечнике свидетельствует о вероятном аутоиммунном компоненте патогенеза. В печени и легких умерших от COVID-19 не выявлено значимого скопления гранул Fe3+и Fe2+

Клинико-патологический анализ летальных исходов в зависимости от генотипа коронавируса SARS-COV-2

The genotype of the SARS-CoV-2 virus pathogen plays an important role in the epidemiological and clinical characteristics of a new coronovirus infection. There are no published data on the morphological features of lesions caused by different virus genotypes.The aim of the study was to evaluate clinical, laboratory and morphological changes depending on the genotype of the SARS-CoV-2 virus.Materials and methods. A retrospective analysis of the medical records of 39 patients with COVID-19 with a severe course of the disease, which ended in death, who were hospitalized at the St. Petersburg State Budgetary Infectious Diseases Clinical Hospital named after S.P. Botkin” in 20202022. Clinical and laboratory characteristics were assessed, including determination of the virus genotype, levels of leukocytes, lymphocytes, alanine aminotransferase, creatinine, ferritin, C-reactive protein, D-dimer, interleukin-6. Macro- and microscopic changes were assessed, including immunohistochemical examination of the lungs and other organs using sera to CD14 68, 163, type 1 and 3 collagen. The preparations were digitized on a Panoramic scanner, morphometric studies were carried out using the SlideViewer program, including the quantitative determination of the content of CD68+ macrophages in 12 cases.Results. In all patients, the disease was complicated by the development of pneumonia, the majority had concomitant diseases (94.6%). The average time of hospitalization was 19.0±1.6 days, the average time of stay in the intensive care unit was 7.7±1.2 days. The analysis, depending on the genotype of the SARS-CoV-2 virus, showed a statistical difference between the age of patients, the length of stay in the intensive care unit and the level of lymphocytes. Differences in the average duration of hospitalization, the level of laboratory parameters were not revealed. Histopathological picture in all examined was approximately the same. The content of CD68+ macrophages per unit area in different genotypes did not differ, but varied significantly within the same genotype.Conclusion. Thus, it was not possible to identify significant differences between the changes caused by different genotypes of the new coronavirus, which can probably be explained by the fact that mutations do not include genome regions that are relevant to virulence factors, although further research is needed.Генотип вируса SARS-CoV-2 играет важную роль в эпидемиологической и клинической характеристике новой короновирусной инфекции. Литературные данные о морфологических особенностях поражений, обусловленных разными генотипами вируса, отсутствуют.Цель: оценка клинико-лабораторных и морфологических изменений в зависимости от генотипа вируса SARS-CoV-2.Материалы и методы. Проведен ретроспективный анализ медицинских карт 39 больных COVID-19 с тяжелым течением заболевания, закончившимся летальным исходом, находившихся на стационарном лечении в Клинической инфекционной больнице им. С.П. Боткина в 2020–2022 гг. Оценена клинико-лабораторная характеристика, включая определение генотипа вируса, уровни лейкоцитов, лимфоцитов, аланинаминотрансферазы, креатинина, ферритина, С-реактивного белка, Д-димера, интерлейкина-6. Произведена оценка макро- и микроскопических изменений, в том числе иммуногистохимическое исследование легких и других органов с использованием сывороток к СD14 68, 163, коллагену 1 и 3 типа. Препараты были оцифрованы на сканере Panoramic, морфометрические исследования проведены с использованием программы SlideViewer, в том числе количественно определено содержание CD68+ макрофагов в 12 наблюдениях.Результаты. У всех пациентов заболевание осложнилось развитием пневмонии, большинство имели сопутствующие заболевания (94,6%). Среднее время госпитализации 19,0±1,6 дня, среднее время пребывания в реанимационном отделении 7,7±1,2 дней. В зависимости от генотипа вируса SARS-CoV-2 установлены статистически значимые различия между возрастом больных, длительностью пребывания в отделении реанимации и уровнем лимфоцитов. Различий по средней продолжительности госпитализации, уровню лабораторных показателей не выявлено. Гистопатологическая картина у всех обследованных была примерно одинаковой. Содержание макрофагов CD68+ на единицу площади при различных генотипах не отличалось, но значительно колебалось в пределах одного генотипа.Заключение. Таким образом, существенных различий между изменениями, обусловленными разными генотипами нового коронавируса, выявить не удалось. Вероятно, это можно объяснить тем, что в состав мутаций не входят участки генома, релевантные факторам вирулентности, хотя необходимы дальнейшие исследования

Использование искусственного интеллекта у больных с новой коронавирусной инфекцией для прогнозирования течения заболевания в условиях инфекционного стационара

Aim. To create algorithm and risk calculator for predicting the lethal outcome in patients with COVID-19.Materials and methods. Based on machine learning approach mortality risk calculator was developed in Almazov National Medical Research Centre using data of the hospitalised patients with an established diagnosis of COVID-19 (n=4071).Results. This mathematical model, which includes 11 significant features, has been proposed for estimation of fatal outcomes in the Clinical Infectious Hospital named after S.P. Botkin. Some key features were not assessed in most hospitals according to accepted standards of care for COVID-19. So systematic analysis of factors affecting the course of disease in patients (n=2876) were conducted and «urea» and «total protein» were replaced with «sex» and «BMI». Modified algorithm demonstrated high sensitivity and specificity. Conclusion. This calculator is able to predict hospitalisation outcome with high accuracy in patients infected with different strains of SARS-CoV-2. This decision support system may be used for risk stratification and following correct patients routing.Цель: создать алгоритм и разработать калькулятор расчета риска летального исхода у больных COVID-19 со средней и тяжелой степенью, госпитализированных  в инфекционный стационар.Материалы и методы: на основании данных пациентов с подтвержденным диагнозом COVID-19, госпитализированных в Национальный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова в период с 05.2020 г. по 08.2021 г. (n=4071), создан калькулятор прогнозирования риска летального исхода с применением технологии машинного обучения.Результаты: разработанный алгоритм, включающий 11 значимых признаков, был применен для расчета риска летального исхода в Клинической инфекционной больнице им. С.П. Боткина в период с 05.09.2022 г. по 01.03.2023 г. Учитывая, что факторы «Мочевина»  и «Общий белок» не входили в стандарт обследования госпитализированных больных, в качестве новых доступных для большинства инфекционных стационаров признаков с применением машинного обучения (n=2876) были выбраны факторы «Пол» и «ИМТ». Такая модификация позволила адаптировать  настоящий  алгоритм к применению в клинической практике, сохранив высокую чувствительность и специфичность модели.Заключение: данный калькулятор позволяет с высокой долей вероятности прогнозировать исход госпитализции, в том числе при различных штаммах вируса SARS-CoV-2. Применение такого алгоритма поддержки принятия клинических решений может рассматриваться как вспомогательный инструмент стратификации риска и дальнейшей корректной маршрутизации пациента в условиях избыточной нагрузки на систему здравоохранения

Is perinatal CoVID-19 possible: first results

Among the problems associated with a new coronavirus infection, the possibility of its occurrence in pregnant women plays an important role. Until now, there is very little data on perinatal COVID-19, and there are no descriptions of structural changes in the afterbirth at all. Material and methods. A clinical and morphological analysis of 6 cases in which women with verified COVID-19 gave birth in an infectious hospital was performed. In all cases, the placenta was examined in detail morphologically using antibodies to the nucleoprotein and spike (S1 subunit spike protein) SARS-CoV-2. COVID-19 Results. It is shown that the clinical course of COVID-19 in pregnant women may be different, three were in the intensive care unit, including one was shown to be on a ventilator. 4 children were born at term, 2 children prematurely (at 31- 33 weeks of pregnancy). The condition of children in 5 nab. was assessed as satisfactory, only one child in serious condition was transferred to a children’s hospital. Intrauterine infection with the polymerase chain reaction documented in a single observation. When histological examination of the afterbirth in all observations, both in the maternal and fetal parts, changes characteristic of RNA viral infection was detected. Both of the studied antigens were found in moderate amounts in IHC. Conclusions. Intrauterine transplacental infection with a new coronavirus is certainly possible. Its frequency and clinical significance require further comprehensive study

Features of laboratory tests for diagnosis of rubella in pregnant women

Introduction: Despite on mandatory vaccination against rubella, the amount of pregnant women without immunity to rubella may exceed 20%. These women represent a risk group for the rubella disease.Objectives: The goals of the presented work are to analyze the cases of anti-rubella IgM detection in pregnant women, and to develop an algorithm for management of such patients.Materials and Methods: Screening has been performed by ELISA test systems company Radim (Italy). In total 799 patients were examined for rubella in 2013, 56 of them were pregnant women.Results. Positive IgM antibodies to rubella in 2013 have been identified in 5 cases, including 4 pregnant women. A detailed analysis of medical history, clinical and laboratory data has been done. In none of these cases the diagnosis of rubella has been confirmed.Conclusions. The main criterion for the diagnosis of rubella in pregnant women with rubella markers in the absence of clinical symptoms must be a dynamic examination, including study on IgM- and IgG-antibodies to rubella virus. The study must be conducted in the same laboratory at intervals of 10–14 days. In most cases, determination of IgG-antibodies avidity helps to estimate the time of infection. In complicated cases it is recommended to use PCR and immunoblot

Issues of pathology of a new coronavirus infection CoVID-19

Relevance of the problem of a new COVID-19 coronavirus infection is obvious. Among its most important aspects that require special study, are pathogenesis and morphological changes in severe forms of the disease.Material and methods. The analysis of 18 autopsy observations was carried out. Along with routine assessment of macro – and microscopic changes, immunohistochemical studies of lungs and other organs were performed using sera against antigens CD2,3,4,5,7, 20,31,34, 56,57,69; the presence of Fe2+ and Fe3+ was detected in the lungs and liver. Results. Structural changes in the lungs may be associated with cytopathic and cytoproliferative effects of the virus with damage to both the ciliary and alveolar epithelium, as well as the formation of hyaline membranes. Cellular infiltration is mainly represented by suppressor populations of T-lymphocytes and macrophages. Endothelial damage, vascular thrombosis of vessels of different calibers, and hemorrhages were detected. Many organs (lymph nodes, spleen, intestines, brain, adrenal glands) show changes that may indicate generalization of viral infection, and infiltrationof CD8+ lymphocytes in the kidneys, liver, adrenal glands, pericardium,and intestines indicates a probable autoimmune component of pathogenesis. In the liver and lungs deceased from COVID-19 only small clusters of Fe3+ and Fe2+ granules were detected, which can be associated (including in our control observation) with liver damage in malaria

A Data-Driven Review of the Genetic Factors of Pregnancy Complications

Over the recent years, many advances have been made in the research of the genetic factors of pregnancy complications. In this work, we use publicly available data repositories, such as the National Human Genome Research Institute GWAS Catalog, HuGE Navigator, and the UK Biobank genetic and phenotypic dataset to gain insights into molecular pathways and individual genes behind a set of pregnancy-related traits, including the most studied ones—preeclampsia, gestational diabetes, preterm birth, and placental abruption. Using both HuGE and GWAS Catalog data, we confirm that immune system and, in particular, T-cell related pathways are one of the most important drivers of pregnancy-related traits. Pathway analysis of the data reveals that cell adhesion and matrisome-related genes are also commonly involved in pregnancy pathologies. We also find a large role of metabolic factors that affect not only gestational diabetes, but also the other traits. These shared metabolic genes include IGF2, PPARG, and NOS3. We further discover that the published genetic associations are poorly replicated in the independent UK Biobank cohort. Nevertheless, we find novel genome-wide associations with pregnancy-related traits for the FBLN7, STK32B, and ACTR3B genes, and replicate the effects of the KAZN and TLE1 genes, with the latter being the only gene identified across all data resources. Overall, our analysis highlights central molecular pathways for pregnancy-related traits, and suggests a need to use more accurate and sophisticated association analysis strategies to robustly identify genetic risk factors for pregnancy complications