20 research outputs found
Dentin dysplasia type I
This paper describes a rare case of genetically determined dentin dysplasia type I in 26-year-old male patient. The paper highlights anatomical and radiological aspects of dental abnormalities and emphasizes the significance of the education of both general practitioners and paediatricians as regards referring patients with diagnosed dentin dysplasia for a multi-specialty therapy.
Pseudospherical surfaces on time scales: a geometric definition and the spectral approach
We define and discuss the notion of pseudospherical surfaces in asymptotic
coordinates on time scales. Thus we extend well known notions of discrete
pseudospherical surfaces and smooth pseudosperical surfaces on more exotic
domains (e.g, the Cantor set). In particular, we present a new expression for
the discrete Gaussian curvature which turns out to be valid for asymptotic nets
on any time scale. We show that asymptotic Chebyshev nets on an arbitrary time
scale have constant negative Gaussian curvature. We present also the
quaternion-valued spectral problem (the Lax pair) and the Darboux-Backlund
transformation for pseudospherical surfaces (in asymptotic coordinates) on
arbitrary time scales.Comment: 20 page
Sequence diversity of MHC class II DRB genes in the moose Alces alces from its conitinuous range in Poland
Zdigitalizowano i udostępniono w ramach projektu pn. Rozbudowa otwartych zasobów naukowych Repozytorium Uniwersytetu w Białymstoku – kontynuacja, dofinansowanego z programu „Społeczna odpowiedzialność nauki” Ministra Edukacji i Nauki na podstawie umowy BIBL/SP/0040/2023/01.Many vertebrate species show a very high degree of polymorphism of the genes of the major histocompatibility complex (MHC), which is associated with its key role in their immune response. However, studies on MHC class II DRB gene diversity in moose populations in Europe and North America have shown a low level of polymorphism, with elear differences between populations. In our study we examined the diversity in a fragment of an MHC class II DRB gene with 226 base pairs in 196 moose from Poland from seven populations. We identified eight (from 5 to 8 in particular populations) MHC II DRB alleles, of which DRBl *11 was unique to the moose population in the Biebrza Valley. This population has experienced a series of numerous significant reductions in historical times and has been largely isolated from other moose populations. Although genetic differentiation among populations for the MHC II DRB gene was low, PCA analysis elearly showed the distinct character of the Biebrza population. This may confirm the relict character of this moose population.This study was financed by the Polish Ministry of Science and Higher Education, (grant no. N N304 024134 to M. Ratkiewicz), for
the Biebrza National Park population, and by the National Fund for Environmental Protection and Water Management for the other populations (project no. 326/09/Wn50/NE-PR-IX/D).M. Świsłocka - Department of Molecular Zoology, Institute of Biology, University of BialystokN. Duda - Zespół Szkół Ogólnokształcących No 2 w BiałymstokuM. Ratkiewicz - Department of Molecular Zoology, Institute of Biology, University of BialystokAltizer S., Harvell D., Friedle E. (2003) Rapid evolutionary dynamics and disease threats to biodiversity. Trends in Ecology & Evolution, 18: 589-596.Andersson L., Sigurdardóttir S., Borsch C., Gustafsson K (1991) Evolution of MHC polymorphism: Extensive sharing of polymorphic sequence motifs between human and bovine DRB alleles. Immunogenetics, 33: 188-193.Babik W, Durka W, Radwan J. (2005) Sequence diversity of the MHC DRB gene in the Eurasian beaver (Castor fiber). Molecular Ecology, 14: 4249-4257.Babik W., Pabijan M., Arntzen J.W., Cogălniceanu D., Durka W., Radwan J. (2009) Long-term survival of a urodele amphibian despite depleted major histocompatibility complex variation. Molecular Ecology, 18: 769-781.Bowen L., Aldridge B.M., Gulland F. Van Bonn W., DeLong K. Melin S., Lowenstine L.J., Stott J.L., Johnson M.L. (2004) Class II multiformity generated by variable MHC-DRB region configurations in the California sea lion (Zalophus californianus). Immunogenetics, 56: 12-27.Brincken J. (1826) Memoire descriptif sur la foret imperiale de Białowieża en Lithuanie. N. Ghickserg, Warsaw [In Frensch].Coltman D.W., O'Donoghue P., Jorgenson J.T., Hogg J.T., Strobeck C., Festa-Bianchet M. (2003) Undesirable evolutionary consequences of trophy hunting. Nature, 426: 655-658.De S., Singh R.K., Brahma B. (2011) Allelic Diversity of Major Histocompatibility Complex Class II DRB Gene in Indian Cattle and Buffalo. Molecular Biology International, v2011.Dzięciołowski R., Pielowski P. (1993) Łoś. Anton-5 Sp. z 0.0., Warsaw [In Polish].Ellegren H., Mikko S., Wallin K., Andersson L. (1996) Limited polymorphism at major histocompatibility complex (MHC) loci in the Swedish moose A. alces. Molecular Ecology, 5: 3-9.Ejsmond M. J., Babik W., Radwan J. (2010) MHC allele frequency distributions under parasite-driven selection: A simulation model. BMC Evolutionary Biology, 10: 1254-1259.Excoffier L., Lischer H.E.L. (2010) Arlequin suite ver 3.5: a new series of programs to perform population geneties analyses under Linux and Windows. Molecular Ecology Resources, 10: 564-567.Fernández-de-Mera I.G., Vicente J., Pérez de la Lastra J.M., Mangold A.J., Naranjo V., Fierro Y., de la Fuente J., Gortázar C. (2009) Reduced major histocompatibility complex class II polymorphism in a hunter-managed isolated Iberian red deer population. Journal of Zoology, 277: 157-170.Garrigan D., Hedrick P.W. (2003) Detecting adaptive molecular polymorphism: Lessons from the MHC Evolution, 57: 1707-1722.Gębczyńska Z., Raczyński J. (2001) Sytuacja łosia Alces alces (L.) w Polsce, zagrożenia i program odbudowy jego populacji. Chrońmy przyrodę ojczystą, 4: 35-55 [In Polish].Gumiński W. (2003) Big game and sparse forest - relations between mammal species and the surrounding environment at the Prehistorie fishing campsite of Dudka in Masuria, NE-Poland. Archaeozoologia, 21: 59-72.Hall T.A. (1999) BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series, 41: 95-98Hedrick P.W., Kim K.J. (2000) Genetics of complex polymorphisms: pathogens and maintenance of the major histocompatibility complex variation. pp. 204-234. [In]: Singh RS., Krimbas CB. (ed.). Evolutionary genetics: from molecules to morphology, Cambridge University Press, Cambridge.Janeway C.A., Travers P., Walport D., Shlomchik M.J. (2004) Immunobiology: The Immune System in Health and Disease. New York: Garland Publishing.Klein J., Takahata N., Ayala F.J. (1993) MHC polymorphism and human origins. Scientific American, 269: 78-83.Lachish S., Jones M., McCallum H. (2007) The impact of disease on the survival and population growth rate of the Tasmanian devil. Journal of Animai Ecology, 76: 926-936.Librado P., Rozas J. (2009) DnaSP v5: a software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Bioinformatics, 25: 1451-1452.Linnaeus C. (1758) Systema Naturae. 10th Edition. Stockholm.Loehr J., Worley K., Grapputo A., Carey J., Veitch A., Coltman o.w. (2006) Evidence for cryptic glacial refugia from North American mountain sheep mitochondrial DNA Journal of Evolutionary Biology, 19: 419-430.Mainguy J., Worley K., Cate S.D., Coltman D.W. (2007) Low MHC DRB class II iversity in the mountain goat: past bottlenecks and possible role of pathogens and parasites. Conservation Genetics, 8: 885-891.Marsh S.G.E., Bodmer J.,G. (1990) HLA-DRB nucleotide sequences. Immunogenetics, 31: 141-144.Mikko S., Andersson L. (1995) Low major histocompatibility complex class II diversity in European and North American moose. Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America, 92: 4259-4263.Mikko S., Røed K, Schmutz S., Andersson L. (1999) Monomorphism and polymorphism at MHC DRB loci in domestic and wild ruminants. Immunological Reviews, 167: 169-178.Peakall R., Smouse P.E. (2006) GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes, 6: 288-295.Raczyński J. (2006) Łoś w Polsce: stan i perspektywy. pp. 25-38. [In]: Czy jest miejsce dla łosia? Uroczysko Supraśl [In Polish].Radwan J., Biedrzycka A., Babik W. (2010) Does reduced MHC diversity decrease viability of vertebrate populations? Biological Conservation, 143: 537-544.Radwan J., Kawałko A., Wójcik J.M., Babik W. (2007) MHC-DRB3 variation in a free-living population of the European bison, Bison bonasus. Molecular Ecology, 16: 531-540.Sommer S., Schwab D., Ganzhorn J.U. (2002) MHC diversity of endemic Malagasy rodents in relation to geographic range and social system. Behavioral Ecology and Sociobiology, 51: 214-221.Świsłocka M., Czajkowska M., Duda N., Ratkiewicz M. (2015) Admixture promotes genetic variation in bottlenecked moose populations in eastern Poland. Mammal Research, 60, 169-179.Udina I.G., Danilkin A.A., Boeskorov G.G. (2002) Genetic diversity of moose (Alces aIces L.) in Eurasia. Genetika, 38: 951-957.Van Den Bussche R.A., Ross T.G., Hoofer S.R (2002) Genetic variation at a major histocompatibility locus within and among populations of white-tailed deer (Odocoileus virginianus). Journal of Mammalogy, 83: 31-39.Weber D.S., Van Coeverden De Groot P.J., Peacock E., Schrenzel M.D., Perez D.A, Thomas S., Shelton J.M., Else C.K., Darby L.L., Acosta L., Harris C.,
Youngblood J., Boag P., Desalle R (2013) Low MHC variation in the polar bear: implications in the face of Arctic warming? Animal Conservation, 1-13.Wilson P.J., Grewal S., Rodgers A., Rempel R., Saquet J., Hristienko H., Burrows E., Peterson R., White B.N. (2003) Genetic variation and population structure of moose (Alces aIces) at neutral and functional DNA loci. Canadian Journal of Zoology, 81: 670-683.Wright S. (1978) Evolution and the genetics of population. Vol 4. Variability within and among natural populations. University of Chicago Press. Chicago.Yasukochi Y., Kurosaki T., Yoneda M., Koike H., Satta Y. (2012) MHC class II DQB diversity in the Japanese black bear, Ursus thibetanus japonicus. BMC Evolutionary Biology, 12: 230.13514
Physicochemical, microbiological and biodegradation studies of selected derivatives of benzoic acids and its salts. searching for new antimicrobial compounds applicable in protection and environmental engineering
Ciągle rosnące zainteresowanie badaniami wpływu metali na układy elektronowe kwasów karboksylowych podyktowane jest m.in. ogromnym biologicznym znaczeniem połączeń metal-ligand. Jednym z obszarów zastosowań związków kompleksowych jest inżynieria i ochrona środowiska, gdzie kompleksy z metalami pełnią rolę nowoczesnych związków przeciwdrobnoustrojowych bezpiecznych dla człowieka i środowiska naturalnego. W prezentowanej pracy zostały przedstawione wyniki badań fizykochemicznych o-metoksy-o-nitrobenzoesanów i o-aminonikotynianów litowców z zastosowaniem spektroskopii w podczerwieni (FT-IR), spektroskopii ramanowskiej (FT-Raman), absorpcyjnej spektroskopii elektronowej (UV), spektroskopii protonowego i węglowego magnetycznego rezonansu jądrowego (1H i 13C NMR) oraz obliczeń kwantowo-mechanicznych. Przedstawiono także wybrane badania mikrobiologiczne i określono możliwość biodegradacji. Ocena biodegradacji w/w związków polegały na pomiarze wskaźników zanieczyszczeń wód takich jak: BZT, ChZT, RWO.Still growing interest in studies of the effect of metal ions on the electronic system of carboxylic acids is caused by the huge biological importance of metal-ligand linkages. In the field of protection and environmental engineering metal complexes act as antimicrobial compounds safe for human and natural environment. In this work the results of physicochemical studies of alkali metal o-methoxybenzoates, o-nitrobenzoates and o-aminonicotinates were presented. The following analytical methods were used: infrared spectroscopy (FT-IR), Raman spectroscopy (FT-Raman), electronic absorption spectroscopy (UV), magnetic resonance spectroscopy (1H and 13C NMR) and quantum-mechanical calculations. The degrees of biodegradation of studied compounds were established on the basis of BZT, ChZT and RWO values
Molecular structure and microbiological activity of alkali metal 3,4-dihydroxyphenylacetates
The changes in physical, chemical and biological properties of chemical compounds decide about their biological activity. In this paper the molecular structure of alkali metal 3,4-dihydroxyphenylacetates is studied in comparison to 3,4-dihydroxyphenylacetic acid (3,4-DHPAA) using FT-IR, FT-Raman and UV–Vis spectroscopy as well as density functional theory (DFT) calculations. The B3LYP/6-311++G∗∗ method is used to calculate optimized geometrical structures of studied compounds, atomic charges (Mulliken, APT, NBO), dipole moments, energies as well as the wavenumbers and intensities of the bands in vibrational spectra. Theoretical parameters are compared to the experimental data. The relationship between spectroscopic parameters of studied compounds and their biological activity is analyzed. Antioxidant activity is studied using FRAP and DPPH methods. IC50 parameter is also calculated. Bacillus subtilis, Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli and Klebsiella oxytoca are used in microbiological analysis of 3,4-DHPAA as well as its sodium and potassium salts. Keywords: 3,4-Dihydroxyphenylacetates, IR, UV, DFT, Biological activit
Application of pulse radiolysis and vibrational spectroscopy (FT-IR, FT-NIR, FT-Raman) to test the quality of food products
Zapewnienie bezpieczeństwa zdrowotnego konsumenta jest podstawowym wymaganiem stawianym producentom żywności. Bezpieczeństwo żywności zależy od czystości mikrobiologicznej produktów i surowców spożywczych, a także od obecności zanieczyszczeń chemicznych w żywności. W pracy omówiono metody spektroskopii oscylacyjnej, które mają zastosowanie w analizie jakości żywności, są też poręcznym narzędziem w wykrywaniu jej zafałszowań. Przedstawiono również zastosowanie radiolizy impulsowej do badań wpływu wolnych rodników na właściwości fizykochemiczne żywności i jej składników.Providing the safety of consumer health is a basic requirement for food producers. Food safety depends on the microbiological purity of food products and raw materials, and the presence of chemical contaminants in food. The paper discusses the method of vibrational spectroscopy, which are applied in the analysis of food quality, there are also a handy tool in the detection of adulteration. It also presents application of pulse radiolysis to study the impact of free radicals on the physicochemical properties of foods and food ingredients
Application of analytical methods for detecting food irradiation : an overview of recent methods in regard of EU regulations
Napromienianie żywności jest metodą konserwacji o niemal stuletniej tradycji. Pomimo, że zostało zaakceptowane przez organy kontroli jakości w wielu krajach na całym świecie, nadal budzi kontrowersje. Nie ulega kwestii, że procesy napromieniania żywności powinny być monitorowane, a żywność sterylizowana radiacyjnie powinna podlegać bardzo ścisłej kontroli jakości. Z tej przyczyny poszukuje się nowych metod wykrywania i dozymetrii napromieniowanej żywności. Obecnie wśród metod analitycznych wykrywania żywności poddanej napromieniowaniu, znormalizowanych przez Europejski Komitet Normalizacyjny (CEN), są tylko dwie metody spektroskopowe: rezonans paramagnetyczny i luminescencja stymulowana światłem, jednak badania wskazują na możliwość zastosowania wielu innych dogodnych rozwiązań z zastosowaniem m.in. spektroskopii Ramana i widm w bliskiej podczerwieni. Spektroskopowe metody oceny napromieniowanej żywności dają możliwość szybkiego i precyzyjnego wykrycia zastosowanych dawek, dlatego zasługują na zainteresowanie ze strony zespołów badawczych i wdrożeniowych. Niniejszy przegląd omawia krótko obecny stan naukowy i prawny monitoringu napromieniowania artykułów żywnościowych w Polsce i na świecie, a następnie prezentuje najnowsze doniesienia i osiągnięcia w zakresie zastosowania metod spektroskopowych w ocenie napromienionej żywności.Food irradiation as a method of preservation is nearly a century old. Although it has been approved by the quality control in many countries around the world, it still remains a matter of controversy. There is no question that the process of food irradiation should be monitored, and irradiated foods should be subject to very strict quality control. For this reason the search for new methods of detection and dosimetry of irradiated foods is required. Currently, among the analytical methods for detecting irradiated foods standardized by the European Committee for Standardization (CEN) only two are the spectroscopic methods: EPR and photostimulated luminescence, but studies indicate the possibility of using a number of other convenient solutions, among others Raman and near-infrared spectra. Spectroscopic methods for assessing irradiated foods make it possible to quickly and accurately detect the applied dose, and shall draw attention of the research and implementation teams. This review briefly discusses the current scientific and legal status of irradiated food monitoring in Poland and worldwide and presents the latest achievements in the application of spectroscopic methods in the evaluation of food irradiation
Applications of phenolic compounds and their derivatives in industry and medicine
Artykuł jest przeglądem literaturowym dotyczącym zastosowania związków fenolowych pochodzenia
naturalnego w przemyśle, budownictwie, medycynie, rolnictwie i inżynierii środowiska. Toksyczne związki chemiczne
wprowadzone do środowiska mogą wywoływać wiele szkodliwych skutków zdrowotnych. Ze względu na szerokie
spektrum działania, naturalne związki fenolowe (kwasy fenolowe i flawonoidy) mogą stanowić substytuty, na przykład
niebezpiecznych dla środowiska preparatów stosowanych w budownictwie – jako inhibitory korozji metali i biokorozji
drewna oraz w rolnictwie jako naturalne pestycydy. Właściwości antyoksydacyjne, antyproliferacyjne, proapoptyczne
i przeciwzapalne związków fenolowych są podstawą do stosowania ich w terapii chorób nowotworowych,
neurodegeneracyjnych, alergiach i stanach zapalnych oraz cukrzycy.This article presents a review of literature data about
practical application of phenolic compounds, which are widely
occurring in plants, in: agriculture, building construction and
environmental engineering. Toxic compounds in natural
enviroment can trigger negative health effects. Due to the broad
spectrum, phenolic compounds such as phenolic acids and
flavonoids can be a substitute of harmful compounds, such as
metal-corrosion protectos and microbiologically influenced
corrosion protecors and in agriculture, as natural pesticides.
Antioxidant, antiproliferate, proapoptotic and antiinflammatory
propeties of phenolic compounds are the basis for their
application in therapy of cancer, neurodegeneration, alergy and
inflammation or in diabetes
New mermithid nematode-spider associations, along with a molecular phylogeny of mermithids hosted in spiders
Mermithid parasitoids are well known to infect spiders; however, their impact on hosts and their taxonomic identity are still poorly analyzed. We present the first record of a mermithid nematode infection in the spider genera Piratula (Lycosidae) and Coelotes (Agelenidae), and in the species Alopecosa pulverulenta and Pardosa paludicola (Lycosidae). We describe the maldevelopment of the spiders’ female genitalia induced by the parasitoid and summarize data on the impact of nematode parasitoids on spider development and behaviour. Phylogenetic analysis, based on the 18S rDNA, showed that spider parasitoidism arose independently in different branches of the phylogenetic tree of the family Mermithidae
Wpływ pulsacyjnego pola elektrycznego na przeżywalność Yersinia enterocolitica w mielonym mięsie wołowym : badanie aktywności mikrobiologicznej wybranych linii komórkowych bakterii pod wpływem czynników fizyko-chemicznych
The main purpose of this study was to examine the efficacy of the pulsed electric field (PEF) on inoculated yersinia enterocolitica ATCC 35669 in minced beef meat. The pulse frequencies ranged from 28 to 2800 MHz. The samples were examined after 3 days of storage in temperature of +4 degrees of Celsius and after 30 days of storage in temperature of - 20 degrees of Celsius. Inactivation of Y. enterocolitica increased with the pulse frequencies. The treatment of meat with the electric field with the pulse frequencies of 28 MHz occurred to be ineffective towards Y. enterocolitica. The treatment of meat with the electric field with the pulse frequencies of 280 MHz occurred to be effective only towards Y. enterocolitica contained in beef meat stored at -20 degrees of Celsius for 30 days. The treatment of meat with the electric field with the pulse frequencies of 2800 MHz occurred to be highly effective towards Y. enterocolitica contained in meat stored both +4 degrees of Celsius and -20 degrees of Celsius.Głównym celem tego badania była ocena skuteczności impulsowego pola elektrycznego (PEF) wobec Yersinia enterocolitica ATCC 35669 namnożonej w mielonym mięsie wołowym. Częstotliwość impulsów mieściła się w przedziale od 28 do 2800 MHz. Próbki badano po 3 dniach przechowywania w temperaturze +4 stopni Celsjusza i po 30 dniach przechowywania w temperaturze -20 stopni Celsjusza. Y. enterocolitica wykazała wrażliwość na zwiększenie częstotliwości impulsów pola elektrycznego. Y. enterocolitica była wysoce odporna na działanie pola elektrycznego o częstotliwości impulsów 28 MHz. Potraktowanie mięsa polem elektrycznym o częstotliwości impulsów 280 MHz skutkowało inaktywacją Y. enterocolitica obecną w mięsie wołowym przechowywanym w temperaturze -20 stopni Celsjusza przez 30 dni. Potraktowanie mięsa polem elektrycznym o częstotliwości impulsów 2800 MHz okazało się wysoce skuteczne w eliminacji Y. enterocolitica zawartej w mięsie przechowywanym zarówno w temperaturze +4 stopnie Celsjusza jak i -20 stopni Celsjusza