Tumour-specific microRNA expression pattern in canine intestinal T-cell-lymphomas

Intestinal T-cell lymphomas are common in dogs, but histopathological diagnosis remains challenging because of accompanying enteritis with lymphocyte involvement. Invasively taken full-layer biopsies are still required for reliable differentiation. The detection of specific microRNA expression patterns in canine intestinal T-cell lymphoma could provide new possibilities to differ intestinal lymphoma from benign inflammation and could lead to further understanding of lymphomagenesis. The objective of this study was to characterize microRNA expression in distinct groups of formalin-fixed and paraffin-embedded samples from canine intestinal T-cell lymphomas, lymphoplasmacellular enteritis and healthy intestinal tissue. In a preliminary test with two samples per group, total RNA was extracted (RNEasy FFPE Kit, Qiagen), reverse transcribed (miScript II RT Kit, Qiagen) and pre-amplified (miScript PreAmp PCR Kit, Qiagen). We performed comparative quantitative PCR on microRNA PCR Array plates (Qiagen) with pre-fabricated reactions for 183 different mature canine microRNAs. Subsequently, 12 microRNAs with conspicuous expression changes in the lymphoma group were selected and microRNA expression of all samples (n = 8) per group was analysed with individual microRNA assays (miScript Primer Assays, Qiagen) on the reverse transcribed RNA without pre-amplification. Our results revealed lymphoma-specific expression patterns, with down-regulation of the tumour-suppressing microRNAs miR-194, miR-192, miR-141 and miR-203, and up-regulation of oncogenic microRNAs, including microRNAs from the miR-106a~363 cluster. In addition, we detected only slight expression alterations between healthy intestinal tissue and lymphoplasmacellular enteritis cases. We conclude that microRNA expression patterns can be used to separate T-cell lymphomas from healthy tissue and benign inflammatory disorders

Sığırlarda Tüberküloz Lezyonlarının Patomorfolojik Olarak İncelenmesi ve Mikobakterilerin Gösterilmesi

SIGˆIRLARDA TU¨BERKU¨LOZ LEZYONLARININ PATOMORFOLOJI·K OLARAK I·NCELENMESI· VE MI·KOBAKTERI·LERI·N GO¨STERI·LMESI· Hazal O¨ztu¨rk1, Miriam Leipig1, Birte Rieseberg1, Reinhard K. Straubinger2, Walter Hermanns1 1Veteriner Patoloji Enstitu¨su¨, Mu¨nih Ludwig Maximilian U¨niversitesi, Mu¨nih, Almanya 2Enfeksiyo¨z ve Zoonoz Hastalıklar Enstitu¨su¨, Mu¨nih Ludwig Maximilian U¨niversitesi, Mu¨nih, Almanya Almanya`nın Bavaria eyaletinde 2009 ve 2014 yılları arasında sıgˆır tu¨berku¨lozu salgınları go¨ru¨lmu¨s¸tu¨r. Bu c¸alıs¸manın amacı, bu bo¨lgedeki salgınlar sırasında sıgˆırlarda go¨zlenen tu¨berku¨loz lezyonlarındaki pato-morfolojik degˆis¸iklikleri, olası bulas¸ma yollarını ve enfekte organlardaki mikobakterileri ve mikobakteri antijenlerini go¨stermektir. Post-mortem incelemeler intra-dermal test analizleri baz alınarak, s¸u¨pheli pozitif ve pozitif bulunan 241 sıgˆır u¨zerinden gerc¸ekles¸tirildi. Doku o¨rneklerine parafin, plastik ve epoksi resin doku go¨mme is¸lemleri uygulandı. Doku kesitleri hemotoksilen & eozin (H&E) ve Fite-Faraco (FF) ile boyandı ve mikobateri antijenleri immunohistokimyasal yo¨ntemlerle is¸aretlendi. Histopatolojik ve ultra-stru¨ktu¨rel incelemeler sırasıyla, ıs¸ık ve transmisyon elektron mikroskobu (TEM) kullanılarak degˆerlendirildi. Mikrobiyolojik inceleme sonucu Mycobacterium caprae izole edildi. Sistematik nekropside 241 sıgˆırdan 84`u¨ makroskobik olarak tu¨berku¨loz ile uyumlu bulundu. Patolojik bulgular, makroskobik olarak bes¸ farklı makro-paterne (Makro-Patern I-V) ayrılırken, histolojik olarak do¨rt farklı (Histo-Tip 1-4) sınıflandırma yapıldı. Bunlara ek olarak, akcigˆerlerde eksudatif enflamasyon (Macro-Patern 6) go¨zlendi. Tu¨berku¨loz lezyonlarının vu¨cuttaki dagˆılımları baz alınarak, olası bulas¸ma yolları sırasıyla alimenter yol (%68), solunum yolu (%19) veya her iki yol (%13) olarak saptandı. Mikobakteriler ve mikobakteri antijenleri tu¨berku¨loz lezyonlarında farklı miktarlarda ve lokalizasyonlarda bulundu. Mikobaktelerin ultra-stru¨ktu¨rel yapısı transmisyon elektron mikroskobu kullanılarak go¨sterildi. Sonuc¸ olarak, makroskobik ve histopatolojik bulgular go¨z o¨nu¨ne bulundurularak tu¨berku¨loz lezyonlarının patomorfolojisi detaylı olarak incelendi. C¸alıs¸mada saptanan olası bulas¸ma yolları arasında alimenter yolun daha o¨nce bildirilen solunum yolunun aksine ilk sırada oldugˆu tespit edildi. Literatu¨r ile uyumlu olarak, etkenin go¨sterilmesinde FF boyamanın daha spesifik oldugˆu, ancak IHC ´nin daha duyarlı oldugˆu saptandı. TEM ile mikobakteriler go¨sterildi. Anahtar so¨zcu¨kler: Fite-Faraco, immunohistokimya, sıgˆır, transmisyon elektron mikroskobu, tu¨berku¨loz