Taxa de ocupação da jaguatirica (Leopardus pardalis) e segregação espacial e temporal de felídeos na região norte e nordeste do Estado de São Paulo

The spatial distribution and occurrence of species in the landscape are influenced by environmental conditions and the availability resources. Hábitat fragmentation can cause the reduction or elimination of these resources leading to the decline or disappearance of populations and species. Some interactions such as predation and competition can also be factors influencing species distribution; these interactions may be intensified between related species and may adversely affect species distribution and abundance. The aims of this study were to evaluate occupancy rate of ocelot (Leopardus pardalis), the relative abundance index and competitive relations of the ocelot, the jaguarundi (Puma yagouaroundi) and puma (Puma concolor) in the northern of São Paulo state. Camera traps were used from October/2012 to January/2015 in three protected areas of north and northeast state. The ocelot's occupancy rate in Jataí Ecological Station indicated a higher likelihood of species occupation in locations close to roads and showing higher biomass of prey, and a lower probability of occupying places nearly water courses. In State Park Furnas do Bom Jesus we observed a negative association of the puma with the ocelot and the jaguarundi, and a positive association between the ocelot and the jaguarundi; there was no overlaps of activity time between the ocelot and the jaguarundi, while the puma and ocelot co-occurred temporally. In Jataí Ecological Station, the ocelot and puma were positively associated and co-occurred temporally...A distribuição espacial e a ocorrência das espécies na paisagem são influenciadas pelas condições e disponibilidade dos recursos. A fragmentação do hábitat pode causar a redução ou eliminação desses recursos levando a diminuição ou desaparecimento de populações e espécies. Algumas interações como a predação e competição também podem ser fatores que influenciam a distribuição das espécies, essas interações podem ser mais intensas entre espécies aparentadas e podem afetar adversamente as espécies interferindo nas suas distribuições e abundância. Os objetivos do presente estudo foram avaliar a taxa de ocupação da jaguatirica (Leopardus pardalis), o índice de abundância relativa e as relações competitivas da jaguatirica, do jaguarundi (Puma yagouaroundi) e da onça-parda (Puma concolor) na região norte e nordeste de São Paulo. Foram utilizadas armadilhas fotográficas de outubro/2012 a janeiro/2015 em três Unidades de Conservação da região norte e nordeste do Estado. A taxa de ocupação da jaguatirica na Estação Ecológica Jataí indicou uma maior probabilidade de ocupação da espécie em locais próximos às estradas e com maiores biomassa de presas, e uma menor probabilidade de ocupação de locais próximos à água. No Parque Estadual Furnas do Bom Jesus foi observada uma associação negativa da onça-parda com a jaguatirica e com o jaguarundi, e positiva entre a jaguatirica e o jaguarundi; não houve sobreposição dos horários entre a jaguatirica e o jaguarundi, enquanto a onça-parda e a jaguatirica co-ocorreram temporalmente. No Jataí a jaguatirica e a onça-parda foram positivamente associadas e co-ocorreram temporalmente...Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES

Primeiro mapa genômico comparativo entre o cromossomo 16 do búfalo de rio (BBU16) e o cromossomo 15 bovino (BTA15)

No presente trabalho, apresentamos o primeiro mapa RH do cromossomo 16 bubalino (BBU16), construído com a utilização do painel celular BBURH5000. Seqüências de primers para PCR de 30 genes derivados do cromossomo 15 bovino (BTA15) foram testados com DNA de búfalo para a construção do mapa RH BBU16. Dos marcadores testados, 11 geraram produtos de PCR específicos com o DNA de búfalo, mostrando-se adequados para o mapeamento utilizando o painel BBURH5000. A partir de análises estatísticas, 9 genes foram incluídos no primeiro mapa RH do cromossomo BBU16 contendo apenas um grupo de ligação. As freqüências de retenção (FR) dos marcadores variaram entre 16,6% (SDHD) e 32,2% (PORIMIN). Comparando-se o mapa RH obtido com a sequência do BTA15, pode-se verificar que não houve discrepâncias quanto a ordem dos 9 genes em ambas espécies, evidenciando a conservação da ordem linear desses marcadores nas mesmasThis paper describes a radiation hybrid (RH) map of river buffalo (Bubalus bubalis) chromosome 16, generated from a previously described river buffalo whole genome RH panel (BBURH5000). PCR Primer sequences were selected for 30 cattle derived genes mapped on bovine chromosome 15. From the total number of selected markers, 11 generated specific PCR products with buffalo DNA and were suitable for mapping using the BBURH5000 panel. The statistical analysis included 9 genes on the BBU16 RH map, which were distributed in one linkage group. Retention frequencies (RF) ranged from 16,6% for SDHD and 32,2 % for PORIMIN. The marker order on the linkage group is entirely consistent with the current BTA15 sequence assembly (Btau_4.0), indicating a conservation in the order of the genes on both speciesCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES

The importance of protected areas for conservation of bare-faced curassow (Crax fasciolata spix, 1825) (Galliformes: Cracidae) in the São Paulo State, Brazil

Submitted by Sandra Infurna ([email protected]) on 2019-02-05T15:08:25Z No. of bitstreams: 1 anpaulan_gomes_etal_IOC_2018.pdf: 4032651 bytes, checksum: c6c4a013b2af46714cefc1e6d508d0ab (MD5)Approved for entry into archive by Sandra Infurna ([email protected]) on 2019-02-05T15:16:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 anpaulan_gomes_etal_IOC_2018.pdf: 4032651 bytes, checksum: c6c4a013b2af46714cefc1e6d508d0ab (MD5)Made available in DSpace on 2019-02-05T15:16:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 anpaulan_gomes_etal_IOC_2018.pdf: 4032651 bytes, checksum: c6c4a013b2af46714cefc1e6d508d0ab (MD5) Previous issue date: 2018Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia e Parasitologia de Mamíferos Silvestres Reservatórios. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Estadual Paulista. Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária. Laboratório de Ecologia de Mamíferos. Campus Jaboticabal, SP, Brasil / Universidade Estadual Paulista. Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal. Campus São José do Rio Preto, SP, Brasil.Universidade Estadual Paulista. Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária. Laboratório de Ecologia de Mamíferos. Campus Jaboticabal, SP, Brasil.Universidade Estadual Paulista. Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária. Laboratório de Ecologia de Mamíferos. Campus Jaboticabal, SP, Brasil.Universidade Estadual Paulista. Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária. Laboratório de Ecologia de Mamíferos. Campus Jaboticabal, SP, Brasil.Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia e Parasitologia de Mamíferos Silvestres Reservatórios. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Veiga de Almeida. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.Universidade Estadual Paulista. Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias. Departamento de Biologia Aplicada à Agropecuária. Laboratório de Ecologia de Mamíferos. Campus Jaboticabal, SP, Brasil / Universidade Estadual Paulista. Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal. Campus São José do Rio Preto, SP, Brasil.The Bare-faced Curassow Crax fasciolata (Cracidae:Cracinae) is a vulnerable species that was classified as critically endangered by the São Paulo State -Brazil, in 2008. Specialists recommended “searches for areas where there may be a few remaining populations and protection of the last remaining semideciduous forest in the State”. Protected areas were investigated in the Cerrado and semideciduous forest in São Paulo State by camera trapping to evaluate the presence of the Bare-faced Curassow. Eight protected areas in Cerrado biome were investigated, but the Bare-faced Curassows was recorded only at Furnas do Bom Jesus State Park (2,069 ha), São Paulo State despite the large sampling effort in larger protected areas such as the Santa Bárbara Ecological Station (2,712 ha) and Jataí Ecological Station (9,074 ha); the largest protected area of Cerrado biome in São Paulo State. This record of C. fasciolata is important for the Conservation Action Plan for the Cracid family and shows the importance of monitoring biodiversity and conserving even relatively small remnants of native vegetation for the conservation of this species

NEOTROPICAL CARNIVORES: a data set on carnivore distribution in the Neotropics

Mammalian carnivores are considered a key group in maintaining ecological health and can indicate potential ecological integrity in landscapes where they occur. Carnivores also hold high conservation value and their habitat requirements can guide management and conservation plans. The order Carnivora has 84 species from 8 families in the Neotropical region: Canidae; Felidae; Mephitidae; Mustelidae; Otariidae; Phocidae; Procyonidae; and Ursidae. Herein, we include published and unpublished data on native terrestrial Neotropical carnivores (Canidae; Felidae; Mephitidae; Mustelidae; Procyonidae; and Ursidae). NEOTROPICAL CARNIVORES is a publicly available data set that includes 99,605 data entries from 35,511 unique georeferenced coordinates. Detection/non-detection and quantitative data were obtained from 1818 to 2018 by researchers, governmental agencies, non-governmental organizations, and private consultants. Data were collected using several methods including camera trapping, museum collections, roadkill, line transect, and opportunistic records. Literature (peer-reviewed and grey literature) from Portuguese, Spanish and English were incorporated in this compilation. Most of the data set consists of detection data entries (n = 79,343; 79.7%) but also includes non-detection data (n = 20,262; 20.3%). Of those, 43.3% also include count data (n = 43,151). The information available in NEOTROPICAL CARNIVORES will contribute to macroecological, ecological, and conservation questions in multiple spatio-temporal perspectives. As carnivores play key roles in trophic interactions, a better understanding of their distribution and habitat requirements are essential to establish conservation management plans and safeguard the future ecological health of Neotropical ecosystems. Our data paper, combined with other large-scale data sets, has great potential to clarify species distribution and related ecological processes within the Neotropics. There are no copyright restrictions and no restriction for using data from this data paper, as long as the data paper is cited as the source of the information used. We also request that users inform us of how they intend to use the data