Häufigkeit der hlyA, hlyB, hlyC und hlyD Gene in uropathogenen Escherichia coli, isoliert von HWI Patienten in Schiraz

Background and objectives : One of the most important causes of urinary tract infections (UTI) is Escherichia coli . The infection is mainly due to the uropathogenic strain (UPEC), which has key virulence factors, including hemolysis. In this study, we evaluated the frequency of hlyA , hlyB , hlyC and hlyD genes in UPEC strains isolated from clinical samples from Shiraz city, Iran.Materials and methods: 130 urine samples with suspected UTI were collected from Shiraz medical centers and cultured on blood agar and EMB media. Colonies were then characterized by biochemical methods. The genomes were extracted and the presence of hemolysis genes was detected by polymerase chain reaction (PCR) using hly gene specific primers and 16S rRNA . Drug resistance was assessed by using 10 antibiotic disks in the disk diffusion method, according to CLSI criteria.Results: Out of the 130 collected UTI samples, 100 were identified as UPECs. Within isolates, the hlyD gene had the highest frequency - 95% - and hlyC had the lowest, with 23%. The frequencies of hlyA and hlyB genes were calculated as 50% and 43%, respectively. The rates of antibiotic resistance to Azithromycin, Ampicillin, Cefotaxime, Nalidixic Acid, Tetracycline, Trimethoprim-Sulfamethoxazole, Cefepime, Aztreonam, Gentamicin, and Nitrofurantoin were 95%, 86%, 68%, 66%, 65%, 64%, 51%, 46%, 44%, 14%, respectively. 98% of these isolates belonged to the MDR group.Conclusion: This study shows diversity of hemolysis virulence factor in UPECs and unique UPEC drug resistance that would indicate a high antibiotic use in the general population.Hintergrund und Zielsetzung : Eine der wichtigsten Ursachen für Harnweginfektionen (HWI) ist Escherichia coli . Die Infektion ist hauptsächlich auf den uropathogenen Stamm (UPEC) zurückzuführen, der wichtige Virulenzfaktoren einschließlich Hämolyse aufweist. In dieser Studie evaluieren wir die Häufigkeit der hlyA , hlyB , hlyC und hlyD Gene in UPEC Stämmen, die aus klinischen Proben in Shiraz isoliert wurden.Material und Methode :130 HWI-verdächtige Urinproben wurden auf Blut Agar und EMB Medien kultiviert. Die Kolonien wurden dann mit biochemischen Methoden charakterisiert. Die Genome wurden extrahiert und das Vorhandensein von Hämolyse Genen wurde durch Polymerasekettenreaktion (PCR), hly Gene spezifischer Primer und 16S rRNA nachgewiesen. Die Arzneimittelresistenz wurde anhand von 10 Antibiotikaplättchen im Diffusionsverfahren gemäß den CLSI Kriterien bewertet. Ergebnisse: Von den 130 HWI Proben wurden 100 als UPECs identifiziert. Innerhalb der Isolate hatte das hlyD Gen die höchste Häufigkeit von 95% und das hlyC die niedrigste mit 23%. Die Häufigkeit der hlyA und hlyB Genen wurde als 50% bzw. 43% berechnet. Die Raten der Antibiotikaresistenz gegen Azithromycin, Ampicillin, Cefotaxim, Nalidixinsäure, Tetracycline, Trimethoprim-Sulfamethoxazole, Cefepime, Aztreonam, Gentamicin und Nitrofurantoin betrugen 95%, 86%, 68%, 66%, 65%, 64%, 51%, 46%, 44% bzw. 14%. 98% dieser Isolation gehörten der MDR-Gruppe an.Schlussfolgerungen: Die Studie zeigt die Vielfalt des Hämolysevirulenzfaktors in UPECs und die UPEC-Arzneimittelresistenz, die auf die häufige Antibiotikaanweneung in der Bevölkerung hinweist